NetCDF(Network Common Data Form)是一种广泛用于存储多维科学数据的文件格式,而MAT文件是MATLAB的二进制文件格式,用于存储变量数据。...在某些情况下,可能需要将NetCDF文件转换为MAT文件,以便在MATLAB环境中进行进一步处理或分析。...提取数据:使用.values属性将选定的DataArray转换为NumPy数组,这是scipy.io.savemat所要求的格式。...xarray打开NetCDF文件 ds = xr.open_dataset(nc_file) # 选择你想要的变量 data_var = ds['RAINC'] # 将xarray DataArray...这对于在不同编程环境之间共享数据特别有用,尤其是当目标分析工具是MATLAB时。xarray和scipy提供的强大功能简化了这一转换过程,提高了数据处理的效率和灵活性。
例如转换 pandas[1] 类型数据为 xarray 类型或者读取一些数据文件,如NetCDF[2]文件或zarr[3]文件。...pandas 数据类型转换和读取写入 pandas 若要由pandas对象转换为 xarray 对象或者由 xarray 转为pandas对象,可以对pandas[4] 对象使用to_xarray[5...to_dataframe:将DataArray或Dataset对象转换为pandas.dataframe(数据框)。注意到DataArray对象名称与转换为数据框的名称一样都为a。...文件的后缀为.nc。Xarray 基于 netCDF 数据模型,因此磁盘上的 netCDF 文件直接对应于数据集对象。...Xarray 采用open_dataset / open_dataarray 函数读取NetCDF 文件,采用to_netcdf方法将数据写入文件。
无需外部的库即可很容易的转换为 pickle,json 或 geojson。所有的值都会转换为列表,因此字典可以很大。 netCDF 推荐使用 netCDF 存储 xarray 数据结构。...netCDF是源于地理科学的自描述二进制数据格式。 xarray 基于 netCDF 数据模式,因此磁盘中的 netCDF文件和 Dataset 对象是对应的。...但是在操作之前都会先将 DataArray 转换为 Dataset,从而保证数据的准确性。 一个数据集可以加载或写入netCDF 文件的特定组中。...缩放系数及类型转换 以下选项对于任何 netCDF 版本均适用: dtype:任何有效的 numpy 类型或字符串都可转换为 dtype。控制写入文件的数据类型。...scale_factor 和 add_offset:使用公式: decode = scale_factor * encoded + add_offset 将编码数据转换为解码数据。
1、问题背景问题:需要将 netCDF 文件的数据导出到 *.csv 文件,但希望在不使用循环的情况下完成。目前使用的代码存在性能和代码可读性问题,因为使用了三重循环。...2、解决方案方法:为了解决上述问题,可以使用 xarray 库来将 netCDF 文件中的数据转换为表格格式,然后使用 csv 库将表格格式的数据导出到 *.csv 文件。...使用 data_to_table() 函数将 netCDF 文件中的数据转换为表格格式。使用 export_to_csv() 函数将表格格式的数据导出到 *.csv 文件。...export_to_csv(dataset, 'var_name', 'path/to/csv_file.csv')优点:性能优化:使用 xarray 库可以有效地将 netCDF 文件中的数据转换为表格格式...代码可读性增强:使用 xarray 库可以简化代码,使其更加易于阅读和维护。局限性:如果 netCDF 文件中的数据量非常大,则可能需要对代码进行进一步优化以提高导出数据的速度。
为了更好地处理WRF模型输出数据(当然因为wrfout文件太大了!),我们经常需要批量提取其中的变量,并将提取的数据保存为NetCDF格式(.nc文件),这样可以方便我们后续的分析和可视化操作。..., mode='w', format='NETCDF4', group=None, engine=None, encoding=None): """将 xarray 数据写入 NetCDF 格式的输出文件...使用适用于 wrf-python 的 xarray 数据结构。将投影对象转换为字符串以便作为 NetCDF 属性使用。..., mode='w', format='NETCDF4', group=None, encoding=None): """将 xarray 写入 NetCDF 格式的输出文件 使用适用于...将投影对象转换为字符串,以便可以将其作为 NetCDF 属性使用 :param xarray_array: xarray.DataArray :param mode: 文件打开模式,默认为
以下文章来源于MeteoAI ,作者学前班大队长 xarray专题再次开讲,错过第一部分的可以先去补个课从xarray走向netCDF处理(一):数据结构及数据读取。...今天要介绍的就是xarray的索引功能,通过索引你可以对数据进行切片,从整体中提取你所关注的区域、高度或者时间。...索引核心方法 在xarray的官方文档中给出了如下几种索引方式 索引演示 对如下数据进行索引演示:名为ds的DataSet,名为temp的DataArray,数据链接在文末。...= LATITUDE_FORMATTER #y轴设为纬度的格式 return fig, ax 对数据中感兴趣的区域进行提取并简单的可视化。...lon = ds.longitude time = ds.time temp = (ds['t2m'] - 273.15) # 把温度转换为℃ # 区域选择 lon_range = lon[(lon>
以下文章来源于MeteoAI ,作者学前班大队长 想如今气象数据netCDF(.nc)为盛,用者甚多,初学者见之仰天长啸,倘若再由Python经手,netCDF4-python,Iris,xarray...安装 xarray的安装依旧推荐使用conda,还不会的小伙伴移步:一文教你解决Python所有安装配置 conda install xarray 在终端里输入如上命令,之后输入y,等待安装结束就好了...,比如变量的名字、单位等 数据结构图示 数据类型的使用 读取数据: xarray.open_dataset()读取Dataset类型数据,即能读取多个物理量。...提取物理量 从文件中读取数据ds = xarray.open_dataset() 假如数据中含有一个名为var的物理量可以通过ds.var或ds[var]来获取 实例 此处使用的是ERA-Interim...xarray封装了matplotlib的部分绘图函数,一行代码就可以将数据画出来,不过作为一个负责的公众号,还是用cartopy顺带加载了地图。
如何将ORA-S5西太数据mat格式转为nc格式 前言 本文旨在展示如何将 ORA-S5 西太平洋区域的 MATLAB (.mat) 格式数据转换为 NetCDF (.nc) 格式,以便于进一步的数据分析和可视化...通过使用 Python 中的 scipy.io.loadmat 和 xarray 库,我们将构建一个 xarray.Dataset 对象,并最终保存为 NetCDF 文件。...""" # 提取文件名中的日期部分 date_str = filename.split('_')[1].split('.')[0] # 将字符串转换为 datetime...to_netcdf即可 小结 本文介绍了如何将 ORA-S5 西太平洋区域的 MATLAB (.mat) 数据文件转换为 NetCDF (.nc) 格式。...通过使用 Python 的 scipy.io.loadmat 和 xarray 库,我们成功地构建了一个 xarray.Dataset 对象,其中包含了诸如盐度 (salt)、温度 (temp)、u-方向速度分量
想如今气象数据netCDF(.nc)为盛,用者甚多,初学者见之仰天长啸,倘若再由Python经手,netCDF4-python,Iris,xarray,UV-CDAT选择众多,劳心伤神事小,逼出选择困难症事大...安装 xarray的安装依旧推荐使用conda,还不会的小伙伴移步:一文教你解决Python所有安装配置 conda install xarray 在终端里输入如上命令,之后输入y,等待安装结束就好了...数据结构图示 数据类型的使用 读取数据: xarray.open_dataset()读取Dataset类型数据,即能读取多个物理量。...提取物理量 从文件中读取数据ds = xarray.open_dataset() 假如数据中含有一个名为var的物理量可以通过ds.var或ds[var]来获取 实例 此处使用的是ERA-Interim...xarray封装了matplotlib的部分绘图函数,一行代码就可以将数据画出来,不过作为一个负责的公众号,还是用cartopy顺带加载了地图。
p = getvar(ncfile, "P") 关闭 xarray 和 metadata 有时候你只需要返回常规的 numpy 数组,而不关心元数据。通过以下两种方式可以禁用元数据。...中提取 numpy 数组 如果你需要将 xarray.DataArray 转换为 numpy.ndarray, wrf-python中的 wrf.to_np 函数可以帮助你完成这一操作。...如果指定值的话,那么从每个文件中提取变量时,指定值将应用于每个文件。在具有多个时刻的多个文件中,这样做可能是没有意义的,因为每个文件的第 n 个索引可能表示不同的时刻。...当使用经纬度坐标时,需要提供 netCDF文件对象或是wrf.WrfProj 对象。...对这三种绘图系统,当使用 xarray 时通过变量可直接确定地图对象,如果没有使用 xarray,可从 WRF 输出文件获取。 还包括直接从 xarray 切片中获取地理边界的函数。
xarray专题再次开讲,错过第一部分的可以先去补个课从xarray走向netCDF处理(一):数据结构及数据读取。...今天要介绍的就是xarray的索引功能,通过索引你可以对数据进行切片,从整体中提取你所关注的区域、高度或者时间。 索引核心方法 在xarray的官方文档中给出了如下几种索引方式 ?...索引演示 对如下数据进行索引演示:名为ds的DataSet,名为temp的DataArray,数据链接在文末。...= LATITUDE_FORMATTER #y轴设为纬度的格式 return fig, ax 对数据中感兴趣的区域进行提取并简单的可视化。...lon = ds.longitude time = ds.time temp = (ds['t2m'] - 273.15) # 把温度转换为℃ # 区域选择 lon_range = lon[(lon>
xgrads的主要功能是解析Grads文件为xarray对象,可以更好的利用xarray的高维数据分析和可视化功能,加速气象相关的数据处理、分析和可视化。以下是对此库的具体介绍。...网格分析和显示系统(GrADS或OpenGrADS)是一个广泛使用的软件,用于方便访问、操作和可视化地球科学数据。它使用后缀为.ctl的描述符(或控制)文件来描述原始二进制4D数据集。...ctl文件类似于NetCDF文件的头信息,包含了除了变量数据以外的所有维度、属性和变量的信息。 xgrads是为解析和读取GrADS常用的.ctl文件而设计的。目前,它可以解析各种.ctl文件。...但是,只有常用的原始二进制4D数据集可以使用dask读取,并以xarray.Dataset的形式返回,其他类型的二进制数据,如dtype 是 station 或 grib,将来可能会得到支持。...,但此工具提供了和xarray的兼容,利用此工具将grads文件解析为xarray对象可以更好的利用xarray的大量函数,更好的进行数据分析和可视化。
使用过WRF的人都知道,它的模拟结果是按照我们指定的时间间隔和模拟时间段依次输出的。但在处理数据的时候呢,比如想画一个时间趋势图之类的时候,挨个读取数据非常繁琐。...我们希望能够把所有的数据或者某个我们关心的变量单独提取出来,让其按照指定的维度,如时间维度来排序并整合成一个文件。...因为一般WRF 默认输出文件的文件名后缀没有.nc,无法直接使用xarray进行读取,也就用不了concat函数。所以这里我们先给所有的输出文件批量添加后缀名".nc"。...(也可自行指定文件路径) path = os.getcwd() #一般 WRF 默认输出文件的文件名后缀没有.nc,无法直接使用xarray进行读取,进而用不了concat函数 #这里我们批量修改文件名...= 'wrfout_d01': #通过索引选择想要的数据,可以按照需要进行更改 continue list_names.append(ncfile) #将模拟结果文件名按照时间进行排序
这次我们来简单了解下气象数据常用的格式以及处理的工具,常用的数据格式包括普通的二进制格式、文本数据、NetCDF、HDF4/5以及GRIB1/2数据。...二进制文件和文本数据 气象中的二进制文件是指利用ASCII及扩展ASCII字符编写的数据或程序指令的文件,一般没有格式,用文本编辑器打开只能看到无意义的乱码,需要特定的解码说明才能使用,例如气象雷达的数据...数据处理的介绍,有感兴趣的同学可以关注公众号查看历史精彩文章使用python处理NetCDF格式文件,这里介绍大家利用CDO如何处理netCDF格式的文件 CDO(Climate Data Operators...处理grib文件的常用工具包pygrib,Grib格式数据处理有详细介绍,gribapi也自带python接口,可以通过ECMWF提供的ecCodes或cgrib安装包进行安装使用。...###wgrib2命令行 wgrib2 -d 56 a.grb2 -netcdf a.nc ###将grib文件转位nc文件 wgrib2 a.grb2 -d 1 -s -lon 249 39 -lon
,会出现个三角形,点击查看即可 前言 之前的文章中,有朋友提出水汽通量散度剖面图怎么画,那么我们来探索一下 项目目标 本项目旨在通过 Python 编程语言,结合气象数据处理库(如 xarray、metpy...文件 Parameters: ----------- ds : xarray.Dataset 包含气象数据的数据集 output_path :...str 保存 NetCDF 文件的路径 time_idx : int 时间索引 """ # 获取需要的气压层 levels = [1000...div_q = xr.concat(div_q_list, dim='level') div_q['level'] = levels # 将 DataArray 转换为...剖面图的绘制:使用 metpy 和 matplotlib 绘制水汽通量散度剖面图,并嵌入小地图显示剖面路径。 如果想计算其他气象变量的剖面,先计算后将其存为有经纬度的nc文件再使用metpy函数即可
Dataset xarray.Dataset 是和 DataFrame 相同的多维数组。这是一个维度对齐的标签数组(DataArray)的类字典容器。它用来展示NetCDF文件格式的数据。...同样可以利用 to_* 类方法将 DataArray 转换为 DataFrame, Dataset, Series, Dict, netcdf, masked_array。...虽然 xarray 不会强制限制属性设置,但是如果使用的不是 字符串,数字或 numpy.ndarray 对象,那么在序列化某些文件格式时仍可能会失败。...数据集转换 除了上述的类字典方法外, xarray 还有一些其它方法可以将数据集转换为其它对象。...使用 xarray 创建新数据集不会造成性能损失,即使是从文件中加载。创建新对象代替那些存在的”变异“变量,对于理解代码来说是有利的。
xarray的典型计算工作流程通常包括: 使用xr.open_mfdataset 或 xr.open_dataset(chunks=...)...读取单个或多个文件到 Dataset 对读取的输入对象执行一系列变换操作 使用to_netcdf方法保存结果 上述步骤通常会产生很大的nc文件(>10G),尤其是在处理大量数据时。...最近在处理卫星数据时,最终生成的文件甚至超过了50G,有些甚至超过了100G。而目前xarray对于nc格式的大文件存储让人头疼。在存储这些大文件时耗时很长,甚至可能会导致程序挂起。...netCDF可是的写操作一直是xarray的痛点,尤其是在并行写和增量写文件方面。...目前新版本的netCDF库也逐渐支持zarr格式,但还没测试过效果如何。如果不是一定要netCDF格式的话,可以尝试使用zarr格式。 后话:虽然本文使用了dask,但是涉及到dask的内容比较少。
气象领域的数据存储格式大多都是netCDF、HDF、Grib格式,这些文件格式已经发展的比较成熟了,大家也都已经习惯了处理这些格式的文件。...Zarr和NetCDF格式效率对比 之前也大概了解过 Zarr,之所以要专门介绍 Zarr 是因为在处理数据的过程中,由于需要进行大文件读写操作,而使用 NetCDF 格式写入数据时速度很慢,并且为了避免对文件进行分割实现文件的并行读写...在初步尝试时,使用 Zarr 格式写入数据时比使用 xarray 写入 NetCDF 文件快了 2 倍(未进行数据压缩)。...值得注意的是:xarray 不支持通过 netCDF 格式的增量写文件,支持 Zarr 格式的增量写文件。增量读写在一些场景下是非常关键的,尤其是在数据集较大内存不足的情况下。...在大量文件读写方面我已经逐渐转向 Zarr 了,后续可能也会更新一些这方面的推送,毕竟目前xarray在文件并行读写方面Zarr的支持比netCDF要好一些。
1、CMIP数据 对于使用的CMIP数据,本文并没有使用论文中使用的CMIP5数据,而是使用CMIP6数据。 对于数据的下载,可以直接百度搜索CMIP6然后选择所需的Label下载即可。...我们根据上述规律,使用wget就可以很简单的下载数据了。 接下来是处理CMIP数据,为了统一语言,我使用python中的xarray来处理、merge文件。缺点是很慢,优点是易学。...对于保存nc文件,需要使用**TosAD = xr.Dataset({"TosA": TosAInterped})来将Dataarray转化为Dataset,然后使用TosAD.to_netcdf("..../Cmip6" # 使用 xarray 把分散的几个文件merge起来 FileList = os.listdir(loc) Toslist = [] Zoslist = [] for FName in.../ersstv5D") print(file) 同样的,我们使用xarray来merge下载的多个nc文件,并且保存。
+cfgrib 优缺点对比 优点 缺点 pygrib 读取文件速度快,重写数据方便 查看文件信息相对于cfgrib较麻烦 xarray+cfgrib - 直接将grib文件解析为常见的dataset格式...xarray.open_mfdataset 对于大内存的文件,需要搭配dask使用 读取任意grib 的keys >>> ds = xr.open_dataset('era5-levels-members.grib...将数据写入新的grib文件!有用!...: grb pygrib.index()读取数据后,不支持通过关键字读取指定的多个变量 问题解决:将滤波后的数据替换原始grib中的数据再重新写为新的grib文件 pygrib写grib文件的优势在于...'.grib','wb') for i in range(len(sel_u_850)): print(i) sel_u_850[i].values = band_u[i] #将原始文件中的纬向风数据替换为滤波后的数据
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