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使用sed在FASTA标题行的开头和结尾添加单词

sed是一种流编辑器,常用于文本处理和替换操作。在FASTA标题行的开头和结尾添加单词可以通过以下sed命令实现:

代码语言:txt
复制
sed -e 's/^>/word&word/' -e 's/$/word/' input.fasta > output.fasta

这个命令将会在FASTA文件的每个标题行开头和结尾添加单词"word"。其中,input.fasta是输入的FASTA文件名,output.fasta是输出的文件名。

这个命令使用了sed的替换操作符's',并结合了正则表达式和替换模式。'^>'表示匹配以">"开头的行,'word&word'表示在匹配到的行开头添加"word",'$'表示匹配行尾,'word'表示在行尾添加"word"。

这个操作适用于需要在FASTA文件的标题行开头和结尾添加单词的场景,例如在序列标识符中添加额外的信息或标记。

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