使用dplyr基于重复值的因子级别汇总条件拆分数据帧 - 腾讯云开发者社区

包 #dplyr中基本函数 filter——数据筛选（筛选观测值，行） filter(Hdma_dat,pclass == 1) ###################################...f是分组因子。...在base包里和split功能接近的函数有cut(对属性数据分划)，strsplit(对字符串分划)以及subset（对向量，矩阵或数据框按给定条件取子集）等。...")],function(x) sum(x)) 4、subset()函数利用subset()函数进行访问和选取数据框的数据更为灵活，subset函数将满足条件的向量、矩阵和数据框按子集的方式返回。...##对于数据框 x是对象，subset是保留元素或者行列的逻辑表达式，对于缺失值用NA代替。 Select 是选取的范围，应小于x。

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R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

/tidyr 数据管理 2.1 filter 使用逻辑条件对行筛选。...，后续的参数是条件，这些条件是需要同时满足的，另外，条件中取缺失值的观测自动放弃，这一点与直接在数据框的行下标中用逻辑下标有所不同，逻辑下标中有缺失值会在结果中产生缺失值。...2.3 distinct 用来去除重复行，有时我们希望得到一个或若干个变量组合的所有不同值。...dplyr 包的 distinct() 函数可以对数据框指定若干变量，然后筛选出所有不同值，每组不同值仅保留一行。...nest 与unnest 对于数据框，我们可以使用split 将数据框按某列拆分为多个数据框，并储存在列表中。

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快速掌握R语言中类SQL数据库操作技巧

参考→《R语言数据（集）合并与连接/匹配 | 专题2》 4.过滤/筛选过滤，是对数据集按照某种规则进行筛选，去掉不符合条件的数据，保留符合条件的数据。...排序 #order默认升序，变量前加“-”代表降序 #排序的操作，大多都是基于索引来完成的 #用order()函数来生成索引，再匹配的数据的数值上面。...，大多都是基于索引来完成的 > #用order()函数来生成索引，再匹配的数据的数值上面。...=5) 8 数据分裂分裂计算，是把一个向量按照一列规则，拆分成多个向量的操作。...分成2步操作，第一步先分成与数据集同样长度的因子，第二步进行分裂，可以把一个大的向量拆分成多个小的向量。

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LESS-Map：用于长期定位轻量级和逐渐演进的语义地图方案

本文提出了一种基于地面语义特征、利用低成本摄像头的新型地图制作、定位和地图更新系统，提出了一种精确且轻量级的参数化方法，用于建立改进的数据关联，实现厘米级别的精确定位。...此外还提出了一种新颖的地图更新方法，通过对参数化的语义特征实现高质量的数据关联，允许在重新定位过程中进行连续地图更新和细化，同时保持厘米级别的准确性。...当计算得到的重叠值低于预定义的阈值时，定位结果被视为无效。然后，这一有效性判断将被发送到图优化模块。图6. 说明了地图边缘的重叠值情况。...里程计因子是基于从里程模块获取的帧对帧的结果构建的，而定位因子是基于由定位模块提供的帧对地图的结果构建的。值得注意的是，这些定位因子仅在定位有效时才会被纳入考虑。...基于稀疏语义视觉特征的道路场景的建图与定位自动驾驶中基于激光雷达的车辆道路和人行道实时检测（代码开源）用于三维点云语义分割的标注工具和城市数据集更多文章可查看：点云学习历史文章大汇总 SLAM

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数据处理|R-dplyr

dplyr包实现数据的清洗处理，包括数据整合、关联、排序、筛选、汇总、分组等。...1）安装、加载dplyr包、准备数据 install.packages("dplyr") #加载dplyr包使用dplyr包处理数据前，建议先将数据集转换为tbl对象。...data(iris) #本文使用iris示例数据集。 2）数据记录筛选（行筛选） filter函数:按指定条件筛选符合条件中逻辑判断要求的数据记录。...Width) #计算一个或多个新列并删除原列 6）数据汇总 summarize()函数实现数据集聚合操作，将多个值汇总成一个值 summarise(iris,avg = mean(Sepal.Length...sample_n(mtcars, 50, replace = TRUE) #随机有重复的取50行数 10）数据联结 dplyr包也提供了数据集的连接操作，如左连接、右连接、内连接等： inner_join

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R语言之 dplyr 包

这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。下面以 MASS 包里的 birthwt 数据集为例，介绍 dplyr 包里常用函数的用法。...1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行函数 filter() 可以基于观测值筛选数据框的一个子集。第一个参数是数据框名，第二个参数以及随后的参数是用来筛选数据框的表达式。...例如，筛选数据框里年龄大于 35 岁的对象的所有记录： filter(birthwt, age > 35) 函数 filter ( ) 里可以用逗号分隔多个条件。...为了避免混淆，我们可以使用符号 :: 特别指明使用某一个包里的函数，例如 dplyr::select( )。之后我们将会对函数 select( ) 作进一步介绍。...使用 group_by( ) 拆分数据框函数 group_by( ) 可以将数据框按照某一个或某几个分类变量拆分成多个数据框。

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tidyverse：R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

出版有《R for Data Science》（中文版《R数据科学》），这本书详细介绍了tidyverse的使用方法。...从文件中读取数据 purrr：(提供好用的编程函数 tibble：data.frame升级款 stringr：处理字符，查找、替换等 forcats：处理因子问题 ?...：数据整理 dplyr包的下述五个函数用法 4.1 筛选: filter 4.2 排列: arrange 4.3 选择: select 4.4 变形: mutate 4.5 汇总: summarise...#key：将原数据框中的所有列赋给一个新变量key #value：将原数据框中的所有值赋给一个新变量value #…：可以指定哪些列聚到同一列中 #na.rm：是否删除缺失值 widedata <-...= FALSE, extra = “warn”, fill = “warn”, …) #data：为数据框 #col：需要被拆分的列 #into：新建的列名，为字符串向量 #sep：被拆分列的分隔符

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R语言入门（一）之数据处理

#rep(x,times):x是要重复的对象（例如向量c(1,2,3)）,times为对象中每个元素重复的次数（如times=c(9,7,3)就是将x向量的1重复9次，2重复7次，3重复3次） #rep...(x,times)重复x，times次；使用each=来重复x元素each次；rep(c(1,2,3),2)得到1 2 3 1 2 3；rep(c(1,2,3),each=2)得到1 1 2 2 3 3...str(a1) #以简洁的方式显示对象的数据结构及内容 summary(a1) #可以提供最小值、最大值、四分位数和数值型变量的均值，以及因子向量和逻辑型向量的频数统计 ?...table(a1$chemical) table(a1$chemical, useNA = "ifany") #求因子出现的频数；table()函数默认忽略缺失值（NA），要在频数统计中将NA视为一个有效的类别...duplicated(a1$Species) #duplicated函数是一个可以用来解决向量或者数据框重复值的函数，它会返回一个TRUE或FALSE的向量，以标注该索引所对应的值是否是前面数据所重复的值

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R语言|数据清洗

本文将全面介绍R语言数据清洗的常见技巧，并配以具体的代码示例。数据清洗常见的任务包括：处理缺失值、数据格式转换、去除重复数据、修正异常值、数据标准化、数据分组与聚合、文本数据清理。...2. dplyr dplyr是R语言中最受欢迎的数据操作包之一，擅长数据清洗和操作，语法简洁直观。...其他工具根据需求还可以使用lubridate处理日期时间数据，janitor快速清理变量名等。 TIPS 使用示例缺失值处理：缺失值处理是数据清洗的第一步。可以选择删除、填充或插值的方法。...(data) # 删除重复行 data_unique % distinct() 修正异常值：通过计算分位数或使用业务规则修正数据中的异常值。...：对于分组和汇总操作，dplyr非常方便。

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DESeq2差异表达分析(二)

为了探索样本的相似性，我们将使用主成分分析(PCA)和层次聚类方法进行样本级质量控制。样本级的质量控制使我们能够看到我们的重复聚在一起有多好，以及观察我们的实验条件是否代表了数据中的主要变异源。...我们看到PC1上的样本与我们感兴趣的条件之间有很好的分离，这很好；这表明我们感兴趣的条件是数据集中最大的变异源。...由于大多数基因没有差异表达，样本之间通常有很高的相关性(值高于0.80)。低于0.80的样品可能表示您的数据和/或样品污染中存在异常值。层次树可以基于归一化的基因表达值来指示哪些样本彼此更相似。...Running DESeq2 使用DESeq2进行差异表达分析涉及多个步骤，如下面的蓝色流程图所示。简而言之，DESeq2将对原始计数进行建模，使用归一化因子(大小因子)来考虑库深度的差异。...在所有细胞类型群集上运行DESeq2-Wald测试的脚本下面的脚本将在所有细胞类型集群上运行DESeq2，同时使用Wald测试将感兴趣的条件的每个级别与所有其他级别进行对比。

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R语言快速入门主线知识点分享|文末有资源

set.seed(0) set.seed(1) c() seq() #生成等差数据 rep() #重复生成数据 rep(1:10,2) factor() #因子数据 #语法 factor(x = character...() #读取.csv格式的数据，read.table的一种特定应用 df <- read.csv("da.csv",header = T, stringsAsFactors= T) str(df) #...# 函数 ############ 数据筛选（逻辑）条件筛选、&、| 补充学习《补充-R 语言逻辑运算：TRUE_FALSE _ 专题3.pdf》 # 关于逻辑可适当补充apply系列函数...##### dplyr包的下述五个函数用法 filter # 筛选: arrange # 排列: select # 选择: mutate # 变形: summarise # 汇总: group_by...#分组: #示例分组汇总计算 data("iris") str(iris) library(dplyr) iris %>% group_by(Species) %>% summarise

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R语言基于dplyr实现数据快捷操作

R语言在处理大数据方面一直是被人诟病的地方，那么有人就为R语言打造了一个dplyr包可以实现高效的数据预处理，减少内存的消耗，提升处理效率。今天就给大家详细看下这个包的具体功能。...首先看下包的安装： install.packages("dplyr") 接下来我们看下具体的功能： 1. as_tibble 将大的数据转化为友好展示的格式。...实例： library(dplyr) mtcars <- as_tibble(mtcars) ? 2. arrange 对数据集进行整体基于单列或者多列进行排序。...3. distinct 去除重复的行。...11. summarise 汇总变量的属性，并进行统计输出。

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使用R或者Python编程语言完成Excel的基础操作

数据格式设置：了解如何设置数据格式，包括数字、货币、日期、百分比等。条件格式：学习如何使用条件格式来突出显示满足特定条件的单元格。图表：学习如何根据数据创建图表，如柱状图、折线图、饼图等。...合并与拆分单元格合并单元格：选中多个单元格，点击“合并与居中”。拆分单元格：选中合并的单元格，点击“合并与居中”旁边的小箭头选择拆分选项。 14....以下是一些其他的操作：数据分析工具数据透视表：对大量数据进行快速汇总和分析。数据透视图：将数据透视表的数据以图表形式展示。条件格式数据条：根据单元格的值显示条形图。...R语言进行数据的读取、转换、汇总和排序。...通过dplyr和tidyr包，我们可以轻松地对数据进行复杂的操作。在R语言中，即使不使用dplyr和tidyr这样的现代包，也可以使用基础包中的函数来完成数据操作。

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R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

4.1.1 安装R、RStudio和R包 R提供一个基于命令行的统计框架，RStudio作为IDE，所有统计分析和图形可以使用它进行。...values - try another formula or subset 报错啦，重复的分类值，是啥情况呢？...，升序，可以认为x[order(x)]=sort(x) ifelse()R语言是向量化的，ifelse()可以遍历所有因子并避免使用循环，根据前面我们知道，循环调用函数次数超级多的话会让时间明显变长。...在以行和列转换和汇总表格数据方面，非常有用，包括选择行，过滤列、排序行，增加新列和汇总。...重要的函数包括： select() 和 rename() 基于名字选择列(变量) filter() 基于值过滤行(cases) arrange() 重新排序行 (cases) mutate() 和 transmute

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R语言第二章数据处理③删除重复数据目录总结

主要用的到R base和dplyr函数： duplicated（）：用于识别重复的元素和 unique（）：用于提取唯一元素， distinct（）[dplyr package]删除数据框中的重复行...dplyr包删除数据框中的重复行函数distinct（）[dplyr package]可用于仅保留数据帧中的唯一行。...根据所有列删除重复的行（完全一样的观测值）： my_data %>% distinct() 根据特定列删除重复值 my_data %>% distinct(Sepal.Length, .keep_all...= TRUE) 根据多列删除重复值 my_data %>% distinct(Sepal.Length, Petal.Width, .keep_all = TRUE) 选项.kep_all用于保留数据中的所有变量...总结根据一个或多个列值删除重复行：my_data％>％dplyr :: distinct（Sepal.Length） R base函数从向量和数据帧中提取唯一元素：unique(my_data) R基函数确定重复元素

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R语言之数值型描述分析

在分析之前，先将数据集 birthwt 中的分类变量 low、race、smoke、ht 和 ui 转换成因子。...summary(birthwt) 函数 summary( )可以对每个变量进行汇总统计。...epiDisplay 包的函数 summ( )作用于数据框可以得到另一种格式的汇总输出，它将变量按行排列，把最小值和最大值放在最后两列以方便查看数据的全距。...library(epiDisplay) summ(birthwt) 需要注意的是，对于因子型的变量，函数 summ( )把变量的各个水平当作数值计算统计量。...psych 包里的函数 describe( )可以计算变量忽略缺失值后的样本量、均值、标准差、中位数、截尾均值、绝对中位差、最小值、最大值、全距、偏度、峰度和均值的标准误等。

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生信代码：数据处理（ tidyverse包）

tidyverse 包是 Hadley Wickham 及团队的集大成之作，是专为数据科学而开发的一系列包的合集，基于整洁数据，提供了一致的底层设计、语法、数据结构，包括数据导入，数据规整，数据处理，...可视化，建模以及形成可重复性报告数据分析的全流程。...)——汇总数据而这些函数都可以与group_by结合，分组对原数据框进行处理。...df %>% select(start_with("n")) 3 filter() filter()是对数据行方向的选择和筛选，选出符合我们条件的某些行： df %>% filter( type==...，例如对于我们本文中的数据框，我们如果对个人或者科目感兴趣的话，可以使用group_by（name或者type），然后利用summarize函数就可以求出分类之后的各个统计值。

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R语言常见函数知识点梳理与解析 | 精选分析

) 5、complete.cases( ) 判断对象中是否数据完全 6、grep（）找出所数据框中元素所在的列值（仅数据框中） 7、assign（）通过变量名的字符串来赋值 8、 split（）根据因子变量拆分数据框...dplyr、tidyr | 第4讲 R语言控制流：for、while、ifelse和自定义函数function|第5讲正文 1、str() 显示数据集和变量类型，并简要展示数据集情况 > data...4 5 6 7 8 9 10 8、 split（）根据因子变量拆分数据框/向量 split（x，f）；x 可以为向量或者数据框，f 为对应的因子，函数以列表的形式返回 > x = data.frame...C：把对象用格式转换为字符串 paste，strsplit：连接或拆分 charmatch，pmatch：字符串匹配 grep，sub，gsub：模式匹配与替换 16、因子 factor：因子 codes...：因子的编码 levels：因子的各水平的名字 nlevels：因子的水平个数 cut：把数值型对象分区间转换为因子 table：交叉频数表 split：按因子分组 aggregate：计算各数据子集的概括统计量

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广义估计方程和混合线性模型在R和python中的实现

，通常会在一段时间内对多个同一研究对象进行多次或重复测量，这类数据一般称为纵向数据。...纵向数据具有两个特点，一是研究对象重复；二是观察值可能存在缺失值。...广义估计方程(generalized estimating equations，GEE)：假定每个研究对象的重复观察值间存在某种类型的作业相关矩阵（应变量的各次重复测量值两两之间相关性的大小），应用准似然函数原理...控制、研究，且能独立变化而影响或引起其他变量变化的条件或因素（变数、变量、变项），因此自变量被看作是因变量的原因。...P*P维作业相关矩阵（自变量X），用以表示因变量的各次重复测量值（自变量）之间的相关性大小求参数$\beta$的估计值及其协方差矩阵混合线性模型(mixed linear model，MLM)：构建包含固定因子和随机因子的线性混合模型

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

本节课程大纲六个专题—— 1.玩转字符串★★★ 2.玩转数据框★★★ 3.条件和循环★★★★★ 4.表达矩阵画箱线图★★★★ 5.隐式循环★★★ 6.两个数据框的连接★★ 课前提示：六个专题互不干扰互相独立...") 拆分字符串图片 -（1）拆分之后成为了了列表，列表的每个元素对应原来的每个元素拆分的结果 -（2）列表使用不方便——simplify = T简化结果，简化成矩阵 -（3）注意：之前提到过，矩阵的某一列不能单独转换数据类型...()去重复 # distinct，数据框按照某一列去重复 distinct(test,Species,.keep_all = T) 其中.keep_all = T表示“按'Species'列去完重复后保留所有列...：不符合大于零的条件，就再进行一步判断；练习7-2 # 1.加载deg.Rdata,根据a、b两列的值，按照以下条件生成向量x： #a的值为down； #a>1 且b...使用转换好的数据画图 #数据转换好就可以画图了 library(ggplot2) p = ggplot(pdat,aes(gene,count))+ geom_boxplot(aes(fill =

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

R 数据整理（七：使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0）

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