使用Uniprot SPARQL端点的QueryBadFormed
是指在使用Uniprot SPARQL端点进行查询时出现的查询格式错误。SPARQL（SPARQL Protocol and RDF Query Language）是一种用于查询和操作RDF（Resource Description Framework）数据的标准查询语言。Uniprot是一个蛋白质数据库，提供了丰富的蛋白质信息和相关数据。
当使用Uniprot SPARQL端点进行查询时，如果查询语句的格式错误或不符合SPARQL规范，就会出现QueryBadFormed错误。这种错误可能是由于语法错误、查询变量错误、无效的查询模式等引起的。
解决QueryBadFormed错误的方法是仔细检查查询语句的格式，确保语法正确、查询模式有效，并且查询变量与数据模式匹配。可以参考SPARQL查询语言的文档和Uniprot SPARQL端点的文档来了解正确的查询语法和可用的数据模式。
在腾讯云的云计算服务中，可以使用腾讯云提供的图数据库产品TencentDB for JanusGraph来存储和查询RDF数据，以实现类似的功能。TencentDB for JanusGraph是腾讯云基于JanusGraph图数据库开发的一款高性能、高可用的图数据库产品。它支持SPARQL查询语言，可以用于存储和查询包括蛋白质数据在内的各种图数据。
更多关于TencentDB for JanusGraph的信息和产品介绍，请访问腾讯云官方网站：TencentDB for JanusGraph。
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我正在使用SPARQLWrapper从Python编写一个SPARQL查询。端点是Uniprot，但50%的时间，我在执行代码时出现错误： def getReviewProt(accession): mystring =://sparql.uniprot.org/sparql")
sparql.setQuery("&q
浏览 31提问于2020-07-20得票数 0
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我遇到了这个奇怪的问题，我试图使用python中的SPARQLWrapper库插入到虚拟图中。我能够在localhost:8890\sparql上通过基于浏览器的端点插入一个三元组，但是当我通过python SparqlWrapper尝试相同的查询时，它会引发以下错误：
SPARQLWrapper.SPARQLExceptions.QueryBadFormed: QueryBadFormed:一个错误的请求已经发送
浏览 4提问于2013-12-17得票数 1
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我正在尝试使用python的SPARQLWrapper和我在这里找到的代码片段从GraphDB (version = GraphDB free)中删除一个简单的三元组：https://github.com我总是得到以下异常: SPARQLWrapper.SPARQLExceptions.QueryBadFormed: QueryBadFormed:一个错误的请求被发送到端点，可能是sparql查询的</em
浏览 25提问于2020-08-31得票数 0
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我使用联邦查询从远程服务器检索一些信息，但我不想检索联邦查询中正在处理的所有变量(select *)，我只想返回count变量。我怎么能这么做？代码： ?bp_count)
SERVICE silent <https://sparql.uniprot.org/
浏览 1提问于2018-11-12得票数 2
我有这个SPARQL query in pythonlimit 50
print json.dumps (query
浏览 3提问于2015-01-12得票数 0
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我想问一下，如何在SPARQL端点(而不是整个远程SPARQL端点)的子图上执行联邦SPARQL查询。当SPARQL端点是"“时，我在Virtuoso v7中获得了我的数据，我想对这个端点的子图"”进行远程查询，并且我尝试了WHERE
{ SERVICE <http://localhost:8890/spar
浏览 13提问于2017-10-31得票数 0
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我试图用Python中的.ttl查询(最初是RDFLib )文件。文件的摘录如下所示。我想提取这个例子中的的值。我正在使用来完成这个任务。不过，我认为WHERE条款有问题。有人知道我如何为这个特定的refArea获得这个值吗？SPARQLWrapper import SPARQLWrapper, JSON
result = g.parse('cube7.ttl', format='n3')
spar
浏览 0提问于2016-10-20得票数 0
关于在包装库中插入SPARQL查询中的变量的非常简单的问题。下面的例子是在一个木星笔记本中，我在SPARQL查询之外定义了一个变量'q'，并希望在SPARQL查询中使用它。o """
sparql.setQuery(query)resultsexcept u
浏览 6提问于2022-06-10得票数 0
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通过SPARQLwrapper，我可以使用SPARQL成功地查询和返回结果。当我尝试使用网站的构造示例时，我得到并出错了"ExpatError: no element found: line 1, column 0“sparql =()
print(results.serialize())DBpedia示
浏览 6提问于2022-07-01得票数 1
1回答
我使用SPARQL和Python向DBPedia发出请求。我试图用反斜杠(如下面的代码)来转义它，但它不起作用。我读到我可以指定整个URI，但是它也不能工作(但我可能没有用正确的方法)。 }下面是我遇
浏览 1提问于2019-03-25得票数 1
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现在，我想将这个图中的三元组插入到GraphDB三重存储中。当我在Sesame上托管的GraphDB的旧版本上执行它时，代码工作得很好。但是，在对现在独立的GraphDB 7.0.0执行相同的查询时，我会得到一个错误。在引发错误之前对图进行部分解析，插入的三元组在三重存储中显示。sparql.method = 'POST'
浏览 0提问于2016-04-21得票数 2
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我正在开发一个与其他开发人员一起使用通用Fuseki数据集的应用程序。Javascript函数调用AJAX (jQuery $.ajax())并通过POST请求向Python发送三个变量。注释3: --我尝试了Fuseki上的查询字符串，其形式是专门用于SPARQL的，它工作得很好。SPARQL查询表单中的相同查询没有工作。
我肯定我做错了什么，但我不明白.有什么建议吗？谢谢!，并使用fuseki-server --update --mem /
浏览 10提问于2015-02-02得票数 1
我是语义网编程的新手，我正在尝试用SPARQL查询做一些事情，我不完全确定这是不可能的。然而，在尝试另一种方法之前，我想我应该问问上师。http://purl.uniprot.org/uniprot/Q9UKM9
我想将该URL的最后一部分(Q9UKM9)放入一个变量中，以便在正则表达式命令中使用，以便在另一个资源中找到相同的</e
浏览 0提问于2013-05-11得票数 3
1回答
我正在使用下面的sparql查询，如下所示。['boolean'])CRITICAL: Exiting due to uncaught exception <class 'SPARQLWrapper.
浏览 0提问于2019-03-17得票数 0
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我正在运行来自实时演示()的查询。SPARQL端点被更改为使用Apache Jena Fuseki服务器构建的localhost端点。RDF文件被上传并存储在服务器中，并且设置了SPARQL端点。通过HTTP访问RDF文件的设置基本上是成功的，并且可以通过终端跟踪更改。
因此，我正在尝试实现D3Sparkle来可视化数据。到目前为止，我所做的只是更改端点，并将我的
浏览 18提问于2017-02-25得票数 0
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假设我有这样的查询：<http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8NAT1> up:classifiedWith ?annotation . ?<http://purl.uniprot
浏览 3提问于2020-03-04得票数 0
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是否有可能筛选出SPARQL查询中包含不可解析URI的结果？例如:我正在进行以下查询(端点：)：PREFIX SIO: <http://semanticscience.orglinkedlifedata.com/resource/pubmed/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.
浏览 4提问于2017-01-05得票数 0
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我一直试图让SPARQLWrapper将一个简单的三元组插入到GraphDB中，但没有成功。我对select查询没有问题。下面是失败的Python测试代码：query = '''它返回以下错误：和
&qu
浏览 4提问于2017-09-18得票数 4
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我注意到您可以下载整个数据转储的DBpedia数据，但我不确定如何从我的应用程序中获取它。目前，我需要通过像这样的URL远程访问类别信息，但网站速度很慢，有时还会脱机。我使用的是PHP，有没有更好的方法呢？
浏览 0提问于2013-03-15得票数 0
我想知道Virtuoso是否有内置的特性或包可以让我公开一个人们可以输入只读SPARQL查询的简单页面？(有点像这样：)
我知道如果您登录到售票员，有一个页面可以这样做，但我想提供一个不需要登录的公共访问页面
浏览 4提问于2018-04-19得票数 0
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