我正在运行一个Nextflow管道，它在不同的Docker容器中运行每个进程。我在VM中运行此管道。uk.ac.babraham.FastQC.Analysis.AnalysisRunner.run(AnalysisRunner.java:110)
at java.base/java.lang.Thread.run(Thread.java:834) 我在这个过程中使用的docker容器是biocontainers/fastqc:v0.11.8dfsg-2-deb_
浏览 111提问于2020-01-18得票数 1
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我试图在CodeBuild中运行以下命令：我得到以下错误：
错误:无法使用/flyway&#
浏览 6提问于2020-11-06得票数 3
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我正在尝试构建一个安装了nextflow的奇异容器。完成构建后，我将其安装在dir中，并将其作为ROOT安装。当我试图运行容器时，它会失败，因为我不是root用户。我查看了最佳实践，并指出如下：BootStrap: yumMirrorURL: http://mirror.centos.org/centos-%{OSVERSI
浏览 1提问于2019-10-03得票数 1
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SpringBoot 2.0.3上运行8.5.0应用程序时，我会得到以下错误：
此模块的logback-spring.xmlappender-ref ref="ASYNC_SERVER_JSO
浏览 0提问于2018-11-13得票数 0
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我使用Ubuntu20.04，使用docker运行映像。当我第一次安装并运行docker命令时，shell中发生了以下错误。在尝试连接到unix :/ /var/run/docker.sock: Get "http://%2Fvar%2Frun%2Fdocker.sock/v1.24/containers/json“：拨号unix/var/run/docker
浏览 0提问于2022-01-26得票数 3
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尝试连接到unix : /var/run/docker.sock: Get ：拨号unix/var/run/docker.sock: connect:权限被拒绝时获得权限被拒绝
sudo usermod -
浏览 89提问于2020-06-07得票数 0
我正试图在我的macbook中运行Jenkins管道工作。我还在本地运行了docker实例。最初，我在运行Jenkins作业时得到了"docker命令command “错误。/Library/Containers/com.docker.helper/
在尝试连接unix :/ /var/run/docker.sock: get ：拨号unix/var/
浏览 13提问于2017-07-07得票数 6
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我想通过Docker容器运行Nextflow管道。作为管道的一部分，我想推拉从AWS。为了达到这个目的，我需要将AWS凭据传递给容器，但是我不想将它们写入图像中。Nextflow有一个通过envWhitelist选项作为Docker作用域的一部分传递环境变量的选项，但是在这样做时我还没有找到正确语法的示例。我尝试了以下语法，并获得了一个访问拒绝错误，这表明我没有正确地传递变量。docker {
enabled =
浏览 7提问于2022-09-07得票数 1
我一直在尝试使用我在服务器上创建的Docker镜像运行nextflow管道。在本地客户端上，我对nextflow使用了temp标志，它相当于--mount type=volume,src=<src_path>,target=/tmp标志。这在本地客户端上工作得很好。一旦我把它上传到服务器，我就会遇到不同的问题。我一直使用ssh (Window的‘sPowerShell和wsl2)访问服务器。我发
浏览 167提问于2021-04-14得票数 0
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Docker安装在AWS EC2 Ubuntu16.04实例上，如下所示：docker info引发一个权限拒绝错误：
在尝试连接到unix :/ /var/run/docker.sock: Get ：拨号unix/var/run/docker.sock: connect:权限被拒绝时被拒绝的<em
浏览 0提问于2019-03-28得票数 0
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我正在尝试使用shell在jenkins作业中运行docker命令。我在unix : /var/run/docker.sock:获取：拨号unix/var/run/docker.sock:连接:权限被拒绝“我在终端上尝试了下面的代码，-u jenkins docker</e
浏览 1提问于2019-05-21得票数 0
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我正在使用世博会应用程序，我需要弹出此应用程序到ExpoKit，以创建使用的p2p聊天。当我设法使用ExpoKit弹出我的应用程序时(我在我的终端中收到了来自世博会的“弹出是成功的消息”，所以我想这是可以的)。现在，当我想要构建我的项目时，甚至只是尝试一下它是否工作(不更改代码，这在使用expo start --lan弹出之前是工作的)。下面是这个错误的完整堆栈跟
浏览 0提问于2020-04-19得票数 0
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如何删除悬挂的码头形象？我试过了但这表明
在尝试连接到unix :/ /var/run/docker.sock:Get ：拨号unix/var/run/docker.sock: connect:权限被拒绝时被拒绝<e
浏览 1提问于2018-02-28得票数 25
我正在做一个非常短的工作流程，其中我使用了一个工具，我的分析称为鲑鱼。在我正在工作的hpc中，我无法安装这个工具，所以我决定从biocontainers中提取容器。在特殊情况下，我们没有安装docker (我也没有这样做的权限)，但是我们有singularity。所以我必须拉码头容器(from: quay.io/biocontainers/salmon:1.2.1--hf69c8f4_0)使用奇点)。我正在使用<e
浏览 6提问于2022-01-29得票数 1
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我正在使用CentOS 7。我已经从码头枢纽调出了图像把战争从它让我在webapp.war上被</e
浏览 0提问于2018-02-12得票数 3
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当我尝试运行简单的docker命令时，例如：我收到一条错误消息：
$ ls -al /var/run/srw-rw---- root docker docker</
浏览 0提问于2018-02-01得票数 146
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在Compute引擎VM中，当从中提取码头映像时，我收到了一条被拒绝的权限错误消息：
FATA0000 Post ：拨号unix /var/run/docker.sock:权限被拒绝。您是否试图连接到没有TLS的启用TLS的
浏览 2提问于2017-02-14得票数 7
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我想通过运行以下命令来运行我的码头：在试图连接到unix :/ /var/run/docker.sock: Post ：拨号unix/var/run/docker.sock: connect:权限被拒绝时被拒绝了权限我的问题是:在不添加"
浏览 4提问于2021-01-29得票数 0
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docker:在试图连接到unix :/ /var/run/docker.sock: Post "http://%2Fvar%2Frun%2Fdocker.sock/v1.24/containers/create“：拨号unix/var/run/docker.sock:连接:拒绝权限“的Docker守护进程套接字时被
浏览 0提问于2021-12-11得票数 2
/grafana 它们都会导致权限拒绝错误，尽管用户被添加到停靠组，我发现用户‘任何人’，我认为容器应该以这样的方式运行，但除非- user root，否则我仍然被拒绝了权限：....
nob
浏览 5提问于2020-07-26得票数 0
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