首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

【生信技能树培训】R语言中文件的读取

一、csv格式文件的打开用Excel打开用记事本打开,打开后显示逗号分割每一列sublime打开(适用于大文件)**csv的本质是纯文本文件。...**Tips:**关于文件后缀CSV = Comma Separated Values,即逗号分隔符文件TSV = Tab Separated Values, 即制表符分隔文件对于纯文本文件来说,后缀没有意义...二、R语言读取文件的函数read.csv() : 通常读取csv格式,但也可以读取其他纯文本文件read.table() : 通常用于读取txt格式文件三、 将数据框导出为文件(一)导出为表格文件函数...file参数为给生成的文件指定文件名的参数。加载:load()格式: load('example.Rdata')load函数加载文件的时候,不需要赋值。load是将文件中的变量加载到环境中。...图片单独指定fill参数为TRUE时,E列中826行开始的内容会被移动到D列的空行中。见下图。**原因在于,用纯文本查看文件时会发现,在862行之后的第4列与后面的内容之间有两个制表符分隔。

4K30
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    手把手:R语言文本挖掘和词云可视化实践

    eBDA工作室是植根于运营商的一支数据分析团队,是由一群喜欢数据分析和创新的小伙伴组成的,成立两年以来,我们在底层数据存储HDFS/ORCFile,计算框架和资源管理MapReduce/Storm/Spark...互联网时代,大量的新闻信息、网络交互、舆情信息以文本形式存储在数据库中,如何利用数据分析和文本挖掘的算法,将海量文本的价值挖掘出来,成为我们团队近期的一个研究方向,本案例就是我们的一个初步尝试。...飞信群是我们在工作、生活中交流的重要平台,在将近一年的时间里共产生了几万条的聊天记录,展现了我们这个团队的方方面面。...图二 KNIME的流程 R语言的语句: log csv('feixin.csv', sep=",", header=FALSE) #数据导入并保存为log对象 二、发言热度分布 通过热力图...%S") #设置日期格式 hour 日期值中的“小时”数 hour_name <- as.data.frame(cbind(log$V2,hour

    1.5K30

    AI 技术讲座精选:如何利用 Python 读取数据科学中常见几种文件?

    比如,逗号分隔值(CSV)文件格式用纯文本来储存列表数据。 ? 为了识别一个文件的格式,你通常会去看这个文件的扩展名。...下面是一个用 Notepad 打开的 CSV 文件。 ? 在 Python 中从 CSV 文件里读取数据 现在让我们看看如何在 Python 中读取一个 CSV 文件。...从 XLSX 文件读取数据 让我们一起来加载一下来自 XLSX 文件的数据并且定义一下相关工作表的名称。此时,你可以用 Python 中的“pandas”库来加载这些数据。...3.4 纯文本(txt)文件格式 在纯文本文件格式中,所有的内容都是纯文本。通常,这个文本的形式是非结构的,而且也没有与元数据关联。txt 文件格式可以被任何程序读取。...其中,多媒体格式可以把文本储存为 RTF 格式的数据而不是纯文本格式中的 ASCII 数据。 MP3 是最常用的音频编码格式。

    5.1K40

    2021年大数据Spark(三十二):SparkSQL的External DataSource

    text 数据 SparkSession加载文本文件数据,提供两种方法,返回值分别为DataFrame和Dataset,前面【WordCount】中已经使用,下面看一下方法声明: 可以看出textFile...方法底层还是调用text方法,先加载数据封装到DataFrame中,再使用as[String]方法将DataFrame转换为Dataset,实际中推荐使用textFile方法,从Spark 2.0开始提供...无论是text方法还是textFile方法读取文本数据时,一行一行的加载数据,每行数据使用UTF-8编码的字符串,列名称为【value】。 ...()   } } 运行结果: ​​​​​​​csv 数据 在机器学习中,常常使用的数据存储在csv/tsv文件格式中,所以SparkSQL中也支持直接读取格式数据,从2.0版本开始内置数据源。.../保存数据-API     SparkSQL提供一套通用外部数据源接口,方便用户从数据源加载和保存数据,例如从MySQL表中既可以加载读取数据:load/read,又可以保存写入数据:save/write

    2.3K20

    Spark Streaming入门

    Spark Streaming将监视目录并处理在该目录中创建的所有文件。(如前所述,Spark Streaming支持不同的流式数据源;为简单起见,此示例将使用CSV。)...以下是带有一些示例数据的csv文件示例: [1fa39r627y.png] 我们使用Scala案例类来定义与传感器数据csv文件相对应的传感器模式,并使用parseSensor函数将逗号分隔值解析到传感器案例类中...日常统计汇总的模式如下所示: 泵名称和日期的复合行键 列簇统计 最小值,最大值和平均值。...写HBase表的配置 您可以使用Spark 的TableOutputFormat类写入HBase表,这与您从MapReduce写入HBase表的方式类似。...参考文献和更多信息: Apache Spark入门:从入门到生产书籍 Apache Spark流编程指南 学习Spark O'Reilly Book Databricks Spark Streaming

    2.2K90

    Spark综合练习——电影评分数据分析

    文章目录 引言 今天给大家带来一个Spark综合练习案例--电影评分 补充: 采用DSL编程的详尽注释版 总结 引言 大家好,我是ChinaManor,直译过来就是中国码农的意思,俺希望自己能成为国家复兴道路的铺路人...>200的电影平均分Top10,并写入Mysql数据库中 我:所有字我都认识,怎么连在一起我就不认识了 不管了先new个实例对象,总没错吧 val sparkSession = SparkSession.../APP层 依据需求开发程序,计算指标,进行存储到MySQL表 */ // step2、【ODS层】:加载数据,CSV格式数据,文件首行为列名称 val ratingDF: DataFrame...= readCsvFile(spark, RATINGS_CSV_FILE_PATH, verbose = false) val movieDF: DataFrame = readCsvFile(...", "2") .getOrCreate() } /** * 读取CSV格式文本文件数据,封装到DataFrame数据集 */ def readCsvFile(spark: SparkSession

    1.6K10

    一文了解 NebulaGraph 上的 Spark 项目

    TL;DR Nebula Spark Connector 是一个 Spark Lib,它能让 Spark 应用程序能够以 dataframe 的形式从 NebulaGraph 中读取和写入图数据。.../ 代码例子:example NebulaGraph Spark Reader 为了从 NebulaGraph 中读取数据,比如读 vertex,Nebula Spark Connector 将扫描所有带有给定...再看看一些细节 这个例子里,我们实际上是用 Exchange 从 CSV 文件这一其中支持的数据源中读取数据写入 NebulaGraph 集群的。...它是一个 HOCON 格式的文件: 在 .nebula 中描述了 NebulaGraph 集群的相关信息 在 .tags 中描述了如何将必填字段对应到我们的数据源(这里是 CSV 文件)等有关 Vertecies...,表示从集群获取图数据,输出sink是 csv,表示写到本地文件里。

    78230

    浅谈pandas,pyspark 的大数据ETL实践经验

    )、LOAD(加载) 等工作为例介绍大数据数据预处理的实践经验,很多初学的朋友对大数据挖掘,数据分析第一直观的印象,都只是业务模型,以及组成模型背后的各种算法原理。...脏数据的清洗 比如在使用Oracle等数据库导出csv file时,字段间的分隔符为英文逗号,字段用英文双引号引起来,我们通常使用大数据工具将这些数据加载成表格的形式,pandas ,spark中都叫做...pandas 加载的 result pyspark sdf = spark.read.option("header","true") \ .option("charset","gbk") \...x utf-8 * 在Linux中专门提供了一种工具convmv进行文件名编码的转换,可以将文件名从GBK转换成UTF-8编码,或者从UTF-8转换到GBK。...比如,有时候我们使用数据进行用户年龄的计算,有的给出的是出生日期,有的给出的年龄计算单位是周、天,我们为了模型计算方便需要统一进行数据的单位统一,以下给出一个统一根据出生日期计算年龄的函数样例。

    5.5K30

    数据科学的原理与技巧 四、数据清理

    这是特别有用的,因为我们现在知道这些文件足够小,可以加载到内存中。 作为一个经验法则,将文件加载到内存中,内存大约占计算机总内存容量的四分之一,通常是安全的。...我们可以查看数据集网站: 列 描述 类型 CASENO 案件编号 数字 OFFENSE 案件类型 纯文本 EVENTDT 事件的发生日期 日期时间 EVENTTM 事件的发生时间 纯文本 CVLEGEND...事件描述 纯文本 CVDOW 时间的发生星期 数字 InDbDate 数据集的上传日期 日期时间 Block_Location 事件的街区级别的地址 地点 BLKADDR 纯文本 City 纯文本...: 列 描述 类型 Incident 数字 计算机辅助调度(CAD)程序创建的事件数量 纯文本 Call Date/Time 事件/截停的日期和时间 日期时间 Location 事件/截停的一般位置 纯文本...数字 请注意,网站不包含截停表的前 8 列的说明。 由于这些列似乎包含我们在此次分析中不感兴趣的元数据,因此我们从表中删除它们。

    93320

    开源SPL助力JAVA处理公共数据文件(txtcsvjsonxmlxsl)

    这种类库解决了从外部文件到内部对象的问题,比硬编码取数好写,常见的有解析 txt\csv 的 OpenCSV,解析 json 的 SJ.json\Gson\JsonPath,解析 xml 的XOM\Xerces-J...SPL 是基于 JVM 的开源程序语言,提供了简易的解析方法以读取各类规则或不规则的 txt\csv\json\xml\xls;专业的数据对象能统一地表达二维结构数据和多层结构数据;丰富的计算函数可满足业务中的计算需求...txt\csv SPL 内置多种解析函数,可以用简单代码解析各类文本,并提供了丰富的计算函数,可以统一计算解析后的文本。 格式规则的文本。...二维结构的文本类似数据库表,首行是列名,其他行每行一条记录,列之间用固定符号分隔。其中,以逗号为分隔符的 csv 和以 tab 为分隔符的 txt 格式最为常见。...SPL 的 T 函数用一行代码就可以解析: s=T("D:\\data\\Orders.csv") 格式不规则的文本,可以使用选项丰富的 import 函数。

    1.1K20

    开源SPL助力JAVA处理公共数据文件(txtcsvjsonxmlxsl)

    这种类库解决了从外部文件到内部对象的问题,比硬编码取数好写,常见的有解析 txt\csv 的 OpenCSV,解析 json 的 SJ.json\Gson\JsonPath,解析 xml 的XOM\Xerces-J...SPL 是基于 JVM 的开源程序语言,提供了简易的解析方法以读取各类规则或不规则的 txt\csv\json\xml\xls;专业的数据对象能统一地表达二维结构数据和多层结构数据;丰富的计算函数可满足业务中的计算需求...txt\csv SPL 内置多种解析函数,可以用简单代码解析各类文本,并提供了丰富的计算函数,可以统一计算解析后的文本。 格式规则的文本。...二维结构的文本类似数据库表,首行是列名,其他行每行一条记录,列之间用固定符号分隔。其中,以逗号为分隔符的 csv 和以 tab 为分隔符的 txt 格式最为常见。...SPL 的 T 函数用一行代码就可以解析: s=T("D:\\data\\Orders.csv") 格式不规则的文本,可以使用选项丰富的 import 函数。

    1.2K20

    【Spark手机流量日志处理】使用SparkSQL按月统计流量使用量最多的用户

    作者 :“大数据小禅” 文章简介:本篇文章属于Spark系列文章,专栏将会记录从spark基础到进阶的内容 内容涉及到Spark的入门集群搭建,核心组件,RDD,算子的使用,底层原理,SparkCore...SparkSQL快速入门案例 准备数据 我们假设有一个CSV文件employee.csv,包含了员工的信息,如下所示: id,name,age,gender,salary 1,Jack,25,M,5000....appName("Spark SQL Demo") .getOrCreate() //加载CSV文件 //使用SparkSession对象的read方法加载CSV文件: val df = spark.read..."true") .csv("employee.csv") df.createOrReplaceTempView("employee") val result = spark.sql("SELECT...(arr(1) == null) }).map(tmp => { //处理日期 获取月份 val month: String = tmp(0).split("-")(1)

    63730

    MySQL数据库常见面试题,不得不看!!!

    从表”Tecmint”中列出除了”SAM”以外的所有user记录 答:使用下面的语句 mysql> SELECT * FROM Tecmint WHERE user !...MySQL中如何得到当前日期? 答:在MySQL中获取当前日期就是如下的SELECT语句这么简单。...当你需要查看一个名为’mysql’的数据库中’user’表中的所有索引时,你会如何做?...CSV表以纯文本和表格形式来存储数据。 每一条记录都使用特定的分隔符隔开(如逗号,分号,…),并且每条记录都有着顺序相同的列。...CSV表最广泛地被用来存储用于导入和导出的电话联系人,并能够用来存储任何类型的纯文本数据。 各位老铁们,大家喜欢什么类型的文章可以多多留言,小编会尽量搜集,谢谢!!! END

    82420
    领券