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带有疾病进展的多分组差异结果如何展示?

modulates synovial T cell activation and plasmablast/plasma cell differentiation pathways》,是2017发表的,...使用了他们团队自己2016发表的转录组测序数据,所以其实是有两个转录组测序数据集。...复现的图: 这个图主要展示了 A:治疗后 与 治疗前的差异火山图,B:治疗前 与正常对照 差异基因在三组样本中的表达热图,以及 C&D:一些 marker 基因在三个组别中的箱线图+抖动散点+显著性比较...(两个数据集都是同一个科研团队的,所以理论上可以先不考虑里面的批次效应哈) 如果实在不放心,可以选择下载fq数据放在一起定量,拿到表达矩阵走后面的分析。...limma 算法,我们也尽量复现同样的哈,其中,疾病和对照肯定是差异巨大,但是治疗前后就很难说了因为从文献里面的pca来看本来就是分组内的差异并没有显著的小于组间差异!

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原 在PostgreSQL中秒级完成大表添加带有not null属性并带有default值的实验

近期同事在讨论如何在PostgreSQL中一张大表,添加一个带有not null属性的,且具有缺省值的字段,并且要求在秒级完成。...建表,并查询表信息,插入数据: postgres=# create table add_c_d_in_ms(id int, a1 text, a2 text, a3 text, a4 text, a5...default 'test'; ALTER TABLE Time: 36803.610 ms (00:36.804) 明显看到时间花费相当长,其实PostgreSQL在这里将数据完全重写了,主要原因就是就是添加的字段带有...,如何快速添加这么一个字段: 首先,在这里我们涉及三张系统表,pg_class(表属性)、pg_attribute(列属性)、pg_attrdef(缺省值信息),接下来依次看一下三张表的信息: #pg_class...:oid表系统序列号,relname表名,relnatts列个数(主要修改属性) postgres=# select oid,relname,relnatts from pg_class where relname

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    Python中的groupby分组

    写在前面:之前我对于groupby一直都小看了,而且感觉理解得不彻底,虽然在另外一篇文章中也提到groupby的用法,但是这篇文章想着重地分析一下,并能从自己的角度分析一下groupby这个好东西~...OUTLINE 根据表本身的某一列或多列内容进行分组聚合 通过字典或者Series进行分组 根据表本身的某一列或多列内容进行分组聚合 这个是groupby的最常见操作,根据某一列的内容分为不同的维度进行拆解...one) (('b', 'two'), data1 data2 key1 key2 3 -1.125619 -0.836119 b two) 通过字典或者Series进行分组...Series传入 data2 = people.groupby(mapping2,axis=1).mean() 无论solution1还是2,本质上,都是找index(Series)或者key(字典)与数据表本身的行或者列之间的对应关系...,在groupby之后所使用的聚合函数都是对每个group的操作,聚合函数操作完之后,再将其合并到一个DataFrame中,每一个group最后都变成了一列(或者一行)。

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    SQL中的分组集

    分组集的定义 是多个分组的并集,用于在一个查询中,按照不同的分组列对集合进行聚合运算,等价于对单个分组使用"UNION ALL",计算多个结果集的并集。...分组集种类 SQL Server的分组集共有三种 GROUPING SETS, CUBE, 以及ROLLUP, 其中 CUBE和ROLLUP可以当做是GROUPING SETS的简写版 GROUPING...并且更加的 高效,解析存储一条SQL于语句 GROUP SETS示例 我们以Customers表为例,其内容如下: 我们先分别对城市和省份进行分组,统计出他们的数量 SELECT 城市,NULL 省份,...这样不仅减少了代码,而且这样的效率会比UNION ALL的效率高。通常GROUPING SETS使用在组合分析中。...,其作用是对每个列先进行一次分组,并且对第一列的数据在每个组内还进行一次汇总,最后对所有的数据再进行一次汇总,所以相比GROUPING SETS会多了个所以数据的汇总。

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    从Mysql备份中恢复单个表

    因为云平台的备份是把库中所有的表都打包成一个 .sql文件,然而这一个.sql文件大约有20G,现阶段的方法是把.sql文件source到数据库数据处理机器上,然后再根据需求提出需要的表。...思路(原谅我也理解了好一会儿): 主要使用sed命令来实现,加上-n,-e参数把打印的结果追加到一个文件中,就得到了想要的表的内容。...在一般 sed 的用法中,所有来自 STDIN的资料一般都会被列出到萤幕上。但如果加上 -n 参数后,则只有经过sed 特殊处理的那一行(或者动作)才会被列出来。...我们使用如下sed命令从原始sql中导出wp_comments表: 意思是:打印DROP TABLE....此时,lianst.wp_comments.sql 就是我们从原始备份sql(lianst.sql)中导出的wp_comments表的sql语句。接下来我们就可以针对这一个表来进行恢复了。

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    HBase学习—高表与宽表的选择

    utm_content=m_31236 hbase中的宽表是指很多列较少行,即列多行少的表,一行中的数据量较大,行数少;高表是指很多行较少列,即行多列少,一行中的数据量较少,行数大。...据此,在HBase中使用宽表、高表的优劣总结如下: 查询性能:高表更好,因为查询条件都在row key中, 是全局分布式索引的一部分。高表一行中的数据较少。...数据压缩比:如果我们对一行内的数据进行压缩,宽表能获得更高的压缩比。因为宽表中,一行的数据量较大,往往存在更多相似的二进制字节,有利于提高压缩比。...根据查询模式,需要分布式索引、分片、**有很高选择度**(即能据此查询条件迅速锁定很小范围的一些行)的查询用字段,应该放入row key;能够均匀地划分数据字节数的字段,也应该放入row key,作为分片的依据...选择度较低,并且不需要作为分片依据的查询用字段,放入column family和column qualifier,不放入row key。

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    分组后合并分组列中的字符串如何操作?

    一、前言 前几天在Python最强王者交流群【IF】问了一个Pandas的问题,如图所示。...下面是他的原始数据: 序号 需求 处理人 1 优化 A 2 优化 B 3 运维 A 4 运维 C 5 需求 B 6 优化 C 7 运维 B 8 运维 C 9 需求 C 10 运维 C 11 需求 B...如果不去重,就不用unique,完美地解决粉丝的问题! 后来他自己参考月神的文章,拯救pandas计划(17)——对各分类的含重复记录的字符串列的去重拼接,也写出来了,如图所示。...这篇文章主要盘点了一个pandas的基础问题,文中针对该问题给出了具体的解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【IF】提问,感谢【月神】、【瑜亮老师】给出的思路和代码解析,感谢【dcpeng】等人参与学习交流。

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    Oracle中的分组查询与DML

    1、Group by 进行分组查询, group by 子句可以将数据分为若干个组 1.1 分组查询 注意: 出现在 SELECT 子句中的字段,如果不是包含在多行函数中,那么该字段必须同时在...1.2 带 where 的分组查询 注意: group by 子句要写到 where 子句的后面 a) 查询每个部门的人数和平均工资, 排除 10 部门 select deptno, count(...子句中不允许使用分组函数, 分组函数用于分组前过滤 having 用于过滤分组后的条件 a) 查询每个部门的总工资和平均工资, 排除平均工资低于 1600 的部门 select deptno...分组查询时相关关键词的顺序: from–>where–>group by–>select–>having–>order by a) 在 emp 表中,列出工资最小值小于 2000 的职位 select...(数据库操作语言) 2.1 复制一个测试表格 a) 复制 emp 表格, 命名为 tmp create table temp as (select * from emp); b) 赋值 emp 表格的表结构

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    如何在 Linux 中创建带有特殊字符的文件?

    在 Linux 系统中,创建文件是进行各种操作的基础。有时候,我们需要创建带有特殊字符的文件,例如包含空格、特殊符号或非ASCII字符的文件。...本文将详细介绍在 Linux 中如何创建带有特殊字符的文件,以便您能够轻松地完成这样的任务。...图片准备工作在开始创建带有特殊字符的文件之前,请确保您已具备以下条件:一台安装有 Linux 操作系统的计算机。以 root 或具有适当权限的用户身份登录。...步骤二:使用引号创建文件另一种创建带有特殊字符的文件的方法是使用引号。在 Linux 中,可以使用单引号(')或双引号(")将带有特殊字符的文件名括起来。...结论通过本文的指导,您已学会在 Linux 中创建带有特殊字符的文件。

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    如何在 Linux 中创建带有特殊字符的文件?

    在 Linux 系统中,创建文件是进行各种操作的基础。有时候,我们需要创建带有特殊字符的文件,例如包含空格、特殊符号或非ASCII字符的文件。...本文将详细介绍在 Linux 中如何创建带有特殊字符的文件,以便您能够轻松地完成这样的任务。...图片准备工作在开始创建带有特殊字符的文件之前,请确保您已具备以下条件:一台安装有 Linux 操作系统的计算机。以 root 或具有适当权限的用户身份登录。...步骤二:使用引号创建文件另一种创建带有特殊字符的文件的方法是使用引号。在 Linux 中,可以使用单引号(')或双引号(")将带有特殊字符的文件名括起来。...结论通过本文的指导,您已学会在 Linux 中创建带有特殊字符的文件。

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    VR中对带有约束的物理对象的交互

    在VR游戏中, 使用双手(控制器)直接对虚拟世界中的对象进行交互, 已经成为一种”标准化”的设计, 一切看起来能够用手去交互的物体, 都需要附合物理规则....稍微复杂一点儿的物理对象, 是带有约束(Constraint)关系的, 比如门, 抽屉, 转盘, 滑杆, 绳索等等....这里以最常见的滑动和转轴约束进行一下分析, 它们都是把位移或者旋转限制在一个轴上, 计算起来比较简单. 对带有约束的物理对象进行交互, 难点在于如何使物理对象仍然严格按约束关系来运动....出于手感的考虑, 肯定是手的抓握点保持跟手同步运动的效果最为理想, 所以只能选择第一种设置位置的方法. 但是对于带有约束关系的物理对象, 这个是比较难保证的....通过设置位置的方式, 对于间接接触的物理对象是没有连续性的作用的. 比如一个转盘, 上面放了一个球. 我们通过设置角度的方式让转盘转起来, 上面的球并不会平滑地滚动起来.

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    第10期:选择合适的表空间

    表空间的选择,可以说是对表的日常管理以及访问性能有非常紧密的联系。 表空间是用来管理 MySQL 关系表的一种形式,有自己的磁盘文件。...系统表空间在无限制增大导致磁盘满需要扩容时,无法快速的把表从系统表空间里分离出来,必须得经过停服务;改配置;扩容;重新导入数据;启服务等步骤方才可行。 原因 3:多张表的数据写入顺序写。...有两种方式: 方式 1:在配置文件中开启。 在配置文件中开启单表空间设置参数 innodb_filer_per_table,这样默认对当前库下所有表开启单表空间。...比如:当多张表被大量的增删改后,表空间会有一定的膨胀;相比系统表空间,打开表需要的文件描述符增多,浪费更多的内存。...三、通用表空间 通用表空间先是出现在 MySQL Cluster 里,也就是 NDB 引擎。从 MySQL 5.7 引入到 InnoDB 引擎。通用表空间和系统表空间一样,也是共享表空间。

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    常用的ClickHouse表引擎及其选择场景

    图片ClickHouse是一个面向列存储的分布式数据库管理系统,支持多种表引擎。不同的表引擎适用于不同的数据访问模式和性能需求。以下是几种常用的ClickHouse表引擎及其选择场景的示例:1....ReplicatedMergeTree引擎:在MergeTree引擎的基础上添加了数据复制和分布式查询的功能。适用于需要高可用性和数据冗余的场景。...其中,date是按照时间进行排序的列,(order_id, user_id)是主键列,8192是数据块的大小。这种配置适用于具有大量写入操作和复杂查询需求的场景。...Distributed引擎可以将查询分发到多个ClickHouse集群中的节点上执行,并且可以将结果合并返回给客户端。这种引擎常用于构建跨地域的数据分析系统或数据仓库。...总结选择合适的ClickHouse表引擎取决于数据的特性,例如数据的排序方式、访问模式、写入要求、查询复杂度和数据冗余需求等。根据具体的场景和需求,开发人员可以选择适合的引擎来优化系统的性能和可用性。

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