编译：丁一 黄念 丁雪 校对：席雄芬 姚佳灵 程序验证：郭姝妤 序言 在Python中调用R或在R中调用Python，为什么是“和”而不是“或”？ 在互联网中，关于“R Python”的文章，排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点，而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的：这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。然而，随着数据科学家的增加，这种区别开始变得模糊
在Python中调用R或在R中调用Python，为什么是“和”而不是“或”？ 在互联网中，关于“R Python”的文章，排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点，而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的：这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。然而，随着数据科学家的增加，这种区别开始变得模糊起来： 数据科学家就是这样一种人：软件工程师中最懂统计学，统计学家中最会编程的人。
一个图形化的交互式运行环境，对于编程语言的学习和开发，特别是可视化方面，提供了极大的便利。比如在window上使用R语言进行绘图，在R语言自带的交互环境中，可以实时观测到代码的可视化效果，从而方便的进行参数调整。
然后就能看到各个环节加载时间，以ms毫秒为单位，即小数点前面是毫秒数。 其中第一列是时间点，第二列是时长，我们主要关注第二列。 一般标准： ”200ms 以下感觉是很好的，超过 500ms 会觉的有点卡，如果超过 1s 就会觉得非常难受了“
本来想着R语言虽然重要，但是肯花心思学习的人可能还是少数，大家可要持之以恒哟。今天，我们就开始进入到《R语言从入门到精通》的第二节：R和RStudio的使用。
使用tf.keras，您可以设计，拟合，评估和使用深度学习模型，从而仅用几行代码即可做出预测。它使普通的深度学习任务（如分类和回归预测建模）可供希望完成任务的普通开发人员使用。
在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png(“aa.png”)可以生成图片。
这个代码以 ipynb后缀名的文件存储，我打开这个文件的方式是使用 Jupyter lab，安装好anaconda3以后jupyter lab默认就可以使用了。
本来想着R语言虽然重要，但是肯花心思学习的人可能还是少数，但是这两天大家高涨的学习热情着实让人惊讶，很多同学后台催着要我们赶紧更新。看来咱们科研猫真是猫系慵懒
在前面两篇文章R语言入门系列之一与R语言入门系列之二中，我分别介绍了R语言中的对象与结构、数据的输入输出及可视化。基于前面的基础，今天我介绍一下R语言中基础的程序结构，来帮助我们完成更复杂的数据处理任务。此外，如果你有大批量数据处理、可视化任务，需要着重学习R脚本在命令行的调用方式以及命令行参数的使用方法。
而在个人电脑，通常是Mac或者Windows，都是直接使用界面版本的rstudio更方便的交互式使用R语言。交互式的好处是所见即所得，每个代码随时响应随时看到效果，尤其适合各种各样的统计可视化需求。
入门生信，第一件事情除了之前部分人可能都有所接触的R语言外，就是Linux系统了。为什么要用Linux系统呢？我们很多人都会有这个疑问，windows系统不够用么？事实是真的不太够用。
上一篇文章，我们介绍了 Go 语言的一些特性以及环境的安装。具体可以参见：https://juejin.cn/user/3491704659786455
这本书是关于如何利用命令行做数据科学的。我的目标是通过教你使用命令行的力量，让自己成为一名更高效和多产的数据科学家。
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。简单来说，R是一门统计计算语言，是一套开源的数据分析解决方案。
构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一，对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一。
Spring Boot CLI 是运行 SpringBoot 命令的命令行工具，能够帮助你快速的构建 Spring Boot 项目。只需要编写简单的 groovy 脚本，即可用最少的代码构建并运行一个完整的 Spring Boot 项目。
LibreOffice 拥有所有你想要的办公软件套件的生产力功能，使其成为微软 Office 或谷歌套件的流行的开源替代品。LibreOffice 的能力之一是可以从命令行操作。例如，Seth Kenlon 最近解释了如何使用 LibreOffice 用全局 命令行选项将多个文件 从 DOCX 转换为 EPUB。他的文章启发我分享一些其他 LibreOffice 命令行技巧和窍门。
中 , 将结构体 ( 数组 ) 数据写入到了文件中 , 然后又从文件中读取 结构体 ( 数组 ) 并打印出来 ;
在整本书中，我将向您介绍许多基本上适合一行的命令和管道。这些被称为一行程序或管道。能够只用一行程序执行复杂的任务是命令行的强大之处。这是一种与编写和使用传统程序截然不同的体验。
下载地址为：https://cran.r-project.org 进入链接，如下图所示，在页面顶部提供了三个下载链接，分别对应三种操作系统：Windows、Mac和Linux。请选择自己操作系统对应的链接。
从打开网址开始教你一步一步的下载TCGA的数据，图文并茂，真的是详细的不能再详细了！
写在前面： 在如何通过Google来使用ggplot2可视化这篇文章中，我们曾经介绍过R语言在生物信息学中的重要性。 这篇文章也激发了很多小伙伴学习的热情。学习R语言必然会安装各种各样的包，很多人在这一步就遇到了困难， 刚开始学习R语言的时候我们经常会遇到各种包安装错误，比如 package ‘airway’ is not available(for R version 3.1.0)等等， 这篇文章我们就来系统性地整理一些新手可能遇到的问题以及解决方案。 当然，你不一定现在就会遇到，但是如果你遇到了，请记住
PHP作为一门web开发语言，通常情况下我们都是在Web Server中运行PHP，使用浏览器访问，因此很少关注其命令行操作以及相关参数的使用，但是，特别是在类Unix操作系统上，PHP可以作为一门脚本语言执行与shell类似的处理任务。
R语言绘图中的中文默认字体宋体，希望用其他字体绘图，保存成PDF格式不能识别中文。
在这里，我们介绍一个开源的Python项目，它主要结合matplotlib的绘图实用程序和xarray包的数据管理，并将它们集成到一个可以通过命令行和GUI使用的软件中。
Burp Suite是一个集成化的渗透测试工具，它集合了多种渗透测试组件，使我们自动化地或手工地能更好的完成对web应用的渗透测试和攻击。在渗透测试中，我们使用Burp Suite将使得测试工作变得更加容易和方便，即使在不需要娴熟的技巧的情况下，只有我们熟悉Burp Suite的使用，也使得渗透测试工作变得轻松和高效。
Selenium IDE 通常是从 Chrome 或 Firefox 的 Web 应用商店进行安装的，安装后通过在浏览器的菜单栏中单击其图标来启动它，并进行脚本的录制与编写，之后回放执行该脚本。
命令行参数是根据命令行选项将不同的值传递给测试函数，比如平常在cmd执行”pytest —html=report.html”,这里面的”—html=report.html“就是从命令行传入的参数 对应的参数名称是html，参数值是report.html
1.1 安装sdk和运行时 浏览器打开网址https://www.microsoft.com/net/download， 到.Net Core下载页面。 根据操作系统，下载对应的SDK进行安装。安装之后可以从命令行运行dotnet命令，查看是否安装成功。 1.2 使用VS2015 首先确保你的电脑上安装Visual Studio 2015 Update3，当然我们也可以安装 Visual Studio Community 2015（https://www.visuals
R是一种编程语言，也是一款软件和一个环境，可在linux、win、mac系统上安装运行。
写在前面： 谨以此文献给那些“奋斗”在转发送别人资源，为了博人眼球，而践踏别人的辛勤的劳动成果的公众号们。 当然了，R包本来就是免费的，你只是不会下载而已，所以重新发下这篇优秀的文章，教大家如何解决R包安装问题。如果你使用了别人的R包，一定要在写文章的时候引用，尊重别人的劳动。 刚开始学习R语言的时候我们经常会遇到各种包安装错误，比如 package ‘airway’ is not available(for R version 3.1.0)等等， 这篇文章我们就来系统性地整理一些新手可能遇到的问题以及解决
点击next到选择组件界面（这里1是在桌面创建图标，2是决定在所有控制台窗口中使用TrueType字体和是否每天检查Git是否有Windows更新的）根据需要选择，这里我没有选择第二个。
Shiny是RStudio公司开发的新包，有了它，可以用R语言轻松开发交互式web应用。
在这篇文章中，笔者猫头虎将带领大家探讨一种不依赖外部服务器，仅通过命令行即可启动 WAR 文件的方案。通过深入研究和实践，我们将了解到 Spring Boot 的强大功能，它不仅支持创建可执行的 JAR 和 WAR 文件，而且内含内嵌的服务器，如 Tomcat、Jetty 和 Undertow，极大地简化了 Java Web 应用程序的部署和运行过程。本文将从理论到实践，全面、详尽地展示如何利用 Spring Boot 和命令行工具在后台运行 WAR 文件，同时捕获并输出启动日志。通过本文，你将掌握一种快速、简便的 Java Web 应用程序部署方法。
Linux 提供了一系列网络和系统设置。在你的桌面计算机上，Linux 允许您调整系统上的任何内容。大多数这些设置都出现在 /etc 目录下的纯文本文件中。这里我将介绍你使用桌面 Linux 操作系统的过程中最常用的设置。
本文作者是 Omry Yadan，他是 Facebook 人工智能软件工程师，创建了 Hydra。
Julia是于2012年发布的一种函数式编程语言。它的创建者希望将Python的可读性和简单性与以C语言为代表的静态编译语言的速度相结合。
虽然有点难度，但其实确实是可以的，对生信工程师来说，就是整理流程（把Linux命令替换成为R语言代码）工作量比较大。如果大家感兴趣而且确实有需求，不妨看看这个文档：《RNASeqR : RNA-Seq analysis based on one independent variable》
存在问题： 好多小伙伴都想搞linux开发，我们常用的一些配置就需要去网上搜索查找，所以我们将一些服务配置分享给大家，需要的深入了解或者备用。 解决方案： 安装NFS服务 首先安装nfs服务包： apt-get install nfs-kernel-server 修改nsf配置文件： vi /etc/exports 在文件中添加nfs的目录格式如下 /home/xxx *(rw,sync,no_subtree_check,no_root_squash) 例：/home/ygq *(rw
有幸与生信技能树创始人曾老师在4月20日学术会议上相识，跟曾老师说了目前自身生信的困境，曾老师便向我引入技能树的马拉松课程，但由于前面一直没抽出时间，没来得及开始，曾老师还在4月20日关心我的进度，并说学术对于研究生是重要的，但我目前开展的实验都是硕士期间都学会的，对自身提高并不大，反而学习新的技能对我应该更重要，所以我今天开始争取每天抽取时间学习并写下自己的学习感悟（PS:督促自己学习并加强学习记忆）。
在本篇文章中，我来讲一讲如何利用WebHost来加载配置文件和设置启动的Url 在前面的文章中讲过，ASP.Net Core应用程序会自动加载appsettings.json中的配置文件，那么如果配置
经过之前的系列文章，我们已经知道了netty的运行原理，还介绍了基本的netty服务搭建流程和消息处理器的写法。今天本文会给大家介绍一个更加复杂的例子，文本聊天室。
注意 defer 的使用：当打开dst文件时发生了错误，那么 defer 仍然能够确保 src.Close() 执行。如果不这么做，src文件会一直保持打开状态并占用资源。
PMD是一个静态源代码分析器。它找到常见的编程缺陷，如未使用的变量，空的catch块，不必要的对象创建等等。它主要关注Java和Apex，但支持其他六种语言。 PMD具有许多内置检查（在PMD术语，规则中），这些检查在规则参考中针对每种语言进行了记录。我们还支持广泛的API来编写您自己的规则，您可以使用Java或作为自包含的XPath查询来执行。 在集成到构建过程中时，PMD最有用。然后，它可以用作质量门，以强制执行代码库的编码标准。除其他外，PMD可以运行：
比如李东风的这本：23 用bookdown制作图书 | R语言教程 (pku.edu.cn)[3]
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关于为Ubuntu 14.04服务器版添加xfce桌面。如题，写这篇文章仅作为备忘而用，如果能顺便帮助到你，我将非常开心！
使用 PHP 开发的同学多少都会接触过 CLI 命令行。经常会有一些定时任务或者一些脚本直接使用命令行处理会更加的方便，有些时候我们会需要像网页的 GET 、 POST 一样为这些命令行脚本提供参数。比如在针对某些日期做统计的脚本，就需要传递一个日期给它，这样我们就统计指定日期的一些数据。这类需求应该非常常见，那么，我们都是如何来接收这些命令行的参数的呢？今天，就来介绍一下这方面的内容。
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