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跟着Nature学作图:R语言ggplot2散点图并给指定的点添加颜色

,争取把有原始数据的图都用R语言来复现一下 41586_2023_5710_MOESM4_ESM (1).xlsx 今天的推文复现一下论文中的Fig1a image.png 部分示例数据 image.png...最基本的散点图 library(tidyverse) fig1a<-read_delim("data/20230521/Figure1a.txt", delim = " ")...shape=21, fill="#f1f1f1", color="black")+ theme_bw() image.png 给指定的点映射颜色...这里我的处理方式是把想要映射颜色的点单独挑出来,然后再叠加一层 geneSelected<-c("ZBP1","IFNB1","CGAS","IFNAR1","STING","IFNAR2") match...,内容可能会存在错误,请大家批判着看,欢迎大家指出其中的错误 示例数据和代码可以给推文点赞,然后点击在看,最后留言获取 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享

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    2024-04-21:用go语言,给一棵根为1的树,每次询问子树颜色种类数。 假设节点总数为n,颜色总数为m, 每个节点的颜色,

    2024-04-21:用go语言,给一棵根为1的树,每次询问子树颜色种类数。...假设节点总数为n,颜色总数为m, 每个节点的颜色,依次给出,整棵树以1节点做头, 有k次查询,询问某个节点为头的子树,一共有多少种颜色。 1 的输入数组,按给定格式依次读取节点数n,建立树的连接关系,记录每个节点的颜色。...• 第二次DFS(dfs2):处理每个节点的子树,包括处理重节点和非重节点的不同子树,更新颜色计数和子树的颜色种类数。...4.颜色计数:通过add函数和delete函数实现颜色的增加与减少操作,维护当前节点子树中颜色种类的计数。 5.输出查询结果:对于每次查询,按照给定节点进行处理,并输出计算得到的颜色种类数。

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    论plt.scatter()画散点图未设置“颜色参数c”却能画出五颜六色点的原因

    () 方法产生多个点 ---- 1 问题描述 今天重点学习了 matplotlib 库的理论与用法,在进行到使用 matplotlib 库中 plt.scatter() 方法画散点图的内容学习时,遇到了一个问题...:绘制散点时未设置“颜色参数c”却能画出五颜六色的点,找同学解决无果后在老师的指点下解决了该问题,现将问题产生原因分享给大家,希望给需要的人予以帮助!...画散点图关键语句中并未对颜色参数c进行设置: plt.scatter(x, y, s, alpha=z) # 关键语句 却能画出五颜六色的点: 2 原因剖析 我在此处用的是一个循环语句随机绘制出位置...matplotlib 的 plt.scatter() 方法在每次生成点时,为了让使用者容易区别这些点是不同次使用 plt.scatter() 方法产生的点,系统会自动为每一个点随机匹配一种颜色。...(X[2], Y[0], s=111) 可以看到,未设置“颜色参数c”,调用三次 plt.scatter() 方法生成的三个点是不同的三种颜色。

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    使用Pandas返回每个个体记录中属性为1的列标签集合

    一、前言 前几天在J哥的Python群【Z】问了一个Pandas数据处理的问题,一起来看看吧。 各位群友,打扰了。能否咨询个pandas的处理问题?...左边一列id代表个体/记录,右边是这些个体/记录属性的布尔值。我想做个处理,返回每个个体/记录中属性为1的列标签集合。...例如:AUS就是[DEV_f1,URB_f0,LIT_f1,IND_f1,STB_f0],不知您有什么好的办法? 并且附上了数据文件,下图是他的数据内容。...二、实现过程 这里【Jin】大佬给了一个答案,使用迭代的方法进行,如下图所示: 如此顺利地解决了粉丝的问题。...后来他粉丝自己的朋友也提供了一个更好的方法,如下所示: 方法还是很多的,不过还得是apply最为Pythonic! 三、总结 大家好,我是皮皮。

    1.6K30

    Python:matplotlib绘制散

    与线型图类似的是,散点图也是一个个点集构成的。但不同之处在于,散点图的各点之间不会按照前后关系以线条连接起来。 用plt.plot画散点图 ? ?...奇怪,代码和前面的例子差不多,为什么这里显示的却是散点图而不是sin曲线呢?原因有二:一是点集比较少,稀疏,才30个;二是没有指定线型。...用plt.scatter画散点图 scatter专门用于绘制散点图,使用方式和plot方法类似,区别在于前者具有更高的灵活性,可以单独控制每个散点与数据匹配,并让每个散点具有不同的属性。...主要参数说明: x,y:输入数据 s:标记大小,以像素为单位 c:颜色 marker:标记 alpha:透明度 linewidths:线宽 edgecolors :边界颜色 上面的例子可以拓展到Scikit-learn...这个散点图让我们看到了不同维度的数据:每个点的坐标值x和y分别表示花萼的长度和宽度,点的大小表示花瓣的宽度,三种颜色对应三种不同类型的鸢尾花。这类多颜色多特征的散点图在探索和演示数据时非常有用。

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    Pandas知识点-绘制统计图

    绘制散点图时,通过x参数和y参数指定散点图的x轴数据和y轴数据。x和y都是DataFrame中的列标签,绘图时会根据列标签读取对应列的数据。 s: 使用s参数设置散点图中点的大小。...c: c参数用于设置散点图的颜色,可以指定一个颜色,也可以设置成一个数组或浮点数,如例子中使用numpy生成一个随机的数组,颜色随机从cmap中获取。...cmap: cmap参数用于设置点的颜色热力图,默认为image.cmap,可以设置成自己需要的颜色类型,参考matplotlib中的colors模块。...s参数也可以设置成一个数组,如例子中也是用numpy生成一个随机的数组,使每个点的大小不一样。...color: color参数用于设置柱状图的颜色,前面折线图和散点图是用c参数,有一点差异。当柱状图中有多组数据时,最好传入一个数组,使不同组的柱状图颜色不一样,方便区分。

    4.4K20

    Matplotlib数据关系型图表(1)

    s:数据点的大小,可以传入一个整数,表示为所有点设置一样的大小;也可以传入形状为(n, 1)的数组,为每一个点指定大小。(可选参数) c:数据点颜色,可以是颜色简写、十六进制等。...也可以传入形状为(n, 1)的数组,为每个点指定颜色。(可选参数) marker:数据标记点样式。(可选参数) marker 描述 '.'...当且仅当c为浮点数数组才可使用。(可选参数) norm:如果c为浮点数数组,norm将调整c的范围至0-1用于在cmap中映射。...(可选参数) 1.1 带有颜色映射的散点图 示例1:现在有一个文件,记录了2015年全国所有站点的PM2.5值,要求将1001A站点的全年PM2.5值用散点图表示,横坐标为时间,纵坐标为PM2.5浓度...(cf, ax = ax2) #因为每个点都有颜色,该语句是形成色条,这个语法以后会讲,不用管 #为每个点设置颜色,并指定色条 为'jet'样式,其余色条参照以前写的文章 ax3 = fig.add_subplot

    1.3K10

    高级可视化神器Plotly玩转散点图

    本文开始将会详细介绍基于Plotly绘制的各种图形,Plotly绘图主要是两个模块: plotly_express,简写为px plotly.graph_objects,简写为go 本文介绍的是如何绘制散点图和折线图..."sepal_length" # y轴 ) fig.show() [008eGmZEgy1gpagx7ebltj31ic0qi40o.jpg] 同时我们可以传入改变散点颜色和大小的参数...# 指定散点大小 ) fig.show() [008eGmZEgy1gpagznq28ij31jg0ruq99.jpg] 3、同时指定颜色和大小 gap = px.data.gapminder...] 散点图显示数据 有时候我们需要将数据显示在每个散点附近: x_data = [0,2,4,6,8] y_data = [1,3,5,7,9] fig = px.scatter(x=x_data,...冒泡散点图是通过每个散点的大小来决定的: fig = go.Figure(data=go.Scatter( x=[1,3,5,7], y=[12,18,24,6], mode=

    2.7K40

    C++ Qt开发:Charts绘制各类图表详解

    每个面积图的面积表示该系列在该点上的数值,而整个堆叠面积图的高度表示各个系列在该点上的累积总和。 堆叠图的优势在于能够直观地显示各部分在整体中的相对比例,并清晰地展示随时间或其他维度的变化。...散点图的每个数据点由两个数值组成,分别对应于图表的横轴和纵轴。通过在图表中绘制这些点,可以观察和分析变量之间的关联性、趋势、聚集程度等。...散点图的特点包括: 数据点表示:每个数据点在图表上表示为一个独立的点,其中横轴对应一个变量,纵轴对应另一个变量。 关系展示:散点图主要用于展示两个变量之间的关系,例如相关性、分布情况、趋势等。...setPen(const QPen &pen) 设置散点图的画笔,即散点的边框颜色和样式。 pen() 返回散点图的画笔。...setBrush(const QBrush &brush) 设置散点图的画刷,即散点的填充颜色。 brush() 返回散点图的画刷。

    2.6K10

    C++ Qt开发:Charts绘制各类图表详解

    每个面积图的面积表示该系列在该点上的数值,而整个堆叠面积图的高度表示各个系列在该点上的累积总和。堆叠图的优势在于能够直观地显示各部分在整体中的相对比例,并清晰地展示随时间或其他维度的变化。...散点图的每个数据点由两个数值组成,分别对应于图表的横轴和纵轴。通过在图表中绘制这些点,可以观察和分析变量之间的关联性、趋势、聚集程度等。...散点图的特点包括:数据点表示:每个数据点在图表上表示为一个独立的点,其中横轴对应一个变量,纵轴对应另一个变量。关系展示:散点图主要用于展示两个变量之间的关系,例如相关性、分布情况、趋势等。...离散数据:适用于离散型数据,每个点表示一个具体的观测值。聚类发现:通过观察数据点的分布,可以发现数据是否呈现出某种聚类模式。异常值检测:可以用于检测异常值,即图表中偏离正常分布的离群点。...setPen(const QPen &pen) 设置散点图的画笔,即散点的边框颜色和样式。

    5.2K00

    Python+matplotlib绘制三维图形5个精选案例

    两个方向的步长,这决定了曲面上每个面片的大小;2)color用来指定面片的颜色;3)cmap用来指定面片的颜色映射表。...) 其中常用的参数有:1)xs、ys、zs分别用来指定散点符号的x、y、z坐标,如果同时为标量则指定一个三点符号的坐标,如果同时为等长数组则指定一系列散点符号的坐标;2)s用来指定散点符号的大小,可以是标量或与...xs等长的数组;3)表8-3中这里没有提到的其他参数也适用于三维散点图。...:1)x、y、z分别用来指定每个柱底面的坐标,如果这三个参数都是标量则指定一个柱的底面坐标,如果是三个等长的数组则指定多个柱的底面坐标;2)dx、dy、dz分别用来指定柱在三个坐标轴上的跨度,即x方向的宽度...、y方向的厚度和z方向的高度;3)color用来指定柱的表面颜色。

    9.9K30

    【数据可视化包Matplotlib】Matplotlib基本绘图方法

    color: 指定柱形的颜色。可以是单个颜色字符串,也可以是颜色字符串的列表或数组,用于指定每个柱形的颜色。 edgecolor: 指定柱形的边框颜色。 linewidth: 指定柱形的边框线宽度。...labels:指定每个扇形的标签,可以是一个数组或者列表,用于标记每个扇形所代表的含义。 colors:指定每个扇形的颜色,可以是一个数组或者列表,用于设置每个扇形的颜色。...s:指定散点的大小,可以是一个标量,也可以是与x和y相同长度的数组,用于指定每个点的大小。 c:指定散点的颜色,可以是一个颜色或者颜色序列,用于指定每个点的颜色。...marker:指定散点的形状,可以是一个字符,例如’x’、‘o’、‘+’、'*'等。 cmap:指定颜色映射,如果c是一个浮点数数组,并且没有指定cmap,则默认使用viridis颜色映射。...edgecolors:指定散点边界的颜色,可以是一个颜色或者颜色序列,用于指定每个点边界的颜色。 label:指定散点图的标签,用于图例显示。

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    【深度学习】 Python 和 NumPy 系列教程(十六):Matplotlib详解:2、3d绘图类型(2)3D散点图(3D Scatter Plot)

    多子图和布局:Matplotlib允许您在单个图像中创建多个子图,以便同时展示多个相关的图表或数据视图。您可以自定义子图的布局和排列,以满足特定的展示需求。...导出图像:Matplotlib支持将图像导出为多种格式,包括PNG、JPEG、PDF、SVG等。这使得您可以方便地将生成的图表保存为文件,或嵌入到文档、报告和演示文稿中。...x、y 和 z 坐标数据 colors数组存储了每个散点的颜色数据。...使用ax.scatter函数创建了3D散点图。 我们通过传递x、y和z参数来指定每个散点的位置。 c参数指定了散点的颜色,可以使用一个数值数组来表示不同的颜色值。...cmap参数指定了颜色映射,这里我们使用了viridis颜色映射。 marker参数指定了散点的形状,这里我们使用了圆形。

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    关于“Python”的核心知识点整理大全43

    15.2.3 使2散点图并设置其样式 有时候,需要绘制散点图并设置各个数据点的样式。例如,你可能想以一种颜色显示较小的 值,而用另一种颜色显示较大的值。...将 这些列表传递给scatter()时,matplotlib依次从每个列表中读取一个值来绘制一个点。...15.2.6 删除数据点的轮廓 matplotlib允许你给散点图中的各个点指定颜色。默认为蓝色点和黑色轮廓,在散点图包含的 数据点不多时效果很好。但绘制很多点时,黑色轮廓可能会粘连在一起。...要使用这些颜色映射,你需要告诉pyplot该如何设置数据 集中每个点的颜色。...为获取漫步中下一个点的x值,我们将x_step与x_values中的最后一个值相加(见6),对于y 值也做相同的处理。

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