首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

为什么我得到“参数”输出“is missing,no default”当我试图用R shiny和networkD3制作一个sankey图时?

当您试图使用R Shiny和networkD3制作一个sankey图时,出现“参数”输出“is missing,no default”的错误信息,这通常是由于缺少必要的参数或参数设置不正确导致的。

首先,确保您在代码中正确设置了所需的参数。sankey图通常需要指定节点和链接的数据源。您需要提供一个包含节点和链接信息的数据框,以及指定节点和链接的列名。请确保您已正确命名这些列,并将其传递给相应的参数。

其次,检查您是否正确设置了sankey图的其他参数,如节点颜色、链接颜色、节点标签等。确保这些参数的设置是有效的,并且符合您的需求。

此外,还需要确保您已正确加载和安装了所需的R包,如shiny和networkD3。您可以使用以下代码来安装和加载这些包:

代码语言:txt
复制
install.packages("shiny")
install.packages("networkD3")

library(shiny)
library(networkD3)

如果您已经安装了这些包,还需要确保您在代码中正确加载了它们。

最后,如果问题仍然存在,可能是由于其他代码逻辑或环境配置问题导致的。您可以尝试在云计算环境中重新部署您的应用程序,或者检查其他相关代码以查找潜在的错误。

总结起来,当您在使用R Shiny和networkD3制作sankey图时遇到“参数”输出“is missing,no default”的错误信息时,您应该检查以下几个方面:确保正确设置了所需的参数,包括节点和链接的数据源以及其他相关参数;检查是否正确加载了所需的R包;排除其他代码逻辑或环境配置问题。希望这些提示能帮助您解决问题并成功制作sankey图。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

purrr:函数式编程工具,在做数据整理非常有用。...:交互式绘图包,中文介绍详见这里 rbokeh:用于创建交互式图表地图,中文介绍 Highcharter:绘制交互式Highcharts visNetwork:绘制交互式网状 networkD3...是Gradient Boosting Machine的一个c++实现。目前已制作了xgboost工具的R语言接口。...自动化分析 以下R包用于创建自动化分析结果的数据科学产品: shiny一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。...:提供了一个执行非负矩阵分解的算法框架 crayon:用于在输出终端添加颜色 RJSONIO:rjson是一个R语言与json进行转的包,是一个非常简单的包,支持用 C类库转型R语言本身转型两种方式

4.1K31

学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

仓库 数据整理 以下R包主要用于数据整理,以便于你后续建模分析: tidyr:用于整理表格数据的布局 dplyr:用于将多个数据表连接成一个整齐的数据集 purrr:函数式编程工具,在做数据整理非常有用...:交互式绘图包,中文介绍详见这里 rbokeh:用于创建交互式图表地图,中文介绍 Highcharter:绘制交互式Highcharts visNetwork:绘制交互式网状 networkD3...是Gradient Boosting Machine的一个c++实现。目前已制作了xgboost工具的R语言接口。...:用于自定义数据表的输出 xtable:用于自定义数据表的输出 highr:用于实现R代码的LaTeX或HTML格式输出 formatR:通过tidy_source函数格式化R代码的输出 yaml:用于实现...crayon:用于在输出终端添加颜色 RJSONIO:rjson是一个R语言与json进行转的包,是一个非常简单的包,支持用 C类库转型R语言本身转型两种方式。

3.6K60
  • 学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

    ,在做数据整理非常有用。...:交互式绘图包,中文介绍详见这里 rbokeh:用于创建交互式图表地图,中文介绍 Highcharter:绘制交互式Highcharts visNetwork:绘制交互式网状 networkD3...是Gradient Boosting Machine的一个c++实现。目前已制作了xgboost工具的R语言接口。...自动化分析 以下R包用于创建自动化分析结果的数据科学产品: shiny一个使用R语言开发交互式web应用程序的工具。...:提供了一个执行非负矩阵分解的算法框架 crayon:用于在输出终端添加颜色 RJSONIO:rjson是一个R语言与json进行转的包,是一个非常简单的包,支持用 C类库转型R语言本身转型两种方式

    3.7K40

    教你用pyecharts制作交互式桑基,赶快学起来吧!

    这次就来说一说,如何用python的第三方库-pyecharts制作交互式桑基。 示例 1 什么是桑基? 桑基是可视化图表的一种,一般用来表示数据流量。...,如 bar.render("mycharts.html") bar.render() 3 使用pyecharts制作桑基 前面我们展示了一张生活开支交互式桑基: 下面就来用pyecharts...一个是所有类别的集合-nodes,一个是子类、父类、数据的三方集合-links。 这两个都是以json数据格式传入,最后以html形式输出图表。...第一步:数据准备 我们已经有这样的数据表: 对数据进行整理,的做法是先初步整理成:子类-父类-数据,以这样的数据形式保存在csv中: 接着,写个简单转换代码,将上面数据转换成nodeslinks...python中制作交互式桑基,希望能给大家的可视化提供帮助!

    2.2K20

    (数据科学学习手札83)基于geopandas的空间数据分析——geoplot篇(下)

    4   这样我们就得到4,需要注意的是,geoplot.choropleth()只能绘制地区分布,传入面数据后hue参数必须指定对应映射列,否则会报错,因此这里我们叠加纽约州新泽西州单独面图层使用的是...7   这时图像等值线间得到相应颜色的填充,使得点分布中心看起来更加明显,再添加参数shade_lowest=True,即可对空白区域进行填充: ?...8   随之而来的问题是整幅图像都被填充,为了裁切出核密度图像的地区轮廓,将底层行政区面数据作为clip的参数传入,便得到理想的效果: ?...()可以用来绘制这种,尴尬的是sankey()绘制出的OD流向实在太丑,但sankey()中将数值映射到线数据色彩粗细的特性可以用来进行与流量相关的可视化,其主要参数如下: df:传入对应的GeoDataFrame...13   以上就是本文的全部内容,将在下一篇文章中继续与大家一起探讨学习geoplot中更高级的绘图API。如有疑问意见,欢迎留言或在的Github仓库中发起issues与我交流。

    1.8K30

    基于geopandas的空间数据分析—geoplot篇(下)

    ,传入面数据后hue参数必须指定对应映射列,否则会报错,因此这里我们叠加纽约州新泽西州单独面图层使用的是polyplot()。...=True,即可对空白区域进行填充: 8 随之而来的问题是整幅图像都被填充,为了裁切出核密度图像的地区轮廓,将底层行政区面数据作为clip的参数传入,便得到理想的效果: 9 2.3 Sankey...而geoplot.sankey()可以用来绘制这种,尴尬的是sankey()绘制出的OD流向实在太丑,但sankey()中将数值映射到线数据色彩粗细的特性可以用来进行与流量相关的可视化,其主要参数如下...,对全球主要河流的形态进行优雅地可视化: 12 针对其河流宽度方面的可视化,我们基于上文中的sankey()来实现,由于原图中南极洲区域实际上是夸大了的,其R源码中设置的纬度范围达到了-110度,这是原作者为了放得下标题内容...如有疑问意见,欢迎留言或在的Github仓库中发起issues与我交流。 -END-

    1.6K50

    Matplotlib类别比较(3)

    本篇继续介绍matpltolib类别比较的绘制,分别是桑基词云图。 1、桑基 桑基是展现数据流动的很好工具,是一种特定类型的流量。在这个图中,指示箭头的宽度与流量大小成比例。...默认新建一个绘制,例如ax = ax1。...ax1子图中,标签与箭头偏移0.3 sankey = Sankey(ax = ax1, offset = 0.3) #设置桑基图名称、数据流、箭头颜色桑基颜色 sankey.add(patchlabel...")) ) # 输出html可视化结果 c.render(r"C:\Users\Smile\Desktop\桑基.html") 注:由于笔者并未掌握pycharts图像转图片的语法,读者可以自行探索...(可选参数) stopwords:停止词设置,修正词云图需要设置。(可选参数) colormap:颜色映射,可更改名称,进而更改整体风格。

    98010

    RShiny:响应式编程(三)响应表达式

    首先我们定义一些常规的 R 函数驱动后面创建的应用。 动机 想象一下我们想要使用一个一个假设检验来比较两个模拟的数据集。...**当然输入发生改变Shiny 可以非常聪明地自动更新结果;但 Shiny 无法聪明到选择性运行更新输出的代码。**换句话说,输出是原子类型的,它们整体要么执行要么不执行。...但 Shiny 会把它们看作一个整体,只要更新输入中的任意一个,x1 x2 都要更新。 因此,响应如下: ? 我们注意到这个非常稠密:几乎每个输入都跟每个输出直接连接到了一起。...这个更简单的让我们更容易理解该应用;分布参数值也仅仅影响对应的输出。代码的重写不仅减少了计算以提升了效率,而且现在当我们改变图形参数,底层的数据不再会变动。 ?...模块化的响应 为什么我们需要响应表达式 因为通过创建变量函数的方式减少重复在 Shiny 中是不工作的。

    1.6K40

    互联网游荡指北(第一期)

    一、编程与工具 可视化 1、R 中绘制PPI 网络[3] 当要绘制网络一个想到的是cytoscape,现在使用R包igraph 也可以解决类似的需求了。...此外生信星球也写过文章,个人觉得相对来说下面这个版本的更好看一些: . 此外,还有networkD3 ggraph 这两个包[4],可以实现比较丰富的网络绘图。...但我觉得这种还是存在一定的缺点,比如乍一看很难发现各层所代表的内容(按照顺序A-E)。这里觉得可以采用外围边框color 内圈填充fill 两种颜色区分。...通过vs code 拓展vscode-pyodide[9],并创建ipynb 文件,我们可以实现了Jupyter 笔记本风格的python 代码运行: 但我也发现了一个小bug,就是底下的输出结果只可以显示一行...中绘制PPI 网络: https://zhuanlan.zhihu.com/p/163498417 [4]networkD3 ggraph 这两个包: https://www.jianshu.com

    72040

    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-04

    上面是shiny团队的稿件 l4-反应输出 了解小工具如何反应输出联系,反应输出即无何时用户改变小工具都会自动更新的对象 展示反应输出 是时候给app注入灵魂了,此篇介绍如何构建一个反应输出在app中展示...告诉shiny如何在server函数构建对象,该对象会在它的代码构建一个小工具的值的时候反应 第一步:加一个R对象到UI shiny提供了一个函数家族,将R对象转换成在UI中的输出,每个函数创建特定类型的输出...这些函数捕捉R表达式,并进行一些渲染预处理,每个render*函数对应特定类型的反应对象,如下表 每个render *函数都有一个参数一个用大括号{}括起来的R表达式。...将R表达式视为稍后于shiny的一组指令,当首次启动appshiny会运行这个指令,当每次需要更新对象shiny也会重新运行这个指令。...那应该怎么做呢 通过在构建文本,让shiny调用小工具的值,从而实现文本反应 看一下代码发现,server函数的第一行有两个参数inputoutput 已知output是个列表类的对象,储存构建app

    7.2K10

    RShiny:响应式编程(一)server 函数

    响应式编程的核心思想是指定依赖关系,以便当输入发生更改时,所有相关的输出都会自动更新。这使得编写 Shiny 应用的流程变得相当简单,但是要花一些时间才能了解它们如何组合在一起。...这部分内容将对响应式编程进行简要介绍,指导读者在 Shiny 应用中使用最基本的响应式编程。我们将从 server 函数开始,讨论更多让 input output 参数工作的细节。...这保证了每个线程都有一个唯一的状态,同时隔离了在函数内部创建的变量。这也正是我们为什么基本上只在 Shiny 的 server 函数内使用响应式编程的原因。...相反,它们是 Shiny 启动自动创建的,绑定一个特定的会话。从现在起,我们将关注前两个参数,最好一个参数留到以后介绍(通常情况下我们不会用到它)。...render 函数做了两项工作: 它建立了一个特殊的响应式语境用于自动捕获(追踪)输出使用的输入 它将 R 代码的输出转换为了 HTML 内容用于网页展示 像 input 一样,output 对使用方式也很挑剔

    2.5K10

    RShiny:案例研究:急诊室受伤情况分析

    因此,让我们制作一个 Shiny 应用! 原型 在构建复杂的应用程序时,强烈建议读者尽可能简单地开始,这样你就可以在开始做更复杂的事情之前确认基本的机制是正常工作的。...在这里,我们将从一个输入(产品代码),三个表格一个绘图开始。 制作一个原型,面临的挑战是“尽可能简单”。快速让基础功能工作和规划 Shiny 应用的未来之间存在着复杂关系。...通常,在启动 Shiny 应用程序之前花一点间清理分析代码是个好主意,因此,在增加反应性的复杂性之前,我们可以在常规 R 代码中考虑这些问题。...但这种写法是一个良好的习惯,它更好理解拓展。 接下来运行 Shiny 看看原型结果。 shinyApp(ui, server) ?...这使输出在美学上更令人愉悦,因为它减少了偶然的变化量。 更改后的 App 如下: ? 比率 vs 计数 到目前为止,我们仅显示一个,但我们希望为用户提供可视化的受伤人数或人口标准化率之间的选择。

    4.3K30

    数据可视化基础与应用-07-数据可视化第二版各种类型图表的绘制优化版

    : 环形柱状 plt.axes解释参考:https://www.zhihu.com/question/51745620 axes的用法subplot是差不多的,四个参数的话,前两个指的是相对于坐标原点的位置...: 子弹 import plotly.graph_objects as go fig = go.Figure()#每一个制作一条子弹轨道 fig.add_trace(go.Indicator(...ymin, ymax:这些参数包含一个数组,它们代表每行的开头结尾。 colors:此参数是可选参数。它是默认值为k的线条的颜色。 linetsyle:此参数也是可选参数。...labeldistance, default: 1.1饼状图标签绘制的径向距离(认为这个也与8类似是个比率)。...布局也可用pos参数指定,例如,nx.draw(G, pos = spring_layout(G)) 这样指定了networkx上以中心放射状分布. ''' 输出为: 弧形 环形弧形长链接 #

    31710

    Python交互式数据分析报告框架:Dash

    只因去年下半年的时候,用R语言的博哥和龙少有Shiny这样的框架可以开发交互式整合Web数据分析报告,让这个成天鼓吹用Python做数据分析的人眼馋不已。...下面是一个包含5个输入项,3个输出交叉筛选的例子,这个例子只有160行代码,并且都是用Python编写的。 ? Dash应用:含交叉筛选,多个输入与输出项,仅163行Python代码。...认为更多是因为分享Excel比Python程序更容易,并且编辑Excel单元格也编辑比命令行参数更方便。...如果你使用R语言开发,那你还是蛮幸运的。Shiny仅使用R语言即可开发Web应用,它也是一种响应式程序框架,非常棒!你还可以使用ShinyPlotly的R语言库创建交互式图形。...DashShiny很像,但是Dash不会成为Shiny的复制品,毕竟PythonR之间的习语与理念非常不同,所使用的语法也不同。 ?

    7K92

    RShiny:用户界面(三)布局

    在我们知道如何创建一系列输入输出控件之后,我们需要学会如何在一个页面中对它们进行排列,以达到比较好的展示效果。这正是布局函数的工作,布局函数提供了一个应用高层次的可视化结构。...依旧先载入 Shiny。 library(shiny) 概览 Shiny 应用布局由层次函数调用创建,其中 R 中的层次结构与输出中的层次结构匹配。...页面函数 最重要的布局函数是上面已经展示过的 fluidPage(),我们使用它将多个输入输出控件组合形成一个 Shiny 应用。如果我们仅使用 fluidPage() 会是怎样的? ?...接下来,将给读者介绍 2 个通用的页面结构:带侧边栏的页面多行页面。...这样可行的原因是Shiny 代码本质上就是 R 代码,读者可以使用 R 中已知的任何工具增强效率、减少重复。请谨记三的原则:当你拷贝粘贴代码超过 3 次,就应该考虑编写一个函数或者 for 循环。

    3.7K10

    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-05

    上面是shiny团队的稿件 l5-更复杂的反应app 创建一个更复杂的依赖R脚本额外数据的有灵魂的(能反应的)app 使用R脚本和数据 此篇旨在展示如何载入数据,R脚本,包,用来构建app。...helpers.R一个帮助你使用地区分布R脚本,就像上面的。...地区分布使用颜色展示变量的地区差异 此例中,helpers.R 将会创建一个percent_map ,一个设计用于匹配counties.rds数据的函数,下载 脚本将会使用mapsmapproj包,...,一个名为"map"的,有percent_map构建,采用五个参数 前三个参数,var, color, legend.title, 取决于选择框小工具的值 后两个参数,maxmin,取决于滑块小工具的最大值最小值...R的switch函数能随心所欲转换选择框的输出

    1.5K20

    女程序员大起底:Stack Overflow调研称女性更偏爱这些编程语言

    我们为什么使用Stack Overflow? 接下来,让我们以问卷中的一个问题为例来比较一下男性女性的回答。这是一个多选题:“你为什么使用Stack Overflow?”...尽管男性女性在使用的技术上有很多相似之处,但在对某些技术的认可上依旧存在着不小的差异:选择使用Salesforce、Matlab、RRuby的女性比例更高。作为一个数据科学家(一个女性!)...,也会在工作中使用R,所以我觉得这一发现十分有趣。相比之下,男性使用比例较高的编程语言和技术则包括Rust、Redis、F# Arduino/Raspberry Pi。...Shiny[4](译者注:Shiny是RStudio公司开发的R程序包。有了它,用户就可以使用R语言轻松开发交互式的网络应用程序。)...制作一个应用程序,这样用户就可以自己用它来探究这些问卷的答复。 上图:基于Shiny的应用程序(用户界面展示):Stack Overflow程序员问卷调查结果。

    56330

    CIRCOS圈绘制 - 最简单绘图和解释

    Circos可以在线使用,在线使用时是把表格转为圈,不过只允许最大75行75列;做一些简单的示意图会比较好,最后时会介绍下在线的tableviewer的使用。...最简单出 把下面的内容存储到任意目录下的任意文件比如ehbio.conf下,然后运行circos -conf ehbio.conf就可以获得circos的circos.pngcircos.svg。...radius,半径) default = 0.005r # 染色体区域的绘制位置,默认所有染色体都处于远离圆心同样距离的位置 # 这里设置的是图形半径的0.9...> 最开始看CIRCOS的配置文件,不理解其是如何查找用到的数据配置目录,不过上面配置文件中被注释掉的一句话泄露了天机look in.../MPATHB/soft/circos-0.69-6/bin 不得不敢写CIRCOS的日志输出,很详细,每次都刷屏。当我们运行CIRCOS失败,看下日志信息,会得到很多提示。

    4.7K4433

    Nucleic Acids Research 在线发表癌症miRNA组学数据库CancerMIRNome

    该项目论文得到我的博士导师加州大学河滨分校的贾老师,广州市第一人民医院的钟老师,以及贵州省人民医院的朱老师的大力支持帮助。的母校华中农业大学信息学院的谢老师也提供了非常好的建议和指导。...最大的不同是TCGA数据中可以做生存分析预后模型。当选定一套miRNome数据集,会自动产生一些summary信息,包括样本分布,年龄分布,生存曲线等等。...抛开这些不足,Shiny可能是最容易上手的工具且跟R语言无缝连接 (只是说“可能”,因为其他工具也不了解),再多花些时间学习一下也能做出很专业漂亮的页面。...另外有很多针对advanced Shiny app开发的R包可以直接拿来学习使用。...从零创建一个App 理解inputoutput 保持正确的要点 渲染输出 session的解释 ID的用法 根据数据更新UI 表格-方案选择 表格-renderTable 表格-kableExtra

    1.5K21

    不会做图表?10个Python数据可视化库来帮你!

    虽然用matplotlib可以很方便的得到数据的大致信息,但是如果要更快捷简单地制作可供发表的图表就不那么容易了。...但是跟ggplot不一样的是,它完全基于Python而不是从R引用过来的。 它的长处在于它能用于制作可交互,可直接用于网络的图表。图表可以输出为JSON对象,HTML文档或者可交互的网络应用。...Boken也支持数据流实时数据。Bokeh为不同的用户提供了三种控制水平。 最高的控制水平用于快速制图,主要用于制作常用图像, 例如柱状,盒状,直方图。...Plotly 跟 Bokeh 一样致力于交互图表的制作,但是它提供在别的库中很难找到的几种图表类型,比如等值线图,树形三维图表。...你可以用它来制作多种地图,比如等值区域, 热度,点密度。 你必须安装 Pyglet (一个面向对象编程接口)来使用geoplotlib。

    89420
    领券