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Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

标签ylabel('RMSECV')              % 添加y标签返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...Ypred:预测值Ytrue:真实值RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。PLS的双重交叉验证(DCV)说明如何对PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...底部面板描述了每个变量的回归系数(每条线对应一个变量)如何随着迭代而变化。星形垂直线表示具有最低RMSECV的最佳模型。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    y_fit:y的拟合值。 R2:Y的解释变异的百分比。...添加x标签 ylabel('RMSECV')              % 添加y标签 返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS 说明如何对PLS建模进行MCCV。与K-fold CV一样,MCCV是另一种交叉验证的方法。...Ypred:预测值 Ytrue:真实值 RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 PLS的双重交叉验证(DCV) 说明如何对PLS建模进行DCV。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    标签ylabel('RMSECV')              % 添加y标签返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...----蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS说明如何对PLS建模进行MCCV。与K-fold CV一样,MCCV是另一种交叉验证的方法。...Ypred:预测值Ytrue:真实值RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。PLS的双重交叉验证(DCV)说明如何对PLS建模进行DCV。...底部面板描述了每个变量的回归系数(每条线对应一个变量)如何随着迭代而变化。星形垂直线表示具有最低RMSECV的最佳模型。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    添加x标签 ylabel('RMSECV')              % 添加y标签 返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...Ypred:预测值 Ytrue:真实值 RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 PLS的双重交叉验证(DCV) 说明如何对PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...底部面板描述了每个变量的回归系数(每条线对应一个变量)如何随着迭代而变化。星形垂直线表示具有最低RMSECV的最佳模型。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    标签ylabel('RMSECV')              % 添加y标签返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...Ypred:预测值Ytrue:真实值RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。PLS的双重交叉验证(DCV)说明如何对PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...底部面板描述了每个变量的回归系数(每条线对应一个变量)如何随着迭代而变化。星形垂直线表示具有最低RMSECV的最佳模型。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    y_fit:y的拟合值。 R2:Y的解释变异的百分比。...添加x标签 ylabel('RMSECV')              % 添加y标签 返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...---- 蒙特卡洛交叉验证(MCCV)的PLS 说明如何对PLS建模进行MCCV。与K-fold CV一样,MCCV是另一种交叉验证的方法。...Ypred:预测值 Ytrue:真实值 RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 PLS的双重交叉验证(DCV) 说明如何对PLS建模进行DCV。

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    Matlab中的偏最小二乘法(PLS)回归模型,离群点检测和变量选择|附代码数据

    添加x标签 ylabel('RMSECV')              % 添加y标签 返回的值CV是带有成分列表的结构数据。...RMSECV:交叉验证的均方根误差。越小越好 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 optLV:达到最小RMSECV(最高Q2)的LV数量。...Ypred:预测值 Ytrue:真实值 RMSECV:交叉验证的均方根误差,越小越好。 Q2:与R2含义相同,但由交叉验证计算得出。 PLS的双重交叉验证(DCV) 说明如何对PLS建模进行DCV。...与K-fold CV一样,DCV是交叉验证的一种方式。...底部面板描述了每个变量的回归系数(每条线对应一个变量)如何随着迭代而变化。星形垂直线表示具有最低RMSECV的最佳模型。

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    RDA-PLS:多数据集关联分析

    在OLS回归分析中,多重共线性会造成模型的回归系数置信区间过分夸大,造成模型的解释能力大大降低,这时可以采用偏最小二乘(Partialleast squares,PLS)回归的方法。...(即系数绝对值)以及两个约束排序轴的方差解释量计算加权得分,从而筛选出受不同饮食处理影响较大的物种,以便最后进行PLS回归分析,最终的图形绘制如下所示: #最终绘图 group=as.vector(tret...回归 接下来我们关注的是肠道微生物与宿主也即小鼠生理状况的关系,也即通过其肠道微生物主要物种的丰度变化能否预测小鼠的生理状况,能较好的预测那些生理参数,这时物种为自变量,生理参数为响应变量。...首先我们需要提取通过RDA分析筛选的100个物种及其丰度,然后与小鼠生理数据构建PLS回归预测模型,具体如下: #PLS回归分析 #提取100个物种丰度 sph=t(sph) specih=as.matrix...最后我们提取分析结果: #提取最终的RMSECV rmse=RMSEP(rdapls2) rmsecv=rmse$val #提取相关系数R r=R2(rdapls2) #提取回归系数 coef=coef

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    偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    然后,PCR只是这两个成分的因变量的线性回归。当变量具有非常不同的可变性时,通常首先通过其标准偏差来规范每个变量。...从某种意义上说,上图中的比较并不合理 - 通过观察双组分PLSR模型预测因变量的程度来选择成分数(两个),并且没有说明为什么PCR模型应该限制相同数量的成分。...从这个角度来看,更少的成分更易于解释,并且由于PLSR通常需要更少的成分来充分预测因变量,因此会导致更简约的模型。另一方面,PLSR和PCR都导致每个原始预测变量的一个回归系数加上截距。...如前所示,来自PCR模型拟合的一些成分可主要用于描述预测变量的变化,并且可包括与因变量不强相关的变量的权重。因此,PCR会导致保留预测不必要的变量。...对于本例中使用的数据,PLSR和PCR所需的成分数量之间的差异不是很大,PLS权重和PCA载荷选择了相同的变量。其他数据可能并非如此。有问题欢迎下方留言!----点击文末“阅读原文”获取全文完整资料。

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    MATLAB偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    两种方法都将新的预测变量(称为成分)构建为原始预测变量的线性组合,但它们以不同的方式构造这些成分。PCR创建成分来解释预测变量中观察到的变异性,而根本不考虑因变量。...然后,PCR只是这两个成分的因变量的线性回归。当变量具有非常不同的可变性时,通常首先通过其标准偏差来规范每个变量。...从这个角度来看,更少的成分更易于解释,并且由于PLSR通常需要更少的成分来充分预测因变量,因此会导致更简约的模型。另一方面,PLSR和PCR都导致每个原始预测变量的一个回归系数加上截距。...如前所示,来自PCR模型拟合的一些成分可主要用于描述预测变量的变化,并且可包括与因变量不强相关的变量的权重。因此,PCR会导致保留预测不必要的变量。...对于本例中使用的数据,PLSR和PCR所需的成分数量之间的差异不是很大,PLS权重和PCA载荷选择了相同的变量。其他数据可能并非如此。有问题欢迎下方留言!

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    神经网络ANN——SPSS实现

    神经网络[] 一、起源与历史 1、与传统统计方法的区别 传统线性回归模型可通过最小平方方法获取知识并在回归系数存储知识。在此意义下,其为神经网络。实际上,您可以证明线性回归为特定神经网络的特殊个案。...径向基层, 径向基神经元权重与输入层权重对比,相近的权重设定趋于1,偏离的权重设定趋于0(不起作用)。从而相近权重的输入变量激活了“隐含层——输出层”的权重。...五、SPSS的R组件安装 使用PASW Statistics-R Essentials插件作为接口, 自动安装。 同时excel也支持了R语言的插件接入。...Scipy/Numpy官方地址: http://www.scipy.org/Download 再安装 PLS Extension Module 拷贝到位,将PLS.py和plscommand.xml...放入SPSS安装文件夹下\extensions;或将PLS.py放入Python文件夹下Lib\site-packages,plscommand.xml放入\extensions 再安装 R 注意版本

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    MATLAB偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    然后,PCR只是这两个成分的因变量的线性回归。当变量具有非常不同的可变性时,通常首先通过其标准偏差来规范每个变量。...然而,使用相同数量的成分,PLSR做得更好。实际上,观察上图中拟合值的水平分布,使用两个分量的PCR几乎不比使用常数模型好。回归的r方值证实了这一点。...从这个角度来看,更少的成分更易于解释,并且由于PLSR通常需要更少的成分来充分预测因变量,因此会导致更简约的模型。 另一方面,PLSR和PCR都导致每个原始预测变量的一个回归系数加上截距。...如前所示,来自PCR模型拟合的一些成分可主要用于描述预测变量的变化,并且可包括与因变量不强相关的变量的权重。因此,PCR会导致保留预测不必要的变量。...对于本例中使用的数据,PLSR和PCR所需的成分数量之间的差异不是很大,PLS权重和PCA载荷选择了相同的变量。其他数据可能并非如此。

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    MATLAB偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)分析光谱数据|附代码数据

    然后,PCR只是这两个成分的因变量的线性回归。当变量具有非常不同的可变性时,通常首先通过其标准偏差来规范每个变量。...然而,使用相同数量的成分,PLSR做得更好。实际上,观察上图中拟合值的水平分布,使用两个分量的PCR几乎不比使用常数模型好。回归的r方值证实了这一点。...从这个角度来看,更少的成分更易于解释,并且由于PLSR通常需要更少的成分来充分预测因变量,因此会导致更简约的模型。 另一方面,PLSR和PCR都导致每个原始预测变量的一个回归系数加上截距。...如前所示,来自PCR模型拟合的一些成分可主要用于描述预测变量的变化,并且可包括与因变量不强相关的变量的权重。因此,PCR会导致保留预测不必要的变量。...对于本例中使用的数据,PLSR和PCR所需的成分数量之间的差异不是很大,PLS权重和PCA载荷选择了相同的变量。其他数据可能并非如此。 有问题欢迎下方留言! ----

    41000

    【视频讲解】偏最小二乘结构方程模型PLS-SEM分析白茶产业数字化对共同富裕的影响|附代码数据

    当结构模型中加入了氛围感知变量后,共同富裕水平的被解释R2值增加到0.774,表明模型对于共同富裕的解释能力在中等至较大之间,模型解释力较好其次,数字化水平对于氛围感知的回归系数为0.703,p 值远小于...缺点: PLS估计不再是因变量的线性函数,其优良特性与非线性估计的特性仍在研究中,这可能使得PLS在某些复杂模型中的解释性受到限制。...PLS的结果可能受到初始变量选择的影响,不同的变量组合可能导致不同的结果。 PLS在处理高维数据时可能会遇到计算复杂性和稳定性方面的问题。...summary(lm 回归系数是相同的(好!)。...这是一个“经典”数据集,用于许多关于结构方程建模 (SEM) 的论文和书籍,包括一些商业 SEM 软件包的手册。数据包括来自两所不同学校的七年级和八年级儿童的心理能力测试成绩。

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    【机器学习笔记】:大话线性回归(三)

    这对于一些自变量的可解释性来讲可能是致命的,因为得到错误系数无法解释正常发生的现象。 那究竟为什么多重共线性会导致回归系数,以及模型不稳定呢?...(2)当模型线性关系(F检验)显著时,几乎所有回归系数的t检验不显著。 (3)回归系数的正负号与预期的相反。 (4)方差膨胀因子(VIF)检测,一般认为VIF大于10,则存在严重的多重共线性。...VIF的公式是基于拟合优度R2的,其中VIF代表自变量X的方差膨胀系数,R代表把自变量X最为因变量,与其他自变量做回归时的R2。关于R2介绍可以参考【机器学习笔记】:大话线性回归(二)。...-r2) for i in df.columns: print(i, '\t', vif(df,col_i=i)) 如果自变量X与其他自变量共线性强,那么回归方程的R2就会较高,导致VIF也高...LASSO回归可以实现筛选变量的功能。 (4)维数缩减:包括主成分回归(PCR)和偏最小二乘回归(PLS)方法。 由于篇幅原因,关于这些处理方法,后续会慢慢介绍。

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    偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR)

    然后,PCR只是这两个组分的响应变量的线性回归。当变量具有非常不同的可变性时,通常首先通过其标准偏差来规范化每个变量是有意义的,但是,这里没有做到。 ?...然而,使用相同数量的组件,PLSR在安装方面做得更好y。实际上,观察上图中拟合值的水平散射,使用两个分量的PCR几乎不比使用常数模型好。两次回归的r平方值证实了这一点。...从这个角度来看,更少的组件更易于解释,并且由于PLSR通常需要更少的组件来充分预测响应,因此会导致更简约的模型。 另一方面,PLSR和PCR都导致每个原始预测变量的一个回归系数加上截距。...如前所示,来自PCR模型拟合的一些组件可主要用于描述预测变量的变化,并且可包括与响应不强相关的变量的大权重。因此,PCR可以导致保留预测不必要的变量。...对于本例中使用的数据,PLSR和PCR所需的组件数量之间的差异不是很大,PLS权重和PCA负载似乎选择了相同的变量。其他数据可能并非如此。

    2.3K10

    万字长文,演绎八种线性回归算法最强总结!

    欠拟合,则降低 值 过拟合,则增加 值 不同的 对系数的影响 较小 (红色五角星)与较大 (蓝色菱形)所得到的回归模型系数对比图。...输出包含每个alpha的Lasso回归系数的DataFrame。...不同分位数下的回归系数估计量常常不同,即解释变量对不同水平被解释变量的影响不同。...中位数回归的估计方法与最小二乘法相比,估计结果对离群值则表现的更加稳健,而且,分位数回归对误差项并不要求很强的假设条件,因此对于非正态分布而言,分位数回归系数估计量则更加稳健。...不同分位数对应的回归系数 上述分位数回归的结果说明,在收盘价分布的不同位置(不同分位数),开盘价对其的影响是不同的。下图展示了这一点。

    3.4K40

    【视频】结构方程模型SEM分析心理学营销数据路径图可视化|数据分享

    协方差结构分析和 LISREL(Jöreskog 共同开发的程序的名称)是偶尔与结构方程建模互换使用的其他术语。 它与营销研究有什么关系?...想象一下,如果您想更好地了解哪些消费者感知与您的产品或服务类别中的喜欢、购买兴趣或满意度最密切相关,并查看是否存在不同感知的潜在消费者细分(聚类)。...在这个例子中,双头箭头是潜在外生(独立)变量之间的相关性。 与箭头相邻的数字是回归系数、相关系数和因子载荷。在 SEM 中,回归系数通常小于相关性和载荷,就像这里一样。...第一种方法是将 R 与外部商业 SEM 程序连接起来。这在模拟研究中通常很有用,其中使用 SEM 软件拟合模型是模拟管道的一部分。 第二种方法是使用专用的 R 包进行结构方程建模。 为什么是R 包?...R 包旨在吸引那些教授 SEM 课程或 SEM 研究的人;理想情况下,教师应该能够使用易于使用但完整的 SEM 程序,该程序在计算机教室中安装成本低廉。 R 包旨在吸引在 SEM 领域工作的统计学家。

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    回归,岭回归。LASSO回归

    选择k或者lambda使得: (1)各岭回归系数的岭基本稳定 (2)正负直接穿梭时,不合乎实际意义 (3)残差平方和增大不太多。 用R语言进行岭回归: lm.ridge(y~....R的Lars 算法的软件包提供了Lasso编程,我们根据模型改进的需要,可以给出Lasso算法,并利用AIC准则和BIC准则给统计模型的变量做一个截断,进而达到降维的目的。...[] (5)岭回归与lasso算法[] 这两种方法的共同点在于,将解释变量的系数加入到Cost Function中,并对其进行最小化,本质上是对过多的参数实施了惩罚。而两种方法的区别在于惩罚函数不同。...近年来兴起的Compressed sensing(Candes & Tao, Donoho)也与LAR一脉相承,只是更加强调L1-norm regularization其他方面的数学性质,比如Exact...三、R语言包——glmnet和lars 1、glmnet包与算法 glmnet包是关于Lasso and elastic-net regularized generalized linear models

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