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Nat. Chem. | 利用高通量实验和几何深度学习实现药物后期多样化

通过LCMS测量和数据分析，研究人员能够确定（1）二元（是/否）反应结果，即条件与单个底物结合是否产生了期望的单硼化或双硼化产品，以及（2）反应产率，提供有关期望反应产物量的信息。...这些不同的组合共产生了针对每个反应任务（二元反应结果和反应产率）的八种不同GNN，以及针对区位选择性的四种（表1）。对于反应任务，使用了ECFP指纹作为基线神经网络进行研究。...实验结果 图 3 作者总共采用了八种不同的图神经网络（GNN）以及一个基线方法（ECFP4NN），它们被优化用来预测反应产率和二元反应结果。...首先，对随机数据分割评估了二元反应结果预测。图3d（中左）展示了为此任务开发的九种不同神经网络的比较。与反应产率预测一样，可以看出相似的趋势；即，GTNN略微优于ECFP4NN模型和GNN模型。...aGNN3D还被应用于包含文献数据集之外的底物的分布外反应，这些底物来自罗氏医药化学遗留项目（图4b）。该模型预测了吗啉45的三个潜在反应位点，其中两个得到了实验验证。

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效能时代，数栈专属DevOps跑出加速度

，亦要保证产品的质量与稳定，两者之间产生了矛盾。...本文接下来将结合数栈产研近两年遇到的研发效能问题分享下数栈DevOps建设实践。...业务量持续增加的同时，团队规模也在日渐扩大，流程制约和异地协同等影响产研效能的问题因此逐渐浮现。提升产研效能、确保产品质量，对实现快速交付至关重要。...数栈研发流程规约 ​如图所示，开发在接到需求后进入研发工作，研发完成经由Gitlab提交代码并完成联调自测，自测通过后于禅道发起提测单，测试人员将利用Jenkins进行环境的构建与部署，并完成一系列测试与结果的反馈...流水线能力建设 在数栈DevOps平台上可根据项目分别进行流水线管理，可配置适应企业内部不同部门、不同产品线的研发流程流水线。

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    自动化测试框架详解【2022】

    随着计算机技术人员的大量增加，通过编写代码来进行测试成为一种更为高效的测试方式，由此而诞生了以计算机语言为基础的自动化测试方案，当然测试工程师需要具备代码能力。...jenkins（可以支持java、python等大多数语言的项目） jenkins是一个基于java语言开发的，可以取代繁杂的手动集成，用于监控持续重复工作的持续集成工具，简单说就是一个可以设置定时任务...，自动执行并报告结果的工具。...学习资料：requests库 · Python爬虫 · 看云 allure allure是一款开源的，用来展示测试结果的工具。...学习资料：allure测试报告_测试之道.的博客-CSDN博客_allure测试报告 pytest、requests、allure、jenkins等工具的关系如下图： 结合通用的工具，不同的自动化测试场景下对应的自动化测试框架如下

    2.1K20

    Jenkins Gitlab持续集成打包平台搭建

    CI作为敏捷开发重要的一步，其目的在于让产品快速迭代的同时，尽可能保持高质量. CI一种可以增加项目可见性，降低项目失败风险的开发实践。...CI 是团队成员间（产研测）更好地协调工作，更好的适应敏捷迭代开发，自动完成减少人工干预，保证每个时间点上团队成员提交的代码都能成功集成的，可以很好的用于对Android/iOS项目的打包。...蒲公英 蒲公英(pgyer)为移动开发者提供App免费测试分发应用的服务平台，支持iOS与Android，简单两步分发应用。类似的还有fir.im等....Notification，设置如下如所示 Jenkins Jobs配置 Jobs基础配置 配置编译参数 例如，如果需要打包者自行选择打包类型，如需要编译Release/Debug/Test等不同版本的包...设置 Last Show 构建成功后最终的结果如下如所示： 后记 签名和证书问题(iOS) Set up code signing for iOS projects 安装JENKINS到发布IPA中的那些坑

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    Jenkins Gitlab持续集成打包平台搭建

    CI作为敏捷开发重要的一步，其目的在于让产品快速迭代的同时，尽可能保持高质量. CI一种可以增加项目可见性，降低项目失败风险的开发实践。...CI 是团队成员间（产研测）更好地协调工作，更好的适应敏捷迭代开发，自动完成减少人工干预，保证每个时间点上团队成员提交的代码都能成功集成的，可以很好的用于对Android/iOS项目的打包。...蒲公英 蒲公英(pgyer)为移动开发者提供App免费测试分发应用的服务平台，支持iOS与Android，简单两步分发应用。类似的还有fir.im等....Jenkins Jobs配置 Jobs基础配置 配置编译参数 例如，如果需要打包者自行选择打包类型，如需要编译Release/Debug/Test等不同版本的包，那需要配置Jobs的编译参数，配置方法如下图所示...设置 Last Show 构建成功后最终的结果如下如所示： ?

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    我的devops实践经验分享一二

    gitlab 开源的git仓库，主要有几个用途 1.源代码管理 分支管理规则可以参考gitflow，或者规定一个合适自己的就好，微服务化后，一个站点或者说一个项目参与的开发人员只有有限的几个人。...根据环境、源代码语言、部署方式等有所不同 ? jira jira敏捷开发管理工具，管理需求、研发迭代等。在加上他们家公司的wiki做知识库管理基本稳了。 jira用下来发现还是相当强大！...虽然，jira里面有jenkins插件，jenkins里面有jira的插件，但是组件对各个系统都有版本要求，然后组件使用上也蛮不方便的，最后也有一些需求要解决起来相当麻烦，所以才有了自己的发布系统。...目前我们配置的是发布到产线的时候才做sonar的静态代码检查，然后再sonar系统里面配置了。 后面看需要，是否要对sonar的结果进行邮件。打算这样做。...每周出一份代码质量报告，统计一周内已上线的项目和上一周相比错误，漏洞，坏味道，覆盖了等数据的变化。弄个定时任务，sonar 2个接口获取一下数据，存储对比结果，发个邮件就完事了。

    1.1K50

    如何在Ubuntu上使用Jenkins自动构建

    有关详细说明，请参阅我们的如何安装docker镜像的指南。 出于本指南的目的，仅使用Jenkins主服务器。 您将需要已创建的GitHub帐户，或类似的程序可用于Bitbucket和GitLab。...您还需要一个Docker Hub或类似的注册帐户。 了解Jenkins的工作原理 在自动化工作流程之前，有必要了解基本的CI / CD过程。...您的最终项目分发将类似于： 注意：文件夹结构的方法和两个Docker容器的实现是不寻常的，但出于教学原因用于展示Jenkins Pipeline功能。...安装Jenkins 使用Jenkins项目维护的包允许您使用比分发包管理器中包含的版本更新的版本。...See logs for details.' } } } 的Mocha Tests阶段开始两个图像并执行自动测试，产生了reports.xml保存到詹金斯工作区文件

    9.8K10

    流水线使用浅谈

    - Jenkins:有丰富的预置环境、凭证、缓存等资产,可以重复使用,但也增加了管理难度。 那么到底如何选择： GitLab CI简单易用,但功能略少,扩展和管理也相对简单。适用于中小型项目。...Jenkins功能强大,但较复杂,需要投入更多时间去管理与扩展。适用于大型项目。 两者可以很好地结合使用,例如使用GitLab CI进行 daily build,使用Jenkins进行发布管理。...那么同一个项目中需要注册两个gitlab-runner吗？ 可以注册两个，也可以一个项目用一个runner。...那为什么注册的时候还要选择执行器类型？注册GitLab Runner时让我们选择执行器类型,似乎与一个Runner可以处理不同执行器类型的job相矛盾。 这主要出于两个原因: . 默认执行器。...选择不同的执行器类型,可以为该Runner优化不同类型job的运行环境。

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    任务流引擎简介

    任务流的例子 Jenkins 最早接触任务流工具应该是在 jenkins, 实际上 CI/CD 也是任务流最常见的场景之一，不过 jenkins 并不局限于 ci/cd （大部分 ci/cd 工具也是这种设计...，以及 kubenetes 提供基础设施的强大能力，使得在 kubernetes 上实现类似的工具变得门槛很低，笔者也在早年也做过类似的玩具项目 https://github.com/arlert/kubepipe...同时 这两个工具又局限于 kubernetes 语境，其第四层的设计也比较局限。...看下 cncf 的 spec 可以看出 cncf的标准指定得还是比较复杂, 支持 subflow，foreach，delay, paralle 等特性，而云产商如 aws 实现的类似产品 spec 则更为简单...目前还没有知名的 cncf 标准的 workflow 实现出现，不过可以预期，以 cncf 的影响力，类似的开源项目很快就会出现，这个领域还有很多机会。

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    【QCon分享】携程无线App自动化测试实践

    每一种方式都有优缺点，携程采用的是访问携程App最多的设备类型进行采购，这样可以保证大部分用户没有问题，其他机型可以由各个产线各自再进行测试。...Automation Platform as a Service（APS） APS是经过自动化框架到平台慢慢演化而来，最终成为了包含从初始化项目、运行测试用例、查看测试结果等整个测试项目生命周期功能的平台...对于并行部分尤其需要注意appium的处理，其本身并没有明确表示提供并行运行的能力，因此需要做一些处理，一个是对于其使用的多个端口需要指定为不同的端口号，另一个是appium会访问一些共享文件，可以通过修改...• 测试调度 这是为了保证CI Jenkins对用户透明，以减低用户学习成本的功能。 • 测试执行 测试执行是有自动化框架完成。 • 报告生成 针对每一次运行均保存运行设备、结果以及用例的日志。...图3 Mobile App Testing in Ctrip 随着基础设施与APS的构建完善，在此基础上诞生了一系列的自动化产品。 1.

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    DevOps平台实践落地之构建管理详解

    项目中有用maven编译的、有用ant编译的，如果有移动应用，有android系统的、ios系统的，还有一些前端应用的编译，比如：nodejs，这么多不同的环境我们怎么支持？...从构建任务的分类上大家可以看到，项目中使用的编程语言五花八门，对应的编译工具也各有不同，代码分析和测试工具也是五花八门，面对不同语言、不同类型的工具在构建过程中可能出现各种情况的组合，如何能够灵活地支撑这种任务的组合呢...只需要选择通知发送的项目组成员即可，设定完毕后DevOps平台将会发送构建成功或失败的邮件给选定的成员，以便相关人员及时了解构建结果。 四、构建执行与跟踪 首先介绍一下构建执行。...，在DevOps中使用npm构建时配置单元测试报告存放路径，这样就可以在DevOps中查看前端项目的单元测试结果了。...五、总结 总结一下，在DevOps中进行构建，平台帮您屏蔽了不同操作系统、不同构建工具、不同应用等等复杂的环境，您可以很方便地编排自己的构建流程，定义构建策略，并对构建结果进行跟踪。

    2.6K100

    jenkins + docker自动化部署maven项目

    -> D(将docker镜像上传到docker仓库) D --> E(jenkins远程登陆生产环境的服务器) E --> F(从docker仓库拉取构建的镜像并运行) 对于我们大部分人来说，实际上很多工作都是在同一台服务器上完成...配置凭据 一般我们的个人项目是私人仓库，所以需要配置凭据让jenkins能够访问到自己的gti仓库 注意，是用左边的那个进行配置，而不是右边的 有两种方式，第一种直接用git的账号密码来获取代码...，我这里保存在/root/id_rsa，需要保存在其他地方自行更改 然后要输入密码，可以为空 生成完毕后，会产生两个文件id_rsa和id_rsa.pub，带.pub的是公钥，把这个文件的内容复制到...，注意类型需要选择SSH的那个 5 构建项目 完成上面步骤后，就可以开始构建项目了 首先到gitee或者github上复制代码的地址下来，因为我们用的是SSH私钥来拉取代码，所以复制地址的时候记得选择...SSH 然后新建一个自由风格的项目，进入配置界面 输入刚刚的地址，以及选择上一步添加的SSH凭据，jenkins将使用这个凭据去拉取代码 如果凭据用的是git的用户名和密码，那么代码URL则选择

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    苹果AR产品商标曝光 过半比特币交易造假 初代3nm工艺被台积电弃用... 今日更多新鲜事在此

    他们给的分析结果出入很大：例如有的认为比特币最新24小时交易量为320亿美元，有的则得出50亿美元的分析结果。 因此，这给比特币的监管带来极大的困难，也给不良分子创造了洗钱的机会。...杰克·多西意思并不是希望推特的相关构想和项目完全不存在，而是希望它能成为一个开放、可验证的协议，而不是由某个国家或某家公司拥有。...如果推特真的是一种协议，其运营模式将会与email非常相似：没有一个中央实体控制，使用不同电子邮件提供商的人都可以相互通讯。 眼下推特正在应对多个棘手的问题。...台积电将把发展方向转到产性价比更高的N3E工艺上，预计在2023下半年起实现量产。 当然N3工艺≠3nm芯片的全部技术。所谓N3工艺，指的是台积电初代3nm工艺；N3E是N3工艺的增强版。...研究者在测试中发现，这样可获得与N95相似的防护效果。 此外研究者也表示，这个方法是应 急 用 的 ！

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    高效率团队为啥都会选择Jenkins？一文带您了解Jenkins

    它非常适合应该在不同平台上使用多种工具进行编码和开发的项目。 为什么需要选择Jenkins？ 想象一下没有Jenkins的时候，一个软件项目从初期到交付是什么样的。...开发人员首先完成代码开发、测试，然后检查错误，一般来说团队中的开发人员倾向于独立工作，每个人都会写大段代码添加到项目中，那么对于这个整体项目而言，检查项目整体的代码错误就显得非常繁琐而庞大。...Kawaguchi 于 2004 年在 Sun Microsystems 工作时首次开发了Hudson，当甲骨文在 2010 年收购 Sun Microsystems 时，甲骨文和Hudson社区之间就使用的基础架构发生了争执...Jenkins集群架构 主从单元使用 IP/TCP 协议相互通信，下面我们来介绍一下Jenkins主从节点： Jenkins主节点 Jenkins 主节点负责处理许多任务，包括但不限于调度构建作业、记录和呈现构建结果...易于配置、扩展和修改，允许即时生成测试以及在不同平台上构建、自动化和部署代码。

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    Network Embedding

    分为两个部分： 建立模型 目的：基于训练数据构建神经网络，训练好后使用模型通过训练数据所学到的参数（建模不是最终目的） 通过模型获取嵌入词向量 基于神经网络的语言模型的目标函数通常取为如下对数似然函数：...skip -gram 关键思想：产长预测句子中附近的单词嵌入 Node2vec 类似于deepwalk，主要的创新点在于改进了随机游走的策略，定义了两个参数p和q，在BFS和DFS中达到一个平衡，同时考虑到局部和宏观的信息...，该方法提出了一阶相似度与二阶邻近度的概念，基于这两个邻近度，提出了优化函数，得到的最优化结果即为每个节点的向量表示 一阶相似性：直接相连的节点表示尽可能相近（适用于无向） 二阶相似性：两个节点公共的邻居节点越多...，两个节点的表示越相近，类似，使用预警相似的两个单词很有可能是同义词（适用于有向图和无向图） 边缘采样算法优化目标，采样概率与权重成比例 因为边的权重差异大，直接 SGD 效果不好，这里按照边的权重采样...在矩阵分解这个框架中，将文本直接以一个子矩阵的方式加入，会使学到的向量包含更丰富的信息。 文本矩阵是对TFIDF矩阵的SVD降维结果 ?

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    基于 Jenkins Log 秒级数据的研发效能改进

    一、数据是第一生产力 今天我希望带来一个目前的想法，就是可能的一种解决方案。...我碰到更多的有的项目经理要求比较高，一天发两个，我估计项目自己也看不出来。...这样带来一个问题项目好不容易收集一个报告，但是数据跟实际情况不一定完全符合，在项目的管理上风险度是非常高的。 2.2、jenkins log采集方法 这个怎么破呢？...这样的话就自然而然想到Jenkins Log的采集，这个Log记录了整个研发流程的所有数据。优点我这儿也列了，实时性非常好，Jenkins Log只要产生了就保存在Jenkins的服务器上。...假设发现这个问题就是A和B两个模块有一个可能出问题了，但是在企业里边经常碰到A和B两个不同的部门，两个互相踢皮球。作为集成测试团队来说经常碰到这个问题，最后扔到谁就是谁，先改了再说。

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    【译】Serverless Jenkins with Jenkins X

    jenkins在取得巨大成功的同时，也产生了一些问题。 下面让我们来简要描述一些我们了解到的比较重要的问题。 jenkins服务的单点问题。...Prow被用于Istio和Jetstack的同时，还被140个项目使用。有许多不同的职责的微服务组成的基于事件的解决方案--为一个云本地体系结构提供了理想的松散耦合体系结构。...多亏了War Packager (CWP)， Jenkins X发布过程构建了不同风格的Jenkins服务器，其中包含必要的构建工具。语言检测确保使用正确的风格。...这里可以看到上述变化的一个例子。 要启用prow的ChatOps/approve注释，您还需要一个类似的OWNERS文件到该链接，该文件使用批准者GitHub ID。...这意味着如果要迁移具有多个不同容器{...}块的现有Jenkinsfiles，则需要将每个容器的构建工具添加到上面由CWP创建的单个一次性Jenkins中。

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    uni-app命令行构建Module parse failed:Unexpected token错误处理

    分享一次打包环境升级导致的jenkins部署流程失败问题的解决过程。...# 背景 最近在使用公司内jenkins部署uni-app项目时又遇到了如下的错误： Error: Error: Missing binding /data/apps/nginx/web/jnpf-app...单纯从错误信息看也知道是环境发生了变化导致的，后又找了运维确认得知打包的环境统一改为使用node14版本的docker镜像进行了，所以导致bind.node文件与实际使用环境不匹配了，这个问题之前已经总结了解决方案...经过一番调查之后，发现是项目内含有可选链操作符这种新特性，但是缺少库来进行转译操作导致js编译失败，jenkins部署流程没有成功。...# 总结 这里jenkins报错的原因一个是其它项目打包需要node14环境，然后执行命令时并没有对binding.node文件进行重新构建，所以使用了基于低版本node构建的binding.node文件

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