主动脉分割及中心线提取

利用Segment Editor中的局部阈值工具（Local Threshold）对主动脉进行分割操作（视频教程参见视频号3DSlicer曹玉福），利用SlicerVMTK血管分割模块中的中心线提取模块对主动脉进行中心线提取。

模块名称：

Segment Editor

工具说明：

局部阈值工具（Local Threshold）

根据指定区域的阈值范围进行自动分割的方法，勾画指定区域并设定阈值范围后，按住键盘Ctrl键+鼠标左键单击，将阈值范围内所选岛添加到该分割。

选项：

Minimum diameter（最小直径）：防止通过小于指定尺寸的泄漏。

Segmentation algorithm（分割算法）：用于对指定区域执行选择的算法。

Feature size（特征大小）：用于WaterShed模式下的平滑度设定。值越大则表面越平滑。

ROI（感兴趣区）：将在其中进行阈值分割的感兴趣区域，选择较小的区域将减少泄漏并提高计算速度。

模块名称：

SlicerVMTK

VMTK扩展模块可用于4.10.2更高的版本，需要在扩展模块管理器中安装SlicerVMTK扩展。

Extract Centerline

中心线提取：从输入分割或模型节点确定血管树中的中心线。它可以进行快速的网络提取，也可以进行精确的中心线计算并在指定端点之间进行分支提取。该模块可以简化输入以快速进行计算（通常为5-20秒），而不会显著降低精度，还可以检测和标记网格错误。

模块说明：

Network extraction

网络提取：可用于快速，近似地提取完整的中心线网络。单击端点“Auto-detect（自动检测）”按钮或选择一个节点作为“网络模型”输出时，将自动调用它。

Surface：输入在Segment Editor模块中分割的主动脉的Segment。

Endpoints：起点可以自定义，选中标记点工具进行分支末端的标记，如果未定义起点，则选择最接近模型拐角之一的点。中心线线段可能会出现在起点和中心线网络之间。为了避免出现这种小的额外分支，可以通过Endpoints在任何分支的末尾放置标记点来手动定义起点。

Centerline tree extraction

通过指定输入分割体（Surface）和端点（Endpoints），可以利用泰森多边形法对分割体模型进行精确的中心线树提取。

Endpoints（端点）：是将通过中心线连接的分支端点的列表。通过将相应的标记点分别设置为“unselected（未选定）”或“selected（选定）”，端点可以是入口或出口类型。通常一个入口点就足够了，但是如果网络由几个独立的树组成，那么应该在每个树中定义一个入口点。如果没有指定入口点，则第一个端点将用作入口。如果一个端点是不可到达的，那么它可以通过一条直线连接到其他点。删除或重新定位这些端点以创建完整、有效的中心线网络。

Centerline model（中心线模型）：如果选择模型节点作为模型中心线，则提取的中心线将保存到模型节点中。

Centerline curve（中心线曲线）：如果选择标记曲线节点作为中心线曲线，则分支将拆分为单独的曲线节点。

Centerline properties（中心线属性）：如果选择表节点作为量化结果，则计算几何特性（长度、平均半径、曲率、扭转度、弯曲度）。弯曲度计算为中心线长度与直线端点距离之间的比率。重要提示：确保所有端点都是可到达的（没有一个端点是通过一条直线连接到树中的其他点），因为不可到达的端点可能会使计算无休止地运行。

Voronoi diagram（沃罗诺伊图）：是一个类似于中间曲面的曲面，用于搜索分支端点之间的路径。可以保存此模型以进行质量检查，并获取可以可靠放置分支端点的曲面。

中心线提取后可以在Markups模块中更改显示属性。

视频号部分教程