病理检查是癌症诊断的“金标准”。病理专家每天要花很多时间研究病理切片,但这些切片提供的有效信息可能很少。
一种被称为机器学习的人工智能技术可以简化这一过程,使病理专家能够将注意力集中在最有价值的切片上。
尽管癌症病理诊断至关重要,但在过去的150年里,病理学几乎没有任何实质性的进步。仍需要进行组织活检,提取薄层肿瘤组织装片,然后在显微镜下观察。
最近,纪念斯隆·凯特琳癌症研究中心(MSKCC)数据科学家和机器学习专家Thomas Fuchs团队开发的一个叫作Machine Learning的AI系统,有望为肿瘤病理学带来颠覆性改变。研究团队训练超级计算机通过数字化显微切片识别癌症,大大加快了样本分析的进程,使病理专家能将注意力集中在最相关、信息量最大、最有价值的切片上。
这项研究发表在《自然医学》杂志上,堪称癌症病理学的一个重要里程碑。研究分析了来自1.5万多名癌症患者的4.4万多张数字化切片图像。结果表明,Machine Learning可以识别出几乎100%的癌症活组织切片,预计在临床上能减少病理医生65-75%的无效读片工作。
研究团队已建立了一个精准检测模型,准确度堪比训练有素的病理专家。这种新型的AI系统有望被全球病理专家用来辅助他们做出更准确的诊断。
研究团队开发的新方法运用了强大的计算机技术,并经过大量数据训练。这是目前建立的首个临床级别AI系统。
其他计算机模型在面对实际临床样本时可能会崩溃。“它们就像在一个在空旷的停车场训练出来的自动驾驶汽车。在训练时或许行得通,但一旦来开到大马路上就可能彻底失败。”Fuchs说。
高效的AI系统
Machine Learning基于深度学习算法,模仿人类大脑通过看实例来识别物体的方式,可在出错时不断调整参数,最终使其能够高精度地检测癌症。
以往的AI系统需要经验丰富的病理专家煞费苦心地对切片进行注释,以准确地标出癌症的位置,严重限制了可检查的切片数量。
而这种AI系统的一个强大特点是,切片不需要经过事先处理,也无需病理专家对切片手动标注,就能够自我训练,以更少的人为输入来识别癌症。
每张切片先被分成几千个非常小的单位,AI模型将自己的结果与病理报告进行比较,通过不断的迭代从而获得识别能力,判断什么是癌症,什么不是癌症。
这一系统可用于癌症病理专家稀缺的地区。病理专家每天要花好几个小时研究切片,但这些切片提供的有用信息可能很少。例如,一个病人的前列腺活检程序可产生45张以上切片,而且每张切片都必须单独检查。
“在这样大量的图像中检测微小的癌症病变如同大海捞针,病理专家必须经过多年的训练才能可靠地做到这一点。而这个模型提供了一个可复制的、强大的系统,帮助他们更准确、更高效地识别病变,这对病人也更好。”
真实的临床数据
研究的样本来自MSK一年多来拍摄的所有切片,全都是真实的临床数据。患者患有三种类型的常见癌症:前列腺癌、皮肤癌或已扩散到淋巴结的乳腺癌。一些瑕疵切片也包括在内,例如不规则的形状、气泡、固定不佳、组织不平整等,也有数字化过程引起的图像模糊等。这些会使切片难以分析和阅读,但都是病理专家在实际工作中会遇到的。
这与早期的研究形成了鲜明的对比。早期的AI系统只使用“精选”过的切片集,因为它们清晰可见、易于分析。
Machine Learning系统是MSK的计算机科学家、机器学习专家、病理专家和肿瘤专家多年密切合作的成果,是第一个真正临床级的病理学AI模型。结果证明,可以利用混乱、无规则的真实数据大规模训练深度学习模型。
数字化病理在美国还没有广泛应用于初级诊断,一定程度上是因为这项技术成本高昂,并且其获益有待确切证明。
希望这一AI系统能早日在临床普及,让全世界的病理专家和肿瘤患者都能从中受益。
参考资料:
https://www.mskcc.org/blog/researchers-report-milestone-use-artificial-intelligence-pathology
领取专属 10元无门槛券
私享最新 技术干货