简介
mlpack是一个C++机器学习库,侧重于可扩展性、速度和易用性。它的目的是通过一个简单的、前后一致的API让新用户使用机器学习成为可能,同时利用C++语言特征为专家用户提供最好的性能和最大的灵活性。这些通过提供一系列命令行执行程序完成,就像使用一个黑箱,而且专家用户和研究者可以容易的更改一个模块化的C++ API的内部算法。
mlpack
m'lpack
这种方法的结果就是mlpack的性能大幅度超过其他竞争的机器学习库;
mlpack由全世界的贡献者开发。基于伯克利发行软件许可的第三个条款免费发行。(比1.0.12更老的版本基于GNU通用公共授权规定发行:LGPL,第3版。)
安装
mlpack存储在许多Linux的发行版本中,所以在你的系统中使用程序包管理器可能更容易一些。例如:在Ubuntu上,你可以使用下面的命令安装mlpack。
1.$ sudo apt-get install libmlpack-dev
如果mlpack不能在你的系统的程序包管理器中使用,那么你可以按照下面的步骤编译和安装mlpack源文件。
Mlpack使用CMake作为生成系统,允许几个灵活的生成配置选项。你可以查询大量的CMake教程得到更多的文件,但是这个教程应该足够让你在大多数Linux和类UNIX系统中(包括OS X)成功生成和安装mlpack。如果你想在Windows操作系统中生成mlpack,请看这里。
首先下载mlpack。
当mlpack的源文件完成解压,你可以创建一个生成目录。
1.$ cd mlpack-2.2.5
2.$ mkdir build
这个目录可以是任何名字,不仅仅是“build”,但是“build”足够了。
mlpack依赖项
mlpack依赖下面的库,它们需要被安装在系统中并有一些头文件出现。
Armadillo >=4.200.0(支持LAPACK(线性代数程序包))
Boost(math_c99, program_options, serialization, unit_test_framework, heap, spirit)>=1.49
在Ununtu和Debian中,你可以通过apt获得所有这些依赖项:
1.# apt-get install libboost-math-dev libboost-program-options-dev
2. libboost-test-dev libboost-serialization-dev libarmadillo-dev binutils-dev
配置CMake
运行CMake相当于使用autotools运行./configure。
如果你工作中使用mlpack的svn trunk版本,且不带任何选项运行CMake,它将配置这个生成项目带有调试符号和分析信息:如果你工作中使用发行版本的mlpack,不带任何选项运行CMake,它将配置这个生成项目不带调试符号和分析信息(为了速度)。
1.$ cd build
2.$ cmake ../
你可以手动指定选项去编译或不编译调试信息和分析信息(也就是说尽可能快):
1.$ cd build
2.$ cmake -D DEBUG=OFF -D PROFILE=OFF ../
Mlpack允许的全部选项为:
DEBUG=(ON/OFF): compile with debugging symbols (default ON in svn trunk, OFF in releases)
PROFILE=(ON/OFF): compile with profiling symbols (default ON in svn trunk, OFF in releases)
ARMA_EXTRA_DEBUG=(ON/OFF): compile with extra Armadillo debugging symbols (default OFF)
BUILD_TESTS=(ON/OFF): compile the mlpack_test program (default ON)
BUILD_CLI_EXECUTABLES=(ON/OFF): compile the mlpack command-line executables (i.e. mlpack_knn, mlpack_kfn, mlpack_logistic_regression, etc.) (default ON)
TEST_VERBOSE=(ON/OFF): run test cases in mlpack_test with verbose output (default OFF)
每个选项都可以被指定给带有‘-D’标记的CMake。其他工具也可以用于配置CMake,但是它们没有被记录在这里。
生成mlpack
一旦CMake配置好,生成库就像打出‘make’一样简单。这将生成所有库组件和‘mlpack_test’。
1.$ make
2.Scanning dependencies of target mlpack
3.[ 1%] Building CXX object
4.src/mlpack/CMakeFiles/mlpack.dir/core/optimizers/aug_lagrangian/aug_lagrangian_test_functions.cpp.o
如果你不想生成每一个库,可以指定你想生成的单个组件。
1.$ make mlpack_pca mlpack_knn mlpack_kfn
一个有趣的特殊组件是mlpack_test,它是运行mlpack的测试组件。你可以使用这个命令生成这个组件:
1.$ make mlpack_test
然后运行所有的测试组件或单个的测试组件:
1.$ bin/mlpack_test
2.$ bin/mlpack_test -t KNNTest
如果生成失败,而你不能找到为什么失败,在Github上注册一个账户,提交这个问题,mlpack的开发人员将会尽快帮你解决,
或者在irc.freenode.netm上的mlpack的IRC中也可以找到mlpack的帮助。
安装mlpack
如果你想将mlpack安装在/usr/include/mlpack/、/usr/lib/和/usr/bin/中,当它生成后,确保你有root权限(或向那两个目录的写入许可),然后简单的打出:
1.# make install
现在你可以通过名字运行可执行程序;你可以使用-lmlpack链接到mlpack,mlpack的头文件可以在目录/usr/include/mlpack/中找到。
示例
最近邻搜索是一个常见的机器学习任务。在这个背景下 ,我们有一个查询数据集和一个参考数据集。对于在查询数据集中的每个点,我们希望知道参考数据集中距离给定查询点最近的k个点。
或者,如果查询和参考数据集是相同的,问题可以更简单的说明:对于每个数据集中的点,我们希望知道距离那个点最近的k个点。
Mlpack提供:
一个简单的命令行程序包运行最近邻搜索(和最远邻搜索)。
一个简单的C++接口用于完成最近邻搜索(和最远邻搜索)。
一个通用的、可扩展的和强大的C++类(邻域搜索)用于复杂算法。
命令行‘mlpack_knn’
在mlpack中完成最近邻搜索最简单的方式是使用mlpack_knn程序包。这个程序将完成最近邻搜索,并将得到的邻近点放入一个文件,同时将对应的距离放入另一个文件。输出文件被整理为第一行对应第一个被查询点的最近邻点,第一列对应最近的点,以此类推。
还有几个简单用法的例子(和输出结果)。由于使用了选项‘-v’,因此输出是给定的。更多关于每个选项的文档可以通过这个语句找到。这里列举一个。
TraverserType策略类
邻域搜索NeighborSearch类提供的最后一个模板参数是TraverserType类。它具有的策略是在单一树或者双树搜索模式下遍历树。默认情况下,它被设置为使用指定TreeType(成员TreeType::DualTreeTraverser)的默认遍历器。
这个类必须实现下面两种方法:
1.// Instantiate with a given RuleType.
2.TraverserType(RuleType& rule);
3.
4..// Traverse with two trees.
5.void Traverse(TreeType& queryNode, TreeType& referenceNode);
RuleType类用在遍历器中时提供下面的功能:
1.// Evaluate the base case between two points.
2.double BaseCase(const size_t queryIndex, const size_t referenceIndex);
3.
4.// Score the two nodes to see if they can be pruned, returning DBL_MAX if they
5.// can be pruned.
6.double Score(TreeType& queryNode, TreeType& referenceNode);
注意任何指定的遍历器必须满足修剪双树遍历的定义,其在文章”Tree-independent dual-tree algorithms”中指定。
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