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清单文章

1

NC | 使用GraphST对空间转录组进行空间信息聚类、整合和去卷积

2

NC | Bulk2Space：以空间单细胞分辨率对RNA-seq数据进行从头分析

3

超详细 | 生物医学研究和临床应用中scRNA-seq的数据分析指南

4

空转应用篇 | 空间转录组学为肠道的理解增加了新维度

5

NC | Spatial-ID：通过迁移学习和空间嵌入进行空间高分辨转录组数据的细胞注释

6

空转工具盘点 | 空间转录组细胞类型聚类方法综合比较

7

Nat Biotechnol | SPOTS：一种允许在完整组织中大规模同时测量蛋白质标记物和全转录组的新方法

8

BASS：为单细胞分辨率的空间转录组学提供多尺度和多样本分析

9

热点综述 | scRNA-seq细胞类型鉴定方法综合比较

10

数据分析工具推荐 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多组学数据的交互式工具包

11

热点综述 | 空间多组学技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用

12

空转工具盘点 | 空间转录组细胞类型聚类方法综合比较

13

NC | Spatial-ID：通过迁移学习和空间嵌入进行空间高分辨转录组数据的细胞注释

14

BASS：为单细胞分辨率的空间转录组学提供多尺度和多样本分析

15

Nature子刊 | 空间转录组技术及其发展方向

16

Life Med综述 | 时空组学技术在病理应用中的革命性意义

17

EmAtlas：探索哺乳动物胚胎发育时空动态的综合图谱

18

BT × IT | DeepST：通过深度学习识别空间转录组学中的空间域

19

重磅发布 | 时空组学数据库STOmicsDB，“一站式”赋能时空组学研究！

20

Hist2ST：联合Transformer和图神经网络从组织学图像中进行空间转录组学预测

21

国产空转工具推荐 | STRIDE：使用scRNA-seq对空间转录组进行精准的整合分析

22

Science Advances：利用iSpatial对全基因组空间表达进行精确推断

23

NC：利用SpaceFlow分析组织中细胞的时空模式 | 空转工具推荐

24

前沿综述 | 空间转录组学入门指南

25

空转工具推荐 | 10款空间转录组去卷积工具的综合比较

26

CCST：基于图神经网络对空间转录组数据进行聚类分析

27

前沿综述 | Nature子刊：空间转录组学的临床和转化价值

28

时空组专辑数据库 | 小鼠器官发育时空转录图谱（MOSTA）成果登上Cell封面！

29

MEFISTO：从多模态数据中识别变异的时间和空间模式

30

Cell专题发表全球首批生命时空图谱，国家基因库发布时空组专辑数据库开启文献“可视化解读”新模式！

31

超全总结 | 用于空间分辨转录组数据分析的统计和机器学习方法

32

空间转录组实验篇 | 临床组织样本制备过程中哪些因素会影响空间转录组测序质量？

33

前沿综述 | 如何从空间转录组数据中分析空间变异基因？

34

VR-Cardiomics：一个沉浸式空间转录组分析系统

35

SpatialTE：从空间转录组数据集分析转座因子表达的工具 | 空间转录组分析工具推荐

36

DSTG：基于图形的卷积网络对空间转录组数据进行去卷积

37

BT × IT | 如何利用神经网络做空间转录组分析？

38

Baysor：在基于成像的空间转录组学中实现细胞分割

39

前沿Perspective | 空间转录组数据分析方法最新进展

40

CCDA-seq：一种单分子层级研究ecDNA染色质开放性的新技术

41

CoSTA：用于空间转录组分析的无监督卷积神经网络学习方法

42

盘点 | 空间转录组下游分析工具大PK，你在用哪个？

43

热点综述 | Nature Methods：利用空间组学和多路成像技术探索癌症生物学

44

热点综述 | Nature：利用空间转录组技术探索组织结构

45

stPlus：利用scRNA-seq数据中的信息精确增强空间转录组学分析

46

热点综述 | 单细胞+空间转录组的整合分析方法总结

47

JSTA：将空间转录组原始数据转换成单细胞水平空间表达谱的专用工具

48

stereoscope：利用scRNA-seq和空间转录组数据对细胞类型和空间分布进行概率推断

49

BayesSpace：实现更高分辨率的空间转录组分析

共 49 篇

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