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比对到hg19和hg38对somatic变异的寻找影响很大

4.5G Mar 29 07:26 T_marked_fixed.bam 其中B是正常组织的WES数据，使用varscan找somatic mutation的时候作为normal，然后对另外两个样本（D和T...了解hg19和hg38参考基因组异同需要知道hg38这个新版参考基因组到底进步在哪里。...，小写字母的文件是我比对到hg38后跑varscan得到的。...可以看到，如果是比对到hg38参考基因组的，那么找到的变异位点要稍微少一点点，不过我意识到参考基因组的有一些是非染色体的片段，所以我重新看了看染色体个数分布情况。...hg38 hg19 chr hg38 hg19 chr 10 18 1 8 16 1 8 12 2 8 14 2 5 9 3 4 7 3 7 20 4 8 22 4 6 7 5 6 9 5

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torch中的copy()和clone()

torch中的copy()和clone()1、torch中的copy()和clone()y = torch.Tensor(2,2):copy(x) --- 修改y并不改变原来的xy = x:clone(...) 修改y也不改变xy = x 修改y这个时候就开始改变x了注意，官网中Returns a clone of a tensor.

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git clone 指定分支和切换分支

git clone 指定分支：git clone -b 分支名称项目地址假设分支名称为test，则： git clone -b test 项目地址 git命令查看当前分支：git branch

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关于Cloneable接口和clone方法「建议收藏」

1、使用创建对象有两种方式: new 和 clone 当一个对象创建过程复杂，我们是否可以根据已有的对象直接来克隆一份，而不必关系创建的细节呢（原型模式）。...方法时，构造方法并没有被调用，所以我说创建一个对象new和clone是两条路 public static void main(String[] args) throws CloneNotSupportedException...} 打印: CloneModel{name=’null’, age=0} 2、重写clone方法原则 x.clone !...但建议这么做） 3、浅克隆和深克隆 3.1 默认clone方法时浅克隆 Object默认的clone方法实际是对域的简单拷贝，对于简单数据类型，是值的拷贝；对于复杂类型的字段，则是指针地址的拷贝，clone...后的对象和原对象指向的还是一个地址空间所以说默认的clone方法时浅克隆。

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Copy.deepcopy()和Pytorch中的clone()

在Python中可以使用copy.deepcopy()和还有Pytorch的clone()来进行复制。在本文中，我们将介绍这两种复制方法及其应用程序的细微差别、性能问题以及如何选择适当方法。...使用 clone() 方法可以创建一个不再与原始计算图相关联的新张量，使我们能够执行自由操作。 clone()是专门为PyTorch张量和对象设计的。...它确保在创建张量的独立实例时共享张量内存，从而允许高效的计算和内存利用。clone()是PyTorch针对张量操作优化的，避免了冗余的内存分配和复制操作。...这表明clone()方法在共享底层内存的同时创建了顶级对象(张量)的独立副本。clone()可以应用于各种PyTorch对象，包括张量、模型和其他复杂结构。...总结 deepcopy和clone都可以可以创建一个独立的副本，那么该如何选择呢？

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Java中clone( )和new效率哪个更高？

何为clone（）？ clone（）和new那个更快？...是从文件中还原类的对象也不会调用构造函数何为clone（）？...clone（）和new那个更快？利用clone，在内存中进行数据块的拷贝，复制已有的对象，也是生成对象的一种方式。...还有值得一提的是在执行clone操作的时候，不会调用构造函数。还有clone操作还会面临深拷贝和浅拷贝的问题。关于这方面的问题，网上有很多的相关知识了，不再累述了。...，其他对象可以使用clone。

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git的pull和fetch区别_git pull和git clone

git fetch和git pull都可以将远端仓库更新至本地那么他们之间有何区别?想要弄清楚这个问题有有几个概念不得不提。...在不指定分支时通常默认为master （3）git fetch origin dev 指定远程remote和FETCH_HEAD，并且只拉取该分支的提交。...所以可以认为git pull是git fetch和git merge两个步骤的结合。

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Git教程 git pull 和 git clone的区别

网上看好多人解释pull和clone的区别，说什么pull是更新本地代码，clone是本地从无到有的过程，但有一点没提到，恰好我今天又犯了这个问题，因为我原来都是直接从远程仓库pull，今天突然发现发现...pull不能用，clone才生效，我才意识到这个问题。...所以得用git clone 2 git clone git clone适用于本地没有代码，你要下载。你连不连接远程仓库都可以，有无仓库权限皆可。...接上边的说，意识到使用git clone之后，我删除了刚才的HTTPS连接远程仓库，然后直接git clone，代码成功下载下来了。...我删除了上边的https连接远程仓库的方法 git remote -v用于查看你本地仓库都连接了哪些远程仓库，如果连接了会显示仓库代号和连接方式，我这里输出空白，就是没连接任何远程仓库的状态 git clone

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Rust中move、copy、clone、drop和闭包捕获

本文中的变量，指的是通过如下代码定义的常量a和变量b。实例指的是绑定到a的i32类型在stack内存的数据，和绑定到b变量的String类型在stack内存和heap内存中的数据。...clone语义 move和copy语义都是隐式的，clone需要显式的调用。...自定义类型实现Copy和Clone trait Clone trait，对于任何自定义类型都可以实现。...S2中也包含了E1类型，E1类型没有实现Clone和Copy trait，但是我们可以自己实现S2类型的Clone trait，在Clone::clone方法中生成新的E1实例，这就可以clone出新的...("moto", &s); } 最后总结 move、copy、clone、drop和闭包捕获是rust中基本的概念，代码过程中随时要清楚每个变量的变化。

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Linux内核14-clone()、fork()和vfork()的区别

其余的3个字节是一组标志，如下表所示：名称描述CLONE_VM共享内存描述符和所有的页表CLONE_FS共享文件系统CLONE_FILES共享打开的文件CLONE_SIGHAND共享信号处理函数，阻塞和挂起的信号等...sys_clone()系统调用没有参数fn和arg。事实上，clone()把fn函数的指针保存到子进程的栈中return地址处，指针arg紧随其后。...父进程和子进程暂时共享相同的用户态堆栈。然后采用写时复制技术，不管是父进程还是子进程，在尝试修改堆栈时，立即获得刚才共享的用户态堆栈的一个副本。也就是成为了一个单独的进程。...总结 clone、vfork和fork是根据不同的需求而开发的。 clone 参数比较多，可以实现的控制就比较多，clone的设计初衷是给pthread线程库的开发提供支持的。...clone、vfork和fork在内核层都是调用的_do_fork()这个函数。

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Git知识总览(一) 从 git clone 和 git status 谈起

不过还是要聊一下集中版本控制系统和分布式版本控制的区别。...第一步要做的就是将远程仓库中的代码克隆到本地，git clone 命令做的就是这件事情。其后边跟的参数就是上述截图中的地址，其具体操作如下所示： ?...在第一部分我们就先简单的看一下 git clone 的演示操作。...首先使用了git clone 命令将远端的代码以及相关分支信息clone到本地，然后在本地进行了一次提交（git commit）, 最后将提交push到远端。...下方是git push操作的相关内容，我本地是配了github的ssh-key的，不过之前clone的时候使用的是https的方式，需要在第一次PUSH的时候都要求输入用户名和密码。

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Linux命令行终端优化与使用

$ bash-it disable alias hg [tmux]......-1575613390 in ~ ○ → bash-it search git aliases: git gitsvn plugins: autojump git git-subrepo...git-subrepo jgitflow jump #本例中的gitsvn、jgitflow、git_flow 也一并启用了 # completions: git git_flow git_flow_avh...自定义定制描述:Bash-it 的确为我们提供了不少好用的别名、自动补全和插件,我们可以对其进行定制的机制,可以定制的内容包括别名、自动补全、插件、主题样式等等路径和名称如下: • aliases...git clone https://github.com/powerline/fonts.git --depth=1 # install cd fonts .

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Linux命令行终端优化与使用

$ bash-it disable alias hg [tmux]......-1575613390 in ~ ○ → bash-it search git aliases: git gitsvn plugins: autojump git git-subrepo...git-subrepo jgitflow jump #本例中的gitsvn、jgitflow、git_flow 也一并启用了 # completions: git git_flow git_flow_avh...自定义定制描述:Bash-it 的确为我们提供了不少好用的别名、自动补全和插件,我们可以对其进行定制的机制,可以定制的内容包括别名、自动补全、插件、主题样式等等路径和名称如下: • aliases...clone https://github.com/powerline/fonts.git --depth=1 # install cd fonts .

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Git知识总览(一) 从 git clone 和 git status 谈起「建议收藏」

第一步要做的就是将远程仓库中的代码克隆到本地，git clone 命令做的就是这件事情。...其后边跟的参数就是上述截图中的地址，其具体操作如下所示：在第一部分我们就先简单的看一下 git clone 的演示操作。...首先使用了git clone 命令将远端的代码以及相关分支信息clone到本地，然后在本地进行了一次提交（git commit）, 最后将提交push到远端。...5、git push 下方是git push操作的相关内容，我本地是配了github的ssh-key的，不过之前clone的时候使用的是https的方式，需要在第一次PUSH的时候都要求输入用户名和密码...git commit -a : 对那些被修改的文件单尚未暂存和提交的文件进行暂存和提交。注意：对未暂存的新增文件无效。

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wintel&mac的不同感受

该篇总结下这些年同时使用windows+intel（本文简称wintel）和mac电脑的明显的不同感受先说个人结论：若是用于IntelliJ全家桶从事软件开发，remote ssh服务器，mac是最好选择...毕竟在软件覆盖面，人工智能和游戏需要的GPU算力方面，需要大内存的工作等领域mac还是较弱。...性能从12代酷睿开始wintel的cpu性能全面超越 m1/m1 pro/m2 性价比 mac笔记本2万元以下相对同配置的wintel略贵，2万以上的型号性价比差很多；mac studio 2万以下的和PC...git使用有个巨坑的地方：git仓库的超链接文件clone下来，本应该是链接文件的，缺变成了链接对象的复制文件。解决方法是：安装git的时候，要选中下面的选项，默认是不选的。...git clone时候要加个参数-c core.symlinks=true git clone -c core.symlinks=true

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版本管理工具Mercurial HG实用教程

克隆到本地 hg clone http://server:8000/xxx # 会自动创建xxx目录也可以先建文夹，再克隆到当前目录 mkdir xxx cd xxx hg clone http...# 克隆到当前文件夹，不会创建xxx目录 Tips 克隆后切换到指定分支(默认是default分支): hg clone http://server:8000/xxx xxx cd xxx hg branches...建立本地仓库 hg init 3. 添加、删除、重命名文件 hg add xxx.v hg remove xxx.v hg rename xxx.v yyy.v 4....merge和push前应仔细确认文件合并是否有问题。 12....三、.hgignore的写法有glob和regexp两种： syntax: glob *.mr INCA_libs syntax: regexp # 即python的正则语法 ^.*\.mr$

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Linux中fork，vfork和clone详解（区别与联系）include #include #include #include

子进程复制了父进程的task_struct，系统堆栈空间和页面表，这意味着上面的程序，我们没有执行count++前，其实子进程和父进程的count指向的是同一块内存。...这种思想相当简单：父进程和子进程共享页帧而不是复制页帧。然而，只要页帧被共享，它们就不能被修改，即页帧被保护。...当需要改变共享数据段中变量的值，则拷贝父进程 vfork用于创建一个新进程，而该新进程的目的是exec一个新进程，vfork和fork一样都创建一个子进程，但是它并不将父进程的地址空间完全复制到子进程中...clone可以让你有选择性的继承父进程的资源，你可以选择想vfork一样和父进程共享一个虚存空间，从而使创造的是线程，你也可以不和父进程共享，你甚至可以选择创造出来的进程和父进程不再是父子关系，而是兄弟关系...CLONE_VFORK 父进程被挂起，直至子进程释放虚拟内存资源 CLONE_VM 子进程与父进程运行于相同的内存空间 CLONE_PID 子进程在创建时PID与父进程一致 CLONE_THREAD

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告别Hugging Face模型下载难题：掌握高效下载策略，畅享无缝开发体验

Qwen2-7B-Instruct模型为例，模型地址：https://huggingface.co/Qwen/Qwen2-7B-Instruct，运行以下命令可以添加 --local-dir-use-symlinks...False 参数禁用文件软链接，这样下载路径下所见即所得 #以下命令都可 huggingface-cli download --resume-download --local-dir-use-symlinks...hfd 是基于 Git 和 aria2 实现的专用于huggingface 下载的命令行脚本： hfd.sh（Gitst链接）。...具体步骤： Step1：Git clone 项目仓库中lfs文件之外的所有文件，并自动获取 lfs 文件的 url； Step2：利用 aria2 多线程下载文件。...Q2:不推荐 Git clone原因此外官方还提供了 git clone repo_url 的方式下载，这种方法相当简单，然而却是最不推荐直接用的方法，缺点有二：不支持断点续传，断了重头再来； clone

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mac 安装TortoiseHg

Install TortoiseHg Clone TortoiseHg repository using Mercurial: $ hg clone http://bitbucket.org/tortoisehg.../thg/ ~/Tools/TortoiseHg $ cd ~/Tools/TortoiseHg/ $ hg update stable Quick test....Install TortoiseHg Mac App Clone thg-mac-app repository $ hg clone https://bitbucket.org/skrysmanski/

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实战 | 如何愉快地学习“狗”语言？

Windows和MacOS系统会自动配置环境变量和GOPATH。如果是Linux系统，需要配置环境变量。有更多安装问题可阅读安装说明或者菜鸟教程。 ?...首先下载gotour的源代码，需要去官网安装hg（好狗） hg地址：https://mercurial.selenic.com/wiki/Download 2....安装完hg，clone代码到$GOPATH/src/bitbucket.org/mikespook/目录下（目录不存在则手动创建）： # 进入目录 cd $GOPATH/src/bitbucket.org.../mikespook # 下载gotour源码 hg clone https://bitbucket.org/mikespook/go-tour-zh 注意，此处的$GOPATH是go env中GOPATH...包 git clone https://github.com/golang/net.git git clone https://github.com/golang/tools.git 未安装git的同学

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比对到hg19和hg38对somatic变异的寻找影响很大

torch中的copy()和clone()

git clone 指定分支和切换分支

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Copy.deepcopy()和Pytorch中的clone()

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git的pull和fetch区别_git pull和git clone

Git教程 git pull 和 git clone的区别

Rust中move、copy、clone、drop和闭包捕获

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Linux命令行终端优化与使用

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