前面我们对slurm作业调度系统进行了一个简单的介绍【科研利器】slurm作业调度系统（一），今天我们继续对如何用slurm提交批处理任务以及使用 sinfo、squeue、scontrol命令查询作业信息进行具体的介绍...在其默认的输出中，partition 表示分区名、avail 表示分区状态(up 可用，down 不可用)，timelimit 表示分区可供最大运行时长，nodes 表示节点数，state 表示节点运行状态...； -r # 只显示响应的节点； -R # 显示节点不正常工作的原因； 2 编写slurm脚本 在slurm作业调度系统下，主要支持两种作业形式：提交交互式任务和提交批处理任务。...test.out #SBATCH -e test.error # 指定作业标准错误输出文件的名称为test.error #SBATCH -p gpu...作业运行完成)，F-FAILED作业运行失败，NF-NODE_FAIL节点问题导致作业运行失败，PR作业被抢占，S作业被挂起，TO作业超时被杀。
srun、批处理式sbatch或分配式salloc等命令提交，提交后可以利用相关命令查询作业状态等，Slurm 会为任务队列合理地分配资源，并监视作业至其完成。...交互式作业提交（采用srun命令提交）： 资源分配与任务加载两步均通过srun命令进行： 当在登录shell中执行srun命令时， srun首先向系统提交作业请求并等待资源分配，然后在所分配的节点上加载作业...批处理作业（采用sbatch命令提交，最常用方式）： 对于批处理作业（提交后立即返回该命令行终端，用户可进行其它操作） 使用sbatch命令提交作业脚本，作业被调度运行后，在所分配的首个节点上执行作业脚本...实时分配模式作业（采用salloc命令提交）： 分配作业模式类似于交互式作业模式和批处理作业模式的融合。 用户需指定所需要的资源条件，向资源管理器提出作业的资源分配请求。...提交后，作业处于排队， 当用户请求资源被满足时，将在用户提交作业的节点上执行用户所指定的命令， 指定的命令执行结束后，运行结束，用户申请的资源被释放。
cpu核，可理解为作业所需的cpu核数 socket：cpu插槽，可理解为物理cpu颗数 stdout：标准输出文件，程序运行正常时输出信息的文件，一般指输出到屏幕的信息 stderr：标准错误文件，程序运行出错时输出信息的文件...，一般指输出到屏幕的信息 命令 sbatch：提交作业脚本。...CG：完成中，COMPLETIONG F：已失败，FAILED TO：超时，TIMEOUT NF：节点失效，NODE FAILURE CD：已完成，COMPLETED 作业信息查看 image.png...批处理模式提交作业 1.用户编写作业脚本 2.提交作业 3.作业排队等待资源分配 4.在首节点加载执行作业脚本 5.脚本执行结束，释放资源 6.用户在输出文件中查看运行结果 ?...开头，指定解释程序 脚本中可通过srun加载计算任务 一个作业可包含多个作业步 脚本在管理节点上提交，实际在计算节点上执行 脚本输出写到输出文件中 以下是一些常见的作业资源需求参数，使用#SBATCH
命令 command Description sbatch 向 SLURM 提交批处理脚本 squeue 列出当前正在运行或在队列中的所有作业 scancel 取消提交的工作 sinfo 检查所有分区中节点的可用性...scontrol 查看特定节点的配置或有关作业的信息 sacct 显示所有作业的数据 salloc 预留交互节点 3.1. squeue 第一个 SLURM 命令是 squeue。...的名称 USER 提交作业的用户名 ST 作业状态，running(R), PenDing(PD) NODES 请求的节点数 NODELIST(REASON) 作业在哪个节点上运行（或未运行的原因）...3.3. sbatch sbatch 命令是最重要的命令，用于向超级计算集群提交作业。作业是在计算资源上运行的脚本。该脚本包含您要在超级计算节点上运行的命令。...节点数 所需的处理器或作业数量 要使用的分区/队列类型（可选） 内存要求（可选） 想要运行作业的时间长度（每个分区都有一个默认值） 在哪里写入输出和错误文件 在 HPC 上运行时的作业名称 获取工作状态的电子邮件
3 一个案例 在这里，我们先给出一个使用slurm作业系统最常用的方式：提交 SLURM 作业脚本的批处理方式。至于slurm的具体使用及参数介绍，我们会在后面另推出文章进行讲解。.../bin/bash #SBATCH -J test # 作业名是 test #SBATCH -p cpu # 提交到 cpu分区 #SBATCH -N...之后有 # 开头的若干行表示 SLURM 作业的设置区域，它告诉工作站运行任务的详细设定：它被提交到 cpu 分区当中，申请 1 个节点的 1 个 核心，限制任务最大运行时间是五分钟，将标准输出和标准错误放在...在准备好slurm脚本后，使用如下命令就可以将刚才的任务提交上去，这里 sbatch 是提交 SLURM 脚本的命令。 如果工作站有空闲资源，那么我的程序将会被放在某一个节点的某 一个核心上运行。...系统默认会将标准输出文件和标准错误文件复制到调用 sbatch 的目录下。默认的文件名是 slurm-.out，其中 JOBID 是作业号。
Slurm是一个开源，容错，高度可扩展的集群管理和作业调度系统，适用于大型和小型Linux集群。...主要有三个功能： 它在一段时间内为用户分配对资源（计算节点）的独占和/或非独占访问，以便他们可以执行工作。 它提供了一个框架，用于在分配的节点集上启动，执行和监视工作（通常是并行作业）。.../bin/bash #SBATCH -n 8 # 核心数 #SBATCH -N 1 # 节点数 #SBATCH -t 12:00:00 # 时间 #SBATCH --mem=10G # 内存 #SBATCH...--partition=12hours #SBATCH -e err.log # 错误输出 #SBATCH -o out.log # 输出 #SBATCH --job-name=test # 任务名..." 2.提交 sbatch sbatch test.sh 3.查看任务 squeue 类似于top命令。
前言 在实际的生产环境中，使用单用户模式直接运行命令的机会不是很多，通常是采用提交作业任务给集群计算的方式。...PBS 简介 PBS （Protable Batch System） 作业管理系统会根据一个集群上的可用计算节点的计算资源管理和调度所有计算作业（无论是批处理作业还是交互式作业）。...Slurm 常用命令 下面是一些最常用的 SLURM 命令： sacct：查看历史作业信息 salloc：分配资源 sbatch：提交批处理作业 scancel：取消作业 scontrol：系统控制 sinfo...交互模式，以 srun 命令运行； 批处理模式，以 sbatch 命令运行； 分配模式，以 salloc 命令运行。 .../etc/slurm-llnl/slurm.conf，本配置文件配置控制节点的主机名为 workq（可根据实际进行修改，如与实际不一致 Slurm 主服务会启动不了），配置单用户可提交多个任务同时进行
而超算上的计算资源却是有限的。所以当作业被提交以后，其能否运行会取决于用户申请的资源配置情况以及当前系统内计算资源被使用的情况。...is not available A：报错显示你所申请资源的节点配置不匹配，如该分区中每个节点只有32个核心，但是你在脚本中申请的单节点核心数超过32，就会报这个错误。...所以仔细检查你的作业脚本，尤其是节点数、核心数、进程数之间的配置是否一致。 (5) Q：提交任务后报错 QOS Not Allowed A：报错显示没有指定正确的qos。...如果出现该错误的，通常都是账户里面没钱啦。当然，也有可能是账户被超算管理员封锁了。 (7) Q：我的任务只需要20G的内存，在作业脚本中我申请了一个128G的节点，但是还是报错说内存不足。...所以出现这个报错的时候，可以去作业脚本里面指定 #SBATCH --cpu-per-task 参数解决。
Spark应用程序，伴随应用程序启动的同时Spark会在当前终端启动REPL（Read–Eval–Print Loop）来接收用户的代码输入，并将其编译成Spark作业提交到集群上去执行；二是批处理，批处理的程序逻辑由用户实现并编译打包成...由于所有的Spark进程都是在Gateway节点上启动的，这势必会增加Gateway节点的资源使用负担和故障发生的可能性，同时Gateway节点的故障会带来单点问题，造成Spark程序的失败。...它提供了以下这些基本功能： 提交Scala、Python或是R代码片段到远端的Spark集群上执行； 提交Java、Scala、Python所编写的Spark作业到远端的Spark集群上执行； 提交批处理应用在集群中运行...在Livy服务端配置Spnego认证后，用户发起Http请求之前必须先获得Kerberos认证，只有通过认证后才能正确访问Livy服务端，不然的话Livy服务端会返回401错误。...为了使用该特性我们需要配置Livy使其开启此功能： ? 失败恢复能够有效地避免因Livy服务端单点故障造成的所有会话的不可用，同时也避免了因Livy服务端重启而造成的会话不必要失效。
框架还为Step提供了重启、事务、重启次数、并发数；以及提交间隔、异常跳过、重试、完成策略等能力。基于Step的灵活配置，可以完成常见的业务功能需求。...如下是一个声明事务的示例： 框架对于事务的支持能力包括： Chunk支持事务管理，通过commit-interval设置每次提交的记录数； 支持对每个Tasklet设置细粒度的事务配置：隔离界别、传播行为...实现作业的健壮性与扩展性 批处理要求Job必须有较强的健壮性，通常Job是批量处理数据、无人值守的，这要求在Job执行期间能够应对各种发生的异常、错误，并对Job执行进行有效的跟踪。...并行Step提供了在一个节点上横向处理，但随着作业处理量的增加，有可能一台节点无法满足Job的处理，此时我们可以采用远程Step的方式将多个机器节点组合起来完成一个Job的处理。...基于SI实现Remote Chunking模式的示例： Step本地节点负责读取数据，并通过MessagingGateway将请求发送到远程Step上；远程Step提供了队列的监听器，当请求队列中有消息时候获取请求信息并交给
框架还为Step提供了重启、事务、重启次数、并发数；以及提交间隔、异常跳过、重试、完成策略等能力。基于Step的灵活配置，可以完成常见的业务功能需求。...框架对于事务的支持能力包括： Chunk支持事务管理，通过commit-interval设置每次提交的记录数； 支持对每个Tasklet设置细粒度的事务配置：隔离界别、传播行为、超时； 支持rollback...实现作业的健壮性与扩展性 批处理要求Job必须有较强的健壮性，通常Job是批量处理数据、无人值守的，这要求在Job执行期间能够应对各种发生的异常、错误，并对Job执行进行有效的跟踪。...并行Step提供了在一个节点上横向处理，但随着作业处理量的增加，有可能一台节点无法满足Job的处理，此时我们可以采用远程Step的方式将多个机器节点组合起来完成一个Job的处理。...Step本地节点负责读取数据，并通过MessagingGateway将请求发送到远程Step上；远程Step提供了队列的监听器，当请求队列中有消息时候获取请求信息并交给ChunkHander负责处理。
，所以每节点的任务最好设置为24 yhbatch(sbatch): 批处理作业提交 后台提交任务，功能与yhrun相同，命令yhbatch -N 1 -n 1 -c 24 job.sh yhcancel...(scancel): 取消已提交的作业 命令用法yhcancel JOBID yhacct(sacct) 查看历史作业信息 yhacct -u pp100 -S 03/01/17 -E 03/31/17...JOBID: 取消已提交的作业 福建省超算中心曙光集群 福建省超算中心曙光集群普通计算节点配备 2颗 Intel(R) Xeon(R) Gold 6132 CPU @ 2.60GHz 共28物理核，内存为...: 提交作业 job.pbs中填写提交参数与执行程序，参数格式为 #PBS -q queue qstat： 查看已提交作业 可通过-u 参数指定用户名进行只查看自己的任务 qdel JOBID： 取消已投递作业...qconf -sql： 显示队列 qconf -sq QUEUE: 显示指定队列信息 qhost： 查看计算节点使用情况 qsub： 提交作业 qstat：查看已提交作业 qdel JOBID： 取消已提交作业
上一期我们给出了一些在slurm作业系统中常见的报错提示的含义及解决方法。今天我们主要来看看如何在超算中配置运行环境。”...但超算上的用户之多，我们在进行自己的作业任务时，难免会用到超算上没有具备的环境，又或者当前超算上的软件版本已经老旧，不适合我们的任务了。这时候我们便会用到本文所将介绍的内容，配置任务的运行环境。...2 查看超算中可用的的module 在我们运行一个作业任务之前，首先需要查看任务中用到的软件所需要的运行环境是否满足，否则可能无法使用该软件或者使用错误的版本。...那我们通过 slurm 脚本提交任务时，会分配到不同的计算节点上，并非我们的个人账户所在的节点。.../bin/bash #SBATCH -J test #SBATCH -p cpu #SBATCH -t 5:00 module load netcdf/4.5.6 .
slurmdbd直接通信，默认端口为6819，下面的命令从slurmdbd获取信息： sacct sacctmgr sreport 当用户使用srun启动一个作业时，必须有一个从调用srun的机器到作业分配的节点的通信路径...srun向slurmctld发送作业分配请求 slurmctld批准分配并返回详细信息 srun向slurmctld发送步骤创建请求 slurmctld用步骤凭证进行响应 srun为I/O打开套接字 srun...，并为下一个作业释放资源 图片 与多个控制器的通信 你可以配置一个次要的slurmctld和/或slurmdbd，作为主控制器发生故障时的后备。...图片 与多个集群的通信 在多个slurmctld实例共享同一个slurmdbd的环境中，你可以将每个集群配置成独立的，并允许用户指定一个集群来提交他们的作业。...在这个模式下，所有的东西都必须有一个有效的IPv6地址，否则连接会失败。 slurmctld希望一个节点能映射到一个IP地址（这将是用getaddrinfo()查找节点的IP时返回的第一个地址）。
如支付失败，用户立马感知，投诉或电话客服，该模块也包含退款业务 任务作业：将处理中的交易进行状态同步，和核心交易通过MQ解耦 查询服务：仅对公司内部提供一个交易状态查询功能 3.5 任务作业 内部查询策略设计为两个队列...这里的"等待一些时间"就可能采取"2的N次方"的间隔策略。如第一次查询失败后，系统会等待2^1（也就是2）秒再查询一次，如果还是失败，那就等待2^2（也就是4）秒后再次查询，以此类推。...数据分片：订单号取模存储（zset） 3.7 数据结构 有序集合（zset）：按分片逻辑，将订单号取模，存放至对应队列 string：交易明细序列化存储 设计思路 MQ 消费者（作业节点），接收到消息后...，将数据存入缓存 作业节点根据分片项、score 范围，定时从对应的缓存队列中获取指定数量的订单号 业务循环处理，根据订单号再去缓存中获取对应的详细信息 执行查询逻辑 zset元素数据过期，需业务自己处理...通过 Hystrix 命令模式，将每个类型的业务请求封装成对应的命令请求。每个命令请求对应一个线程池，创建好的线程池是被放入到 ConcurrentHashMap 中。
合适的重启策略可以减少作业不可用时间和避免人工介入处理故障的运维成本，因此对于 Flink 作业稳定性来说有着举足轻重的作用。下文就将详细解读 Flink 的错误恢复机制。...作业执行容错 众所周知，用户使用 Flink 编程 API（DataStream/DataSet/Table/SQL）编写的作业最终会被翻译为 JobGraph 对象再提交给 JobManager 去执行...对于分布式系统来说，通常单个 Task 错误的处理方式是将这个 Task 重新调度至新的 worker 上，不影响其他 Task 和整体 Job 的运行，然而这个方式对于流处理的 Flink 来说并不可用...Spark 可以独立地恢复一个 Task，很大程度上是因为它的批处理特性，这允许了作业通过缓存中间计算结果来解耦上下游 Task 的联系。而 Flink 作为流计算引擎，显然是无法简单做到这点的。...TaskManager 上运行的所有 Tasks 标记为失败，从而触发 Flink 作业执行的容错机制以恢复作业。
，HistoryServer 会删除缓存的存档 [ FLINK-20195 ] - Jobs 端点返回重复的作业 [ FLINK-20370 ] - sink 主键与查询不同时结果错误 [ FLINK-...为 Window TVF 生成无效的 Calc [ FLINK-24232 ] - 暂停作业的存档可防止中断后续存档尝试 [ FLINK-24255 ] - 测试环境/迷你集群不转发配置。...24334 ] - 配置 kubernetes.flink.log.dir 不起作用 [ FLINK-24366 ] - 当任务已被取消时，有关还原失败的不必要/误导性错误消息。...REST API 提交作业时，JM 上的 ThreadLocals 的 ClassLoader 泄漏 [ FLINK-25067 ] - 更正 RocksDB 后台线程的描述 [ FLINK-25084...] - 为读者注册和拆分请求添加日志消息。
若false，可用commitAsync异步提交偏移量，防同步提交偏移量失败而一直阻塞。如发出请求用于提交偏移量20，发生通信问题，服务器收不到请求，不会作出响应。...ISR里的副本少于配置数时，调用会报错误。...全同步 AP配置，保证可用性，满足AP。写入一条数据，主节点提交后就返回ack；若主节点在数据同步到从节点前就宕机，重新选举后，消费端就读不到这条数据。这种配置，保证了可用性，但是损失了一致性读。...异步 介于AP和CP间的配置，损失了一定的一致性读和可用性。这种配置可以容忍一个节点(包括主节点)宕机的情况下，任然保证数据强一致性读和整体可用性；但有两个节点宕机的情况，就整体不可用了。...注意：只能在访问失败的这层服务进行重试，最终失败的话要返回无须重试错误码，避免级联重试风暴。不建议写操作做重试(数据重复)，若要做，业务方要做好幂等操作。
这个锁服务将会跟踪数据库的锁（例如在一个专用的数据库表（db-table）中存储必要的信息），然后在应用程序请求数据库操作时授予权限或拒绝。...批量处理作业窗口中的常规处理 针对运行在一个单独批处理窗口中的简单批量处理，更新的数据对在线用户或其他批处理来说并没有实时性要求，也没有并发问题，在批处理运行完成后执行单次提交即可。...如果没有合适的锁定策略，系统仍然依赖于一个单一的提交点，则修改批处理程序会是一件痛苦的事情。 因此，即使是最简单的批处理系统，也应该为重启-恢复（restart-recovery）选项考虑提交逻辑。...还应该每处理一批事务就提交一次数据库。这减少了其他程序不可用的数据数据量，也压缩了数据不可用的时间。 另一个可以使用的方案就是使用逻辑行基本的锁定实现来替代物理锁定。...另外分区号必须在整个处理过程中用来： 为了使合并程序正常工作，需要将分区号添加到输出文件/数据库更新 向框架的错误处理程序报告正常处理批处理日志和执行期间发生的所有错误 死锁最小化 当程序并行或分区运行时
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