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    单细胞转录组高级分析二:转录调控网络分析

    组织内细胞异质性的基础是细胞转录状态的差异,转录状态的特异性又是由转录因子主导的基因调控网络(GRNs)决定并维持稳定的。因此分析单细胞的GRNs有助于深入挖掘细胞异质性背后的生物学意义,并为疾病的诊断、治疗以及发育分化的研究提供有价值的线索。然而单细胞转录组数据具有背景噪音高、基因检出率低和表达矩阵稀疏性的特点,给传统统计学和生物信息学方法推断高质量的GRNs带来了挑战。Single-cell regulatory network inference and clustering (SCENIC)是一种专为单细胞数据开发的GRNs算法,它的创新之处在于引入了转录因子motif序列验证统计学方法推断的基因共表达网络,从而识别高可靠性的由转录因子主导的GRNs。SCENIC相关的文章2017年首先发表于nature methods,2020年又将流程整理后发表于nature protocls。需要深入了解分析原理和流程的朋友可以参考这两篇文章:

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    MySQL · 引擎特性 · MySQL内核对读写分离的支持

    读写分离的场景应用 随着业务增长,数据越来越大,用户对数据的读取需求也随之越来越多,比如各种AP操作,都需要把数据从数据库中读取出来,用户可以通过开通多个只读实例,将读请求业务直接连接到只读实例上。使用RDS云数据库的读写分离功能,用户只需要一个请求地址,业务不需要做任何修改,由RDS自带的读写分离中间件服务来完成读写请求的路由及根据不同的只读实例规格进行不同的负载均衡,同时当只读实例出现故障时能够主动摘除,减少对用户的影响。对用户达到一键开通,一个地址,快速使用。 MySQL内核为读写分离的实现提供了支持,包括通过系统variable设置目标节点,session或者是事务的只读属性,等待/检查指定的事务是否已经apply到只读节点上,以及事务状态的实时动态跟踪等的能力。本文会带领大家一起来看看这些特征。说明一下,本文的内容基于RDS MySQL 5.6与RDS MySQL 5.7。

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