HDF也是一种自描述格式文件，主要用于存储和分发科学数据。气象领域中卫星数据经常使用此格式，比如MODIS，OMI，LIS/OTD等卫星产品。对HDF格式细节感兴趣的可以Google了解一下。...这一次呢还是以Python为主，来介绍如何处理HDF格式数据。...Python中有不少库都可以用来处理HDF格式数据，比如h5py可以处理HDF5格式(pandas中 read_hdf 函数)，pyhdf可以用来处理HDF4格式。...此外，gdal也可以处理HDF(NetCDF，GRIB等)格式数据。...某月全球闪电密度分布 上述示例基于pyhdf进行HDF4格式数据处理和可视化，HDF4文件中包含的变量和属性获取方式见文末的Notebook，其中给出了更详细的示例。
HDF5 读取 pd.read_hdf('foo.h5', 'df') 写入 df.to_hdf('foo.h5', 'df') 3....Series Series是一维标记数组，可以存储任意数据类型，如整型、字符串、浮点型和Python对象等，轴标一般指索引。...创建Series的方法为 >>>s=Series(data, index=index) data可以是Python词典、ndarray和标量值。 2.
今天在执行一个用到hdf5的python脚本时，遇到如下错误 Warning!...***HDF5 library version mismatched error*** The HDF5 header files used to compile this application...do not match the version used by the HDF5 library to which this application is linked....version of static or shared HDF5 library....Headers are 1.8.11, library is 1.8.9 SUMMARY OF THE HDF5 CONFIGURATION ==
通过查看FindHDF5.cmake的源码可以知道，可以通过定义HDF5_ROOT环境变量，来指定要使用的HDF5位置。...(HDF5)时cmake自做聪明的找到系统安装的版本。...@FindHDF5.cmake 然而理想很丰满，现实很骨感，当我使用HDF5_ROOT来指定HDF5安装位置时，cmake在执行find_package(HDF5)却并没有找到我编译的版本，还是找到了.../usr下安装的版本，调用代码下如： export HDF5_ROOT=$hdf5_install_folder cmake ....Used only to detect HDF5 compile flags." ) 上面的代码中，通过ENV HDF5_ROOT这样的写法来引用一个环境变量，这显然是错误的。
install hdf5 on ubuntu 12.04 you can probably install the debian libraries into quantal with no issues...Code: $apt-get install devscripts equivs ubuntu-dev-tools $pull-debian-source hdf5 experimental...$cd hdf5-* $sudo mk-build-deps -ir $debuild -us -uc 上述方法现在已经不适用,Google后发现,可以直接使用hdf5...二进制包,由于本机为64bit linux,下载64位下的二进制包： $wget http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8.9/bin...:/usr/local/lib:$HOME/hdf5-1.8.9-linux-x86_64-shared/lib $export HDF5_DIR=$HOME/hdf5-1.8.9-linux-x86
python如何查看hdf5文件 说明 1、hdf5不支持用其他浏览器打开，建议写一个代码来进行读取。 2、读取HDF5文件中的所有数据集，然后传输到路径。...实例 # 读取HDF5文件中的所有数据集 def traverse_datasets(hdf_file): import h5py def h5py_dataset_iterator...print(path, dset) return None # 传入路径即可 traverse_datasets('datasets/train_catvnoncat.h5') 以上就是python...查看hdf5文件的方法，希望对大家有所帮助。...更多Python学习指路：python基础教程 本文教程操作环境：windows7系统、Python 3.9.1，DELL G3电脑。 收藏 | 0点赞 | 0打赏
参考链接： 数据科学用Python 原文链接：https://blog.csdn.net/Fairy_Nan/article/details/105914203 HDF也是一种自描述格式文件，主要用于存储和分发科学数据...对HDF格式细节感兴趣的可以Google了解一下。 这一次呢还是以Python为主，来介绍如何处理HDF格式数据。...Python中有不少库都可以用来处理HDF格式数据，比如h5py可以处理HDF5格式(pandas中 read_hdf 函数)，pyhdf可以用来处理HDF4格式。...此外，gdal也可以处理HDF(NetCDF，GRIB等)格式数据。 ...格式数据处理和可视化，HDF4文件中包含的变量和属性获取方式见文末的Notebook，其中给出了 更详细的示例。
本文详细介绍基于Python语言gdal等模块实现多波段HDF栅格图像文件（即.hdf文件）的读取、处理与像元值可视化等操作。...此外，基于gdal等模块读取.tif格式栅格图层文件的方法可以查看Python中gdal实现多幅栅格影像批量绘制直方图，读取单波段.hdf格式栅格图层文件的方法可以查看Python中gdal栅格影像读取计算与写入及质量评估...栅格图像文件读取部分的代码：首先，多波段.hdf格式文件的读取在一开始与单波段.hdf格式文件或.tif格式文件的读取一致，即通过gdal.Open()函数实现；但随后，需要额外借助len()函数获取HDF...因为我们读取的HDF文件是多波段，因此hdf_band_num肯定是大于1的，那么刚刚读取进来的mcd_sub_dataset其实就是一个列表（List）；其中，这个列表的元素个数就是对应的多波段HDF...HDF文件的当前波段对应的文件像素行列数、名称与数据类型。
HDF5支持层次化结构，能够在单个文件中存储和管理大规模的多维数据集。Python中的Numpy库虽然以数值计算著称，但借助于外部库如h5py，可以轻松实现HDF5文件的读写操作。...HDF5文件简介 HDF5是一种支持层次化数据存储的文件格式，允许用户在同一个文件中存储多个数据集和元数据。...创建HDF5文件并写入数据 先创建一个新的HDF5文件，并在其中保存Numpy数组作为数据集。...读取HDF5文件 HDF5文件支持随机访问，可以直接访问特定的数据集或组，而无需加载整个文件。这使得HDF5在处理大规模数据时表现出色。...总结 本文详细介绍了如何使用Python的Numpy库结合h5py处理HDF5文件，涵盖了HDF5文件的创建、读写、压缩存储、分块访问等常见操作。
HDF5（Hierarchical Data Format 5）是一种用于存储和管理大量科学数据的文件格式，其由HDF Group开发和维护，广泛应用于科学计算、工程、金融和医学等领域。...谈及HDF5图像数据在Windows中的打开方式，主要包括基于HDF Group开发的HDFView软件来打开，以及用C++、Python来打开等2种方式。 ...在之前，我很少选择用HDFView软件来打开HDF5，因为早些时候这个软件的安装比较麻烦，还需要修改一下环境变量什么的，不如在Python中配置对应的库（比如h5py、gdal等）然后用代码读取来的容易...Windows中通过Python的h5py、gdal等方便地打开了（Linux下C++ 的hdf5库我试了，还是可以正常打开的，但是Windows中C++ 的hdf5库是否能打开我还没试过）。...同时，该软件也可以打开HDF4格式（也就是.hdf）的文件。 这里就介绍一下HDFView软件的下载、安装方法。
hdf5 简介 ?...概述 HDF5 (Hierarchical Data Format) 是由美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，是一种跨平台传输的文件格式，存储图像和数据 hdf5的优势 通用数据模型，可以通过无限多种数据类型表示非常复杂...hdf5的文件格式，极其类似unix操作系统 datasets HDF5数据集包含数据和描述文件也就是metadata ?...Attributes 与hdf5文件关联的文件，包含两个部分，名字和值，通俗点讲就是一个描述文件 语言支持 C语言 python的h5py模块（备用） R语言基于R6对象的hdf5r包（主要） 结束语...hdf5是一个非常专业的数据存储格式，同时支持的数据类型广泛，有更高级的使用，但是考虑到时间和需求，我应该不会在这方面深入过多，后续应该会更新r语言的hdf5文件处理，python备用。
一切预备工作齐备，接下来就是利用Python+GDAL进行读取的工作。...首先，导入库： import gdal 紧接着，重头戏，开始读取： hdf=r'C:\pytemp\Thesis\aodrepair\maiac\hdf\MCD19A2.A2017365.h21v03.006.2018119214031....hdf' ds=gdal.Open(hdf) sub=ds.GetSubDatasets() 可以发现，HDF文件中包含了13个层。...其中第一层是470nm处AOD信息（顺带说一句，Python的计数基本都是从0开始）。 第二层是550nm处的AOD： 数据的位数都是16bit。...好啦~今天到此为止 往期 PyCharm2019亲测破解方式 中国范围2019年道路网数据分享 分享一套中国区域的矢量图层（到县级）-更新 UTM坐标的遥感图，Python终于把它扶正啦(手动狗头
文件 将hdf文件存在Landcover文件夹目录下，然后查看hdf文件 > hdf=list.files(pattern = ".hdf") > hdf [1] "MCD12C1.A2010001.006.2018053185051....hdf" "MCD12C1.A2011001.006.2018053185321.hdf" [3] "MCD12C1.A2014001.006.2018053185556.hdf" "MCD12C1.....hdf" [7] "MCD12C1.A2018001.006.2019200161458.hdf" 譬如我们需要读取第二个文件 MCD12C1.A2011001.006.2018053185321.hdf...hdf_filesname=hdf[2] hdf_tif_name=paste0(unlist(str_split(hdf_filesname,".hdf"))[1],".tif") gdalinfo(...hdf_filesname) hdf_time = str_extract(hdf_filesname,"()[0-9]{7}") sds = get_subdatasets(hdf_filesname
本文由腾讯云+社区自动同步，原文地址 http://blogtest.stackoverflow.club/hdf5-usage/ 介绍了hdf5的用法 简介 HDF（英语：Hierarchical Data...指一种为存储和处理大容量科学数据设计的文件格式及相应库文件 读取keys无法显示 import h5py data = h5py.File('your_file_name') data.keys() 此时KeysV显示iew(HDF5
HDF和NetCDF简介 HDF HDF（Hierarchical Data Format）由NCSA（National Center for Supercomputing Applications）...HDF是对HDF数据模型，数据格式以及HDF库API等一系列技术的总称. HDF的最新版本是HDF5....HDF数据模型基于组（groups）和数据集（datasets）概念：如果把HDF数据比作磁盘，那么组相当于文件夹，数据集相当于文件。组和数据集都有用户自定义的属性（attributes）....MODIS影像，以及我国的风云卫星数据都适用HDF格式进行存储....HDF和NetCDF栅格数据集特点 HDF和NetCDF数据都可能包含数据子集（一个文件中包含多个子文件），我们需要找出需要的子集数据，然后就可以像普通的GeoTIFF影像那样进行读写和操作了.
在Python中操纵HDF5文件的方式主要有两种，一是利用pandas中内建的一系列HDF5文件操作相关的方法来将pandas中的数据结构保存在HDF5文件中，二是利用h5py模块来完成从Python原生数据结构向...HDF5格式的保存。...（不在当前工作目录时需要带上完整路径信息） 「mode」：用于指定IO操作的模式，与Python内建的open()中的参数一致，默认为'a'，即当指定文件已存在时不影响原有数据写入，指定文件不存在时则新建文件...图6 删除store对象中指定数据的方法有两种，一是使用remove()方法，传入要删除数据对应的键： store.remove('s') 二是使用Python中的关键词del来删除指定数据： del...图13 HDF5用时仅为csv的1/13，因此在涉及到数据存储特别是规模较大的数据时，HDF5是你不错的选择。
Python大数据分析 1 简介 HDF5（Hierarchical Data Formal）是用于存储大规模数值数据的较为理想的存储格式。...在Python中操纵HDF5文件的方式主要有两种，一是利用pandas中内建的一系列HDF5文件操作相关的方法来将pandas中的数据结构保存在HDF5文件中，二是利用h5py模块来完成从Python原生数据结构向...HDF5格式的保存。...（不在当前工作目录时需要带上完整路径信息） 「mode」：用于指定IO操作的模式，与Python内建的open()中的参数一致，默认为'a'，即当指定文件已存在时不影响原有数据写入，指定文件不存在时则新建文件...对象中的数据直接用对应的键名来索引即可： store['df'] 图6 删除store对象中指定数据的方法有两种，一是使用remove()方法，传入要删除数据对应的键： store.remove('s') 二是使用Python
MOD043km的hdf数据转为tifc尝试了两种办法，1是靠 gdal.open(r'D:/Thesis/ML/modis3km/MOD04_3K.A2018001.0320.061.2018003202214....hdf') 代码如下： import gdal, osr import numpy as np import os import rasterio from rasterio.warp import...import convertModisGDAL ds = gdal.Open(r'D:/Thesis/ML/modis3km/MOD04_3K.A2018001.0320.061.2018003202214.hdf...坐标参数，还有行列数目貌似 于是尝试第二种办法： import subprocess import os subprocess.call('gdal_translate'+' -of GTiff'+' "HDF4..._EOS:EOS_SWATH:"D:/Thesis/ML/modis3km/MOD04_3K.A2018001.0320.061.2018003202214.hdf":mod04:Image_Optical_Depth_Land_And_Ocean
为大数据而生hdfr5 概述 hdf5文件是一种大数据存储结构，除了目前介绍的hdf5r包之外，同时cran中的h5包，Bioconductor中的rhdf5也能够实现类似的功能。...简单开始 创建文件、分组和数据集 library(hdf5r) # 创建一个临时hdf5文件 test_filename <- tempfile(fileext = ".h5") # 读取hdf5文件，...H5S_SIMPLE ## 4 H5S_SIMPLE attributes, datatypes, datasets的信息 HDF5...然而，hdf5-table类型只有一个维度，因此，不可能有选择地读取列所有的列都必须在同一时间读取 # 读取1-5行的数据 weather_ds[1:5] ## origin year month...此外，只要任何对象仍然打开，文件就不能以常规方式重新打开，因为HDF5禁止文件被多次打开。 close all关闭文件以及与文件关联的所有对象。任何指向该对象的r6类都将自动失效。
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