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    「优质题解」DNA

    这道题的地址,想尝试的小伙伴可以来试哦: https://www.dotcpp.com/oj/problem1115.html 思路: (这里A,B就是题目中的a,b); 1.总的思路,把整个DNA的输出变成得到每一行...,然后输出; 2.首先得到DNA的第一行,用字符数组记录; 3.第一行DNA的宽度就是A,即字符数组的有效长度为A,且第一行DNA的型式都是第一个字符和最后一个字符都是'X' 中间的为空格; 4.交换X...得到下一行的DNA;(交换如图)k代表空格; x k k k x k x k x k k k x k k k x k x k x k k k x 5.交换的注意事项在下面(注意事项里); 6.把整个DNA...的输出变成每一行的输出; 7.输出第一行,交换后; 8.再次递归处理,直到输出所有行; 9.每组DNA输出的行数等于A*B-(B-1);(即DNA的行数,也就是递归的次数,题目例子中如上图输出4组,就是

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    使用机器学习和Python揭开DNA测序神秘面纱

    2 单个DNA线(螺旋)的序列 这些碱基的顺序决定了DNA链中包含哪些生物学指令。例如,序列ATCGTT可能指示蓝眼睛,而ATCGCT可能指示棕色眼睛。 使用Python处理DNA序列数据 ?...熟悉诸如Biopython和squiggle之类的Python包将在处理Python中的生物序列数据时为您提供帮助。...Biopython是python模块的集合,这些模块提供处理DNA,RNA和蛋白质序列操作的功能,例如DNA字符串的反向互补,寻找蛋白质序列中的基序列等。...是的,我们可以使用Squiggle python库将这些DNA序列可视化,进行操作并运行: Squiggle example.fa --method=gates ?...在基因组学中,我们将这种类型的操作称为“ k-mer计数”,或者对每种可能出现的k-mer序列进行计数,而Python的自然语言处理工具使其变得非常容易。

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    一杯DNA装下全世界? MIT团队突破DNA新检索技术,实现DNA数据「冷存储」!

    近日,麻省理工学院开发了一种检索DNA数据文件的新方法,或许能成为DNA存储数据的重要一步。 一个咖啡杯就能装下全世界? 有了DNA数据存储,这是可能的。...DNA数据存储发展过程(1965-2018)(图源:nature) DNA数据存储是什么 DNA数据存储是一个将二进制数据转换成人工合成DNA链的编码过程。...但DNA并非没有缺点,成本高昂是阻碍其发展的主要问题。 目前,DNA链的碱基模式中没有编码比特的标准方法,合成特定的序列仍然很昂贵。而用目前的方法访问数据不仅慢,而且会消耗用于存储的DNA。...把所有数据存储到DNA上的瓶颈 在DNA中存储数据的系统涉及到向包含数据的DNA片段添加特定的序列标签。 为了得到想要的数据,你只需添加能与正确的标签碱基配对的DNA位,并使用它们来扩增完整的序列。...不过,目前,该实验室已经成立了一家名为Cache DNA的初创公司,正在开发DNA的长期存储技术,既可以用于长期的DNA数据存储,也能用于短期的临床和其他现有的DNA样品存储。

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    空间单细胞DNA测序

    空间单细胞DNA测序技术:Topographic Single Cell Sequencing 发表于2018年CELL杂志,文章题目是:Multiclonal Invasion in Breast Tumors...一图胜千言,很容易看明白这个流程,就是先对组织样品进行染色,这样可以区分3种细胞,然后利用LCM技术来挑选微小区域的细胞,再利用laser catapulting精准的挑选一个单细胞去建库测序,单细胞的DNA...如上图所示,对4号病人,作者在2额病变区域采用,共分析了46 in situ cells and 58 invasive cells 单细胞DNA测序数据。...对10个病人综合起来总共测了 425 in situ and 503 invasive 和365 stromal diploid cells,这些单细胞DNA测序数据都是可以从SRA数据库里面下载的。...比较奇怪的是有4个病人都是单克隆,或者说仅仅是从单细胞DNA测序得到的拷贝数变异无法区分不同的克隆。

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