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    R语言绘制火山图_r语言画曲线图

    提到差异火山图,相信很多同学肯定不陌生。因为形似火山(喷发),所以称为火山图。差异火山图最常见于转录组数据的分析中,在基因表达层面,用于展示两组间表达量上调和下调的基因。常规的火山图中主要包含了两个重要信息,差异表达倍数(Fold Change值,简称FC,作图时会对FC进行log转化,根据logFC值的正负判断这些基因的表达量是上调了还是下调了)以及统计学显著性p值(p-value,通常是FDR校正后的p值,根据校正后p值判断基因表达量上调或下调是否具有显著性)。因此在判断差异基因时,与常规的统计学方法相比,除了p值,通常还会考虑差异倍数,即结合这两个统计结果筛选表达量显著上调或下调的基因(一般而言,差异倍数不能太小)。

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