编辑手记：在Oracle12.2 中提供了多种创建PDB的方式，能够更快速便捷地实现数据库的扩展和变更。今天我们来介绍通过SQL*Plus管理的方式。 注：文档内容来自于官方文档翻译，想了解更多信息请参阅官方文档。 1 PDB的创建 在创建PDB之前，需要满足以下条件： CDB必须存在。 CDB必须处于读/写模式。 操作用户必须是当前CDB root或application container的公共用户。 操作用户必须具有CREATE PLUGGABLE DATABASE的系统特权。 必须为每个容器确定
PDB（Program Data Base），意即程序的基本数据，是VS编译链接时生成的文件。DPB文件主要存储了VS调试程序时所需要的基本信息，主要包括源文件名、变量名、函数名、FPO(帧指针)、对应的行号等等。因为存储的是调试信息，所以一般情况下PDB文件是在Debug模式下才会生成。
PDB (Program Data Base) 即程序的基本数据，是 VS 编译链接时生成的文件，每个程序集（EXE 或 DLL）都有一个与之对应的 PDB 文件。DPB 文件主要存储了 VS 调试程序时所需要的基本信息，主要包括源文件名、变量名、函数名、对应的行号等等。因为存储的是调试信息，所以一般情况下 PDB 文件是在 Debug 模式下才会生成。有了这个文件，我们才能对程序进行 断点调试 ，才能一步步执行程序。
PDB 的创建和访问 在使用 dbca 建库时，创建数据库之前，可以保存一下创建脚本，分析其具体执行过程。以自定义方式创建名称为julia的数据库为例，其主要脚本 julia.sql 中包含如下脚本调
PDB Files: What Every Developer Must Know http://www.wintellect.com/CS/blogs/jrobbins/archive/2009/05/11/pdb-files-what-every-developer-must-know.aspx PDB文件：每个开发人员都必须知道的
前言 熟悉.Net开发的朋友会知道，项目在编译时，除了可执行的.exe文件外，在运行目录常常会生成.pdb的文件，好多人都不知道这个文件是干什么用的，今天就详细介绍一下。 介绍 本文帮助那些处于初级或
使用种子 PDB PDB$SEED 在容器数据库 cdb1 中创建新的 PDB: PDB2
数据库（DATABASE）是一个数据集合，Oracle数据库都将其数据存放在数据文件中。在物理结构上，Oracle数据库必须的3类文件分别是数据文件、控制文件和联机Redo日志文件。在逻辑结构上，Oracle数据库由表空间、段、区和块组成。数据库名称由DB_NAME来标识。
程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息，使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。当以 /ZI 或 /Zi(用于 C/C++)生成时，将创建一个 PDB 文件。
容器(container)是多租户体系结构中的数据或元数据的逻辑集合。CDB(containerdatabase)容器数据库在图形化创建实例时若勾选了“创建为容器数据库(C)”则会出现容器数据库称之为CDB，否则称之为 Non-CDB，如之前的 11g 数据库就称之为非容器数据库 Non-CDB，那么 PDB（Pluggable Database ）在 CDB 下被称作可插拔数据库。19c 还可以选择创建为非容器数据库 Non-CDB，但 20c 以后则强制使用 CDB，不在支持非容器数据库了。
由于创建软链接这个事情，在算法开发的日常中使用到的并不是很多，因此本文也是做一个简单的回顾。这里我们使用的案例是通过TMalign这个蛋白质打分文件，在编译好可执行文件之后，可以使用建立软链接的方法快捷的使用该可执行文件。
为了更好的管理CDB及其PDB中的权限，12c推出一项新功能 – PDB锁定配置文件 ( PDB Lockdown Profile)，用于控制连接到PDB用户的可用操作。比如，禁止执行alter system。
Debug里的PDB是full，保存着调试和项目状态信息、有断言、堆栈检查等代码。可以对程序的调试配置进行增量链接。 Release 里的PDB是pdb-only，出什么错了+错误在哪行。 由此我明白了，原来pdb文件包含了编译后程序指向源代码的位置信息，用于调试的时候定位到源代码，主要是用来方便调试的。而程序在上线时是不需要xml文件和pdb文件的，可以进行配置，只生成dll文件。
在可插拔数据库 pdb2 中创建永久表空间 BDC_DATA，数据文件大小 10M。
内容来源：2017 年 04 月 08 日，ITPUB管理版版主吕海波在“DBGeeK+PG数据库技术沙龙（4月杭州站）”进行《Oracle中最容易被忽略的那些实用特性》演讲分享。
咱造了一个轮子，咱可以非常方便将这个轮子库作为 NuGet 发布出去，造福其他开发者，或者毒害其他开发者。为什么说是毒害呢？因为有时候这个库存在坑，此时使用这个库的开发者就受到了伤害。为了安抚脆弱的开发者们，咱可以提高一下开发者们的调试效率，例如让开发者们可以调试到库里面的源代码 本文来告诉大家如何在项目文件里面添加上 EmbedAllSources 属性，将自己的代码嵌入到 PDB 符号文件里面，让开发者们在调试的时候，可以看到库的源代码
在Oracle Database 12c版本中，一个重要的新特性：插接式数据库（Pluggable Database）被引入进来。在12c之前的版本中，Oracle数据库中的多用户管理通过Schema – 模式管理方式来实现，而在12c中，插接式数据库在更高级别实现了进一步的隔离。 1. 插接式数据简介 插接式数据库由一个使用 CDB（Container Database）选项创建的容器数据库和一个或多个 PDB（Pluggable Database）组成，CDB 作为容器容纳 PDB，而 PDB 彼此
由于 PDB 的引入，Oracle 数据库的备份和恢复也发生了很多变化，基于 PDB 级别的表空间、库备份同时被支持。以下通过实际测试介绍一下12c中关于 PDB 的备份恢复过程。 ⑴ 启动归档模式
原文链接 https://martincarstenbach.wordpress.com/2017/07/11/12-2-new-feature-the-flex-asm-disk-group-part-2/ 译者 周天鹏 在上一部分中，我讲了一些基础知识和人们使用ASM Flex Diskgroup一般想达到的目的。这一部分我将介绍一些Flex Diskgroup的相关新概念。 Flex ASM Diskgroup相关新概念 当Flex Diskgroup挂载之后，下一步就是创建一些新的实体（这里
在Oracle中基于PDB种子复制数据库的方式，这个与SQLServert中直接创建数据库比较类似。在SQLServer中有一个model数据库，这个库的功能就和PDB种子数据库一样，就是一个模板数据库。从某种程度上来说，Oracle的多租户数据库几乎借鉴了80%的SQLserver的一些设计架构和理念。也即是通过从pdb数据库复制数据文件来达到快速建库的目的。下文是基于PDB种子建库的步骤及演示。
程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息，使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。 在使用 /debug 生成时，会创建一个 PDB 文件。 可以使用 /debug:full 或 /debug:pdbonly 生成应用程序。 使用 /debug:full 生成将产生可调试的代码。 使用 /debug:pdbonly 生成将产生 PDB，但是不会产生通知 JIT 编译器调试信息可用的 DebuggableAttribute。 如果您想为不希望其成为可调试的发布版本生成 PDB，请使用 /debug:pdbonly。 有关更多信息，请参见 /debug (C# 编译器选项)或 /debug (Visual Basic)。
Python提供类似于C++ gdb的调试工具pdb，我们可以在Linux下使用pdb在命令行下进行Python程序的调试。 官方参考网站： Python2： https://docs.python.org/2/library/pdb.html Python3： https://docs.python.org/3/library/pdb.html
其中xml是同名dll的注释文档，pdb是调试库。我们最终应该只想要exe和dll，除了手工删，我知道的有两招，可以让项目生成后，xml和pdb不会出现：
作者 杨禹航 出品 沃趣技术 Oracle 12.1发布至今已有多年，但国内Oracle 12C的用户并不多，随着12.2在去年的发布，选择安装Oracle 12c的客户量明显增加，在接下来的几年中，Oracle 12c将逐步得到普及。 目前关于12C新特性的文章很多，但大多都不成体系，本次的文章是一个非常完整、连贯的系列，将带你全面的从基础到深入全方位的理解Oracle 12C。 本篇为Oracle 12c系列的开篇文章《Oracle 12c系列(1)Multitenant Container》。
没有pdb文件，或者设置pdb目录下找不到对应的pdb文件时，崩溃堆栈列出来的信息较少。
前情回顾：Oracle 12c多租户特性详解：从Schema到PDB的变化与隔离 COMMON 和 Local 用户 无论在 CDB 和 Non-CDB 数据库中，用户都拥有一个 Schema，拥有一
openmm是用于分子模拟的高性能工具包。该代码是开源，并在MIT和LGPL license下。是 Omnia(预测生物分子模拟的工具套件)的一部分。
今天使用cloba版本的alpahfold预测了21个蛋白质序列。用过colab版本的alphafold的你应该知道，alphafold运行结束之后会自动下载一个压缩包。例如这个样子：
了解蛋白质的基本组成单元和结构，有助于了解蛋白质的特性。对于蛋白质结构的研究，在医药领域是非常核心的重要工作。这里我们仅仅介绍一些蛋白质的基本组成单元——20种氨基酸的种类，以及可以用于蛋白质建模的一些工具。
这一个条目的意思是，我们可以使用python3 -m这样的指令，在终端的命令行内运行python的一些仓库。比如我们常用的pip，就可以通过python3 -m pip install numpy这样的操作指令来运行。还有一个比较常见的上传python编译安装包到pypi网站上面的工具twine，可以通过python3 -m twine的方法来使用。本文我们主要探讨一下如何在代码中，实现python3 -m 这种命令行运行的模式。
Oracle 12.1发布至今已有多年，但国内Oracle 12C的用户并不多，随着12.2在去年的发布，选择安装Oracle 12c的客户量明显增加，在接下来的一两年中，Oracle 12c将逐步得到普及。
在git操作中，有时候为了保障线上分支的简洁性，会在.gitignore文件中屏蔽一些关键词，比如可以加一个*.txt来屏蔽掉项目中所有带txt后缀的文件，还可以加上*test*来屏蔽所有的本地测试文件或者目录（当然，这个操作需要谨慎，有时候线上版本也需要同步测试案例）。那么如果想在被屏蔽的文件中找几个特殊案例，传到线上版本去，要如何操作呢？
这个是正常版本的 链接: Windows10安装Oracle19c数据库详细记录
为了能够调整两个结构到同一个坐标体系，这个时候就需要使用Pymol软件中的align命令了，也可以使用鼠标来实现。选中需要被align的结构，在A选项的下拉选项卡中选择align，并依次选择“align—to molecule—1ywtA”。这样就成功的将模板坐标和需要补全的分子结构调整到了同一个坐标体系。
Oracle 12c 中引入了一个新功能就是Oracle Multitenant，这个功能可以在多租户容器数据库中，创建并维护许多个可插拔数据库。Oracle Multitenant是Oracle企业版中需要额外付费的组件。然而，在所有Oracle版本中都可以在一个可插拔数据库中免费使用它。 多租户容器数据库（CDB）是指能够容纳一个或者多个可插拔数据库的数据库。容器是指CDB中的数据文件和元数据的集合。可插拔数据库是指可以通过克隆另一个数据库轻松创建的数据容器。如果有必要，也可将可插拔数据库从一个CDB传送到另一个CDB。 所有含有一组主数据文件和元数据的CDB都是根容器。每个CDB也会含有种子容器，它是用于创建其它可插拔数据库的模板。每个CDB都由一个根容器、一个种子容器和0个、1个或多个可插拔数据库构成。
当我们需要将Non-CDB数据库类型更改为PDB数据库类型时，可以使用Cloning的方式将其复制到现有的CDB中，但是该方法需要将Non-CDB中的数据文件复制到新的目录中，除了Cloning的方式外我们还可以使用DBMS_PDB包来生成Non-CDB数据库的XML元数据文件，该XML元数据文件中描述了Non-CDB中的数据文件信息，可以使用XML文件将Non-CDB数据库附加为CDB中的PDB，通过该方式将Non-CDB数据库转换成CDB中的PDB，它的优点在于省去了复制Non-CDB数据文件的过程，但要求Non-CDB必须为12.1.0之上的版本，如果Non-CDB为12c之前的版本，需要将其升级到12c，另外需要我们提前创建一个CDB容器数据库，或者现有环境中已存在CDB容器数据库(将Non-CDB插入已存在的CDB中)。
因此我们将2H8L分割成三个pdb文件。 [1] "split_chain/2H8L_A.pdb" "split_chain/2H8L_B.pdb" "split_chain/2H8L_C.pdb"
在新的 .NET 上，将会默认使用 Portable PDB 符号格式，而如果 VisualStudio 配置了使用托管兼容模式，那么将在加载符号的时候，将会提示不支持 PDB 格式
原文链接 https://martincarstenbach.wordpress.com/2017/07/21/12-2-new-feature-the-flex-asm-disk-group-part-3/ 译者 周天鹏 本专题的上一部分中，我介绍了Flex ASM Diskgroup的两个相关概念，配额组和文件组。但配额组的配额是否真的写多少就是多少呢？（还是超出个百分之多少也没关系）我对此非常好奇。 幸运的是，我又发现了12c ASM相关的值得写博客跟大家分享的一些点，所以： 这并不是本专题的最
今天在 Oracle 原厂公众号上看到了一篇描述 Oracle 21c ADG 新特性的文章，基于 PDB 级别的 ADG 可以实现自由切换，非整个 CDB 级别的 ADG 及 Switchover 十分不错，值得推荐，故分享给大家。
如果是PDB数据库的蛋白，只需要PDB蛋白的id，然后通过get.pdb函数获取即可。
数据字典视图CDB_pbds : CDB内所有的PDBCDB_tablespaces： CDB内所有的表空间CDB_users : CDB内所有的用户DBA_tablespaces： PDB内所有的表空间DBA_data_files : PDB内所有的数据文件DBA_tables PDB中所有的表DBA_users PDB的所有用户 CDB 中查看数据文件SYS@cdb1> col FILE_NAME for a50SYS@cdb1> select con_id,file_id,file_name,
现在很多的编辑器其实都带着「调试程序」的功能，比如写 c/c++ 的 codeblocks，写 Python 的 pycharm，这种图形界面的使用和显示都相当友好，简单方便易学，这个不是我这篇文章要讲的重点。今天主要是想给大家介绍一下 「Python调试器」，快速定位各种疑难杂症。
蛋白质数据库（PDB）是生物大分子3D结构的存储库，其中包含其原子的坐标，通过使用两个原子的这些坐标，可以计算它们之间的距离。使用典型的pdb文件，可以使用类似于Biopython文档中介绍的方法来计算结构中两个原子之间的距离。如下所示：
我们可以在认为可能出错的地方打印变量，但这有很大的弊端，因为打印的代码没有实际功能，都是垃圾信息。而且print最后还得删除，所以第二种方法是用assert替代print
写过C语言的同学们想必都很怀念（读者：¿）gdb调试器，使用gdb可以随意在程序运行过程中暂停流程、查看变量。
pdb模块是python自带一个调试模块，在没有pycharm的iIDE环境情况下，最佳调试方式就是使用pdb模块调试。
Oracle 12c中的PDB一下子让数据文件的格式复杂了一些，所以Data Guard就很有必要了，一旦出现问题，受损失的数据库是全局的。没想到在搭建Data Guard的时候还是碰到了一些小问题。 问题源自于一次PDB创建的时候，早些时候我在搭建好Data Guard后，主备库的日志应用都没有问题，过了几天，根据需求需要再添加一个PDB,导入一些数据供应用使用。按照要求创建了数据文件然后导入数据，但是查看备库的状态发现MRP异常停止了。 DG Broker检测的状态如下： DGMGRL> show co
全面解读Oracle 12.2体系架构图系列课程，精彩继续。本期的内容由两部分组成，一是数据库实例与文件系统的访问；二是多租户解决方案。文中将会简单列举视频要点 数据库实例与文件系统 几个重要的进程和内存组件 RVWR：Recovery Writer Process，当数据库设置了闪回区域的时候，该进程定期将内存中，具体来讲是shared pool中的flashback buffer里面的闪回数据写入flashback logs. Result cache --> RCBG:result cache 用于存
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