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这篇17分的文章告诉你:深度学习和分子分型其实并不难!

亚型的信息:管腔亚型患者的生存率最高,而基底型和管腔p53样型肿瘤的预后较差。 图 1.TCGA 队列的特征 2....管腔亚型主要以乳头状生长。管腔型 p53 样亚型, 以小细胞巢或肿瘤细胞弥漫性浸润, 它们常被富含软骨细胞的间质所包围,呈粘液样外观。...对于基底样型、管腔型、管腔p53样型,这些型别成功鉴别的概率不超过 80%,且鉴别为这些型别的决策准确的概率不超过 80%;调和了召回率和精确度之后输出的 F1 score表明预测的精度不超过 80%。...对于双阴型,基底样型、管腔型、管腔p53样型,负例覆盖率均较高。以上证明mibCNN 模型准确性更高。...到目前为止,分类精度还没有达到常规临床应用所能接受的水平,甚至在二元分类任务中也是如此。模型仍需优化。

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单细胞多组学联合分析鉴定鼠乳腺上皮新调节细胞

呐,等你关注都等出蜘蛛网了~ 当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步。...总 览 乳腺上皮细胞(MEC)系统是由管腔和基底细胞组成的双层导管上皮网络,由干细胞和祖细胞群组成。...通过整合单细胞转录组学和染色质可及性数据,结果揭示了新的细胞类型特异性转录调控因子以及确定了新的顺式和反式调控元件,这些元件在特定的上皮细胞类型和作者新定义的腔内分化状态中被差异性激活。...10周龄的小鼠3只,乳腺组织 方法 ? 全部乳腺上皮组织细胞用来做scRNAseq。分离出的管腔和基底细胞用来做scATACseq ? ? 主要结果 ?...作者还在L-Seq中定义了新的分化状态,将其分为L-Sec祖细胞和L-Sec成熟细胞。这项工作为揭示MEC分化相关调节原价提供了重要支持,为确定乳腺癌中染色质可及性的变化提供了有价值的参考。

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    更新边模抑制比

    可通过analysis中的子选项进行计算。 了解了边摸定义之后,我们再来理解动态单纵模: 由于激光器谐振腔的作用,在垂直和水平于光传输方向上会存在横模和纵模。...在laser的光谱中,若光强仅存在一个极大值,就成为单纵模。如果激光器在高速直接调制情况下仍然保持单一纵模,就成为动态单纵模DSLM。...如何提高laser的边模抑制比,就是如何实现频谱更窄的单纵模激光, 通过上图我们可以知道,抑制边摸的基本方法是“过滤”不希望的波长。...该方法是在芯片阶段做光栅结构,牺牲掉一部分光腔来做布拉格反射模块。无需二次外延生长。 2、DFB 分布反馈(DFB)半导体激光器....从设计角度,主要考虑在保持较高的斜率效率的情况下,提高最大工作电流,同时维持单模工作状态。主要优化手段包括量子阱优化、腔长优化、分别限制层及盖层优化、模式控制等。

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    大功率半导体激光器

    这种激光器由于光学谐振腔与半导体芯片的衬底垂直,因此能够实现芯片表面的激光发射,有着低阈值电流、稳定单波长工作、可高频调制、容易二维集成、没有腔面阈值损伤等优点。...提高单管激光的输出功率,需要改进激光器的芯片结构,提升材料生长、芯片制备、腔面镀膜及封装散热等关键技术。...在可以保证单层激光器bar条连续输出数百瓦激光功率的情况下,受限于热沉内微通道的水压降,激光器迭阵中激光器 bar 条数一般不能超过 50 层。这样,单个激光器迭阵能够实现连续工作数千瓦的激光输出。...3.3 半导体激光器的可靠性 半导体激光器的可靠性在应用中是一个重要的技术指标。在通信、光存储等领域,小功率半导体的可靠性已基本解决,工作寿命可以达到实用要求。...解决这些问题一般通过以下方法: 提高晶体生长质量;改进制备工艺和封装技术;增大光斑尺寸;优化传热结构和散热方法等。

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    带CT三维重建技术的医院影像PACS系统

    CT三维重建主要包含以下基本后处理方法:多层面重建(MPR)最大密度投影(MIP)最小密度投影(MinIP)表面阴影遮盖(SSD)容积漫游技术(VRT)虚拟内镜技术(VE)下面对常用的几个方法进行简要介绍图片...MPR适用于任一平面的结构成像,以任意角度观察正常组织器官或病变,可以显示腔性结构的横截面以观察腔隙的狭窄程度、评价血管受侵情况、真实地反映器官间的位置关系等。优点:a....和MIP正好相反,它是在某一平面方向上对所选取的三维组织层块中的最小密度进行投影,主要用于气道的显示。偶尔也用于肝脏增强后肝内扩张胆管的显示。...这种CT重建图像可以模拟各种内镜检查的效果,它是假设视线位于所要观察的管“腔”内,通过设定一系列的参数范围,即可看到管“腔”内的结构。...VRT图像直观生动,深受广大医生的喜爱,称得上是辅助诊断、显示病变的大杀器,但是我们要注意一点,VRT图像的伪彩设置很重要,不恰当的伪彩设置会将血管外层像素过滤掉,显示的血管狭窄的程度会比真实情况严重。

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    Nature Communication:Claudin-low亚型乳腺癌的综合特征分析揭示细胞起源对肿瘤进化的影响

    基因表达谱分析鉴定四种临床相关的分子亚型(基底样,富含HER2的,管腔A,管腔B和正常样)。...在这些内在亚型中,基底样亚型是最明显的,其特征是细胞角蛋白在皮肤的基底层独特表达、管腔相关基因表达水平非常低。...分析claudin-low亚型的基因组结构表明,成熟的管腔细胞和管腔祖细胞在癌基因驱动下发生转化,引发大量的癌基因诱导的DNA损伤和早期的染色体不稳定(CIN),正常的人乳腺干细胞可以耐受异常的有丝分裂活动...分析结果:①干细胞相关特征在CL1富集;②管腔相关特征在CL2中富集;③细胞周期相关通路在CL3中富集(Fig. 3a)。...与之前的结果相同,三个claudin-low亚组中,CL2和CL3分别在管腔和基底样特征的得分最高。

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    这么简单的类器官模型也能发一区?

    O-POST中HER-2表达降低,EGFR表达增加,PI3K/Akt 信号通路的失调,上皮倾向于管腔成分,上皮-间充质转化细胞类型减少。新辅助治疗后留下对治疗不敏感的管腔表型细胞群。...此外,它们显示细胞间腔和液泡,表明具有强烈的分泌活性,并且在嵴中富含线粒体,表明它们参与功能性能量代谢。在两种类器官的细胞连接处挤出的大量细胞碎片表明高分泌活性和细胞更新。...CD24low/CD44型high群体与多能性、肿瘤起始潜力和转移特性相关,在O-POST中99.37%高于O-PRE93.57%。...O-POST细胞中EGFR表达增加。不仅在平均荧光强度(MFI)方面,而且在 EGFR阳性细胞的百分比方面。...image.png O-PRE强烈富集基底/肌上皮细胞类型(2,5,8,9),而在O-POST中,管腔成分(1,6,7)占主导地位,表明新辅助化疗后留下的肿瘤组织是对化疗不太敏感的管腔成分,这些管腔成分具有较高的干性和侵袭性

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    前工程师讲解:开关电源设计-LLC电源

    随着技术的进一步提高,各种电子设备,对开关电源的体积性能有了越来越高的要求,然后人们就开始研究消除或者减小开关损耗的方法。...至于为什么实现了零压开通,这正是利用了交流电路里面电流电压之间,相位角会随着频率发生变化这一特性,如果始终保证LLC谐振腔工作在感性区域,那么我们就始终保证了谐振腔电流滞后于电压一定的相位角。...由于交叉损耗的存在,限制了PWM模式开关电源工作频率的进一步提高。交叉损耗也就是开关管在开通和关断时候,电压电流有重叠的一部分产生的,那么P=U*I。...谐振腔电流红色的是谐振腔总电流,紫色的是励磁电流,因为次级二极管导通,Lm端电压被钳位到n*(Vout-Vf),所以励磁电流是线性上升的。...平台是因为谐振腔总电流开始小于励磁电流,次级二极管不再导通,Lm不再被钳位,Lm也参与了谐振,平台其实是个假象,那也是一段正弦波,频率由Cr、(Lm+Lr)来决定。

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    【语音处理】声音的产生机制和数学模型

    经过咽腔之后,若软腭下垂,则气流主要经过鼻腔发音,即为鼻音,此外鼻腔的形状是固定的,因而共振峰频率固定;若软腭上抬,则完全由口腔发音,即为口音,但是口腔形状不固定,因而共振峰频率不确定。...2.2 声道模型 对于声道,常见的数学模型有:声管模型和共振峰模型。声管模型将声道视为多个不同截面的声管串联;而对于常用的共振峰模型,其将声道视为一个谐振腔。...发音时声带不震动、送气的叫清辅音;发音时声带震动、不送气的叫浊辅音。...但是,研究表明,声道中的语音信号并不总是以平面波的形式传播,气流在通过声道腔体的某些部分时存在湍流,因此在声道模型中,语音信号应该由平面波部分的线性部分和湍流区域部分的非线性部分共同组成。...在模型中,语音中的单个共振峰的输出,相当于以该共振峰为载波频率进行频率调制和幅值调制的结果,并且语音信号是由多个这样的共振峰调制叠加而成的。

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    几篇不错的激光芯片专利

    4 沉积doped掺杂层 5 做热处理,也就是热扩散 6 去掉doped层 7 长cladding包层在刻蚀区域 8 做电极 大概思想就是这么回事,主要工作在芯片制造,难点在于掺杂工艺,采用何种材料...采用此制作方法制作的接触层包括掺杂区域和非掺杂区域,非掺杂区域电流无法注入,只有掺杂区域能够注入电流,并且掺杂区域内能够注入电流面积沿腔长方向逐渐增大,以抵消谐振腔内的光子密度分布不均导致的载流子密度和增益沿增反膜到减反膜方向不均匀分布的影响...,使载流子在腔长方向均匀分布,提高半导体激光器的输出功率和性能稳定性。...本发明公开了一种激光二极管及其制造方法,在本发明的一个实施例中的激光二极管包括:衬底,所述衬底具有相对的第一表面和第二表面;形成在所述衬底的第一表面的外延层,所述外延层在顶部形成有脊;形成在所述脊的上方的第二电极接触层...本发明的激光二极管的光场包覆层进一步形成了光场限制,同时可以保护脊的侧壁,防止漏电;增大了出光面的绝缘层的面积,降低出光腔面端的增益,平衡了腔体的电流注入和光场的分布。

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    神经网络在Keras中不work!博士小哥证明何恺明的初始化方法堪比“CNN还魂丹”

    铜灵 发自 凹非寺 量子位 出品 | 公众号 QbitAI 南巴黎电信学院(Télécom SudParis)的在读博士生Nathan Hubens在训练CNN时遇到点难题。...论文地址: https://arxiv.org/pdf/1502.01852.pdf 初始化方法 初始化一直是深度学习研究中的重要领域,特别是随着架构和非线性研究的不断发展,一个好的初始化方法可能决定着网络最终的质量...上述公式为单个卷积层输出的方差,若考虑网络中的所有层,需要得到它们的乘积: ? 有了乘积后可以看出,如果每层的方差不接近1,网络就会快速衰减。若小于1,则会朝0消散;若大于1,则激活值将无限增长。...在默认情况下,在Keras中,卷积层按Glorot正态分布进行初始化: keras.layers.Conv2D(filters, kernel_size, strides=(1, 1), padding...何恺明的初始化方法 先重建VGG 16模型,将初始化改成he_uniform,在训练模型前检查激活和梯度。 ? 通过这种初始化法,激活平均值为0.5,标准偏差为0.8。 ?

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    薄壁管类工件车铣夹具设计

    数控编程、车铣复合、普车加工、Mastercam、行业前沿、机械视频,生产工艺、加工中心、模具、数控等前沿资讯在这里等你哦 在实际生产过程中,经常会遇到加工各种不同形状尺寸的薄壁管件,在加工过程容易变形...薄壁件的加工是车削和铣销中比较棘手的问题,原因是薄壁件刚性差,强度弱,在加工中极容易变形,使零件的形位误差增大,不易保证零件的加工质量。 1 影响薄壁管类工件加工精度的主要因素有 1.1受力易变形。...2 减少和防止薄壁件加工变形的方法 2.1 应采用轴向夹紧夹具。车铣薄壁工件时,尽量不使用径向夹紧,而优先选用轴向夹紧方法。...精铣外侧所有孔槽形状 3.3 改进前主要加工方法及存在的问题 (1)粗精铣内腔形状时用的夹具是一个开缝套筒外胎,用三爪卡盘夹紧固定,这样装夹时就会使工件本身径向受力,工件薄壁会使工件本身就处在一个变形的状态下...—支撑环外侧壁蓝色部分与胎具主体上边蓝色部分配合,内侧壁与工件外圆配合起到挡住工件上端左右前后不晃动和定位的作用保证每次装夹使工件回转中心在同一个位置 3、要加工的工件 4、胎具主体如图 3—胎具主体内侧下端有

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    单细胞揭示不同类型转录重构助力人类前列腺癌研究进展

    如预期的那样,腔管是大多数肿瘤的主要上皮类型(图1e和图2b的扩展数据)。然而,基底/中间细胞是样品154的主要上皮细胞类型(基底/中间体:管腔= 7;图1e)。...除了10和12细胞群外,PAM50分类的管腔A和B信号同时在大多数细胞群显示高信号。然而10细胞群高表达管腔A具有的信号,而12细胞群富集管腔B特征,表明这官腔A和B特征分别由这两个细胞群具体确定。...与其管腔细胞相比,CellCycle和基底/中间细胞显示出独特的细胞功能(图2c)。CellCycle细胞群具有丰富的功能,例如氧化磷酸化和DNA复制,而却缺乏普通的管腔细胞功能。...含EV沉淀的不连续超速离心碘克沙醇梯度显示,KLK3 RNA和蛋白质主要存在于囊泡中,但不存在于不含EV的馏分中。综上所述,这些数据表明,前列腺癌细胞分泌的EVs可以改变浸润性T细胞的转录组。...尽管需要更多的工作来说明前列腺癌中肌成纤维细胞CAF的实际来源,这些数据为CAF和TME中非成纤维细胞谱系之间共享的调控网络提供了证据。

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    改善红光激光COD

    提高激光器芯片COD阈值的方法有很多,其中非吸收窗口技术是适合大功率激光器芯片量产的常用方法。...638nm 波段激光器中功率最高的半导体激光器.据 相关报道,三菱公司生产的638nm 大功率红光半导 体激光器产品均采用非吸收窗口结构.美国nLight 公司报道了其最新的639nm 激光器.在25...除了在激光器腔面制作非吸收窗口外,蒸镀钝 化膜、大光腔结构、制作电流非注入窗口 等方式都可以有效抑制COD现象,提高器件的单 管输出功率....半导体激光器阵列也是提高器件输出功率的有 效方法.在半导体芯片上集成多个激光单元,形成激 光阵列.激光阵列分为一维阵列(bar条)和二维阵列 (叠阵),一个激光 bar条的功率可达数十瓦.1995年,美国...光显示的红光光源系统中并不常见.

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    仅不到35元!中美研发全球首个用于内镜下球囊扩张术的软体机器人登《Soft Robotics》

    这个机器人可以推动自己在气道内移动、转弯,并进行扩张治疗。 内窥镜下球囊扩张术是指在内镜引导下将球囊送至腔内狭窄处,进行扩张狭窄管腔的治疗方法,一般用于治疗气道、食管等部位的各种良性狭窄。...先在猪气管中做实验 随后,科学家们在猪的支气管中进行了机器人体外实验,机器人的任务是到达小猪支气管的特定位置进行球囊扩张治疗。在实际医疗中,这可以缓解肺移植后可能发生的阻塞。...在最小直径尺寸在11-12mm之间的体外猪气管中,机器人的速度也超过了3 mm/sec,研究人员表示,如果在更粗的管腔内,可以达到更高的移动速度。...另外,这种设备也足够便宜(仅不到35元人民币),可以作为一次性设备使用,同时还能适应不同的管腔内径。...这篇文章发表在《Soft Robotics》期刊中,标题为“A Soft Robotic Balloon Endoscope for Airway Procedures”。

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    月经周期过程人类子宫内膜的单细胞转录图谱

    重要的是,研究者在无纤毛上皮的时间轨迹中观察到时期4和之前的时期之间显著的不连续(图3a)。这种不连续性在降维或者特征富集方法中同样观察到。...例如,MAOA和NUPR1的活化早于DPP4,尽管在无纤毛上皮的两个亚型中水平相当。在管腔上皮中CXCL14、GPX3以及PAEP的活化晚于腺体中的细胞。...分离腺体和管腔上皮中转录组学特征 在无纤毛上皮,研究者注意到C1和10x 数据集中,垂直于整体的月经周期细胞进一步分离。...在多个时期持续分化亚群的基因中(图5b-d),研究者发现与管腔和腺体上皮相关的基因。例如WNT7A在所有增生性时期的亚群中过表达(图5c),并且在人类、灵长目、小鼠子宫内膜管腔上皮中特异表达。...在增生性时期的管腔上皮中过表达的基因进行功能富集分析(图5e),结果发现在与组织结构发育相关的形态发生和管腺增生中大量富集,并且在导致分化的形态发生中富集。

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    用于3D摄像头的VCSEL技术

    因特尔公司研发的RealSense 3D摄像头架构 目前,可以提供800-1000nm波段的近红外光源主要有三种:红外LED、红外LD-EEL(边发射激光二极管)和VCSEL(垂直腔面发射激光器)。...早期3D传感系统一般都使用LED作为红外光源,但是随着VCSEL技术的成熟,性价比已经接近红外LED,除此之外,在技术方面,由于LED不具有谐振腔,导致光束更加发散,在耦合性方面很差,而VCSEL在精确度...对 VCSEL 的设计集中在高反射率、低损耗的 DBR 和有源区在腔内的位置。...从表中我们可以看出,VCSEL有源区的体积小、腔短,这就决定了它容易实现单纵模、低阈值(亚毫安级)电流工作,但是为了得到足够高的增益,其腔镜的反射率必须达到99%。...三基色纯激光显示原理示意图 技术进展来看,红光激光二极管技术(包括VCSEL红光阵列)发展已经十分成熟,蓝光激光二极管价格尚高,绿光激光二极管则还有待发展。

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    Clinical Cancer Research|乳腺癌种族预后差异研究

    文章主要讲的是,通过比较腔内分化的主转录调节因子的功能表达和预后相关性,揭示了欧洲美国人(EA)和非洲裔美国人(AA)在乳腺癌生存率方面存在差异的功能性因素。...the Association Between Luminal Master Regulator Gene Expression Levels and Breast Cancer Survival 管腔主要调节性基因表达水平与乳腺癌生存率关系的种族差异...基于此背景,研究人员收集了293名欧洲美国人和262非洲裔美国人的临床以及病理等相关数据,通过IHC分析了样本的管腔分化的功能标志物的蛋白质水平以及网络水平的基因表达,如ESR1、FOXA1和GATA3...为了证明FOXA1 和 GATA3在预测过程中的意义,研究人员发现FOXA1或GATA3中的任一高表达会使得本倾向好转的病人病情恶化(fig3B、C)。...ECU和TCGA的数据库比较分析种族与生存率的关系 三、 结论 本研究基于收集的不同种族美国人的乳腺癌患者数据,通过更高级的回顾性队列研究,分析揭示了管腔主表达因素与生存率之间的种族差异的机制。

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    单细胞分析支持人类前列腺癌研究中腺泡-神经内分泌的转分化的观点

    名患者(患者#2、#5和#6)中检测到明显的神经内分泌分化(NED),与病理结果一致。...在这三名患者中检测到的NE High细胞群都属于上皮细胞,而不是非上皮细胞间隔,支持NED的上皮性起源。...其它加分项 确定了NED的上皮性表型后,通过计算去除所有非上皮性细胞,然后对剩余细胞进行Pearson相关性分析 通过分析细胞表型/状态,发现所有NE细胞都显著地表现出管腔表型而不是基础表型,CNV分析支持...(簇0-3) UMAP显示NE细胞在转录水平上更接近管腔细胞,而不是基底细胞或尿路上皮样细胞,通过对SYP和KRT8的分析进一步验证了SYP表达细胞的腔表型。...提出了一个模型,前列腺癌可以从基底细胞和管腔细胞开始,而局灶性和最终的神经内分泌性前列腺癌更可能是由具有管腔表型的去甲肾上腺素前体细胞引起的。 看完记得顺手点个“在看”哦!

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    高分文献分享---健康乳腺组织的完整单细胞衰老图谱(scRNA + scATAC + Spatial)

    知识积累 衰老是癌症的最大危险因素 scRNA + scATAC + Spatial 在人类乳腺肿瘤中发现了衰老乳腺细胞的转录特征,这表明衰老与癌症之间可能存在联系。...结果1、乳腺随着年龄的增长而发生细胞组成变化 结果2、老年上皮细胞的基因表达和染色质变化 总体而言,80%、71%和82%的与年龄相关的差异表达(DE)基因分别在管腔AV、管腔HS和肌上皮细胞中具有细胞类型特异性...结果4、成纤维细胞表达ECM和衰老标志物与年龄的关系 在基质中,成纤维细胞、周细胞和血管细胞显示出与年龄相关的基因表达和染色质可及性变化。...结果5、毒性T细胞随着年龄的增长而扩增并表现出耗竭标志物 细胞类型特异性标记基因启动子周围的染色质在相关细胞类型中更容易获得。...结果6、骨髓细胞亚群随年龄增长而扩大 结果7、老年乳腺细胞相互作用的空间分布 细胞类型与配受体之间的共定位分析 结果8、小鼠衰老与人类乳腺癌症的保留特征 最后关注一下分析方法,细胞类型和配受体的共定位

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