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linux 软件安装

rna,并指定环境python版本为python=3 conda create -y -n rna python=3 创建小环境成功后会出现3个done 图片 三、安装软件 图片 1.安装软件方法...: 图片 安装 conda install 出现三个done 显示安装完成 图片 2.安装特定版本 图片 3.特殊情况 图片 4.查看conda 环境中已经安装软件 conda...list #基本用法 conda list fast #查看符合正则表达式软件 conda list -n rna #查看指定环境软件 5.删除软件 conda remove ...conda remove -n rna #删除指定环境里软件 6.常用命令 图片 7.安装软件另一种方式:用yml文件安装 • 导出当前环境: conda env export...envname > env.yml • 导入环境: conda env create -n envname --file env.yml 8.mamba 安装软件更加丝滑 #安装mamba conda

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    LINUX 安装软件

    1.4 安装软件方法RPM(红帽软件包管理器)RPM有点像Windows系统中控制面板,会建立统一数据库,详细记录软件信息并能够自动分析依赖关系。...Yum软件仓库便是为了进一步降低软件安装难度和复杂度而设计技术。Yum软件仓库可以根据用户要求分析出所需软件包及其相关依赖关系,然后自动从服务器下载软件包并安装到系统。...all列出仓库中所有软件包yum info 软件包名称查看软件包信息yum install 软件包名称安装软件包yum reinstall 软件包名称重新安装软件包yum update 软件包名称升级软件包...软件包组安装指定软件包组yum groupremove 软件包组移除指定软件包组yum groupinfo 软件包组查询指定软件包组信息安装软件命令是“yum install软件包名称”,那么现在则是...初始化进程作为Linux系统启动后第一个正式服务,它需要完成Linux系统中相关初始化工作,为用户提供合适工作环境。同学们可以将初始化进程粗犷地理解成从我们按下开机键到看见系统桌面的这个过程。

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    Linux基础软件-软件安装

    Linux进阶部分又分了很多小部分,我们刚讲完了Linux日常运维。...讲那些东西都算是系统自带,但是Linux作为一个服务器操作系统,肯定是要安装运行软件来满足我们业务需要,本章基础软件部分,将从下面几个部分来讲解: Linux基础软件-软件安装(本章节) Linux...基础软件-yum(一) Linux基础软件-yum(二) Linux基础软件-ntp Linux基础软件-chrony Linux基础软件-dns(一) Linux基础软件-dns(二) Linux基础软件...-nfs Linux基础软件-lvm Linux基础软件-Selinux&库文件&swap 前面的操作都是基于默认自带软件,而且我们讲过很多命令,默认最小安装情况下,都是不自带,都需要额外安装,那我们应该如何安装这些软件呢...RPM安装软件 其实前面yum安装软件格式都是rpm格式,只是yum是从网上下载包来安装,而部分包是在网上仓库里面是没有的,或者没有网络环境就可以使用rpm包进行安装

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    Linux安装软件几种方式

    Linux软件安装方式主要有源码安装,rpm安装,yum安装,而常用安装包主要有以下三种: tar包:例如software-1.2.3-1.tar.gz。...注意:大多数Linux应用软件命名也有一定规律,它遵循:   名称-版本-修正版-类型 例如:software-1.2.3-1.tar.gz 软件名称:software 版本号:1.2.3 修正版本...:1 类型:tar.g 常见安装方法 常见安装方法之源码安装 源码安装 几乎所有的开源软件都支持在Linux下运行,而这些软件一般都以源码形式发放,只需要Linux安装了gcc、make、automake...由于是本机编译,只要编译通过,就没有各种库依赖问题) 源码安装缺点 编译麻烦 缺乏自动依赖管理,软件升级麻烦 rpm包安装 rpm包安装方式 rpm包安装几乎在所有Linux平台上都支持,它就像...,它是安装一个软件,在CentOS中是软件管理器 Yum软件仓库便是为了进一步降低软件安装难度和复杂度而设计技术,为了解决软件包之间依赖关系,但是必须要在联网情况下完成 yum -y install

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    Linux软件安装(三)

    软件安装 1.1 软件安装方式 在Linux系统中,安装软件方式主要有四种,这四种安装方式特点如下: 安装方式 特点 二进制发布包安装 软件已经针对具体平台编译打包发布,只要解压,修改配置即可 rpm...(安装过程需要联网) 源码编译安装 软件以源码工程形式发布,需要自己编译打包 1.2 安装JDK 上述我们介绍了Linux系统软件安装四种形式,接下来我们就通过第一种(二进制发布包)形式来安装JDK...RPM:全称为 Red-Hat Package Manager,RPM软件包管理器,是红帽Linux用于管理和安装软件工具。...将资料中提供MySQL安装包上传到Linux并解压 A. 上传MySQL安装包 在课程资料中,提供有MySQL安装包 ,我们需要将该安装包上传到Linux系统根目录 / 下面。 B....-permanent firewall-cmd --reload 1.5 安装lrzsz lrzsz 是用于在Linux系统中文件上传下载软件

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    Linux基础(软件安装

    Linux中,安装软件通常有三种途径:既可以使用安装包,也可以借助于APT,还可以从源码安装。他们各有特点,操作方式也不尽相同。...Linux软件既可以是软件安装包,就像windows一样,也可以是源码包。...而对于安装包而言,不同Linux发行版所使用格式不一样,比如RedHat使用是yum格式安装包,Ubuntu则使用deb格式 以Ubuntu为例,安装软件第一种方法,就是搜索并找到所需要deb...但是这种办法一般不推荐使用,因为Linux软件一般都只包含最精简代码,不会包含所依赖库或者其他函数接口程序,这就导致我们直接安装deb包时常常会发现系统缺少它所依赖其他库或者服务,不得已需要先安装它们...然而,有时我们需要研究、改造软件源码,在Linux世界中绝大多数软件都遵循GPL开源条款,我们可以获取源代码并编译他们,例如我们获取了jpeg库源码,在源码顶层目录中编译安装三部曲如下: .

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    Linux软件安装

    而在Linux安装软件难度高于Windows、Android、ios和windows phone下软件安装。下面我就详细讲解Linux下如何安装软件。...Linux软件安装大概可以分为如下几种: 1....源码安装 3.2 二进制安装 Linux下二进制格式软件是指事先已经在各种平台编译安装好相关软件,然后压缩打包,在安装时只需解压或者执行安装可执行文件即可。...、授权许可、安装需求、安装注意事项、安装方式等等,由于linux各个版本差异,以及安装环境不同,软件安装方式也不尽相同,所以在安装软件前,一定要事先阅读这个README文件,确保安装正确性。...3.7.3.2 分析安装平台环境 在软件包解压完毕之后,我们进入源码目录,一般都会存在confifigure和README这么两个文件,README就是上面我们讲到,是对软件介绍和安装说明;linux

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    linux安装软件

    业界软件标准安装有三步:configure,make,make install,下面是它们定义: ./configure是用来检测你安装平台目标特征。...make是用来编译,它从Makefile中读取指令,然后编译。 make install是用来安装,它也从Makefile中读取指令,安装到指定位置。.../configure --prefix=/usr/bin/gdb-7.10,意思是将gdb软件安装到/usr/bin/gdb-7.10下面,如果后续要卸载,可以使用make uninstall或者直接将.../usr/bin/gdb-7.10删除即可;同时如果其他机器也需要该软件,只要简单拷贝过去改下环境配置就可以用,而无需再次安装。...注意:要安装到指定位置必须执行make install命令 安装到自定义目录后,如果需要系统在任意目录都能识别该命令,则需要在PATH环境变量中添加该路径。

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    linux环境下软件安装

    _64.sh 在linux环境下复制粘贴点击右键,不动键盘安装详细过程linux安装脚本运行代码:bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh然后开始安装过程,中间会出现很多版权信息...,执行代码在教程中有标注,还顺便换了pip和yum镜像conda使用查看当前服务器上安装所有软件conda list实操过程(图片放不上来)(base) bio10@ecm-cefa:~/biosoft...因为只有安装成功软件才能看到帮助文档,所以出现了这篇帮助文档就可以确定已经安装成功。...每一个项目都需要不同软件,另外软件之间结合也是需要版本要求,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件V 1.5版本,就可以按照项目定制不同分身,安装不同软件,互不干扰...然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic(这两个可以一步完成)(这里指定python版本是因为有的软件是基于python开发,不需要学习或者做什么)conda create

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    Linux软件安装

    Debian 系列(如 Ubuntu) 使用 APT(高级软件包工具) APT是Debian系列发行版默认包管理工具,通过以下步骤来安装、更新和卸载软件包: 更新软件包列表: sudo apt update...来升级所有已安装软件包。...使用 dpkg(Debian软件包管理器) 如果您有一个.deb格式软件包文件,可以使用dpkg命令进行安装: sudo dpkg -i package.deb Red Hat 系列(如 CentOS...使用包管理工具时,尽可能使用官方软件源以确保软件可靠性和安全性。 在使用源码编译安装时,可能需要安装相关开发工具和依赖项。 这只是一个基本介绍,具体步骤可能会有所不同。...在安装软件包之前,请查阅相关文档和官方指南以获取更详细信息。希望这篇文章能够为您提供一个入门指南!

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    Linux 软件常用安装方法

    Linux系统中常用软件安装方式有yum rpm gcc(编译源码安装) 这3种方式,以下内容将对着3种安装方式做详细介绍。...rpm不会自动分析依赖关系,并且需要准备一个.rpm软件包,所以你在使用rpm安装软件时候经常会先安装依赖软件,这么才能安装成功。...其实依赖软件也可以使用yum来安装,rpm对软件查询提供了很好支持,当然查询是指已安装软件,列举几个常用查询软件方式。...名称 说明 示例 rpm -qa 查询系统中所有的软件包 rpm -q httpd 查找指定软件包有木有安装 rpm -qi 查询软件详细信息 rpm -ql httpd 查看httpd安装所有文件...Target: x86_64-redhat-linux Configured with: ..

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    linux软件安装(一)——源码安装

    Linux源码安装步骤 获取源码 将软件源码下载至/usr/local/,并解压。...注意:–prefix参数指定软件安装目录。当执行make install命令时,会将软件安装在此路径中。...6.执行make install,将软件安装至指定目录 make install 此时二进制文件会被安装到先前configure prefix参数设置路径中去。 安装完成!...Linux函数库 1. 什么是“Linux函数库”? 运行在Linux软件时常会调用Linux内核某些功能或其他软件某些功能,那么这些被软件调用功能称为Linux函数库。...软件自身函数库存放在软件安装目录下lib中,而Linux函数库存放在/usr/lib和/usr/include中,linux内核函数库存放在/lib/modules中。 2.

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    Linux软件安装 01 Conda安装与使用

    Conda主要是解决软件安装问题1.1 下载Condawget 相当于Linux迅雷wget -c 断点续传 - - continue1.2 安装Miniconda3安装后需要重新加载查看conda...list/conda info --env列出已经存在小环境1.4.3 小环境修改与删除1.4.4 使用conda安装软件1.4.4.1 需要安装哪些软件?...1.4.4.2 哪些软件可以使用conda来安装?在安装之前确保小环境被激活conda可以一次安装多个软件,但是容易遇到报错1.4.4.3 如何指定安装软件版本?...1.4.4.4 如何确定软件是否安装上?3个done表示下载完成通过调用软件帮助文档来检查是否下载成功安装软件和调用软件不一定一样!...1.4.4.5 查看conda环境中已经安装软件conda list图片1.4.4.6 删除软件conda remove fastqc删除特定环境下特定软件conda remove -n rna fastqc

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    Day3_linux软件安装

    最后还得激活一下才能用:source ~/.bashrc #激活conda代码,注意空格conda #出现满屏信息说明成功了2.配置conda镜像安装软件需要配置镜像:所谓镜像网站,相当于主网站副本...conda list安装软件conda install fastqc -y #-y是yes,安装过程中conda问问题全部回答yes默认安装最新版本,但是有的软件新版本有bug,可能需要用到老版本...,要指定版本号conda install fastqc=0.11.7 -y3.确认fastqc软件是否安装成功输入fastqc --help,如果出现一大片文字,这是软件帮助文档。...因为只有安装成功软件才能看到帮助文档,所以出现了这篇帮助文档,就可以确定已经安装成功。4. 创建conda环境首先理解一个叫做“conda 环境”东西。...按照你项目,定制不同分身,安装不同软件,互不干扰。这个分身就是不同“conda environment”。

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    linux安装软件几种方法

    但由于RPM出现得更早,所以在各种版本Linux都常见到。 而debian包管理器dpkg则只出现在Debina Linux中,其它Linux版本一般都没有。   1....这也是一个Linux特色问题。其实,一般来说, Linux应用软件可执行文件会存放在/usr/local/bin目录下!...这个命令会将已安装软件包裹.deb文件一并删除。 apt-get clean——这个命令会把安装软件备份也删除,不过这样不会影响软件使用。...六、yum方式安装:(安装rpm包) rpm 是linux一种软件包名称,以.rmp结尾,安装时候语法为:rpm -ivh。...rpm包安装有个很大缺点就是文件关联性太大,有时装一个软件安装很多其他软件包,很麻烦。

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    linux软件安装,更新与卸载

    linux软件安装,更新与卸载 Linux常见安装为tar,zip,gz,rpm,deb,bin等。我们可以简单分为三类....bin里面的sh来解          压bin中zip或安装rpm过程 1. rpm安装,更新与卸载    RPM包,这种软件包就像windowsEXE安装文件一样,各种文件已经编译好,并打了包.../configure --help 来查看配置软件功能;大多软件是提供./configure 配置软件功能;少数也没有,          如果没有的就不用....     2) 用CD 命令进入编译后软件目录,即安装目录      3) 执行反安装命令:make uninstall 4. yum安装    yum是rpm管理工具,管理一个软件库,可以很好解决依赖关系...软件名    或    yum erase -y 软件名 5  apt-get安装    apt-get是deb管理工具,类似yum    apt-get install package 安装

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    Linux软件安装(伪)指南

    ---- 在一开始学习Linux时候,就发现装个软件怎么这么难,并且有好多个命令。 一会是apt,一会是yum。其实这是由于linux不同发型版导致。...他们都是在linux内核基础上增加了一些常用工具和软件等打包而成,通过销售服务在开源linux上获得盈利 linux发行版主要分为以下两类: 一类是使用rpm 方式安装软件系统,包括Red...一类是dpkg方式安装软件系统,包括Debian,Ubuntu,B2D等。 rpm与dpkg 当你有个软件包,想要安装它时,然后就可以根据软件格式不同来选用这两个命令。...,也是通过一条命令就能安装软件。...Python pip 安装与使用 参考 鸟哥Linux私房菜 Red Hat、Fedora和Ubuntu软件包操作对比 欢迎与我分享你看法。

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