IO 重定向是为了改变默认输入、输出的位置，如默认情况下标准输出（STDOUT），标准错误输出（STDERR）都是输出到显示终端，如对标准输出、标准错误输出改变其默认输出位置，可重定向输出到指定的文件中（实际工作中经常这么使用），要重定向就要配合一些语法符号。
Linux下的标准输入、输出、重定向、管道 在Linux系统中，有4个特殊的符号，<, ‘>’, ‘|’, ‘-‘，在我们处理输入和输出时存在重要但具有迷惑性的作用。 默认Linux的命令的结果都是输出到标准输出，错误信息 (比如命令未找到或文件格式识别错误等) 输出到标准错误，而标准输出和标准错误默认都会显示到屏幕上。 >表示重定向标准输出，> filename就是把标准输出存储到文件filename里面。标准错误还是会显示在屏幕上。 2 >&1 表示把标准错误重定向到标准输出。Linux终端用2表示标准
杂项题目主要是以文件附件作为题目，但是给的文件不一定是有后缀名的，这就需要我们识别这些文件
编译：丁一 黄念 丁雪 校对：席雄芬 姚佳灵 程序验证：郭姝妤 序言 在Python中调用R或在R中调用Python，为什么是“和”而不是“或”？ 在互联网中，关于“R Python”的文章，排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点，而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的：这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。然而，随着数据科学家的增加，这种区别开始变得模糊
什么是数据？数据是指对客观事件进行记录并可以鉴别的符号，是对客观事物的性质、状态以及相互关系等进行记载的物理符号或这些物理符号的组合。它是可识别的、抽象的符号。数据可以是连续的值，也可以是离散的。
在Python中调用R或在R中调用Python，为什么是“和”而不是“或”？ 在互联网中，关于“R Python”的文章，排名前十的搜索结果中只有2篇讨论了一起使用R和Python的优点，而不是把这两种语言对立起来看。这是可以理解的：这两种语言从一开始都具有非常显著的优缺点。从历史上看，尽管把两者分割开来是因为教育背景：统计学家们倾向用R，而程序员则选择了Python语言。然而，随着数据科学家的增加，这种区别开始变得模糊起来： 数据科学家就是这样一种人：软件工程师中最懂统计学，统计学家中最会编程的人。
二、管道 1.管道 （1）是什么? 命令从 标准输入 到 读取数据，并将 数据 发送到 标准输出 的能力，是使用了名为 管道 的 shell特性。 （2）管道操作符“|”（怎么做） 使用管道操
标准错误输出：在Linux中是stderr，在JAVA中是System.err，在Golang中是Print()/Println()
这时我们就不能看到输出了，如果我们既想把输出保存到文件中，又想在屏幕上看到输出内容，就可以使用tee命令了。
补充说明： fmt命令读取文件的内容，根据选项的设置对文件格式进行简单的优化处理，并将结果送到标准输出设备。
本章将要探讨——I/O重定向 功能。I/O 是input/output的缩写。这个功能可以把命令行的输入 重定向为从文件中获取内容，也可以把命令行的输出结果 重定向到文件中。如果将多个命令行关联起来，将形成非常强大的命令——管道。接下来，将通过介绍以下命令来展示I/O重定向。
所有者的权限为rw-,对应着4+2+0，也就是最终的权限6，以此类推，用户组的权限为6，其他用户的权限为4.
tee命令从标准输入读取数据后，将数据重定向到给定的文件和标准输出。给定的文件可以有多个。
精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
作者精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
在日常使用Linux命令时候，经常使用重定向或者管道的方式处理命令的结果。以前对这两个命令的使用场景存在一些困惑，所以本文对这两个命令进行详细的总结。
shell 俗称叫做壳，计算机的壳层，和内核是相对的，用于和用户交互，接收用户指令，调用相应的程序。
System类代表系统，系统级的很多属性和控制方法都放置在该类的内部。该类位于java.lang包。
将把 dir 命令的标准屏幕输出重定向到文本文件 filelisting.txt 文件里
重定向与管道符 重定向 --- 作用： 将命令的执行结果输出到指定的文件中，而不是直接显示在屏幕上 0 标准输入 键盘 stdin 仅读取 1 标准输出 终端 stdout 仅写入 2 标准错误 终端 stderr 仅写入 3+ filename 其他文件 读/写 在Linux中构建了一个带有编号标记的通道（文件米描述符）的进程来管理打开文件 通过进程连接到文件，进行文件数据的操作 重定向标准输出 - 1>（1可省略） - 将命令的执行结果输出到指定文件中，而不是显示在屏幕上，覆盖写 -
Linux基础IO 零、前言 一、C语言文件IO 1、C库函数介绍 2、stdin/stdout/stderr 二、系统文件IO 1、系统调用介绍 2、系统调用和库函数 三、文件描述符 1、open返回值 2、fd分配规则 四、重定向 1、概念及演示 2、dup2系统调用 3、重定向的原理 4、缓冲区和刷新策略 五、文件及文件系统 1、FILE 2、文件系统 3、软硬链接 六、动静态库 1、制作使用静态库 2、制作使用动态库 零、前言 本章主要讲解学习Linux基础IO流的知识 一、C语言文件IO 1
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在许多UNIX说明文件里，都有RLF控制字符。当我们运用shell特殊字符">"和">>"，把说明文件的内容输出成纯文本文件时，控制字符会变成乱码，col指令则能有效滤除这些控制字符。
命令格式： 命令1 | 命令2，有一定的编程思想在里面 命令1的正确输出作为命令2的操作对象，和逻辑与不一样
文 | 豌豆 来源 | 菜鸟教程 豌豆贴心提醒，本文阅读时间5分钟，文末有秘密！ Linux col命令 Linux col命令用于过滤控制字符。 在许多UNIX说明文件里，都有RLF控制字符
好了，在有了以上知识的基础上，我们再来看开头提到的>/dev/null 2>&1。这条命令其实分为两命令，一个是>/dev/null，另一个是2>&1。
locate会根据/var/lib/mlocate内的数据库记载，找出用户输入的关键字文件名，即所有包含该关键字的文件都将被输出。但是因为数据库的更新一般为一天一次，所以如果需要查找新的内容，需要用updatedb指令更新数据库，updatedb会根据/etc/updatedb.conf去查找硬盘内的文件名，并更新数据库文件
sambamba 主要是由Artem Tarasov开发的一款高效的生物信息学工具，主要用于处理大规模的测序数据，尤其是针对SAM/BAM格式的文件。这个软件的设计目的是为了提供比现有工具(samtools)更快的性能，特别是在多核处理器系统上，它利用多核处理并显著缩短处理时间。其具有以下特性：
计算机的硬件设备有很多种，常见的输入设备有键盘、鼠标、手写板等，输出设备有显示器、投影仪、打印机等。不过，在 Linux 中，标准输入设备指的是键盘，标准输出设备指的是显示器（屏幕）。
我之前已经用文本编辑器修改过文本。现在，我们要深入理解所谓的“文本”。 文本流 在计算机中，所谓的数据就是0或1的二进制序列，但严格来说，Unix以字节（byte）来作为数据的单位，也就是说这个序列每八位（bit）为一个单位。八位的二进制数字，会落在十进制从0到255的范围内。利用ASCII编码，可以把这一个字节转换成为256个字符中的一个。所以，在Unix中，数据完全可以用字符的形式表示出来，也就是所谓的文本（text）。 实际上，如果以位为单位的话，机器会更容易读懂和传输。但Unix系统坚持用字节为单位
在C语言中，scanf和printf函数用于标准输入和标准输出的输入输出操作。而在Linux中，STDIN_FILENO和STDOUT_FILENO是用于表示标准输入和标准输出的文件描述符。
1 什么是数据流重定向？ Linux中，数据流的重定向被分为输入重定向 和 输出重定向。 输出重定向 将原本应该输出到屏幕上的信息输出到文件中。 当执行一个命令后，该命令输出的结果本应该显示在屏幕上。但输出重定向能让命令的执行结果保存到文件中去。 此外，由于Linux中的设备都是以文件的形式存在，因此输出重定向还可以将命令执行的结果输出到指定设备上去。 命令 > 文件 命令的执行结果将会保存到>后面的文件中去，而不会在屏幕上显示。 输入重定向 将原本应该从键盘输入数据的方式改为从文件中读取
at 命令是用于一次的定时任务，使用起来十分简便，而且定时的日期多样化，注意其需要 atd 服务的支持
iconv命令是用来转换文件的编码方式，比如它可以将UTF8编码的转换成GB18030的编码。Linux下的iconv开发库包括iconv_open,iconv_close,iconv等C函数（非标准库函数），可以用来在C/C++程序中很方便的转换字符编码。
gzip（GNU zip）命令用来压缩和解压缩文件，是在 Linux 系统中经常使用的一个对文件进行压缩和解压缩的命令，采用 LZ77 无损压缩算法，压缩后的文件一般使用 .gz 后缀。
此篇文章主要会带你介绍 Linux 操作系统，包括 Linux 本身、Linux 如何使用、以及系统调用和 Linux 是如何工作的。
当在 C 语言中进行文件操作时，fopen() 和 fclose() 是两个非常重要的函数。下面我将详细讲解它们的作用和用法：
在 Linux 中，数据流重定向是一种将命令的输出或错误输出从一个地方（如屏幕）重定向到另一个地方（如文件或设备）的技术。
在企业Linux Server 坏境中，经常是没有图形环境，只有一个终端窗口（黑乎乎的命令行和闪动的提示符）。Linux的前身是Unix，保留着很多Unix下的使用习惯，所以大多数命令也适用于其他UNIX系统，比如我比较熟悉的思科路由器底层。
1.标准输入(stdin)是指令数据的输入，代码为0，使用<或者<<,默认是键盘。
kingfisher是由昆士兰科技大学微生物组研究中心的 Ben J. Woodcroft 教授开发的一款专门用于高通量测序数据下载的工具。
小编最近在研究Linux下的脚本编写，其中很多环节涉及到和多个命令组合使用，如：自动输入系统密码等；而在Linux下最常用的就是管道和重定向。
1、Linux标准输入输出 Linux标准输入、输出设备主要是键盘和显示器，详细介绍如下表所示。
大家知道，在 Linux 下，一切皆文件，对于设备文件也是如此。我们在工作的过程中，经常会看到 /dev/null 这个玩意，那它到底是什么呢？
原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-shell-redirect.html
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