前面我们简单介绍过什么是gmt文件，基因矩阵转置文件格式（* .gmt）。今天我们就用R来去读gmt文件。...首先我们从GESA(https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp)的官网上，下载一个gmt文件。...这里以KEGG的gmt文件为例，其他gmt文件的读取方法一样。 ? c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt这个文件里面保存的是基因的名字， ?...而c2.cp.kegg.v7.0.entrez.gmt这个文件里面保存的是基因的Entrez gene id， ?...下面我们会用两种不同的方法来将KEGG symbol的gmt文件读到R里，并转换成列表。由于gmt文件的每一行都是不一样长的，所以传统的read.table在这里是毫无用武之地的。
UTC（Coordinated Universal Time，世界协调时间） 多数的两地时间表都以GMT来表示，但也有些两地时间表上看不到GMT字样，出现的反而是UTC这3个英文字母，究竟何谓UTC？...”为单位的国际原子时所综合精算而成的时间，计算过程相当严谨精密，因此若以「世界标准时间」的角度来说，UTC比GMT来得更加精准。...所以基本上UTC的本质强调的是比GMT更为精确的世界时间标准，不过对于现行手表来说，GMT与UTC的功能与精确度是没有差别的。...一个简单的时间转换，如北京东8区为例： GMT + 8 = UTC + 8 = CST GMT与UTC区别 GMT和UTC都以伦敦格林威治时间为准，不同点是UTC比GMT更精准！...在UTC中，每一年或两年会有一个“闰秒”，而我们一般不理会这个“闰秒” 参考推荐： GMT，UTC，DST，CST时间表示的区别 UCT和GMT时间 双重标准？ Retina屏科学原理
GMT GMT是指格林尼治标准时间，它对应位于英国伦敦郊区的皇家格林威治天文台的标准时间。 理论上来说，格林威治标准时间的正午是指当太阳横穿格林威治子午线时（也就是在格林威治上空最高点时）的时间。
MSigDB（Molecular Signatures Database）数据库里面的gmt文件超级多，是broad研究所为他们开发的gsea分析定义的文本文件规范，就是每一行都是一个通路（基因集合），...R里面，就可以自己写一个函数，比如 write.gmt 进行输出到gmt文件（本质上仍然是文本文件）： library(msigdbr) all_gene_sets = msigdbr(species...(gs,file) 读取gmt文件 假如你拿到了gmt文件，很容易读取它并且去做分析，下面有两个不同包的函数： file="Homo-H-examp.txt" gmt <- GSEABase::getGmt...( file ) #GeneSetCollection 对象 gmt clusterProfiler::read.gmt( file ) # 普通数据框 跨越gmt文件 其实完全没必要写出gmt文件...和GSEA 首先呢，clusterProfiler重新改写了gmt文件和做gsea的方法，所以代码稍微有一点点不同。
gmt文件可能对于很多人来说比较陌生，但是对于使用GSEA（https://www.gsea-msigdb.org/）做过基因富集分析的人应该并不陌生。...gmt（Gene Matrix Transposed，基因矩阵转置）文件，里面保存的是一些基因列表的信息。每一行代表一个基因列表，基因之间以制表符隔开。下面是一个gmt文件的示例。...下期我们将来谈谈如何用R读取gmt文件，为后续富集分析做准备。
GMT-格林尼治标准时 GMT 的全名是格林威治标准时间或格林威治平时 （Greenwich Mean Time），这个时间系统的概念在 1884 年确立，由英国伦敦的格林威治皇家天文台计算并维护，并在往后的几十年往欧陆其他国家扩散...在刚开始的几十年，GMT 的测量方法非常简单：观测者随时监控太阳在天空的位置，并且把每天太阳爬升到仰角最高的时候记录下来，这个时间点称呼为“过中天”。...这个就是 GMT。 GMT 12:00 就是指的是英国伦敦郊区的皇家格林尼治天文台当地的中午12:00，而GMT+8 12:00，则是指的东八区的北京当地时间的12:00。...如果上述时间指的是纽约时间，那么纽约是GMT-5，所在地北京GMT+8，相差13个小时,转换成北京时间为2019年2月1号09:00。...如果上述时间指的是东京时间，那么东京是GMT+9，所在地北京GMT+8，相差1个小时,转换成北京时间为2019年2月1号21:00。
时间修改 查看虚拟机系统时间 [root@node01 ~]$ timedatectl Local time: 日 2022-09-18 10:22:31 GMT Universal time...2022-09-18 10:22:31 UTC RTC time: 日 2022-09-18 10:22:31 Time zone: Atlantic/Reykjavik (GMT...查看系统时区 [root@node01 ~]$ ls /usr/share/zoneinfo/ Africa Atlantic Chile Eire GB GMT...Pacific PRC Singapore US zone.tab Antarctica Brazil Cuba EST5EDT GMT...Hongkong iso3166.tab leapseconds MST7MDT Poland PST8PDT Turkey UTC Zulu
系统框架为 linux+Huawei LiteOS 双系统架构，媒体业务部署在 Huawei LiteOS 端，为了上电快速预览，需要屏幕需部署在 Huawei LiteOS。...用户交互业务在 linux 端，屏幕亮度、熄屏/亮屏等屏幕动态属性需要在 linux 端提供接口。 屏幕 HAL 层含 linux 和 Huawei LiteOS 业务接口。...linux 通过 ipcmsg 将命令传送给 Huawei liteOS，所有业务功能实现都在 Huawei LiteOS 端。...│ ├── src │ │ ├── hi_product_main.c //linux 端初始化实现 │ ├──Makefile └── Makefile 2. linux 一端的代码 Linux 端初始化主要处理与业务功能强相关的初始化操作...之间利用 IPCM 通信和共享内存，实现其读写 Linux上指定目录下的内容。
一、日期格式后缀法通常new Date()会得到一个这种结构的日期时间：Thu Dec 09 2021 15:19:04 GMT+0800最后的GMT表示格林尼治时间，+0800表示东八区如果new Date...()带有包含时区的参数，会把参数时间转换成当前时区时间，比如：new Date('Thu Dec 09 2021 15:19:04 GMT+0900') 会输出Thu Dec 09 2021 14:19...:04 GMT+0800，意思就是东九区的15点19分实际上是东八区的14点19分，省略掉GMT直接+-数值也是可以的new Date('Thu Dec 09 2021 15:19:04 +9')除了gmt...，utc也可以表示0时区，只是两者意义不同，UTC称为协调世界时，其它常见的还有PDT（太平洋夏季时间），PST（太平洋标准时间、西八区）此外还有一种日期格式：2021-12-09T07:36:28ZT
BST或BDT 美国山区时间：MST或MDT 美国中央时区：CST或CDT 新大陆标准时间：NST 美国东部时间：EST或EDT 太平洋标准时间：PST或PDT...格林威治标准时间：GMT Yukou标准时间：YST或YDT 【示例】 select to_char(sysdate,'yyyy.mm.dd hh24:mi:ss') bj_time..., to_char(new_time(sysdate,'PDT','GMT'),'yyyy.mm.dd hh24:mi:ss') los_angles from dual; 返回： BJ_TIME...---------- 2008.11.05 20:11:58 2008.11.06 03:11:58 【示例】 select sysdate bj_time, new_time(sysdate,'PDT...','GMT') los_angles from dual; 返回： BJ_TIME LOS_ANGLES ------------------- ---------------
格林威治标准时间GMT 十七世纪，格林威治皇家天文台为了海上霸权的扩张计画而进行天体观测。...世界协调时间UTC 多数的两地时间表都以GMT来表示，但也有些两地时间表上看不到GMT字样，出现的反而是UTC这3个英文字母，究竟何谓UTC？...事实上，UTC指的是Coordinated Universal Time－ 世界协调时间（又称世界标准时间、世界统一时间），是经过平均太阳时(以格林威治时间GMT为准)、地轴运动修正后的新时标以及以「秒...」为单位的国际原子时所综合精算而成的时间，计算过程相当严谨精密，因此若以「世界标准时间」的角度来说，UTC比GMT来得更加精准。...所以基本上UTC的本质强调的是比GMT更为精确的世界时间标准，不过对于现行表款来说，GMT与UTC的功能与精确度是没有差别的。
[zk: localhost:2181(CONNECTED) 4] get /test "test" cZxid = 0x300000007 ctime = Thu Sep 24 05:54:51 PDT...2015 mZxid = 0x300000007 mtime = Thu Sep 24 05:54:51 PDT 2015 pZxid = 0x300000007 cversion = 0 dataVersion...zk: localhost:2181(CONNECTED) 7] set /test "111111" cZxid = 0x300000007 ctime = Thu Sep 24 05:54:51 PDT...zk: localhost:2181(CONNECTED) 8] get /test "111111" cZxid = 0x300000007 ctime = Thu Sep 24 05:54:51 PDT...zookeeper-server1]# echo stat|nc 127.0.0.1 2181 Zookeeper version: 3.4.6-1569965, built on 02/20/2014 09:09 GMT
欢迎订阅微信公众号:『气象学家』 阅读建议 仅仅就macOS安装GMT5为例来展开，Linux平台和GMT6暂时不介绍。 后续会增加更多气象领域的更多应用实例。...GMT 默认会安装到 /Applications/GMT-5.4.5.app/ 目录下。...# GMT export GMT5HOME=/usr/local/Cellar/gmt/5.4.5_3/ export PATH=${GMT5HOME}/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH...用gmt pstext -L命令查看 GMT 当前的字体配置: $ gmt pstext -L Font # Font Name ---------------------------------...psconvert -A -P -Tf GMT_Chinese.ps gmt psconvert -A -P -Tg GMT_Chinese.ps rm gmt.* 注意： 生成的 PNG、
下载的gmt格式文件，打开后可以看见是下面这个样子的： gmt（Gene Matrix Transposed，基因矩阵转置）是多列注释文件，列与列之间都是Tab制表符分割。...gmt文件可用 read.gmt()函数读入，读入的数据是一个数据框。 gmt gmt("..../c5.go.cc.v7.2.symbols.gmt") class(gmt) 如何制作自定义的gmt文件？...(filename="data/catabolism1.gmt",gmtInfo = gmtInfo) write.gmt2 <- function(filename,gmtInfo){ if(class...(filename="data/catabolism2.gmt",gmtInfo = gmtInfo) 参考： 上次说的gmt函数(学徒作业) https://blog.csdn.net/coding_Joash
this.beginTime=new Date(this.beginTime) this.endTime=new Date(this.endTime) // CST和GMT
Locale.ENGLISH); Date date = format.parse(string); System.out.println(date); // Sat Jan 02 00:00:00 GMT...minute Number 55 S Millisecond Number 978 z Time zone General time zone Pacific Standard Time; PST; GMT...SimpleDateFormat模式的示例，这些模式可以解析迄今为止的给定字符串： Input string Pattern ———————————— —————————- 2001.07.04 AD at 12:08:56 PDT...EEE, MMM d, ”yy 12:08 PM h:mm a 12 o’clock PM, Pacific Daylight Time hh ‘o”clock’ a, zzzz 0:08 PM, PDT...+8; GMT+08:00; UTC-08:00; X zone-offset ‘Z’ for zero offset-X Z; -08; -0830; -08:30; -083015; -08:30:
另外，还有个关键的知识点：所有HTTP日期/时间戳都必须用格林威治标准时间(GMT)表示，没有例外。对于HTTP来说，GMT完全等于UTC(协调世界时)。...UTC和GMT的区别 UTC和GMT都称作世界标准时间，为毛有了GMT还搞出个UTC，到底有何区别，下面做出简述。...所以称它为世界标准时间是没毛病的，而把GMT称作格林威治当地时间更为合适（也叫旧的标准时间）。 UTC和GMT的联系 由于在大多数情况下，UTC时间能与GMT时间互换。...它就是：格林威治时间(GMT)1970年1月1日的午夜0点0分0秒。 时间戳一般指的UNIX时间，或类UNIX系统（比如Linux、MacOS等）使用的时间表示方式。...NTP的目的是在无序的Internet环境中提供精确和健壮的时间服务，各大操作系统（windows/Linux）对NTP都有实现。
基本知识 GMT (Greenwich Mean Time) GMT 是一个 时区，也指一种 时制。...体系，同时 Greenwich 所在的时区也作为 GMT+0 时区。...Leap Second (闰秒) 据上，可知 UTC 刚引入的时候和 GMT 时间是同步的。...每年11月的第一个周日凌晨2点，时钟从2点拨到1点，时制记为 PDT (Pacific Daylight Time)。...例如 2019-03-10 01:59:59 PST 的下一秒是 2019-03-10 03:00:00 PDT ISO Time Format ISO 8601 规定的时间格式：(由 date 和 time
environment:zookeeper.version=3.5.7-f0fdd52973d373ffd9c86b81d99842dc2c7f660e, built on 02/10/2020 11:30 GMT...zookeeper01:2181(CONNECTED) 8] get -s /sanguo lvbu cZxid = 0x700000004 ctime = Tue Apr 05 08:02:45 PDT...2022 mZxid = 0x700000004 mtime = Tue Apr 05 08:02:45 PDT 2022 pZxid = 0x700000005 cversion = 1 dataVersion...zookeeper01:2181(CONNECTED) 16] get -s /sanguo/shuguo zz cZxid = 0x700000005 ctime = Tue Apr 05 08:04:01 PDT...2022 mZxid = 0x700000008 mtime = Tue Apr 05 08:21:34 PDT 2022 pZxid = 0x700000005 cversion = 0 dataVersion
作者将125+Mothur工具整合进Galaxy，并与第三方可视化软件集成GmT，同时具有两者的优势。
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