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使用R语言读取PUBMED存入MYSQL数据库

最近,在科研狗网站看到了一个有趣的项目,使用R语言读取pubmed存入mysql数据库,之前报名没有报上,还是决心要跟着做一下,无奈R语言水平比较渣渣,只能复制别人的代码来用,悲剧的是,原代码复制过来还是报错...原代码参考自R科研作图学习小组组长:木萱小主的作业: http://group.keyangou.com/RGraph/topic/952 这个项目的难点在于要用R语言和MySQL数据库,两者都是初学...首先这个任务的准备工作是安装数据库和phpmyadmin(当然这只是一个选项,还有好多的图形数据库管理软件,据说大牛都是命令行操作的),这个不表。...主要步骤就是第一,用你要查询的关键词或条件获得pubmed-id,标题和摘要,然后格式化一下,放入数据库。...这里还要补充一下,如果边数据库次数太多而没有关闭会报错,有个哥们定义的函数很有用,一起放这。

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    Scrapy存入MySQL

    一、概述 之前利用Scrapy爬取的数据,都是写入在json文件中,现在需要写入到mysql中。...服务器ip:192.168.0.3 用户名:root 密码:abcd@1234 创建数据库 CREATE DATABASE qunar CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci... varchar(255) DEFAULT NULL,   PRIMARY KEY (`id`) ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8; 二、pipelines写入数据库...classmethod     def from_settings(cls, settings):  # 函数名固定,会被scrapy调用,直接可用settings的值         """         数据库建立连接...        if failure:             # 打印错误信息             print(failure) 注意:insert语句,请根据实际情况修改 最后执行爬虫程序,就可以写入数据库

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    bs4爬虫实战三:获取电影信息并存入mysql数据库

    format(item.moviename, item.moviescore, item.moviestarring))                 self.log.info('电影名为:《{}》已成功存入文件...mylog.warn(u"I'm warn 中文测试")     mylog.error(u"I'm error 中文测试")     mylog.critical(u"I'm critical 中文测试") 如果想要存入...mysql数据库,需要先把数据库,表和表结构创建好,还需要知道库名,ip地址,端口,账号和密码 mysql上面的操作,准备工作 mysql> create database bs4DB; Query OK...  on bs4DB.* to "savemysql"@'%';  # 授权savemysql只能操作bs4DB数据库 Query OK, 0 rows affected (0.00 sec) mysql...登陆到mysql查看一下数据是否成功插入 mysql> use bs4DB; Reading table information for completion of table and column

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    使用python将数据存入SQLite3数据库

    Python从网站上抓取的数据为了可以重复利用,一般都会存储下来,存储方式最简单的会选择存储到文本文件,常见的有方式TXT、CSV、EXCEL等,还有一种方式是将数据存储到数据库,这样也方便管理,常见的关系型数据库有...SQLite3、MySQL,非关系型数据库有Redis、MongoDB。...3、数据入库 利用python内置的sqlite3模块实现对sqlite数据库的操作;注意sql语句中使用了格式化输出的占位符%s和%d来表示将要插入的变量,其中%s需要加引号''。...# -*- conding:utf-8 -*- #导入sqlite3库文件 import sqlite3 import json #数据库存在时,直接连接;不存在时,创建相应数据库,此时当前目录下可以找到对应的数据库文件...至此,便将Json格式的数据存储到SQLite3数据库中了,可以进行后续的分析和操作了,下面将代码总结一下,修改便可使用,如若图片看起来不方便,【JiekeXu_IT】公众号后台回复【SQLite3】获取本节源码

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    Python解析excel文件并存入sqlite数据库

    最近由于工作上的需求 需要使用Python解析excel文件并存入sqlite 就此做个总结 功能: 1.数据库设计 建立数据库 2.Python解析excel文件 3.Python读取文件名并解析...4.将解析的数据存储入库 一 建立数据库 根据需求建立数据库,建立了两个表,并保证了可以将数据存储到已有的数据库中,代码如下: import sqlite3 def createDataBase():...name.decode('GBK')   name = name.encode('UTF-8')   return name 四 解析excel文件并将其存储到sqlite   Python连接数据库...选取了Python自带的sqlite数据库 相对简单 在此不做太多介绍 如果大家对Python操作sqlite有疑惑的话 个人推荐菜鸟教程~   下面是解析excel文件并存入数据库,其中包含了判断单元格内容...print "Successful for'%s'--------" % (filename) cn.commit() 整合上述功能: def importData(path): # 数据库

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