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DOCK教程-1

---- DOCK教程 ---- 简介: DOCK是基于Unix的科学计算软件。 遵循通用的安装方法:下载,解压缩,配置,构建和测试。DOCK的简单配置方案基于纯文本文件。...DOCK的安装是如此简单和透明,以使用户有机会自己解决问题。 DOCK是经典的分子对接程序,用于识别潜在的结合构象以及分子与靶标的相互作用。...DOCK能做的 预测小分子-蛋白质复合物的结合模式 搜索配体的数据库,以模拟经过实验验证的抑制剂的抑制性结合相互作用的化合物 在配体数据库中搜索与特定蛋白质的特定位点结合的化合物 搜索与核酸靶标结合的化合物的配体数据库...---- 对接步骤: (1)下载蛋白结构文件: 1ABE.pdb (2)准备受体文件 删除配体分子文件 使用chimera的dock prep功能对受体文件进行准备(删除) 删除水分子,加氢,加电荷 保存为...或者说对接口袋) 需要程序/指令:showsphere sphere_selector (5)生成Grid 围绕着活性位点建立一个box 生成Grid (6)Docking 进行对接(半柔性): 需要程序/指令:dock6

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    dock是什么意思中文_电脑dock是什么

    Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...2.dock一般指的就是苹果操作系统中的停靠栏,也就是苹果电脑桌面中最下方,类似于Windows系统下方的任务栏,不过要比Windows任务栏更加有趣味性。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。

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