DOCK是经典的分子对接软件,很多对接软件的思路都是它的基础上发展起来的,但是无奈操作太复杂,上手的或者用来做科研的论文上少见。...http://ringo.ams.sunysb.edu/index.php/DOCK_Tutorials
---- DOCK教程 ---- 简介: DOCK是基于Unix的科学计算软件。 遵循通用的安装方法:下载,解压缩,配置,构建和测试。DOCK的简单配置方案基于纯文本文件。...DOCK的安装是如此简单和透明,以使用户有机会自己解决问题。 DOCK是经典的分子对接程序,用于识别潜在的结合构象以及分子与靶标的相互作用。...DOCK能做的 预测小分子-蛋白质复合物的结合模式 搜索配体的数据库,以模拟经过实验验证的抑制剂的抑制性结合相互作用的化合物 在配体数据库中搜索与特定蛋白质的特定位点结合的化合物 搜索与核酸靶标结合的化合物的配体数据库...---- 对接步骤: (1)下载蛋白结构文件: 1ABE.pdb (2)准备受体文件 删除配体分子文件 使用chimera的dock prep功能对受体文件进行准备(删除) 删除水分子,加氢,加电荷 保存为...或者说对接口袋) 需要程序/指令:showsphere sphere_selector (5)生成Grid 围绕着活性位点建立一个box 生成Grid (6)Docking 进行对接(半柔性): 需要程序/指令:dock6
Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...2.dock一般指的就是苹果操作系统中的停靠栏,也就是苹果电脑桌面中最下方,类似于Windows系统下方的任务栏,不过要比Windows任务栏更加有趣味性。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
要安装最新的 Docker 版本,首先需要安装 apt-transport-https 支持,之后通过添加源来安装。要安装最新的 Docker 版本,首先需要安...
前端部分实现如下:https://www.phpvar.com/archives/1382.html JS部分实现如下: </div
对接 直接进行半柔性对接,刚性对接不感兴趣 使用指令: dock6 -i dock.in 创建文件dock.in 参数详解: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials.../ligand_sampling_dock/ligand_sampling_dock.html 格式为: conformer_search_type...../3_grid/grid multigrid_score_secondary no dock3.5...20 rank_ligands yes 输入指令,进行运算: dock6...-i dock.in -o dock.out 输出文件: dock.out为总结的参数文件 anchor_and_grow_ranked.mol2为输出文件,里面有20个排名较高的mol 使用chimera
FF/ UUUUUUU/ CC/ CC\ SSSSSS/ FFFFFFFFF/ University of California at San Francisco, DOCK...-1 working_directory /Users/sujiaqi/Desktop/PyDrug.0.4/PyDrug_going/PyDrug_DOCK...0.75 ____________________File_Input____________________ receptor_file rec-1htp-dock-prep.mol2...box_file rec_box.pdb vdw_definition_file /Users/sujiaqi/Program/dock6
此外,HyperDock还支持对Dock中的文件夹、文档和网站进行快速预览和访问。它还允许用户自定义所需的快捷键和手势,以进一步提高工作效率。
<script type="text/javascript"> var StartTime = new Date("2008/06/15 12:34:03")...
{ "name": "electron-macui", "version": "0.1.0", "description": "基于Electron13+Vite2+ElementPlus仿Mac...electron:serve", "electron:build": "vue-cli-service electron:build" }, "main": "background.js...flexbox flex-col macui__filter"> vue3实现dock菜单 底部的dock菜单固定模式,采用css3...image.png <div class="macui__<em>dock</em>-wrap macui__filter...${ext}" } } ending,基于vue3+vite2+electron13开发仿macOS桌面系统就分享到这里。 11.sinaimg.gif
生成Spheres 官方教程链接: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials/sphere_generation/generating_spheres.htm...步骤 接上文,已经完成了蛋白受体以及配体的准备,加氢加电荷 现在开始准备生成Spheres 生成Sphgen是DOCK的必须 Sphgen生成多组重叠的球体,以描述分子或分子表面的形状。...生成Sphgen (1)使用chimera的工具生成dms File -> Open -> rec-1htp-dock-prep.mol2.
项目简介 svelte-webchat一款基于svelte3.x+sveltekit+svelteLayer开发构建的仿微信PC版聊天实例。...p2.gif 前段时间也有分享一个svelte.js移动端聊天实例。...20220514110928544.png 16360截图20220514111031777.png svelte自定义组件(滚动条+对话框) 项目整体使用到的滚动条及弹窗组件,均是基于svelte.js...22360截图20220514111917258.png svelte-scrollbar一款轻量级svelte.js自定义模拟美化滚动条组件 17360截图20220514112541130.png...-- dock菜单项 --> {#each menu as item,index} {#if item.type == 'divider'} <div class="sv__<em>dock</em>-divider
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)以下是DockView的一些特点:预览窗口:DockView允许用户在Dock中预览不同应用程序的打开窗口,无需切换到该应用程序即可通过鼠标悬停在...Dock图标上进行查看。
如果用户启用 Space 模式,只需把鼠标移到 Dock 正在运行的程序上,即可显示该应用程序属于第几个 Space。...HyperDock for Mac(Dock优化工具)
如何在没有 Ubuntu Dock 的情况下访问活动概览 如果没有 Ubuntu Dock,你可能无法访问活动的或已安装的应用程序列表(可以通过单击 Dock 底部的“显示应用程序”按钮从 Ubuntu...Dock 访问)。...方法 1: 移除 Gnome Shell Ubuntu Dock 包 摆脱 Ubuntu Dock 的最简单方法就是删除包。...Ubuntu Dock 只对你的桌面隐藏,当你进入叠加模式(活动)时,你仍然可以看到并从那里使用 Ubuntu Dock。...to Dock 的一个很好的替代品(Ubuntu Dock 是从 Dash to Dock 分叉而来的)。
这是一款仿Mac osx外观的Wordpress杂志型主题。首页可以添加自定义图片并显示日志摘要,主题包含两套主页面模板。通过主流浏览器测试。...独立页面模板下面仿Mac osx的动态dock导航,由于IE6不支持透明PNG图片,而采用GIF图片,效果差了些。...★顶部幻灯:将主题包中的focus.swf文件上传到你的网站,并获取链接地址,打开sads.js文件查找focus.swf(共两个),用获取的链接地址替换.图片大小388×200,请更改自己的图片链接....☆底部dock动画导航链接,可以通过修改Home-index.php实现。 ★另外,还有一个类似留言板的模板文件,使用方法与上边的类似,新建页面后,选择Message.php模板文件即可.
HyperDock for Mac(Dock优化工具) 图片
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)
Vue自定义Navbar+Tabbar组件 基于Vue.js构建的自定义导航栏+标签栏组件。支持自定义背景(渐变色)、颜色、图标/文字、固定导航、事件处理等功能。...image.png 然后,在 plugins 目录新建 componentsInstall.js 文件并全局引入组件。...item.dock ?...item.dock ?...最后分享一个最近实例项目 taro多端实例|仿微信界面app聊天|taro聊天
定义类库 (function (window) { 'use strict' function defineBayside() { ...
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