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文献解读-LettuceGDB: The community database for lettuce genetics and omics

文献介绍标题（英文）：LettuceGDB: The community database for lettuce genetics and omics 标题（中文）：生菜GDB：生菜遗传学和组学的社区数据库

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nature genetics图表复现-自定义绘制散点图

❝本节来复现「nature genetics」上的一张图，自定义绘制误差线图；下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图；❞ 图形展示 ❝此图作为基础图形系列，但是又在基础图形的基础上做了一点细微的变化

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Nature Genetics杂志特别版单细胞marker基因气泡图

单细胞的marker基因气泡图，我们前面已经绘制过几个，今天的这个还是来自王凌华团队的最新文献，来自2025年10月21号发表在Nature Genetics杂志上，标题为《Multi-modal spatial

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跟着Nature Genetics学数据分析：R语言admixtools群体历史推断初次尝试

https://www.nature.com/articles/s41588-023-01423-w

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Nat Genetics|单细胞、单核、VDJ、空间构建肺全图谱和免疫生态位

spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche,2023年1月发表于nature genetics

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生信程序 | 量化癌症进化谱系中的细胞分裂 | Nature Genetics

evolutionary lineages in cancer 中文标题：量化癌症进化谱系中的细胞分裂发表日期：04 February 2025 文章类型：Article 所属期刊：Nature Genetics

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跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2曼哈顿图完整示例

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w

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最新Visium HD数据发表在Nature Genetics杂志（IF=31.7）：GSE280315

一篇大家已经很熟悉的空间 Visium HD数据于2025年6月5号正式发表在Nature Genetics杂志（IF=31.7）上，文献标题为《High-definition spatial transcriptomic

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跟着Nature Genetics学GWAS分析：emmax软件gwas分析qqman包展示结果

https://www.nature.com/articles/s41588-023-01340-y

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跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图

（示例数据和代码可以在今天推文次条的广告文案留言处获得下载链接，哈哈哈哈想到了一个提高广告阅读量的好办法哈哈哈）

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跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2散点图展示PCA结果

这里直接读入excel文件用到的是readxl包中的read_excel()函数，需要制定

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跟着Plos Genetics学数据分析：LTRpred流程注释完整的LTR（1）安装篇

https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370

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跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画箱线图(boxplot)展示D statistic

论文中提供的是宽格式数据，如果使用ggplot2作图需要转换成长格式，这里本来想尝试一下tidyr包中的pivot_longer()函数了，帮助文档没有看明白。...

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跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图突出强调其中某些点

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w

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跟着Genes|Genomes|Genetics学数据分析：WGCNA分析前期的数据预处理01

https://github.com/bensutherland/sfon_wgcna

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跟着Genes|Genomes|Genetics学数据分析：R语言edgeR包做转录组差异表达分析

https://github.com/bensutherland/sfon_wgcna

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跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图及多图共享图例

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w

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跟着Nature Genetics学数据分析~SNP数据计算距离矩阵然后构建NJ树

工具对应的github主页 https://github.com/BGI-shenzhen/VCF2Dis

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跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画基因结构示意图

今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8c，基因结构图，论文中文字部分对图的描述是 Gene structure of Lsat_6X11620....

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跟着Nature Genetics学做图：R语言ggplot2做热图展示基因存在缺失变异

作图代码不是难点，主要是作图数据准备成什么格式。这里用来填充颜色的数据，基因不存在统一填充为0，基因存在填充为不同的群体值。

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