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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

这些变量应该是真正的属性,而不是同一属性在不同年、月等时间的值分别放到单独的列。...dplyr 包的 distinct() 函数可以对数据框指定若干变 量,然后筛选出所有不同值,每组不同值仅保留一行。...2.6 arrange 按照数据框里的某列或某几列,对所有行进行排序。可以使用 desc 产生倒序,或写入多个列使其按照多个列进行排序。...2.10 表格的拆分与合并 将同一列中的内容分为两列内容。或将两列内容合并为同一列内容。 首先还是可以创建一个数据框。...实际上,tibble 允许存在数据类型是列表 (list) 的列,子数据框就是以列表数据类型保存在 tibble 的一列中的。

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数据处理第3部分:选择行的基本和高级的方法

Basic row filters 在许多情况下,您不希望在分析中包括所有行,而只包括选择的行。 仅使用特定行的函数在dplyr中称为“filter()”。...过滤器的一般语法是:filter(dataset,condition)。 如果您在管道内部进行过滤,则只会在数据集通过管道输入函数时看到条件参数。...在某些情况下,虽然需要根据部分匹配进行过滤。 在这种情况下,我们需要一个函数来评估字符串上的正则表达式并返回布尔值。 每当语句为“TRUE”时,该行将被过滤。...包有一些强大的变体可以一次过滤多个列: *filter_all()将根据您的进一步说明过滤所有列 *filter_if()需要一个返回布尔值的函数来指示要过滤的列。...如果是这样,那么将对这些列执行过滤器指令。 *filter_at()要求你在vars()参数中指定要进行过滤的列。 在这些情况下,有一般语法:首先指定哪些列,然后提及过滤器的条件。

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    R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

    包 #dplyr中基本函数 filter——数据筛选(筛选观测值,行) filter(Hdma_dat,pclass == 1) ###################################...## #dplyr中基本函数 select——子集选取(筛选变量,列) select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...可以看到,计算结果中的第一列实际上是“SELLERID.CLIENT”,我们需要把它拆分成两列并调换顺序才行。...tapply 只对单字段分组适用,在进行双字段联合分组时其结果为二维矩阵,用户还需要进行复杂的处理才行,比如 tapply(orders$AMOUNT, orders[,c("SELLERID","CLIENT...(iris$setosa)] #按照照setosa的大小,重排Sepal.Length数据列 四、dplyr与data.table data.table可是比dplyr以及python中的

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    Apache Druid 底层存储设计(列存储与全文检索)

    字典仅将字符串映射成整数 id,以便可以紧凑的表示 2 和 3 中的值。3 中的 bitmap也称为反向索引,允许快速过滤操作(特别是,位图便于快速进行 AND 和 OR 操作)。...最后,group by和TopN需要 2 中的值列表,换句话说,仅基于过滤器汇总的查询无需查询存储在其中的维度值列表。...Ke$ha位图中第二行的更改,如果一行的一个列有多个值,则其在“列数据“中的输入是一组值。...根据shardSpec来配置分片数据,仅当block完成时,Druid 查询才可能完成。...如果一个 segment 中存在一个字符串列(维),但另一个 segment 中不存在,则涉及这两个 segment 的查询仍然有效。缺少维的 segment 查询将表现得好像维只有空值。

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    MR应知应会:MungeSumstats包

    该推论首先来自输入文件的列标题,但是,等位基因翻转检查通过将 A1(应该是参考等位基因)与参考基因组进行比较来确保这一点。...这只能作为最后的手段。 force_new_z 当“Z”列已经存在时,默认使用它。要从 P 设置为 TRUE 覆盖并计算新的 Z 分数列。 compute_n 是否插补 N。...默认 0.9 FRQ_filter 0-1 SNP 频率(FRQ)允许的最小值(即等位基因频率(AF))(如果在 sumstats 文件中存在)。默认情况下不进行过滤,即值为 0。...默认为 TRUE Convert_ref_genome要转换的参考基因组的名称(“GRCh37”或“GRCh38”)。仅当当前基因组构建不匹配时才会发生这种情况。默认不转换基因组构建(NULL)。...默认值为 TRUE。 allele_flip_drop控制是否删除 A1 或 A2 碱基对值均不与参考基因组匹配的 SNP。默认值为 TRUE。

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    「R」dplyr 行式计算

    「原文来自:dplyr 文档」 上一篇:「R」dplyr 列式计算 通常 dplyr 和 R 更适合对列进行操作,而对行操作则显得更麻烦。...按行汇总统计 dplyr::summarise() 让一列多行的统计汇总变得非常简单,当它与 rowwise() 结合时,它也可以简便地操作汇总一行多列。...,我们县创建一个行式数据框: rf % rowwise(id) 我们然后使用 mutate() 添加一个新的列,或者使用 summarise() 仅返回一个汇总列: rf %>% mutate...因为输入tibble中的列没有那么规则,所以这种方法更不适合这种方法。...由于 rowwise() 显然是有用的,它不再被质疑,我们希望它能够长期存在。 do() 我们对 do()的必要性已经质疑了很长一段时间,因为它与其他 dplyr 动词并不太相似。

    6.2K20

    「R」数据操作(五):dplyr 介绍与数据过滤

    在对数据进行可视化之前我们往往需要进行数据转换以得到可视化所需要的数据内容与格式。这里我们使用dplyr包操作2013年纽约市的航班起飞数据集(2013)。...## lag(): dplyr, stats 注意一下你导入tidyverse包时给出的冲突信息(Conflicts),它告诉你dplyr覆盖了R基础包中的函数。...,这里适配地显示了在一个屏幕前几行和所有的列(我们可以使用View(flights)在Rstudio中查看数据集的所有信息。...现在我们不必纠结于这些差异,在后续内容中我们会进行学习。 你可能已经注意到每个列名下面有三到四个字母的缩写。...另一个你在使用==时可能遭遇的常见问题是浮点数。

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    Apache Druid 底层的数据存储

    字典仅将字符串映射成整数 id,以便可以紧凑的表示 2 和 3 中的值。3 中的 bitmap也称为反向索引,允许快速过滤操作(特别是,位图便于快速进行 AND 和 OR 操作)。...最后,group by和TopN需要 2 中的值列表,换句话说,仅基于过滤器汇总的查询无需查询存储在其中的维度值列表。...Ke$ha位图中第二行的更改,如果一行的一个列有多个值,则其在“列数据“中的输入是一组值。...根据shardSpec来配置分片数据,仅当block完成时,Druid 查询才可能完成。...如果一个 segment 中存在一个字符串列(维),但另一个 segment 中不存在,则涉及这两个 segment 的查询仍然有效。缺少维的 segment 查询将表现得好像维只有空值。

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    Mysql基础

    因此尽量使用 SQL 语句来过滤不必要的数据,而不是传输所有的数据到客户端中然后由客户端进行过滤。...IN 操作符用于匹配一组值,其后也可以接一个 SELECT 子句,从而匹配子查询得到的一组值。 NOT 操作符用于否定一个条件。 十、通配符 通配符也是用在过滤语句中,但它只能用于文本字段。...十三、分组 分组就是把具有相同的数据值的行放在同一组中。 可以对同一分组数据使用汇总函数进行处理,例如求分组数据的平均值等。 指定的分组字段除了能按该字段进行分组,也会自动按该字段进行排序。...当线程A要更新数据值时,在读取数据的同时也会读取version值,在提交更新时,若刚才读取到的version值为当前数据库中的version值相等时才更新,否则重试更新操作,直到更新成功。...当需要更新时,判断当前内存值与之前取到的值是否相等,若相等,则用新值更新,若失败则重试,一般情况下是一个自旋操作,即不断的重试。

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    两个神奇的R包介绍,外加实用小抄

    就是某些单元格有空值的情况。 三种处理方式:删除整行,根据上下文(瞎)蒙一个,同一列的空值填上同一个数。 ?...expand(列出每列值所有可能的组合,天哪我是写到这里的时候刚看懂的!) 来看示例 ? ? 我是看到了结果才知道我干了啥的喂。就是选中的列中的值各种组合,成为一个新表。...二、Dplyr能实现的小动作 1.arrange 排序 按某一/两列值的大小,按照升/降对行排序。...,一个是dplyr里的bind_rows 按行拼接时,列数、列名需要一致 rbind(frame1,frame4)# frame1 %>%bind_rows(frame4) 8.交集、并集、全集 intersect...这是根据相同的列名进行合并,当在两个表格中列名不一样时,需要在括号内加 by=c("col1"="col2") 其中col1和2分别是在两个表格中的需合并的列名 semi_join,anti_join

    2.5K40

    UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

    Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数,可以对指定变量进行计数,得到每个类别的观测数目,支持根据需要对结果进行排序。...Dplyr Distinct keep unique rows distinct 函数用于去除数据框中的重复观测,仅保留唯一的观测。它可以基于指定的列对数据框进行去重操作,确保每个观测都是唯一的。...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列,可以保留感兴趣的变量,并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-值” 对,便于进一步的分析和处理...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据框中的一列分成多个列,根据指定的列名进行展开,使得数据以更直观的宽格式形式呈现

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    单细胞代码解析-妇科癌症单细胞转录组及染色质可及性分析3

    这部分主要的是对两个去除双细胞的R包的代码进行解析。...(3列:cell,组,组(数字或字符));filename:唯一的文件名,输入文件的名字;location:应在其中存储输出的目录#fullDataFile:包含完整表达式数据的文件名(gene by...rhop:平均值x中的x * SD以确定黑名单中相关性的上限。默认值为1。#write:将输出文件写为.txt文件。默认值为TRUE。...only50:仅使用由50%/ 50%的父单元格混合创建的合成对偶,而不是30%/ 70%和70%/ 30%的扩展选项,默认为FALSE。#min_uniq:挽救群集所需的最小独特基因数,默认值为4。...,选用了两个R包DoubletDecon和DoubletFinder,然后对两个去除双细胞的结果进行相关性分析,去判断结果的可靠性。

    1.2K00

    【22】进大厂必须掌握的面试题-30个Informatica面试

    源限定符转换 滤镜转换 1.在从源读取数据时,它过滤行。 1.它从映射数据中筛选行。 2.只能过滤来自关系源的行。 2.可以过滤任何类型的源系统中的行。 3.它限制了从源中提取的行集。...当您将Lookup转换的属性更改为使用动态高速缓存时,新端口将添加到转换中。NewLookupRow。 动态缓存可以在读取数据时更新缓存。...在聚合器转换中,按关键字列分组并添加新端口。将其称为count_rec即可对键列进行计数。 从上一步将路由器连接到聚合器。在路由器中,分为两组:一组称为“原始”,另一组称为“重复”。...例如:每日余额事实可以通过客户维度进行汇总,而不能通过时间维度进行汇总。 非可 加事实:非可加事实是不能针对事实表中存在的任何维度进行汇总的事实。 例如:具有百分比和比率的事实。...当我们可以从另一个转换中查找时,我们需要使用子字符串再次分隔列。 作为一种情况,我们采用一种来源,其中包含Customer_id和Order_id列。 资源: ?

    6.7K40

    直观地解释和可视化每个复杂的DataFrame操作

    Explode Explode是一种摆脱数据列表的有用方法。当一列爆炸时,其中的所有列表将作为新行列在同一索引下(为防止发生这种情况, 此后只需调用 .reset_index()即可)。...Unstack 取消堆叠将获取多索引DataFrame并对其进行堆叠,将指定级别的索引转换为具有相应值的新DataFrame的列。在表上调用堆栈后再调用堆栈不会更改该堆栈(原因是存在“ 0 ”)。...作为另一个示例,当级别设置为0(第一个索引级别)时,其中的值将成为列,而随后的索引级别(第二个索引级别)将成为转换后的DataFrame的索引。 ?...how参数是一个字符串,它表示四种连接 方法之一, 可以合并两个DataFrame: ' left ':包括df1的所有元素, 仅当其键为df1的键时才 包含df2的元素 。...包括df2的所有元素, 仅当其键是df2的键时才 包含df1的元素 。 “outer”:包括来自DataFrames所有元素,即使密钥不存在于其他的-缺少的元素被标记为NaN的。

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    SQL 性能优化 总结

    ORACLE为管理上述3种资源中的内部花费 (11)用Where子句替换HAVING 子句: 避免使用 HAVING 子句, HAVING 只会在检索出所有记录之后才对结果集进行过滤....,按理说应该速度是最快的,where也应该比having快点的,因为它过滤数据后才进行sum,在两个表联接时才用on 的,所以在一个表的时候,就剩下where 跟 having...如果至少有一个列不为空,则记录存在于索引中.举例:如果唯一性索引建立在表的A 列和B 列上,并且表中存在一条记录的A,B 值为(123,null) , ORACLE将不接受下一条具有相同 A,B 值(123...因此你可以插入 1000条具有相同键值的记录,当然它们都是空! 因为空值不存在于索引 列中,所以WHERE子句中对索引列进行空值比较将使 ORACLE 停用该索引....(30)避免改变索引列的类型.:当比较不同数据类型的数据时, ORACLE 自动对列进行简单的类型转换.假设 EMPNO 是一个数值类型的索引列.

    1.9K20

    生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

    yes:逻辑值T时返回的值no,逻辑值F时返回的值ifelse函数和str_detect()函数连用,王炸炸炸!!!...table(x)2.7 for循环对x里的每个元素进行同一操作for(i in x){CODE}#x是向量;i是代称,i自动等于某个循环里的x元素for( i in 1:4){ print(i)}#for...【小洁老师语录】当一个代码需要复制粘贴3次以上时,要不写成函数,要不写成循环。..., sum)#对test每一行求和向量/列表的隐式循环-lapply,批量操作### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm...7.5.3 箱线图的应用单个基因在两组之间表达量的差异可视化。分组信息:是一个有重复值的离散型的向量,分组向量的元素和表达矩阵的列是一一对应的。

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    Mysql基础

    因此尽量使用 SQL 语句来过滤不必要的数据,而不是传输所有的数据到客户端中然后由客户端进行过滤。...IN 操作符用于匹配一组值,其后也可以接一个 SELECT 子句,从而匹配子查询得到的一组值。 NOT 操作符用于否定一个条件。 十、通配符 通配符也是用在过滤语句中,但它只能用于文本字段。...十三、分组 分组就是把具有相同的数据值的行放在同一组中。 可以对同一分组数据使用汇总函数进行处理,例如求分组数据的平均值等。 指定的分组字段除了能按该字段进行分组,也会自动按该字段进行排序。...当线程A要更新数据值时,在读取数据的同时也会读取version值,在提交更新时,若刚才读取到的version值为当前数据库中的version值相等时才更新,否则重试更新操作,直到更新成功。...当需要更新时,判断当前内存值与之前取到的值是否相等,若相等,则用新值更新,若失败则重试,一般情况下是一个自旋操作,即不断的重试。

    1.8K00

    Java SQL语句优化经验

    ORACLE为管理上述3种资源中的内部花费 (11) 用Where子句替换HAVING子句: 避免使用HAVING子句, HAVING 只会在检索出所有记录之后才对结果集进行过滤....,按理说应该速度是最快的,where也应该比having快点的,因为它过滤数据后才进行sum,在两个表联接时才用on的,所以在一个表的时候,就剩下where跟having比较了。...如果至少有一个列不为空,则记录存在于索引中.举例: 如果唯一性索引建立在表的A列和B列上, 并且表中存在一条记录的A,B值为(123,null) , ORACLE将不接受下一条具有相同A,B值(123,...因为空值不存在于索引列中,所以WHERE子句中对索引列进行空值比较将使ORACLE停用该索引.....: 当比较不同数据类型的数据时, ORACLE自动对列进行简单的类型转换.

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