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独家 | Pandas 2.0 数据科学家的游戏改变者(附链接)

虽然我没意识到所有的大肆宣传,数据中心的人工智能社区迅速伸出了援手: 截图来自作者 2.0发行版看起来在数据科学社区造成了相当大的影响,很多用户都称赞新版本里的改进。...其他值得指出的方面: 如果没有 pyarrow 后端,每个列/特征都存储为自己的唯一数据类型:数字特征存储为 int64 或 float64,而字符串值存储为对象; 使用 pyarrow,所有功能都使用...传统的 int64、uint64 和 float64 为所有 numpy 数字 dtypes Index 值打开了空间,因此我们可以指定它们的 32 位版本: pd.Index([1, 2, 3]) #...例如,整数会自动转换为浮点数,这并不理想: df = pd.read_csv("data/hn.csv") points = df["Points"] points.isna()...在 pandas 2.0 中,我们可以利用 dtype = 'numpy_nullable',其中缺失值是在没有任何 dtype 更改的情况下考虑的,因此我们可以保留原始数据类型(在本例中为 int64

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【文件读取】文件太大怎么办?

关注我们,一起学习~ 我们经常会遇到需要读取大文件的情况,比如十几GB,几十GB甚至更大,而如果直接读取进来,内存可能会爆炸,溢出。笔者最近遇到读取大文件的情况,借此和大家分享一些读取大文件的方法。...,从而减少存储量 对于label或者类型不多的列(如性别,0,1,2),默认是int64的,可以将列的类型转换为int8 对于浮点数,默认是float64,可以转换为float32 对于类别型的列,比如商品...arr.append(data) data = pd.concat(arr) # 计算原始数据大小GB print(data.memory_usage().sum()/(1024**3)) # 将label的int64...转变为int8 data['0'] = pd.to_numeric(data['0'], downcast='unsigned', errors='coerce') # 计算转变后的数据大小GB print...后:1.8263GB,转float32后:0.9323GB,转category后:0.9037GB 可以发现修改类型后,内存的消耗大幅缩减了 参考 https://zhuanlan.zhihu.com/

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    生信分析过程中这些常见文件的格式以及查看方式你都知道吗?

    生信分析过程中,会与很多不同格式的文件打交道,除了原始测序数据fastq之外,还需要准备基因组文件fasta格式和基因注释文件gtf格式。...在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如bed、bed12、sam、bam、wig、bigwig、bedgraph等,生成后我们一般会查看下内容了解文件每一列的含义,以此来决定需要提取哪些有用信息列来进行下一步分析...NGS基础 - FASTQ格式解释和质量评估 2)查看方式 # zcat查看gzip压缩的文件 # head -n 8 显示前8行文件内容(前8行代表2条序列)zcat filename.fq.gz |...序列名字行:以>符号开头,记录了该序列类型和所在基因组位置信息; 序列行(一行或多行):序列信息,soft-masked基因组会把所有重复区和低复杂区的序列用小写字母标出的基因组,小写字母n表示未知碱基...4. bed文件 分析过程中的bed文件一般代表区域信息,如表示Peak位置的bed文件,表示基因注释的bed12文件。

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    NumPy、Pandas中若干高效函数!

    、转置(pivot)数据集; 轴的分级标记 (可能包含多个标记); 具有鲁棒性的IO工具,用于从平面文件 (CSV 和 delimited)、Excel文件、数据库中加在数据,以及从HDF5格式中保存...read_csv(nrows=n) 大多数人都会犯的一个错误是,在不需要.csv文件的情况下仍会完整地读取它。...如果一个未知的.csv文件有10GB,那么读取整个.csv文件将会非常不明智,不仅要占用大量内存,还会花很多时间。我们需要做的只是从.csv文件中导入几行,之后根据需要继续导入。...用于将一个Series中的每个值替换为另一个值,该值可能来自一个函数、也可能来自于一个dict或Series。...这个函数的参数可设置为包含所有拥有特定数据类型的列,亦或者设置为排除具有特定数据类型的列。

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    加速数据分析,这12种高效Numpy和Pandas函数为你保驾护航

    简化将数据转换为 DataFrame 对象的过程,而这些数据基本是 Python 和 NumPy 数据结构中不规则、不同索引的数据; 基于标签的智能切片、索引以及面向大型数据集的子设定; 更加直观地合并以及连接数据集...; 更加灵活地重塑、转置(pivot)数据集; 轴的分级标记 (可能包含多个标记); 具有鲁棒性的 IO 工具,用于从平面文件 (CSV 和 delimited)、 Excel 文件、数据库中加在数据,...read_csv(nrows=n) 大多数人都会犯的一个错误是,在不需要.csv 文件的情况下仍会完整地读取它。...如果一个未知的.csv 文件有 10GB,那么读取整个.csv 文件将会非常不明智,不仅要占用大量内存,还会花很多时间。我们需要做的只是从.csv 文件中导入几行,之后根据需要继续导入。...用于将一个 Series 中的每个值替换为另一个值,该值可能来自一个函数、也可能来自于一个 dict 或 Series。

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    12 种高效 Numpy 和 Pandas 函数为你加速分析

    简化将数据转换为 DataFrame 对象的过程,而这些数据基本是 Python 和 NumPy 数据结构中不规则、不同索引的数据; 基于标签的智能切片、索引以及面向大型数据集的子设定; 更加直观地合并以及连接数据集...; 更加灵活地重塑、转置(pivot)数据集; 轴的分级标记 (可能包含多个标记); 具有鲁棒性的 IO 工具,用于从平面文件 (CSV 和 delimited)、 Excel 文件、数据库中加在数据,...read_csv(nrows=n) 大多数人都会犯的一个错误是,在不需要.csv 文件的情况下仍会完整地读取它。...如果一个未知的.csv 文件有 10GB,那么读取整个.csv 文件将会非常不明智,不仅要占用大量内存,还会花很多时间。我们需要做的只是从.csv 文件中导入几行,之后根据需要继续导入。...用于将一个 Series 中的每个值替换为另一个值,该值可能来自一个函数、也可能来自于一个 dict 或 Series。

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    ComPDFKit - 专业的PDF文档处理SDK

    2.ComPDFKit 转档 SDK PDF转Word 支持将PDF文件中的内容转为流排结构的数据,并保持原文件页面布局。支持字体大小、颜色、粗体、斜体和下划线等识别。...PDF转PPT 提供转档开发库将每页PDF内容转换为可编辑的PPT,将文本转换为文本框;识别文件内的图片并支持进行旋转、裁剪等操作。...PDF转TXT 支持将PDF转为TXT纯文本格式,几乎所有平台都支持打开&阅读的格式,文件体积小便于储存,打开迅速无缓冲。...PDF转CSV ComPDFKit转档SDK支持从PDF中准确提取表格并将其转换为CSV,一个表格转换为一个CSV文件。...PDF转Image 提供SDK将PDF文件转换为高质量的图像格式,包括PNG和JPEG。保证所有图像质量和分辨率都将保持不变。

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    加速数据分析,这12种高效Numpy和Pandas函数为你保驾护

    简化将数据转换为 DataFrame 对象的过程,而这些数据基本是 Python 和 NumPy 数据结构中不规则、不同索引的数据; 基于标签的智能切片、索引以及面向大型数据集的子设定; 更加直观地合并以及连接数据集...; 更加灵活地重塑、转置(pivot)数据集; 轴的分级标记 (可能包含多个标记); 具有鲁棒性的 IO 工具,用于从平面文件 (CSV 和 delimited)、 Excel 文件、数据库中加在数据,...read_csv(nrows=n) 大多数人都会犯的一个错误是,在不需要.csv 文件的情况下仍会完整地读取它。...如果一个未知的.csv 文件有 10GB,那么读取整个.csv 文件将会非常不明智,不仅要占用大量内存,还会花很多时间。我们需要做的只是从.csv 文件中导入几行,之后根据需要继续导入。...用于将一个 Series 中的每个值替换为另一个值,该值可能来自一个函数、也可能来自于一个 dict 或 Series。

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    降低数据大小的四大绝招。

    四大节省内存的方式 01 数据类型转换 通过数据转换往往可以帮助我们节省好几倍的内存,同时因为类型的转换,在一些数值计算中还可以起到加速运算的作用。...我们可以将此转换为仅使用4字节或8字节的int32或int64。典型的技巧如获取十六进制字符串的最后16个字母,然后将该base16数字转换为base10并另存为int64。 2....数值特征,从8 bytes降低为2 bytes 对于一些将float64转化为float32而不损失信息的字段可以直接转化,还有很多字段可以直接从float64转化为float16,这样就可以转化为2个...NumPy中的np.savez()也会对数据进行压缩,一般压缩之后数据还会变小很多。 保存顺序; 一些文件格式(如CSV)逐行保存数据。一些文件格式(如Parquet)逐列保存数据。...小结 适用于所有数据存储问题。 参考文献 How To Reduce Data Size

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    Pandas 2.0 简单介绍和速度评测

    ', use_nullable_dtypes=True) 速度对比 根据官方的介绍我们都知道,使用Arrow主要就是提高了速度,那么我们来做一个简单的测试: 使用NumPy和PyArrow的读取相同的...CSV文件,比较两者的差异。...速度 这个应该不必多说了,借助Arrow的优势,上面看到已经快了很多 2. 缺失值 pandas表示缺失值的方法是将数字转换为浮点数,并使用NaN作为缺失值。...互操作性 就像CSV文件可以用pandas读取或在Excel中打开一样,Arrow也可以通过R、Spark和Polars等不同程序访问。...通过Arrow实现提供了更快、更高效的内存操作,pandas现在可以更好地处理复杂而广泛的数据集。 正式版还没有发布,所以本文的内容也可能与发布的正式版有所出入。

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    Pandas 数据类型概述与转换实战

    Customer Number 列的类型转换 看起来很简单,让我们尝试对 2016 列做同样的事情,并将其转换为浮点数: 同样的,转换 Jan Units 列 转换异常了~ 上面的情况中,数据中包含了无法转换为数字的值...所有值都被解释为 True,但最后一位客户的 Active 标志为 N,竟然也被转换为 True 了 所以,我们可以得到,astype() 的使用是有条件的,仅在以下情况下才有效: 数据是干净的,可以简单地转换为一个数字...np.where() 方法对许多类型的问题都很有用,所以我们选择在这里使用 基本思想是使用 np.where() 函数将所有“Y”值转换为 True 并将其他所有值转换为 False df["Active...datateime64 dtype,很方便 最后,我们把上面处理代码都放到一起 df_2 = pd.read_csv("sales_data_types.csv",...Day int64 Year int64 Active object dtype: object 好了,这就是今天分享的全部内容

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    【Data Mining】机器学习三剑客之Pandas常用用法总结(上)

    上述采用list生成的series,理论上用array-like的形式都可以生成,当然numpy毋庸置疑可以后面会有展示,如果生成的series的list中的每个元素为整型,则dtype默认推理为int64...:dataframe中的colomn参数其实就是series中的index。...4、读取文件,输出文件 在使用中主要针对于excel文件和csv文件,个人推荐csv文件,因为在很多比赛和项目中都采用此类型,主要是兼容性好一些,我在linux下使用excel问题很多,当然对于pandas...数据集内容 此处进行简单读入,并按照算法输入进行简单处理,并输出 import pandas as pd import numpy as np # 读csv文件 Iris_dataset = pd.read_csv...文件 Iris_dataset.to_csv('iris_handle_data') 输出文件如下: ?

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    如何使用EDI系统实现CSV和XML相互转化

    接下来,您需要选择目标文件,即您需要将接收到的文件转换为何种格式?这里我们要将标准的XML文件转换为CSV格式转换需要的XML,则需要设计CSV格式对应的XML。...CSV 转XML 以上我们了解了XML转CSV,同理可知CSV转XML这一逆向过程为: 收到来自交易伙伴的CSV文件后,应该进行怎样的处理,才能使CSV文件转换成为我们需要的XML格式呢?...首先您需要CSV端口以及XMLMap端口。CSV端口可以将输入的CSV文件转换为标准的XML文件,而XMLMap 则负责将标准XML转换为处理所需的XML文件。...使用知行EDI系统可以快速的进行CSV与XML文件之间的格式转化,其中工作量较大的内容是在XMLMap中进行关系映射。需要在源文件的对应字段内取出相应的业务数据填充进XML文件模板字段中。...注:文案部分内容来源于网络,版权归原创作者所有,如有侵犯到您的权益,请您联系我们进行删除,给您带来困扰,我们深感抱歉。 更多EDI相关信息,欢迎讨论。

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    在Pandas中更改列的数据类型【方法总结】

    例如,上面的例子,如何将列2和3转为浮点数?有没有办法将数据转换为DataFrame格式时指定类型?或者是创建DataFrame,然后通过某种方法更改每列的类型?...理想情况下,希望以动态的方式做到这一点,因为可以有数百个列,明确指定哪些列是哪种类型太麻烦。可以假定每列都包含相同类型的值。...') #示例1 df = pd.DataFrame(data=d, dtype=np.int8) #示例2 df = pd.read_csv("somefile.csv", dtype = {'column_name...软转换——类型自动推断 版本0.21.0引入了infer_objects()方法,用于将具有对象数据类型的DataFrame的列转换为更具体的类型。...int64: >>> df = df.infer_objects() >>> df.dtypes a int64 b object dtype: object 由于’b’的值是字符串,而不是整数

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    14个pandas神操作,手把手教你写代码

    03 Pandas的基本功能 Pandas常用的基本功能如下: 从Excel、CSV、网页、SQL、剪贴板等文件或工具中读取数据; 合并多个文件或者电子表格中的数据,将数据拆分为独立文件; 数据清洗,如去重...notebook文件同一目录下 # 如果是CSV,使用pd.read_csv(),还支持很多类型的数据读取 这样就把数据读取到变量df中,输入df看一下内容,在Jupyter Notebook中的执行效果如图...图6 分组后每列用不同的方法聚合计算 10、数据转换 对数据表进行转置,对类似图6中的数据以A-Q1、E-Q4两点连成的折线为轴对数据进行翻转,效果如图7所示,不过我们这里仅用sum聚合。...图13 饼图的绘制效果 14、导出 可以非常轻松地导出Excel和CSV文件。...df.to_excel('team-done.xlsx') # 导出 Excel文件 df.to_csv('team-done.csv') # 导出 CSV文件 导出的文件位于notebook文件的同一目录下

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    GoLang中字符串的一些使用总结

    “ 在项目当中接触到最多的应该就是字符串了,比如在写API时收到前台发来的请求,大部分我相信都是字符串,我们接下来就针对字符串在GoLang中的一些处理做个小小的总结。...” 01 — 字符串的格式化输出 package main import "fmt" func main() { fmt.Println("Hello") } 我相信这是所有人入门输入的第一句代码...,那就要用到格式化了,和其他的C语言啥的都类似,这里我列一下这些动词和功能的具体参数: 动词功能%v按照值的本来值输出%+v在%v基础上,对结构体字段名和1值进行展开%#v输出Go语言语法格式的值%T输出...02 — 字符串的类型转换 当我们收到客户端发来的请求时,大部分数据都是需要我们二次处理才能使用的,比如把字符串转int,转int64等接下来咱们看看Go里面怎么转的。..., 10, 64) fmt.Println(EByInt64 + DByInt64) 这里用到了: string转int64 int64转string strconv包里面有很多API

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