Amber团队花了三年时间创建了一个低成本、便携式、研究级、可像泳帽一样滑动的头戴式耳机,旨在更容易地收集EEG数据。 团队还探索了如何将机器学习的新方法应用于解释脑电图数据。...https://blog.x.company/sharing-project-amber-with-the-mental-health-community-7b6d8814a862 https://openreview.net...id=TVjLza1t4hI https://blog.x.company/sharing-project-amber-with-the-mental-health-community-7b6d8814a862...https://zhidx.com/p/242530.html https://github.com/google/x-amber
平台:windo 软件:gaussina16, ambertools, gromacs2019.6, notepad++, spdbv4.10 蛋白文件:4w52.pdb(配体选用EPE) 小分子amber...**该步骤没有补全丢失的氨基酸,可以使用MOE通过同源模建构建蛋白(参考本公众号教程),再经过autodocktools对接即可** 蛋白amber力场及坐标文件构建 使用AMBER99SB-ILDN力场...操作:将EPE.top中[ atomtypes ]—>[ dihedrals ] ; propers含有的所有信息复制到#include “amber99sb-ildn.ff/forcefield.itp...mol -center 运算结束后,提取轨迹,并对比原始文件 用vmd观察:(氢键) 具体文件可从该网址下载参考: https://gitee.com/PharmDesign/gromacs_amber
concat(0x5e,version(),0x5e,floor(rand(0)*2))x,count(*) from (select 1 union select 2 union select 3)a group...x; //数据不足三条或者关键表被禁用 round(): select concat(0x5e,version(),0x5e,round(rand(0)))x,count(*) from test group...by x; left(): select concat(0x5e,version(),0x5e,left(rand(0),3))x,count(*) from test group by x; rand...(),count()被禁用: select min(@a:=1) from test group by concat(0x5e,@@version,0x5e,@a:=(@a+1)%2); 语句随机应变...函数 group by:分组方式,作为虚拟表的主键 count(*)返回满足条件的行的个数 concat()连接字符串 floor()向下取整 round()四舍五入 left
技术背景 Amber是一个在分子动力学中非常常用的一个软件,可以用于进行分子动力学模拟计算,可以与一些软件配合进行增强采样。...这里我们简单介绍一下如何使用Amber去计算一个分子构象的单点势能值,及其对应的能量分量。 第一步:构造力场文件 首先我们需要运行tleap,加载一个力场,例如这里加载的是ff99SB的力场。...同时准备一个待模拟的pdb文件,load完成后,可以直接存储为prmtop文件和inpcrd文件,这两个文件是Amber在匹配了pdb文件之后,从力场文件中对应搜索出来的参数文件,可以用于后续的分子动力学模拟过程...$ sander -O -i min.in -o min_99.out -p case2_99.prmtop -c case2_99.inpcrd 总结概要 本文主要介绍了如何使用Amber来计算一个给定分子构象的...版权声明 本文首发链接为:https://www.cnblogs.com/dechinphy/p/amber-onesite.html 作者ID:DechinPhy 更多原著文章:https://www.cnblogs.com
[amber_mol_fitted.jpg] 缘起 自己的一个朋友是做科研工作的,不久前他找到我向我咨询一个关于科学计算的需求: 他在做蛋白和药物对接相关的研究,希望使用分子动力学模拟软件Amber (...部署机器选择: [instance.png] 部署Amber 这里部署的是Amber18这个版本。...就需要额外付费购买Amber18。.../configure make -j8 make install 解压Amber 我这里解压到 tar jxvf amber_pkgs/Amber18.tar.bz2 tar jxvf amber_pkgs...=$HOME/amber18 export AMBERHOME=$AMBER_PREFIX export PATH="${AMBER_PREFIX}/bin:${PATH}" # Add location
题目 There are n people whose IDs go from 0 to n - 1 and each person belongs exactly to one group....Given the array groupSizes of length n telling the group size each person belongs to, return the groups...there are and the people’s IDs each group includes.
表2 可是为了能够更好的理解“group by”多个列“和”聚合函数“的应用,我建议在思考的过程中,由表1到表2的过程中,增加一个虚构的中间表:虚拟表3。...2.FROM test Group BY name:该句执行后,我们想象生成了虚拟表3,如下所图所示,生成过程是这样的:group by name,那么找name那一列,具有相同name值的行,合并成一行...number列执行sum操作,即2+3,返回5,最后执行结果如下: (5)group by 多个字段该怎么理解呢:如group by name,number,我们可以把name和number 看成一个整体字段...如执行select name,sum(id) from test group by name,number,结果如下图: (已失效)文章出处:理解group by和聚合函数 注意:mysql对group...by 进行了非ANSI标准的扩展,允许select后含有非group by 的列。
GROUP BY 语句根据一个或多个列对结果集进行分组。 在分组的列上我们可以使用 COUNT, SUM, AVG,等函数。...GROUP BY 语法 SELECT column_name, function(column_name) FROM table_name WHERE column_name operator value...GROUP BY column_name; ---- 实例演示 本章节实例使用到了以下表结构及数据,使用前我们可以先将以下数据导入数据库中。...BY 语句 将数据表按名字进行分组,并统计每个人有多少条记录: mysql> SELECT name, COUNT(*) FROM employee_tbl GROUP BY name; +---...例如我们将以上的数据表按名字进行分组,再统计每个人登录的次数: mysql> SELECT name, SUM(singin) as singin_count FROM employee_tbl GROUP
// group by如何优化?...那么针对group by操作,我们如何优化? 01 group by优化之索引 从上面的描述中不难看出,group by进行分组的时候,创建的临时表都是带一个唯一索引的。...如果数据量很大,group by的执行速度就会很慢,要想优化这种情况,还得分析为什么group by 需要临时表?...这个问题其实是因为group by的逻辑是统计不同的值出现的次数,由于每一行记录做group by之后的结果都是无序的,所以就需要一个临时表存储这些中间结果集。...所以,使用索引可以帮助我们去掉group by依赖的临时表 02 group by优化---直接排序 如果我们已经知道表的数据量特别大,内存临时表肯定不足以容纳排序的时候,其实我们可以通过告知group
概述 group_by的意思是根据by对数据按照哪个字段进行分组,或者是哪几个字段进行分组。 二....语法 select 字段 from 表名 where 条件 group by 字段 或者 select 字段 from 表名 group...by 字段 having 过滤条件 注意:对于过滤条件,可以先用where,再用group by或者是先用group by,再用having 三....select grade from student 查出所有学生等级(包括重复的等级) ② select grade from student group...by grade 查出学生等级的种类(按照等级划分,去除重复的) 3 多个字段分组 select name , sum(salary) from student group
SQLite Group By SQLite 的 GROUP BY 子句用于与 SELECT 语句一起使用,来对相同的数据进行分组。...在 SELECT 语句中,GROUP BY 子句放在 WHERE 子句之后,放在 ORDER BY 子句之前。 语法 下面给出了 GROUP BY 子句的基本语法。...GROUP BY 子句必须放在 WHERE 子句中的条件之后,必须放在 ORDER BY 子句之前。...SELECT column-list FROM table_name WHERE [ conditions ] GROUP BY column1, column2....columnN ORDER...BY column1, column2....columnN 您可以在 GROUP BY 子句中使用多个列。
Expression #1 of SELECT list is not in GROUP BY clause and contains nonaggregated column 'test.w.id'...which is not functionally dependent on columns in GROUP BY clause; this is incompatible with sql_mode...=only_full_group_by 在使用GROUP BY对Mysql的数据表进行查询时如果出现以下错误 1.查询mysql 相关mode select @@global.sql_mode; 可以看到模式中包含了...ONLY_FULL_GROUP_BY,只要没有这个配置即可。...我的Mysql版本是5.7.23,默认是带了ONLY_FULL_GROUP_BY模式。
MySQL GROUP BY 语句GROUP BY 语句根据一个或多个列对结果集进行分组。在分组的列上我们可以使用 COUNT, SUM, AVG,等函数。...GROUP BY 语法SELECT column_name, function(column_name)FROM table_nameWHERE column_name operator valueGROUP...04 15:26:54 | 2 |+----+--------+---------------------+--------+6 rows in set (0.00 sec)接下来我们使用 GROUP...BY 语句 将数据表按名字进行分组,并统计每个人有多少条记录:mysql> SELECT name, COUNT(*) FROM employee_tbl GROUP BY name;+-----...例如我们将以上的数据表按名字进行分组,再统计每个人登录的次数:mysql> SELECT name, SUM(signin) as signin_count FROM employee_tbl GROUP
大家好,又见面了,我是全栈君。 https://addons.mozilla.org/en-US/firefox/addon/tabgroups-menu/? ...
2. group by 的用法: select 字段 from 表 where 条件 group by 字段1(,字段2,字段3) select 字段 from 表 group by 字段1(...By中Select指定的字段限制 select后的字段: 要么就要包含在Group By语句的后面,作为分组的依据; 要么就要被包含在聚合函数中。 ...错误: SELECT name, salary FROM student GROUP BY name select 后的字段 salary 不在 group by 后面,所以salary...都包含在group by 后面,两个字段分组。...正确 2: SELECT name,MAX(salary) FROM student GROUP BY name select 后的字段 salary 虽然不在 group by
今天看到group()方法,有点疑惑,自己动手了解了一下。...举例如下: import re a = "123abc456" print re.search("([0-9]*)([a-z]*)([0-9]*)",a).group(0) #123abc456,返回整体...)([a-z]*)([0-9]*)",a).groups() #['123','abc','456'] print re.search("([0-9]*)([a-z]*)([0-9]*)",a).group...(1) #123 print re.search("([0-9]*)([a-z]*)([0-9]*)",a).group(2) #abc print re.search("([0-9]*)([a-z...]*)([0-9]*)",a).group(3) #456 一开始我理解为group(n)(n=1,2,3)会根据括号里的正则表达式进行匹配,每次都是从字符串a的起始位置开始,会自动匹配到‘123
一、group模块 group模块用于管理用户组和用户组属性。...https://docs.ansible.com/ansible/latest/modules/group_module.html#group-module 参数 说明 name= 组名 state=...persent|absent 创建|删除 system= yes|no 是否为系统组 gid gid #组创建 [root@manage01 ~]# ansible -m group group1 -..."name": "admin", "state": "present", "system": false } #删除组 [root@manage01 ~]# ansible -m group...platform-python" }, "changed": true, "name": "admin", "state": "absent" } 二、学习视频 视频:group
Group Configuration:集群里已经配置的实例列表。 Group Membership Service:维护一致性view变更的服务,作用于节点的新增,退出,以及当前视图的维护工作。...UUID格式 group_replication_local_address ='1.1.1.1:3306' #本地节点IP端口,接受组中其他成员传入连接 group_replication_group_seeds...'; SET GLOBAL group_replication_bootstrap_group=ON; START GROUP_REPLICATION; SET GLOBAL group_replication_bootstrap_group...TO MASTER_USER=START GROUP_REPLICATION; mysql> CHANGE MASTER TO MASTER_USER=SET GLOBAL group_replication_bootstrap_group...GLOBAL group_replication_bootstrap_group = ON的操作; 在启动组复制之前,因为该组已由第一个server创建和引导。
二、看执行计划 可以看到,group by字段上我是加了索引的,也用到了。 三、优化 说实话,我是不知道该怎么优化的,这玩意还能怎么优化啊!先说下,下面的思路都是没用的。...思路二: where条件太复杂,没索引,导致查询慢,但我给where条件的所有字段加上了组合索引,也还是没用 思路三: 既然group by慢,换distinct试试??...虽然知道group by和distinct有很小的性能差距,但是真没想到,差距居然这么大!!!大发现啊!!
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