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育种中如何检查系谱是否有错误

系谱检查常见错误,包括: 个体有重复值 父母本交叉 系谱有循环 这些情况应该如何快速检查呢? 这里推荐我写的R包learnasreml中的check_pedigree函数,简单好用,结果友好。...能够检查: 个体是否有重复值 父母本是否有交叉 至于系谱循环检查,推荐栾生老师写的visPedigree包中的函数tidyped。下面介绍函数的用法。 1....prepPed(ped) : some individuals appear more than once in the pedigree 可以看到,报错,显示ID中有重复,但是没有说明哪些有错误...ID Sire Dam 1 5 A5 B5 2 8 A8 B8 3 5 A11 B11 4 8 A12 B12 可以看到,这里ID有重复,但是其父母本不一样,应该是系谱错误所致...如何安装learnasreml #安装方法: if (!

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    如何使用python把json文件转换为csv文件

    了解json整体格式 这里有一段json格式的文件,存着全球陆地和海洋的每年异常气温(这里只选了一部分):global_temperature.json { "description": {...0.2099", "1885": "-0.2220", "1886": "-0.2101", "1887": "-0.2559" } } 通过python读取后可以看到其实json...由于json存在层层嵌套的关系,示例里面的data其实也是dict类型,那么年份就是key,温度就是value ?...转换格式 现在要做的是把json里的年份和温度数据保存到csv文件里 提取key和value 这里我把它们转换分别转换成int和float类型,如果不做处理默认是str类型 year_str_lst...注意 如果在调用to_csv()方法时不加上index = None,则会默认在csv文件里加上一列索引,这是我们不希望看见的 ?

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    typescript中如何直接引入json文件

    前言 这是以前的笔记, 通过例举问题的方式来寻求解决方法 这里记录一个奇怪的问题, 如代码图片 640.png 这是一个单独的文件, 只是引入一个json文件, 使用typescript编写, 发现require...文件的末尾添加如下代码 declare module "*.json" { const jsonValue: any; export default jsonValue; } 然后就可以在此项目的...ts文件中导入json文件了 如代码 import * as serverConfigJson from "..../serverConfig.json"; console.log(serverConfigJson) 这样, 再使用命令tsc jsonTest.ts来构建成js文件, 之后就可以运行了 ---- update...-1 发现现在引入json文件不需要像上面那样去做, 只需要在tsconfig.json中增加一个编译选项就好了 如增加 "resolveJsonModule": true, 即可 现在我使用的完整的tsconfig.json

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    如何定位导致 Django 错误的文件

    在 Django 核心文件中添加断点,这些文件在错误回溯信息中提到。按步执行代码,直到找到引用它的文件。可以在该文件中找到导致错误的具体原因。...当错误发生时,访问带有关联 request ID 的调试工具页面。可以使用该工具来检查模板文件并找到导致错误的特定位置。方法 3:使用 PyCharm 等 IDE 工具在 IDE 中打开项目。...方法 4:使用模板调试器在模板文件中添加以下代码以启用模板调试器:{% load debug %}当错误发生时,可以在模板中检查带有 {{ debug }} 标签的 HTML 代码,以查看导致错误的具体位置...方法 5:使用 Python 控制台在出现错误的位置添加 print() 语句来打印变量和值。运行代码并检查控制台中的输出,以查找导致错误的原因。...#总结定位 Django 错误的文件和代码行,可以采用以下步骤:查看 Django 错误页面(开发模式)。使用 日志记录 将错误保存到文件。

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    如何完美解决 org.springframework.http.converter.HttpMessageNotReadableException: JSON parse 错误

    如何完美解决 org.springframework.http.converter.HttpMessageNotReadableException: JSON parse 错误 摘要 在Spring...这个错误通常是由于客户端发送的JSON数据格式不正确,导致服务器无法解析。作为一名开发者,掌握如何定位并解决这个错误显得尤为重要。接下来,猫头虎博主将带领大家深入探讨这个问题的成因和解决方法。...解决方案 3.1 检查JSON格式 确保客户端发送的JSON格式正确,可以使用在线工具如 JSONLint 验证。...通常是由于客户端发送的JSON格式不正确或数据类型不匹配引起的。 Q2: 如何调试 HttpMessageNotReadableException?...可以通过日志查看详细错误信息,检查客户端发送的JSON数据格式是否正确。 Q3: 如何避免 HttpMessageNotReadableException?

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    如何使用 SPM 插件从 Pkl 配置文件生成 Swift 接口

    在本文中,你将学习如何安装和使用 pkl-gen-swift 命令行工具,并将其集成到你的 Swift Package Manager(SPM)项目中,方法是使用 SPM 插件。...baseUrl: String retryCount: Int(isBetween(0, 3)) timeout: Duration 如上面的片段所示,我们使用类型和范围来约束可以分配给属性的值,并减少错误的可能性...在此目录中,创建以下文件夹结构: Pkl.artifactbundle ├── info.json ├── pkl-0.25.2-macos │ └── bin │ └── pkl info.json...文章详细介绍了如何安装和使用 pkl-gen-swift 命令行工具,并将其集成到 Swift Package Manager(SPM) 项目中。...然后,通过示例展示了如何创建和修改 Pkl 配置文件,以及如何使用 pkl 命令行工具评估配置文件。接着,介绍了如何生成 Swift 接口文件,以及如何创建 SPM 命令插件来自动生成代码。

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    如何删除错误提交的 git 大文件

    那么如何把这个压缩包彻底从 git 删除? 如果需要删除 git 的历史记录,使用方法很简单,请看 Git如何永久删除文件(包括历史记录) - shines77 - 博客园 。...,于是如何让本地的小伙伴可以使用最新的仓库?...删除原来分支,这样就好 最后的命令是使用 gc 清掉这个提交 这时候查看自己的git 文件夹,如果文件夹还是那么大,那么说明还有一个分支是引用提交大文件,需要自己去看一下是哪个分支。...需要说明,git 如果提交一个文件,然后删除他,继续提交,那么这个文件是存在 git 中,需要使用特殊的命令才可以删除。...E9%99%A4%E9%94%99%E8%AF%AF%E6%8F%90%E4%BA%A4%E7%9A%84-git-%E5%A4%A7%E6%96%87%E4%BB%B6.html ,以避免陈旧错误知识的误导

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    KubeLinter:如何检查K8s清单文件和Helm图表

    以下是如何设置和使用它。 KubeLinter是一款开源工具,可分析 Kubernetes YAML 文件和 Helm 图表,以确保它们遵循最佳实践,重点关注生产就绪性和安全性。...它对配置的各个方面进行检查,以识别潜在的安全错误配置和DevOps最佳实践。 通过运行 KubeLinter,您可以获得有关Kubernetes配置文件和 Helm 图表的有价值的信息。...如何使用 KubeLinter 要使用 KubeLinter,您可以首先针对本地 YAML 文件运行它。只需指定要测试的 YAML 文件的路径,KubeLinter 将执行 linting 检查。...例如,对于 JSON 格式使用 –format=json,对于 SARIF 规范使用 –format=sarif。...以下是如何使用特定配置文件运行 lint 命令的示例: kube-linter lint pod.yaml –config kubelinter-config.yaml 配置文件有两个主要部分 customChecks

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    如何在 Node.js 中流式处理大 JSON 文件

    JSON 文件,下面先给出了两个问题,可以先思考下如果是你会怎么做?...解决第二个问题,现在我们的 JSON 文件是下面这样的。...文中主要介绍如何流式处理类似的大文件,更重要的是掌握编程中的一些思想,例如 SAX 一个核心点就是实现了 “事件驱动” 的设计模式,同时结合 Stream 做到边读取边解析。...处理问题的方式是多样的,还可以在生成 JSON 文件时做拆分,将一个大文件拆分为不同的小文件。...学会寻找答案,NPM 生态发展的还是不错的,基本上你能遇到的问题大多已有一些解决方案了,例如本次问题,不知道如何使用 Stream 来读取一个 JSON 文件时,可以在 NPM 上搜索关键词尝试着找下。

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