首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

"正确地打开方式": [ "阅读", "置顶", "转发" ] } } 在Python中解析...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...Known_CPS.CUI.mfa.psiblast -evalue 0.0001 -outfmt 13 -num_threads 10 -num_iterations 0 -in_msa Known_CPS.CUI.mfa 这次编程的目的是通过解析输出的...JSON结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON...文件,获得想要的Python脚本和解析结果。

2.1K50
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    Tungsten Fabric架构解析丨TF如何连接到物理网络?

    以下分别介绍了这几种连接外部网络的方法。 启用BGP的网关 实现外部连接的一种方法,是使用一系列可外部路由的IP地址创建虚拟网络,并将网络扩展到网关路由器。...这些操作的结果是,vRouters上的公共VRF包含通过VM的本地接口到floating IP地址的路由,以及通过路由器上的VRF的默认路由。...---- 更多Tungsten Fabric解析文章   第一篇:TF主要特点和用例   第二篇:TF怎么运作 第三篇:详解vRouter体系结构 第四篇:TF的服务链   第五篇:vRouter...的部署选项 第六篇:TF如何收集、分析、部署?...第七篇:TF如何编排   第八篇:TF支持API一览 ---- 关于Tungsten Fabric: Tungsten Fabric项目是一个开源项目协议,它基于标准协议开发,并且提供网络虚拟化和网络安全所必需的所有组件

    91530

    性能测试--4、结果解析:有效的根源问题分析

    测试后分析 性能测试结束后,测试工具可以存储性能测试结果供测试后分析。 性能测试输出的类型 统计入门 平均数和中位数 平均数:一系列数字的算术平均值。...Nth百分比 统计学中的Nth百分比用于定义测试结果的采样比例;比如:40th百分比意味着选取在40%及小于40%的一组结果。...负载生成器性能 负载生成器自己在性能测试过程中超负荷,会导致性能测试无法表现真实的行为,同时产生的结果不可信。...测试执行过程中的工作 实时检查负载生成是否过载; 确保每次的测试执行都形成文档,保存下来: 性能测试执行文件的名称,测试执行的日期和时间; 对测试组成部分进行一个简要描述; 当前执行的测试对应的测试结果文件名...,因为你不知道什么时候需要进行回归测试; 编写测试报告的时候,确保测试结果与性能目标对应,这些性能目标是在预测试的需求获取阶段设定的.

    63620

    Request 爬虫的 SSL 连接问题深度解析

    在数据爬取过程中,爬虫需要与使用 HTTPS 协议的网站进行通信,这就牵涉到了 SSL 连接。本文将深入研究 Request 爬虫中的 SSL 连接问题,并提供解决方案以应对各种情况。...问题背景Request 是一款功能丰富的 Python 库,被广泛用于执行 HTTP 请求和数据爬取任务。然而,当需要连接 HTTPS 网站时,经常会出现与 SSL 连接相关的问题。...解决这些问题需要详细了解 SSL 连接的工作原理。解决方案1. 传递自定义 SSL 连接选项要解决 Request 爬虫中的 SSL 连接问题,可以传递自定义的 SSL 连接选项。...维护 SSL 协议支持由于SSL协议不断演进,旧版本的Request可能无法连接到最新的HTTPS网站。因此,要解决SSL连接问题,需要定期升级Request版本以获取最新的SSL协议支持。...实践案例为了更好地理解如何在Request爬虫中处理SSL连接问题,我们来看一个爬取当当网数据的实际案例。在这个案例中,我们将演示如何传递自定义SSL连接选项和代理信息。

    49110

    python执行cmd命令并解析结果_python如何打包成可执行程序

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 身为一个编程小白,最近刚刚接手工作。近期在使用 pyinstaller 的时候,发现了一个很严重的问题,那就是缺少包。...就拿我的文件来说吧,我的python工作空间放在了D盘下。 之后在等待结束后,再进入工作空间中,你会看到你的工作目录中多出了build,dist,和你刚刚打包文件项目同名的.spec文件。...而你的可执行文件就在dist中。 这下到了关键的地方了,如何将包添加进自己的项目中。首先我们将刚刚和项目同名的spec文件,用工具打开。打开后你会看到这样的页面。...保存好了以后,将之前生成的可执行文件删掉,build的里的配置文件也删掉。然后重新pyinstaler。这块要注意,这次打包的不是你的.py文件了,而是你刚刚修改的.spec文件。...pyinstaller -F 文件位置+文件名.spec 一般生成的spec文件,你进入你的工作空间就能看见。打包生成exe文件后,就可以执行了。 希望这篇啰嗦的文章能够解决你的问题。

    1K30

    深入解析:半连接与反连接的原理和等价改写方法

    半连接的原理及等价改写 1. 什么是半连接 当两张表进行关联,只返回匹配上的数据并且只会返回一张的表的数据,半连接一般就是指的在子查询中出现 IN 和 EXISTS。...; 把驱动表的每一行根据连接列去被驱动表中去查找匹配的行; 如果在被驱动表中匹配上一个或者多个,则返回驱动表中的数据。...DEPTNO") Inner join 多了 group by 的操作,emp 的 depno 值不是唯一的,要保证逻辑上跟半连接的一致就需要把 emp 的连接进行去重操作,跟上面 emp 作为驱动表是一致的...DEPTNO") 反连接的原理及等价改写 1. 什么是反连接 两表关联只返回主表的数据,并且只返回主表与子表没关联上的数据,这种连接就叫反连接。...DEPTNO") 总结 通过半连接和反连接的学习,我们可以知道半连接一般是出现在子查询有 IN 或者 EXISTS 的情况,并且只返回主表连接列关联上的数据,如果连接列是唯一值的话可以直接转化为内连接

    1.9K70

    如何快速地计算乘以11的结果?

    陪孩子学数学,碰到了计算乘11的技巧,恕我孤陋寡闻了,学习了解下。 "计算乘11"就是指某个数和11相乘,快速计算结果,公式就是"两头一拉,逐位相加"。 举些例子,可能更容易理解。...第二步:将被乘数十位和个位上的数字相加,即:1+3=4。 第三步:将"4"填入到第一步的括号内,得出结果是143。...(2) 25×11= 同(1)中的方法,首先拆分被乘数2( )5,然后将被乘数中的十位和个位上的数字相加,即:2+5=7,得出结果等于275。...第二步:将被乘数的百位和十位上的数字相加,即:1+1=2,十位和个位上的数字相加,即:1+2=3。 第三步:将2、3,按前后顺序序填入括号内,得出结果为1232。...(4)1234×11= 被乘数是四位数时, 第一步:将千位和个位上的数字1、4分写两边,即:1( )( )( )4。

    17800

    mysql,SQL标准,多表查询中内连接,外连接,自然连接等详解之查询结果集的笛卡尔积的演化

    从结果可以看到,每个教师的信息均与所有课程信息进行了匹配连接。...缺点是,虽然可以指定查询结果包括哪些列,但是不能人为地指定哪些列被匹配。另外,自然连接的一个特点是连接后的结果表中匹配的列只有一个。如上,在自然连接后的表中只有一列C。...而外连接告诉ODBC生成的结果表,不仅包含符合条件的行,而且还包含左表(左外连接时),右表(右外连接时)或两个边接表(全外连接)中所有的数据行。...1,左外连接 左外连接,left outer join ,告诉DBMS生成的结果表中,除了包括匹配行外,还包括join关键字(from子句中)左边表的不匹配行。...右外连接 右外连接,right outer join ,告诉DBMS生成的结果表中,除了包括匹配行外,还包括join关键字(from子句中)右边表的不匹配行。

    2.5K20

    深入解析:半连接与反连接的原理和等价改写方法

    半连接的原理及等价改写 1. 什么是半连接 当两张表进行关联,只返回匹配上的数据并且只会返回一张的表的数据,半连接一般就是指的在子查询中出现 IN 和 EXISTS。...; 把驱动表的每一行根据连接列去被驱动表中去查找匹配的行; 如果在被驱动表中匹配上一个或者多个,则返回驱动表中的数据。...DEPTNO") Inner join 多了 group by 的操作,emp 的 depno 值不是唯一的,要保证逻辑上跟半连接的一致就需要把 emp 的连接进行去重操作,跟上面 emp 作为驱动表是一致的...DEPTNO") 反连接的原理及等价改写 1. 什么是反连接 两表关联只返回主表的数据,并且只返回主表与子表没关联上的数据,这种连接就叫反连接。...DEPTNO") 总结 通过半连接和反连接的学习,我们可以知道半连接一般是出现在子查询有 IN 或者 EXISTS 的情况,并且只返回主表连接列关联上的数据,如果连接列是唯一值的话可以直接转化为内连接

    75410

    如何有效沟通你的机器学习结果?

    造成的结果,是本以为没事儿的年轻人,再次重症发病入院;老年人却不少都治愈后健康回家了。 这种结果的传递沟通,有效地改进了医生的决策和行为方式。...通过文献阅读,我发现了其他机器学习研究人员为了解释结果所做的努力。 在深度学习领域,现在做得比较好的,是卷积神经网络。 在《文科生如何理解卷积神经网络?》...一文中,我给你解释过卷积神经网络的概念和使用方法。 ? 但是,我们当时,还只是给你讲解如何用它进行分类等,没有涉及解释方案。 你看这样一幅图,机器模型可以很容易分辨它为“非洲象”。 ?...单看结果,不好分辨。但是我们可以对卷积神经网络训练的结果参数进行可视化,并且叠加到原图上,你一眼就可以看到,机器做出图像分类的依据,究竟是什么。 ?...只要能够真正影响对方的决策,帮助他们更好地达成自己的目标,你的机器学习分析,便有了更佳的效果。 如果你对数据科学感兴趣,不妨阅读我的系列教程索引贴《如何高效入门数据科学?》

    60950

    深入解析go channel各状态下的操作结果

    channel是golang中独有的特性,也是面试中经常被问到的。相信大家都看到过下面这张图,对于不同状态下通道,在操作时会有什么结果。 这张图总结的非常好。但我们不能死记硬背这些结果。...要了解其底层的基本原理,就能理解这些结果是怎么来的。 我们分三部分来讲。先是channel的基础使用,基础使用提现了channel有哪些特性。再引出channel的底层数据结构。...底层数据结构就是围绕这些特性而建立的。最后再看go是如何基于底层数据结构来实现这些特性的。...根据以上结果,绘制成图会容易理解点,如下: 缓冲通道和非缓冲通道的区别 从定义上,缓冲通道和非缓冲通道都是通过make来初始化的。不同点在于是否在make函数上指定了通道的容量大小。...nil通道 通过以下方式定义的通道类型的变量,其默认值就是nil。 var ch chan int nil通道相当于没有分配通道的底层结构 如下是从源代码中截取的各个操作以及对应操作结果。

    31540

    OpenCV4 | 如何一行代码搞定SSD模型推理与结果解析

    高阶API介绍 最新版本OpenCV4.1.2,针对深度神经网络模块,提供了三个高阶的API,通过它们,自动实现输入图像预处理与后处理,直接输出检测结果,支持图像分类、对象检测、图像分割三种常见的视觉常见任务...Rect > & boxes, // 目标框 float confThreshold = 0.5f, // 阈值 float nmsThreshold = 0.0f // NMS ) 这样就不需要再去解析...是不是有一种级联检测器对象检测的既视感!...代码演示 以OpenCV深度神经网络模型自带的SSD人脸检测为例,首先需要运行: samples\dnn\face_detector文件夹下的 download_weights.py 文件下载模型,下载之后...很简单使用OpenVINO的推理引擎(IE)之后,加速效果满满的。

    1.5K20

    连接的力量:.icu域名如何连接人与思想

    在当今数字时代,连接变得更加重要。它跨越地理距离,促进协作,并在全球范围内实现思想交流。互联网的出现彻底改变了我们相互连接和分享信息的方式。...在众多可用的工具和平台中,.icu域名凭借其强大的连接性成为一个突出的催化剂。在本博文中,我们将探讨连接的重要性以及.icu域名在连接人与思想方面发挥的关键作用。....icu域名的力量在于它作为一个连接人与人、连接思想和创意的媒介。它促进了无缝的沟通和协作,营造了一个开放和互动的数字生态系统。...协作项目和合作伙伴关系通常会促成思想的交叉汇流,促进创新和连接。 / 结论 / 总之,连接性是数字革命的核心,实现了思想、知识和协作的无缝交流。.icu域名是一个连接全球人与思想的强大工具。...通过建立强大的在线存在、参与.icu社区并利用可用资源,您可以充分发挥连接性的真正力量,开启新的增长、合作和成功机会。拥抱.icu域名所提供的连接性,让它成为将您的思想和抱负带给世界的催化剂。

    34030

    光纤连接器如何实现光纤的精密连接?

    当两根光纤接续时,由于两光纤位置、形状、结构等的差异,造成能量并不能100%的从一根光纤进入另一根光纤,即会出现连接损耗。为了尽量地减小连接损耗,两根光纤之间必须精密对准。...光纤连接器的主要作用是快速连接两根光纤,使光信号可以连续而形成光通路。而光纤连接器是如何来实现光纤的精准连接?...从图1中可以看到两根光纤如何通过一个陶瓷套筒实现精密对准,陶瓷套筒的内径比插芯的外径稍小,因为套筒上有开缝,插芯才能插入。被扩张的套筒箍紧两个插芯,实现精密对准。...从图2中可以看到连接损耗与两根光纤横向错位量之间的关系,该曲线是指数关系的,小至2.4μm的横向错位就会产生1dB的损耗。因此对单模光纤连接器,两根光纤之间的横向错位应小于0.5μm。...因此每个光纤接头会增加0.3dB的损耗。 人们通常在端面上镀增透膜来减少反射回波,然而在光纤连接器中不考虑镀膜问题。首先,镀增透膜会增加连接器的成本;其次,光纤连接并不是固定的,重复插拔会破坏增透膜。

    1.1K20

    如何连接ACL认证的Redis

    Python 程序 如果你想使用python通过用户名密码连接开启ACL的Redis,你可以参考以下的方法: 首先,需要安装redis-py库,这是一个python的Redis客户端,可以方便地操作Redis...其次,需要创建一个Redis对象,用来连接Redis服务器。可以使用Redis的构造函数来指定host,port,username和password。..., port=6379, username='admin', password='123456') r.set('test1','1111') v=r.get('test1') print(v) 运行结果如下...java程序 2.1 jedis 如果使用的是java程序,且通过jedis连接Redis6,可以参考以下的方法: • 首先,需要引入jedis的依赖包,jedis是一个java的Redis客户端...2.2 lettuce 如果你想使用Lettuce处理,可以参考以下的方法: 首先,你需要创建一个RedisURI对象,用来指定连接的地址,端口,数据库,用户和密码。

    14610
    领券