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人群接触网络中的 SIR 疫情模拟

视频内容 如何用网络来表示人之间的接触关系？在接触网络中，如何通过 SIR 模型模拟疫情的发展趋势？ 本案例将介绍SIR模型，图和网络的基本知识。...然后使用 networkx 工具，在生成的随机网络和真实的网络数据上，实现网络中的 SIR 模型进行疫情模拟。 1 SIR 模型介绍 SIR 模型用于计算封闭人群中随着时间推移感染传染性疾病的人数。...在 SIR 模型中，假设人之间是随机接触的。如果人之间的接触关系不是随机的，而是形成了一个接触网络。那么在这个网络中，每个人接触到感染者的概率不再相等，而与他在网络中的位置相关。...然后使用 Scipy 中的 odeint 函数对其进行数值求解，模拟疫情的传播。 在基本的 SIR 模型中假设人之间的接触是随机的。而在真实情况中，人与人的接触以网络形式存在。...为了探索在网络中SIR模型的传播。我们介绍了一个网络中的 SIR 模型，借助 networkx 工具，我们实现了该模型。

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    最近疯传的SIR传染病模型到底是什么？

    以下文章来源于俊红的数据分析之路 ，作者张俊红 本文只讲学术，不讨论其他。 最近看到在网上传的一张SIR传染病模型的图，很多人应该对这个模型不是很了解，今天就讲一下这个模型。 ?...SIR模型是传染病模型中最经典的一个，类似的还有SI和SIS两种。...SIR是三个单词首字母的缩写，其中S是Susceptible的缩写，表示易感者；I是Infective的缩写，表示感染者；R是Removal的缩写，表示移除者。 这个模型本身是在研究这三者的关系。...在病毒最开始的时候，所有人都是易感者，也就是所有人都有可能中病毒；当一部分人在接触到病毒以后中病毒了，变成了感染者；感染者会接受各种治疗，最后变成了移除者。 这三者的关系如下图所示： ?...本文旨在科普SIR模型学术学习，这样就不会被学术圈那些看起来高大上理论给唬倒。

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    最近疯传的SIR传染病模型是什么？

    总第188篇/张俊红 最近看到在网上传的一张SIR传染病模型的图，很多人应该对这个模型不是很了解，今天就讲一下这个模型。这一篇只讲学术，不讨论别的。...SIR模型是传染病模型中最经典的一个，类似的还有SI和SIS两种。...SIR是三个单词首字母的缩写，其中S是Susceptible的缩写，表示易感者；I是Infective的缩写，表示感染者；R是Removal的缩写，表示移除者。这个模型本身是在研究这三者的关系。...在病毒最开始的时候，所有人都是易感者，也就是所有人都有可能中病毒；当一部分人在接触到病毒以后中病毒了，变成了感染者；感染者会接受各种治疗，最后变成了移除者。这三者的关系如下图所示： ?...这个模型有两个假设条件： 1.一段时间内总人数N是不变的，也就是不考虑新生以及自然死亡的人数 2.从S到I的变化速度α、从I到R的变化速度β也是保持不变的 在实际环境中上面的两个假设一般是不太容易满足的

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    用Wolfram语言构建SIR｜SEIR模型——流行病数学模型的基础

    用Wolfram语言构建SIR｜SEIR模型——流行病数学模型的基础 SIR 模型是描述传染病传播模型中最简单的模型。...Wolfram 语言帮助您以非常简单和快速的方式使用模型，以查看案例数量如何根据参数值激增然后得到缓解。这可以让您领先一步，设计自己的流行病学模型并模拟更现实的流行病演变。...rate) 和易感人群 (susceptible) 与康复人群 (recovered)之间的关系 （SIR 模型），最后还展示了S(susceptible 易感者)-E(Exposed 潜在感染者)-...I(Infected 已感染者)-R(Recovered 康复者) （SEIR）模型，其考虑了潜伏感染者，自我隔离，社区封禁等因素的传播控制预估。...query=SIR 该视频笔记本下载链接： https://wolfr.am/13E0N97Uc http://mpvideo.qpic.cn/0b2e7maaeaaasqae4jku5zrfb66dal5qaaqa.f10002

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    使用SIR模型对2019新型冠状病毒的疫情发展进行分析

    在对传染病模型的研究上有很多模型比如：SI、SIS、SERS、SIR等，本文将利用SIR模型对这次新型冠状病毒的发展情况进行研究。...这在R中很容易实现： SIR <- function(time, state, parameters) { par <- as.list(c(state, parameters)) with(par...model 2019-nCoV", outer = TRUE, line = -2) 看下最后的结果，beta为0.6746089预测出来大概在两个月左右到达高峰，不过光凭简单的SIR模型估计不太好去准确预测...，模型应该可以被进一步优化，同时从国家施行的各种管制措施，疫情应该得到了很好的控制。...最后 本次SIR建模分析的目的只是为了说明如何使用最简单的SIR模型，其结果依旧有很大的局限性。通过官方通报的部分病例来看，有些确诊病例的病毒潜伏期很长。

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    再见Python！数据分析可以这样做。

    在我的公众号中，数据分析相关文章似乎都是用Python实现的。实际上，R语言和Python编程在数据分析方法都各有所长，今天这篇文章会通过比较的形式介绍R语言和Python数据分析。...大多数用户使用RStudio编写和编辑他们的 R 代码，RStudio是一款用于在 R 中编码的集成开发环境 (IDE)。...R语言中既可以利用sqldf拓展包获取SQL数据库中的数据，也支持SPSS/SAS/Matlab等数据集的导入。...尤其在某些生信、科研、航空等领域，R语言的可视化效果要比Python优秀不少。此外在构建可视化平台方面，Rmarkdown、Rshiny等R包也提供了极大的便利。...推荐好书 & 福利抽奖 《深入浅出R语言数据分析》 本书首先介绍数据分析的方法论，然后介绍数据分析的相关模型方法，并进一步通过数据分析案例，讲解数据分析的思维、方法及模型实现过程。

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    在vscode中配置R的开发环境

    写在前面 有时候各位使用R的用户不知道会不会有这样的感觉，visual studio和Rstudio由于负载过重，在打开或者加载R script时会出现加载过慢的情况，但对于很多数据工作者来说，variable...inspector和data view这类的数据可视化功能必不可少，而visual studio和Rstudio在这方面做得可以说是非常完善。...整体看起来效果还是非常不错的，开发者在整体上还是保留了Rstudio和visual studio中对于View()这个函数的配置，还在此基础上添加了search功能，此外对Rshiny可视化的支持也非常棒...“ FBI WARNING: visual studio code对R的配置显然没有Rstudio和visual studio那么智（傻）能（瓜），需要先装好python，慎入！！！...Path中添加R的执行文件的路径，当然也可以选择radian.exe的路径（该路径存在于python的scripts文件夹中）。

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    datapasta包学习-可复制网页、Excel表格等其他来源的数据至Rstudio中

    datapasta 是一个 R 语言 中用于 优化数据复制和粘贴（copy-paste）的 R 包，旨在简化数据导入和转换过程，减少手动格式调整的需求，提高数据整理的效率。...功能介绍将 Excel/CSV/表格数据快速粘贴到 R 代码：可将剪贴板中的数据直接转换为 data.frame、tibble、vector 等格式，无需手动整理格式。...从R数据转换为文本格式（适用于论文、报告）：支持将 R 变量（如 data.frame、向量等）转换为 Markdown、LaTeX、CSV、TSV 等格式，方便复制到论文、报告或其他文档中。...提供 RStudio 加载项（Addins）：允许用户在 RStudio 界面内 一键转换数据格式，提高数据输入和导出效率。...分析步骤1.导入示例数据：GSE173468 rm(list = ls())install.packages("datapasta")library(datapasta)至网页中复制红色框选的内容 按照

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    java中的内存模型

    内存模型描述了程序中各个变量（实例域、静态域和数组元素）之间的关系，以及在实际计算机系统中将变量存储到内存和从内存中取出变量这样的底层细节，对象最终是存储在内存里面的，这点没有错，但是编译器、运行库、处理器或者系统缓存可以有特权在变量指定内存位置存储或者取出变量的值...在Java中应为不同的目的可以将java划分为两种内存模型：gc内存模型。并发内存模型。 gc内存模型 java与c++之间有一堵由内存动态分配与垃圾收集技术所围成的“高墙”。...java在执行java程序的过程中会把它管理的内存划分若干个不同功能的数据管理区域。如图： ? ? ? hotspot中的gc内存模型 整体上。...java内存模型主要目标是定义程序中各个变量的访问规则，即在虚拟机中将变量存储到内存和从内存中取出变量这样的底层细节。模型图如下： ?...java并发内存模型以及内存操作规则 java内存模型中规定了所有变量都存贮到主内存（如虚拟机物理内存中的一部分）中。每一个线程都有一个自己的工作内存(如cpu中的高速缓存)。

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    如果新冠病毒是在亚美尼亚爆发会发生什么？程序员用Python进行模拟

    流行病学建模 为了回答这些问题，我们将建立一个简单的房室模型来模拟传染病在城市中的传播。 当一种流行病爆发时，其传播动力会有显著变化，这取决于最初感染的地理位置及其与城市其他地区的连接性。...注：compartmental model，房室模型，也称SIR模型，是一种简化的传染病数学模型。...由于我们的目标是展示城市流行病传播的一般原理，而不是建立一个实时的精确模型，我将参考《自然》杂志的一篇文章，通过简单地修改经典SIR模型即可满足我们的需求。...上述的模型十分简洁：为了求得t + 1时刻的j地的尚未感染或易感的人数，我们需要从t时刻的j地的尚未感染或易感的人数中减去j地本地感染的人数（第一个方程的第二部分），还要减去从其他地方来到j地的感染者数...结论 该实验绝不是说我们已经构建了准确的传染病模型（甚至模型中不涉及任何传染病学的基础知识），我们的目标是在传染病爆发时能够即时了解城市交通网络对传染病传播的影响。

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    如果新冠病毒是在亚美尼亚爆发会发生什么？程序员用Python进行模拟

    流行病学建模 为了回答这些问题，我们将建立一个简单的房室模型来模拟传染病在城市中的传播。 当一种流行病爆发时，其传播动力会有显著变化，这取决于最初感染的地理位置及其与城市其他地区的连接性。...注：compartmental model，房室模型，也称SIR模型，是一种简化的传染病数学模型。...由于我们的目标是展示城市流行病传播的一般原理，而不是建立一个实时的精确模型，我将参考《自然》杂志的一篇文章，通过简单地修改经典SIR模型即可满足我们的需求。...上述的模型十分简洁：为了求得t + 1时刻的j地的尚未感染或易感的人数，我们需要从t时刻的j地的尚未感染或易感的人数中减去j地本地感染的人数（第一个方程的第二部分），还要减去从其他地方来到j地的感染者数...如下动图显示了高度依赖公共交通场景下的结果： 结论 该实验绝不是说我们已经构建了准确的传染病模型（甚至模型中不涉及任何传染病学的基础知识），我们的目标是在传染病爆发时能够即时了解城市交通网络对传染病传播的影响

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    软件测试中的V模型

    什么是V模型？ V模型是SDLC模型，是瀑布模型中使每个开发阶段具有对应的测试阶段。它被称为“vee”模型。V模型是瀑布模型的扩展。V模型中测试与开发并行进行。...瀑布模型： 瀑布模型是一个顺序模型，分为软件开发活动的不同阶段。每个阶段都旨在执行特定的活动。仅在系统开发完成后，瀑布模型的测试阶段才开始。...瀑布模型问题 您可能会看到，在模型中，只有在软件开发完成之后才开始进行测试。 但是，如果您在系统复杂的大型项目中工作，很容易错过需求阶段本身的关键细节。...对数千个项目的评估表明，在需求和设计过程中引入的缺陷几乎占缺陷总数的一半。 ? 而且，修复缺陷的成本在整个开发生命周期中都会增加。生命周期中越早发现缺陷，修复它的成本就越低。...测试不是独立的活动，它必须适应为项目选择的开发模型 在任何模型中，都应在所有级别上进行测试，即从需求到维护为止。

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    深度学习中的模型修剪

    本文讨论了深度学习环境中的修剪技术。 本在本文中，我们将介绍深度学习背景下的模型修剪机制。模型修剪是一种丢弃那些不代表模型性能的权重的艺术。...本文的内容分为以下几节： 函数和神经网络中的“非重要性”概念 修剪训练好的神经网络 代码片段和不同模型之间的性能比较 现代修剪技术 最后的想法和结论 （我们将讨论的代码段将基于TensorFlow模型优化工具包...注意： 必须指定修剪计划，以便在训练模型时实际修剪模型。我们还指定UpdatePruningStep回调，以使其在训练过程中处理修剪更新。...将修剪计划中的end_step参数设置为小于或等于训练模型的时期数。另外，您可能需要试验一下frequency（表示应应用修剪的频率），以便获得良好的性能以及所需的稀疏性。...压缩率是修剪后的网络中剩余参数的分数的倒数。 这种量化的方式也称为训练后量化。因此，这里有一个简单的方法供您遵循，以优化您的部署模型： ? 在下一节中，我们将介绍一些现代修剪方法。

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