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LSTM时间序列预测中的一个常见错误以及如何修正

当使用LSTM进行时间序列预测时,人们容易陷入一个常见的陷阱。为了解释这个问题,我们需要先回顾一下回归器和预测器是如何工作的。...预测算法是这样处理时间序列的: 一个回归问题是这样的: 因为LSTM是一个回归量,我们需要把时间序列转换成一个回归问题。...有许多方法可以做到这一点,一般使用窗口和多步的方法,但是在使用过程中会一个常见错误。 在窗口方法中,时间序列与每个时间步长的先前值相耦合,作为称为窗口的虚拟特征。...这里我们有一个大小为3的窗口: 下面的函数从单个时间序列创建一个Window方法数据集。...它需要时间序列、训练大小和样本数量。

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Rust所有权

let mut s = String::from("hello"); let r = &mut s; 可变引用有一个很大的限制:在特定作用域中的特定数据只能有一个可变引用,而且也不能在拥有不可变引用的同时拥有可变引用...("{} and {}", r1, r2); // 此位置之后 r1 和 r2 不再使用 let r3 = &mut s; // 没问题 println!...("{}", r3); 编译器会确保指向 String 的引用持续有效。 【注】在任意给定时间,要么只能有一个可变引用,要么只能有多个不可变引用;而且在作用域内引用必须总是有效的。...在 Rust 中,将获取「引用」作为函数参数称为「借用」。 5. Slice Slice 是一种特殊的引用,它允许你引用集合中一段连续的元素序列,而不用引用整个集合。...在其内部,Slice 的数据结构存储了 Slice 的开始位置和长度,长度对应于 ending_index 减去 starting_index 的值。

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    全长转录组 | ONT Direct RNA测序 (DRS) 技术原理、数据分析和应用

    或 Tombo-resquiggle,将每一个核苷酸和参考序列进行比对;对于每一个核苷酸,电流信号,例如中位数,平均值,方差和滞留时间等被提取出来,作为以三个不同分类方法为基础软件的输入文件:统计检验(...Nanocompore**在体外可以准确地检测到不同的RNA修饰,也可以用于酵母和人类RNA中m6A修饰图谱,以及靶向非编码RNA的鉴别。...可变多聚腺苷化(Alternative polyadenylation, APA)则是指具有多个 PAS 的序列,在其mRNA的3' 端成熟过程中,由于选择不同的PAS,导致产生出多个3' UTR长度和序列组成不同的转录异构体...可变末端外显子APA 或称 剪切APA:产生末端外显子和3'UTR不同的异构体(isoform),影响编码蛋白C端氨基酸的序列(图17 B)。...探索病毒生命周期、变异监控、宿主-病毒互作以及病毒基因表达的复杂性方面。 合成生物学: 在合成生物学研究中,可以用于测定和验证人工合成的RNA分子,确保其序列和结构的准确性。

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    scRNA-seq表达矩阵的构建

    但是,此结果可能会因protocol,reads长度和reads比对的设置而异。一般来说,我们希望所有细胞都具有相似的比对的reads部分,因此应检查并可能删除任何异常值。...4.6.2 比对barcode 由于独特的条形码数量(4N,其中N是UMI的长度)远小于每个细胞的分子总数(~106),每个条形码通常被分配给多个转录本。...注意,建议修剪和/或过滤以去除含有poly-A序列的读段,以避免由于这些读取映射到具有内部poly-A / poly-T序列的基因/转录物而导致的错误。...但是,实际情况往往并非如此,最常见的原因是: 不同的UMI不一定意味着不同的分子 由于PCR或测序错误,碱基对取代事件可导致新的UMI序列。...不同的转录物不一定意味着不同的分子 映射错误和/或多映射读取可能导致某些UMI被分配给错误的基因/转录本。这种类型的错误也会导致高估转录本的数量。

    1.7K30

    重磅 | 小米首次公开发表论文:基于注意力机制的端对端语音识别(附论文翻译)

    现在,在机器翻译任务中应用这种模型可以取得最高的翻译水准[20]。这种模型可以将长度可变的输入序列映射到长度可变的输出序列。...总的来说,我们完成了以下工作: 在基于注意力机制的端对端普通话语音识别上首次取得理想结果; 通过跳帧减小了输入序列长度; 用多种正则化方法增强了模型的泛化和收敛能力; 探究了不同注意力机制的影响。...比如,机器翻译和语音识别, 输入和输出时都会遇到需要处理的可变长度序列;再比如,文本总结时也有很多可变长度序列。...LAS(Listen, Attend and Spell)[12]是一个基于注意力机制的编码器-解码器网络,通常用于处理可变长度的输入和输出序列。...编码器 (倾听模块) 从可变长度的输入语句中提取可变长度序列的表征。

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    【重制版】AI论文速读 | 计时器(Timer):用于大规模时间序列分析的Transformer

    这样,Timer可以通过微调来适应不同的下游任务,而不需要为每个任务单独训练模型。 评估和分析:论文通过在多个真实世界数据集上进行实验,验证了Timer在时间序列预测、插补和异常检测等任务中的有效性。...然后,标准化时间序列以及相应的时间戳被合并到单变量序列池中。单变量序列训练的时间点遵循正态分布,这主要减轻了多个数据集之间幅度和变量数量的差异。...灵活序列长度(Flexible Sequence Length): 可变上下文长度上的性能encoder-only架构提供了额外的灵活性,以适应一系列不同长度的结构。...展示了Timer在处理不同长度的时间序列时的灵活性,包括可变上下文长度和可变预测长度。 领域迁移(Domain Transfer): 跨域迁移(ECL和weather分别属于能源领域和自然领域。)...灵活序列长度处理:Timer模型能够处理不同长度的时间序列,这为处理实际应用中的多样化数据提供了便利。

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    【Python】从基础变量类型到各种容器(列表、字典、元组、集合、字符串)

    ✨序列拆包 序列拆包:多个变量 = 容器。 a,b,c = tuple03 a,b,c = ["A","B","C"] 需要变量个数等于容器长度。...(字符串是不可变的序列容器) 因为存的是变量,变量是一系列相同长度的地址,所以变化地址是允许的。...使用一个字符串存储多个信息。 ⭐️元组 由一系列变量组成的 不可变 序列容器。不可变是指一但创建,不可以再添加/删除/修改元素。 # 1....tuple04 = (10,) ❇️可变与不可变讨论 列表和元组最大的区别是内存存储机制的不同,而不是一个可变,一个不可变。...= s2 # False 编码 容器中的数据是不可变的。因为在原有基础上修改,有可能破坏其他数据的内存空间。变量可以变化其中的指向信息,原因是地址是固定长度的,不会干扰相邻的数据。

    2.2K20

    Python学习笔记整理(一)pytho

    这两种类型的不同之处在于,列表中的元素能够被修改,而字符串中的字符则不能被修改。换句话说,字符串的值是固定的,列表的值是可变的。元组的数据类型,它和列表比较相近,只是它的元素的值是固定的。...它没有固定的大小。不像字符串,其大小是可变的,通过对偏移量进行赋值以及其他各种列表的方法进行调用,列表确实能够修改其大小。 1、序列操作 支持所有字符串所讨论过的序列操作。...比如记录名和姓,多个工作头衔。...那么python提供time,以及timeit模块和profile模块,用于测试运行时间. 5、不存在的键:if测试 尽管我们能通过给新的键赋值来扩展字典,但是获取一个不存在的键值仍然是一个错误...像列表一样,元组是有序列,但是它具有不可变性,和字符串类似。

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    R-learn)Day1+Day2

    #数据类型转换的优先顺序:逻辑可变字符,逻辑可变数值,数值可变字符,也就是说:逻辑和数值都可以变成字符,逻辑也可转变为数值。...= c(3,2,5,6)#(1)比较运算,生成等长的逻辑向x == y # 注意是一一对应比较,1跟3比,3跟2比,5跟5比,1跟6比y == x #写法不同,但是逻辑以及结果与x == y等同#(2...差集,y有x无重点# %in% 前后位置很重要,对调之后意义不同x = c(1,3,5,1)y = c(3,2,5,6)x %in% y #x的每个元素在y中存在吗,返回的逻辑值长度与x长度一致y %in...% x #y的每个元素在x中存在吗,返回的逻辑值长度与y长度一致#x==y和x%in%y的区别x==y #x与对应位置的y相等吗x%in%y #x的每个元素在y中存在吗?...#R特有的变量保存格式:Rdata #用处:存储有用的变量,准备下一次使用#save(g,s,file="gands.Rdata") #将g和s两个变量存储到gands.Rdata中#load("gands.Rdata

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    详解PostgreSQL数据类型

    如果没有长度声明,char等于char(1),而varchar则可以接受任何长度的字串。 数字类型 由2、4或8字节的整数以及4或8字节的浮点数和可选精度小数组成。...位 numeric 可变 用户指定精度,精确 最高小数点前131072位,以及小数点后16383位 real 4字节 可变精度,不精确 6位十进制精度 double precision 8字节 可变精度...当insert没有指定serial列的值时,则默认的从序列中取出值,并且将序列的值自动加1。... / 14位 timestamp [ (p)]withtimezone 8字节 包括日期和时间,有时区 4713 BC 294276 AD 1微秒 / 14位 date 4字节 日期(没有一天中的时间)...有两种类型的SQL位类型:bit(n)和bit varying(n);   n是一个正整数。 bit类型的数据必须准确匹配长度n; 试图存储短些或者长一些的数据都是错误的。

    1.6K50

    110道一线公司Python面试题,推荐收藏

    中是raw_input()函数,python3中是input()函数 21、列出python中可变数据类型和不可变数据类型,并简述原理 不可变数据类型:数值型、字符串型string和元组tuple 不允许变量的值发生变化...42、python中交换两个数值 ? 43、举例说明zip()函数用法 zip()函数在运算时,会以一个或多个序列(可迭代对象)做为参数,返回一个元组的列表。同时将这些序列中并排的元素配对。...zip()参数可以接受任何类型的序列,同时也可以有两个以上的参数;当传入参数的长度不同时,zip能自动以最短序列长度为准进行截取,获得元组。 ?...事务是一种高 级的处理方式,如在一些列增删改中只要哪个出错还可以回滚还原,而 MyISAM 就不可以了; 2、MyISAM 适合查询以及插入为主的应用,InnoDB 适合频繁修改以及涉及到 安全性较高的应用...,一般是不超过1024个字节,而这种说法也不完全准确,HTTP协议并没有设定URL字节长度的上限,而是浏览器做了些处理,所以长度依据浏览器的不同有所不同;POST请求在HTTP协议中也没有做说明,一般来说是没有设置限制的

    2.1K21

    110道python面试题

    中是raw_input()函数,python3中是input()函数 21、列出python中可变数据类型和不可变数据类型,并简述原理 不可变数据类型:数值型、字符串型string和元组tuple 不允许变量的值发生变化...42、python中交换两个数值 ? 43、举例说明zip()函数用法 zip()函数在运算时,会以一个或多个序列(可迭代对象)做为参数,返回一个元组的列表。同时将这些序列中并排的元素配对。...zip()参数可以接受任何类型的序列,同时也可以有两个以上的参数;当传入参数的长度不同时,zip能自动以最短序列长度为准进行截取,获得元组。 ?...事务是一种高 级的处理方式,如在一些列增删改中只要哪个出错还可以回滚还原,而 MyISAM 就不可以了; 2、MyISAM 适合查询以及插入为主的应用,InnoDB 适合频繁修改以及涉及到 安全性较高的应用...,一般是不超过1024个字节,而这种说法也不完全准确,HTTP协议并没有设定URL字节长度的上限,而是浏览器做了些处理,所以长度依据浏览器的不同有所不同;POST请求在HTTP协议中也没有做说明,一般来说是没有设置限制的

    2.8K40

    Datawhale组队学习 -- Task 5: 字典、集合和序列

    可变类型与不可变类型 ---- 序列是以连续的整数为索引,与此不同的是,字典以"关键字"为索引,关键字可以是任意不可变类型,通常用字符串或数值。...由于 set 是无序和无重复元素的集合,所以两个或多个 set 可以做数学意义上的集合操作。 set.intersection(set1, set2) 返回两个集合的交集。...set.symmetric_difference_update(set)移除当前集合中在另外一个指定集合相同的元素,并将另外一个指定集合中不同的元素插入到当前集合中。...---- 在 Python 中,序列类型包括字符串、列表、元组、集合和字典,这些序列支持一些通用的操作,但比较特殊的是,集合和字典不支持索引、切片、相加和相乘操作。...如果各个迭代器的元素个数不一致,则返回列表长度与最短的对象相同,利用 * 号操作符,可以将元组解压为列表。 练习题: 怎么找出序列中的最⼤、⼩值?

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    测序数据比对

    2.7 可变剪切检验 将表达数据比对到参考序列上,如果同一条 reads 或者 pairend 的双末端 reads,同时比对到不同的外显子,则可以用于识别可变剪切。...通过序列比对识别可变剪切 2.8 基因融合检测 与识别可变剪切类似,如果测序数据比对到不同基因或者不同染色体上,则可以用于识别基因融合。...三代测序数据长度更长,有更多的测序错误,包括一些小的插入缺失,之前的二代测序算法已经不再使用三代测序的比对,这就需要新的比对软件及算法。...; 4、比对是整条比上或者比不上,不能像 blast 比对,分开比对; 5、比对仅能容许一定数目的错配和空位; 6、序列太短,会出现一条序列比对到多个位置的情况...随着测序技术的提高,BWA 软件也在不断地进化。使用的算法分别是 BWA-backtrack,BWA-SW 和 BWA-MEM 以及最新的 BWA-MEM2。

    1.9K21

    Python中的文本和字节序列

    字 计算机进行数据处理时,一次存取、加工和传送的数据长度称为字(word)。一个字通常由一个或多个(一般是字节的整数位)字节构成。...例如286微机的字由2个字节组成,它的字长为16;486微机的字由4个字节组成,它的字长为32位机。 字长 字长是指cpu的每个字所包含的位数。根据计算机的不同,字长有固定的和可变的两种。...固定字长,即字长度不论什么情况都是固定不变的;可变字长,则在一定范围内,其长度是可变的。计算的字长是指它一次可处理的二进创数字的数目。...计算机处理数据的速率,自然和它一次能加工的位数以及进行运算的快慢有关。如果一台计算机的字长是另一台计算机的两倍,即使两台计算机的速度相同,在相同的时间内,前者能做的工作是后者的两倍。...、单词字符的匹配操作,容易发现对字节序列的匹配仅限于ASCII中的数字和单词字符,而对字符串的匹配会包含更多的泰米尔数字和上标等其他字符。

    2K30

    转录组测序数据分析的基础和进阶

    转录组测序数据的基础分析通常包括以下几个主要步骤: 质量控制(Quality Control):对原始测序数据进行质量评估,检查测序质量指标如序列长度分布、测序错误率等,确保数据的准确性和可靠性。...实验设计带来的高级分析 时间序列分析(趋势分析) WGCNA(基因划分组别) 亚型分析(样品划分组别) 去卷积细胞比例构成推断(依赖于单细胞参考数据集) 转录组测序数据本身的高级分析 可变剪切(Alternative...可变剪切(Alternative Splicing):在真核生物中,同一基因可能会产生多个不同的转录本,通过对剪接位点的不同选择,形成不同的mRNA剪接异构体。...可变剪切分析旨在鉴定和量化不同剪接异构体在转录组中的表达量,并研究其在生物学过程中的调控和功能。...RNA编辑分析可以鉴定RNA序列中的编辑事件,并研究编辑对转录组和蛋白质组的调控和影响。

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    Python3系统学习记录

    ,如果是可变对象,程序运行时会有逻辑错误 -- 递归函数,使用时注意反之栈溢出。...,把list的[]改成()即可 -- (d for d in os.listdir('C:')) -- 用 yield修饰生成器中需要返回的值,除此之外,执行流程也和函数不同。...r是读取 UTF-8编码的文本, rb是读取图片、视频等二进制文件,若要读取非UTF-8编码的文本,则需要添加一个参数指定编码方式,如encoding=gbk,读取文本文件过程中可能遇到编码错误,可以添加一个参数...error='ignore'来忽略错误 -- 写文件 w和wb代替r和rb即可 -- 在内存中读写数据, from io import StringIO f=StringIO() f.write('...-- struct 模块中pack函数把任意数据类型变成bytes -- hashlib 摘要算法(md5、SHA1),也称哈希算法、散列算法,它通过一个函数,把任意长度的数据转换为一个长度固定的数据串

    90710

    Python基本的变量类型

    long类型,3版本后去掉 错误的方式:数字+字符串,这里不同于Java,不能直接相加 进制 形式: int类型的不同进制 示例: type(0xFFFFF) 均为int类型...可以转义 正确的:' He is ". ' 双引号在内 三引号: 可以在代码中换行输入 代码: >>> '''2' 22' 222222...type(('a',)) = ('a') 赋值的区别 元组(1,2)[0] = 1 是错误的,不支持赋值 列表[1,2][0] = 1 正确,结果为[2,2] 总结: int,float...'set'> 列表内不能含有列表或者字典元素 {1,{1,2,3}}是错的,可以含有元组,字符串和整形的混合 无序:字典 不是序列,类似于集合,但不同 定义方式: {'...必须为不可变类型 int,str,tuple list和set不行 字典的Value类型不限 {2:{2:'a'}}[2][2] = 'a' 定义空字典:直接{}

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    时序论文22|ICML24港科大:面向多变量不规则的时间序列预测方法

    提出了一种可变换的patch图神经网络(T-PATCH GNN),将每个单变量不规则时间序列转换为一系列包含不同数量观测值且具有统一时间分辨率的可变换patch,并学习自适应图神经网络,模拟动态的时间序列间相关性...变化的时间间隔破坏了时间序列数据的一致性流动,使得传统的时间序列预测模型难以准确捕捉潜在的时间动态和依赖性。 时间序列间相关性的异步性建模,IMTS中的观测在时间上可能显著错位。...第一步是不规则时间序列分割,本文提出一种名为可变长片段化(Transformable patching)方法,该方法将IMTS分割成可变长度的片段,每个片段覆盖统一时间窗口,保持时间分辨率一致性,同时避免了预对齐导致的序列长度爆炸问题...第二步是patch编码,利用可变时域卷积网络(TTCN)对每个patch进行编码,该网络通过元滤波器技术自适应地调整滤波器大小以匹配输入序列的长度,实现对不同时间步长的统一表征。...实验和结论 T-PATCH GNN通过将每个单变量不规则时间序列,转换为具有不同观测数量但保持统一时间范围分辨率的可变换patch,实现了异步IMTS之间的对齐。

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    matlab使用长短期记忆(LSTM)神经网络对序列数据进行分类|附代码数据

    此示例训练LSTM网络来识别给定时间序列数据的说话者,该时间序列数据表示连续讲话的两个日语元音。训练数据包含九位发言人的时间序列数据。每个序列具有12个特征,并且长度不同。...数据集包含270个训练观察和370个测试观察。加载序列数据加载日语元音训练数据。 XTrain 是包含长度可变的维度12的270个序列的单元阵列。 ....,“ 9”的分类向量,分别对应于九个扬声器。中的条目  XTrain 是具有12行(每个要素一行)和不同列数(每个时间步长一列)的矩阵。...R语言用FNN-LSTM假近邻长短期记忆人工神经网络模型进行时间序列深度学习预测4个案例左右滑动查看更多01020304准备填充数据在训练过程中,默认情况下,该软件默认将训练数据分成小批并填充序列,以使它们具有相同的长度...使用长短期记忆(LSTM)神经网络对序列数据进行分类R语言实现拟合神经网络预测和结果可视化用R语言实现神经网络预测股票实例使用PYTHON中KERAS的LSTM递归神经网络进行时间序列预测python用于

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