R不能识别package包中的analyze()函数？ - 腾讯云开发者社区

问题你想知道包里有什么。方案在一个新的 R 会话中使用 search() 可以查看默认加载的包。...:base" 以下提供的函数能够列出包中的函数和对象。...showPackageContents <- function(packageName) { # 获取特定包所有内容的列表 funlist 的东西 idx <- grep("<-", funlist) if (length(idx) !...qr.resid qr.solve qr.X quarters quarters.Date quarters.POSIXt quit R_system_version R.home R.Version

7.3K3 0

升级package.json中的包

Upgrade a project's package file: Make sure your package file is in version control and all changes...This will overwrite your package file. $ ncu -u Upgrading package.json [====================] 1/1 100%.../package.json)....-r, --registry Third-party npm registry....Restoring package.json Restoring package-lock.json npm install npm install --no-save react@16.0.0 npm

1.5K3 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

突变signature分析你不能错过的R包！

今天给大家带来的是signature分析的R包“YAPSA”，让大家在分析signature的时候多一个选择，增加绘图展示的多样性，最重要的是让你的老板知道你有多优秀。...这两款R包均可选择signature.nature2013 或 signature.COSMIC作为已知signature进行相关性计算。下边全是干货，请认真阅读，广泛传播！...1、加载包 library(YAPSA)library(knitr) opts_chunk$set(echo=TRUE) opts_chunk$set(fig.show='asis') library(...BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19)#注意基因组版本 2、准备数据 3、运行R代码 #读取突变文件 data<-read.table(file="C:/Users/snp_mutation.txt...CosmicValid_cutoffGen_LCDlist$out_sig_ind_df, in_subgroups_df = COSMIC_subgroups_df) 过滤阈值标准化结果如下这个R包绘图到此就介绍完了

8981 0

Python中模块(Module)和包(Package）的区别

模块（Module）在计算机程序的开发过程中，随着程序代码越写越多，在一个文件里代码就会越来越长，越来越不容易维护。...为了编写可维护的代码，我们把很多函数分组，分别放到不同的文件里，这样，每个文件包含的代码就相对较少，很多编程语言都采用这种组织代码的方式。...相同名字的函数和变量完全可以分别存在不同的模块中，因此，我们自己在编写模块时，不必考虑名字会与其他模块冲突。但是也要注意，尽量不要与内置函数名字冲突。...你也许还想到，如果不同的人编写的模块名相同怎么办？为了避免模块名冲突，Python又引入了按目录来组织模块的方法，称为包（Package）。...└─ xyz.py 文件www.py的模块名就是mycompany.web.www Notes: 自己创建模块时要注意命名，不能和Python自带的模块名称冲突。

1.6K11 0

R语言 shiny包中的交互调用函数renderUI

本次展示shiny的功能有： 1、读取本地数据； 2、交互展示数据（view） 3、动态交互作图（自动读取上传数据的列名）体验网址：https://yanshenli.shinyapps.io...x = input$variableNames_x, title = "ggplot") } }) } shinyApp(ui, server) 一个完整的shiny...，在ui中通过*input调整数值参数、上传数据等，并将数据传递给server进行相应计算；然后，Server对数据进行计算、绘图，并将计算结果（图片、表格等）返回给ui 最后，通过ui中的*output...来展示server计算返回的结果（图片、表格等）

3.1K3 0

「R」使用modules包来组织R的函数集合

接触过Python的朋友肯定对模块很熟悉，R的代码组织方式以包为主。但基于文件的模块形式也是可以实现的，modules[1] 包提供了这种支持。...那么，利用GitHub page加上这里介绍的use()函数构建一个可实时获取的代码库是可能的。对于小的脚本函数，写一个文件总是比写一个包简单轻量。...基于上面的思想，我将去年写的R包安装以及TCGA样本名重过滤等几个函数单独通过GitHub page进行了部署。...这里一个对绝大部分读者有用的函数是install()，它之前被放在R包wfun中。我前几天把它重新进行了迁移和修改。...代码核心其实就是各种情况的检查，优先使用适合的包和函数进行下载、安装。它的存在就是方便国内使用者，特别是初学者简便地下载、安装包。

1.2K2 0

R中的sweep函数

函数的用途 base包中的sweep函数是处理统计量的工具，一般可以结合apply()函数来使用。...函数的参数 sweep(x, MARGIN, STATS, FUN = "-", check.margin = TRUE, ...) x:即要处理的原数据集 MARGIN：对行或列，或者数列的其他维度进行操作...…… 下面我们结合几个具体的例子来看 #创建一个4行3列的矩阵 M = matrix( 1:12, ncol=3) 1.每一行都减去这一行的均值 #方法一，通过rowMeans函数来计算每一行的均值...sweep(M,1,rowMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一行的均值，MARGIN=1，对行做操作 sweep(M,1,apply(M,1,mean)) 2.每一行列都减去这一列的均值...#方法一，通过colMeans函数来计算每一列的均值 sweep(M,2,colMeans(M)) #方法二，通过apply函数来计算每一列的均值，MARGIN=2，对列做操作 sweep(M,2,

2.7K2 0

Ext JS 教程-ExtJS 4中的数据包（Package）

数据包（data package）是用来加载和保存你应用程序中的数据的东西，包含41个类，但是其中有三个类比所有其他类更加重要——Model，Store和Ext.data.proxy.Proxy。...这些类被几乎所有的应用程序用到了，并且受到了许多其他卫星类（satellite class）的支持。 Models 和 Stores 数据包的中心是 Ext.data.Model。...存储自动加载users.json这个url中的User模型实体的集合。...（getUser）是异步的并且需要一个回调函数去获取一个用户的实体。...加载嵌套的（Nested）数据你可能会想到为什么我们认为在User.load调用中传入了一个success函数，但是没有在访问User的posts和comments函数也同样这么做。

1.2K2 0

诡异的R包Hmisc安装错误unable to collate and parse R files for package以及解决方案

诡异的R包Hmisc安装错误: unexpected 'R files for package 这是安装包的结尾字符和安装平台不一致导致的...: 问题的原因和解决方案。...Mac 尝试在编辑期间保留 Windows 行结尾，并且在将文件返回到 Windows 时，编码更改为 UTF8 的一种罕见变体。 Windows 上的 R 编译器无法处理外来编码。...#Hmisc package_url="https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Hmisc/Hmisc_4.8-0.tar.gz" install.packages...(package_url, repos = NULL, type = 'source')

2.6K2 0

ChAMP R包安装中的事故

ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...在加载的时候，却发生了如下的错误错误: package or namespace load failed for 'ChAMP' in inDL(x, as.logical(local), as.logical...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...("d:/Documents/.Renviron", mustWork = FALSE) 第一个参数为.Renviron文件的真实路径，然后在加载ChAMP包就可以了 >> Package version

2.2K2 0

「R」tidyverse 中的公式函数

本文的写作由来是知识星球一个朋友对如何在 tidyverse 系列包中使用公式函数（单侧公式）不太熟悉，所以通过本文分享一下我的心得。...")=R_GlobalEnv> 从属性部分我们可以看到公式保存了创建它的环境。...公式生成匿名函数利用公式这一特点，tidyverse 系列包有很多函数支持用单侧公式替换函数。如果你仔细阅读过相关文档，例如 ?...基本用法假设我们要对 df 中的 x 和 y 列进行归一化处理，在不使用 scale() 函数的情况下，我们可能会手写一个函数： scale2 <- function(x) { (x - mean...在公式中，我们可以直接使用前面已经定义的变量，这里是 cfs。

4K2 0

R中的替换函数gsub

R中gsub替换函数的参数如下 gsub(pattern, replacement, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, fixed = FALSE,...vector举例如下： > x R Tutorial","PHP Tutorial", "HTML Tutorial") > gsub("Tutorial","Examples",x) #将...Tutorial替换成Examplers [1] "R Examples" "PHP Examples" "HTML Examples" 还有其他的一些例子来灵活使用这个函数，结合正则表达式。...，我们知道组织病理分期分成stage I，stage II，stage III和stage IV四个分期接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组，并转换成因子我们使用gsub函数...，并转换成因子我们还是使用gsub函数 #删除组织病理学分期末尾的A，B或者C等字母，例如Stage IIIA，Stage IIIB stage=gsub("[ABCD]$","",clin$ajcc_pathologic_stage

3.2K2 0

Python入门之PyCharm中目录directory与包package的区别

，更好维护，亦或想要在几个程序中均使用某个函数，而不必将其复制粘贴到所有程序中。...为了支持这一点，Python有一种方法将定义函数放在一个文件中，并在脚本中使用它们，这样的文件叫做模块，一个模块中的定义可以被导入到其他模块，或者主模块中。...Dictionary Dictionary在pycharm中就是一个文件夹，放置资源文件，对应于在进行JavaWeb开发时用于放置css/js文件的目录，或者说在进行物体识别时，用来存储背景图像的文件夹...python包是：包是一个有层次的文件目录结构，它定义了由n个模块或n个子包组成的python应用程序执行环境。...python库是参考其它编程语言的说法，就是指python中的完成一定功能的代码集合，供用户使用的代码组合。在python中是包和模块的形式。一般按照API的惯例来设计库。

2.8K12 0

java.lang包中不能被继承的类

大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。

4502 0

「R」ggplot2在R包开发中的使用

尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！...如果你想要将它列入Suggests，那么你不能使用#' @importFrom ggplot2 ...载入函数，但是如果你仍然想要使用ggplot2的像%+replace%这样的中缀操作符号，你可以在函数中进行赋值.../package=roxygen2 [2]rlang: https://rlang.r-lib.org/ [3]ggdendro: https://cran.r-project.org/package=

6.7K3 0

深入解析Laravel5.5中的包自动发现Package Auto Discovery

前言在之前的 Laravel 版本中，安装包通常需要几个步骤，例如添加服务提供器到 app 配置文件并注册相关的 facades。...本文不是聚焦于他是怎么用的，而是看看它的源码，是怎么实现Package Auto Discovery的。...的 build() 方法来达到发现 package 的目的。...这样判断完成之后，Laravel 将 collection 中需要发现的 Package 内容保存到一个缓存文件中bootstrap/cache/packages.php：的好处就是，你还是可以直接在 app.php中定义你的 alias 来覆盖自动发现的 package，从而保证你的项目还是可以运行得很流畅。

1.3K1 0

JavaScript中的匿名函数及函数的闭包

2、闭包闭包的英文单词是closure，这是JavaScript中非常重要的一部分知识，因为使用闭包可以大大减少我们的代码量，使我们的代码看上去更加清晰等等，总之功能十分强大。...闭包的含义：闭包说白了就是函数的嵌套，内层的函数可以使用外层函数的所有变量，即使外层函数已经执行完毕（这点涉及JavaScript作用域链）。...x , y) * } * , time); * } */ 3、举例匿名函数最大的用途是创建闭包（这是JavaScript语言的特性之一），并且还可以构建命名空间，以减少全局变量的使用。...alert(one); } outer = inner; })(); outer(); //2 outer(); //3 outer(); //4 这段代码中的变量...4、注意 4.1 闭包允许内层函数引用父函数中的变量，但是该变量是最终值示例六： /** * * * one * two * <li

1.1K2 0

R中的stack和unstack函数

我们用R做数据处理的时候，经常要对数据的格式进行变换。例如将数据框（dataframe）转换成列表（list），或者反过来将列表转换成数据框。...那么今天小编就给大家介绍一对R函数来实现这样的功能。这一对函数就叫做stack和unstack。从字面意思上来看就是堆叠和去堆叠，就像下面这张图展示的这样。...那么R里面这两个函数具体可以实现什么样的功能呢？下面这张图可以帮助大家来理解。unstack就是根据数据框的第二列的分组信息，将第一列的数据划分到各个组，是一个去堆叠的过程。...一、unstack 下面我们来看几个具体的例子例如现在我们手上有一个数据框，里面的数据来自PlantGrowth 我们可以先看看PlantGrowth 中的内容，第一列是重量，第二列是不同的处理方式...，后面小编会使用这两个函数来给大家举个真实的应用案例，敬请期待。

5.4K3 0

R中的expand.grid() 函数

在R中，expand.grid()函数可以返回几个元素所有可能的组合，使我们免于多层遍历的苦恼。...其实这个就是我们提供的sex，age，major中的变量分别组合起来得到的，类似于，遍历三层循环得到所有的排列组合。

3K1 0

理解Python中的闭包函数

闭包是函数和其相关的引用环境组合而成的实体。闭包允许函数访问其创建时所在的作用域中的变量，即使在其定义之外被调用时仍然有效。这种特性使得闭包能够维持一个变量的状态，并且可以在函数调用之间保持持久性。...以下是一个简单的案例说明闭包的概念：def outer_function(outer_var): # 在内部函数 inner_function 中引用外部函数的变量 outer_var def...outer_var，然后定义了一个内部函数 inner_function，在内部函数中引用了外部函数的变量 outer_var。...在闭包中，inner_function 计算了 inner_var + outer_var，这里的 outer_var 保持了其原始状态 10，因此 5 + 10 = 15。...这个例子展示了闭包的概念，闭包使得内部函数可以访问外部函数的变量，并保持了这些变量的状态，从而实现了在函数调用之间共享和保持状态的功能。

2031 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

「R」获取R包中的函数和对象列表

升级package.json中的包

突变signature分析你不能错过的R包！

Python中模块(Module)和包(Package）的区别

R语言 shiny包中的交互调用函数renderUI

「R」使用modules包来组织R的函数集合

R中的sweep函数

Ext JS 教程-ExtJS 4中的数据包（Package）

诡异的R包Hmisc安装错误unable to collate and parse R files for package以及解决方案

ChAMP R包安装中的事故

「R」tidyverse 中的公式函数

R中的替换函数gsub

Python入门之PyCharm中目录directory与包package的区别

java.lang包中不能被继承的类

「R」ggplot2在R包开发中的使用

深入解析Laravel5.5中的包自动发现Package Auto Discovery

JavaScript中的匿名函数及函数的闭包

R中的stack和unstack函数

R中的expand.grid() 函数

理解Python中的闭包函数

扫码

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

社区

活动

资源

关于

腾讯云开发者

热门产品

热门推荐

更多推荐