❝一句话简介：一个可以用于探索、下载和简单分析 UCSC Xena data hubs 上所有数据集的 R Shiny 交互式应用。...❞ 项目地址：https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny[1] 可以单独作为 R 包下载和使用，目前主要开发了数据集的下载和单基因的分析功能，很多都还需要完善和增加...数据集的选择、查看和下载： ? 一些单基因分析模块：包括泛癌表达、生存分析、Cox分析等 ? 接着看下目前6位参与的开发人员，如果没有他们就没有这个工具的存在啦。 ?...目前该平台正在内测，如果你不想要安装 R 包，又想要尝试一下 UCSCXenaShiny，欢迎注册 最后，如果这个工具能够帮助到你的科研工作，记得引用一下我们的预印本： ❝Wang, S.; Xiong...UCSCXenaShiny: An R Package for Exploring and Analyzing UCSC Xena Public Datasets in Web Browser.
什么是数据库字符集数据库的字符编码集是指数据库系统用于存储和处理文本数据的一套规则和符号体系。字符编码集界定了数据库能够容纳的字符集合，并规定了这些字符的编码与解码方式。...字符集对于支持多语言和国际化应用至关重要。在数据库中的应用在数据库实践中，字符集与排序规则的结合构成了一个关键的应用方面。虽然各自代表不同的概念，但在实际应用中，这两者通常相辅相成。...例如：utf8mb4_general_ci字符集：选择合适的字符集对数据的存储和检索有直接影响。例如，在MySQL数据库中，可以设置数据库、表或列级别的字符集。...如utf8mb4选择合适的字符集可以确保数据的正确显示和处理，特别是在多语言环境下。排序规则：排序规则定义了字符的比较和排序方式，如general_ci表示不区分大小写。...如何选择合适的字符集在当前的MySQL数据库实践中，推荐设置的字符集是utf8mb4，排序规则推荐general_ci。
在R语言中提供了几种实现数据聚合的常用函数，它们分别是基于stats包中的aggregate函数、基于sqldf包中的sqldf函数以及基于dplyr包中的group_by函数和summarize函数。...variable3作聚合统计； data：指定需要分组统计的数据框或列表； subset：通过可选的向量指定data的数据子集用于分组聚合； na.action：指定缺失值的处理办法，默认为删除缺失值；...； dbname：如果数据源来自于MySQL等数据库，该参数用于指定数据集所对应的数据库名称； drv：指定具体的数据库驱动，如SQLite、MySQL以及PostgreSQL等； user：指定访问数据库所需的用户名名称...语法 drv = 'SQLite', # 选择SQLite作为MySQL的驱动器 dbname = 'train', # 指定表sec_buildings...所在的数据库名称 user = 'root', # 指定访问MySQL数据库的用户名 password = '1q2w3e4r' # 指定访问MySQL数据库的密码
大家对通路富集分析应该很熟悉，今天给大家介绍下那些漂亮的可视化展示。...我们需要用到包ReactomePA，这个包主要是基于Reactome数据库进行通路富集，此包支持including ‘celegans’,‘fly’, ‘human’, ‘mouse’, ‘rat’,...首先我们看下包的安装： BiocManager::install("org.Hs.eg.db") BiocManager::install("ReactomePA") 接下来我们直接通过实例来看下这个包中一些功能的实现...##单通路的富集结果展示 gseaplot(y, geneSetID ="R-HSA-69242") ?...至此整个的功能介绍结束，在此需要注意的是可视化的网络图尽量直接生成在文件中，否则可能网络的边不会显示。
之前一直再开发基于GPT的问答知识库机器人，主要是靠qdrant的向量搜索，搜索出相关的条目，然后发送给GPT回答 qdrant向量数据库有集合的概念，相当于表，每个集合里面可以创建多个向量数据。...那么针对集合的操作就是下面这样的，集合列表，创建集合，删除集合 集合列表接口： http://127.0.0.1:8083/collects 创建集合接口，test2集合名称 POST http:
比如：识别到用户上传的图片是一只橘猫，那么就在数据库中查找并返回所有带橘猫标签的图片。...第一步：获取目标图片的嵌入向量。 第二步：在向量数据库中找到距离最近的向量，收集向量的 ID。 第三步：根据检索到的结果，返回对应向量 ID 所代表的图片。...这篇文章中，我们先来介绍最为经典的一种近邻搜索算法：IVF_FLAT，通过向量数据库可视化工具 Feder[1] 揭开它在向量检索过程中的神秘面纱。...关于 Faiss 的入门，可以参考《向量数据库入坑指南：聊聊来自元宇宙大厂 Meta 的相似度检索技术 Faiss》[5]这篇文章，本文就不过多展开了。...，完成整个向量数据库的遍历。
Sqlite的动态类型系统和其他数据库的更为一般的静态类型系统相兼容，但同时，sqlite中的动态类型允许它能做到一些传统刚性类型数据库所不可能做到的事。...Sqlite v3数据库中的任何列，除了整形主键列，可以用于存储任何一个存储列的值。...只是一些列，给予选择的话，将会相比于其他的一些类型优选选择一些存储类型，这个列优先选择的存储类型被称为它的“近似”。 ...3.2 近似名称例子 下面这个表显示了多少来自更传统的SQL操作的普通数据类型名称，使用上一节中的5个规则，被转换到近似类型。这个表只显示了sqlite能够接受的数据类名称的一个子集。...是否在比较操作之前发生转换基于操作数的近似(类型)。
————————图片转载自小洁忘了怎么分身图片R/Rstudio图片数据类型与向量图片tab键、上下键、ctr+L(back)逻辑型数据图片转换和判断图片数据的结构图片脚本直接双击打开，数据要load加载向量的生成图片数据类型的转换优先顺序图片对单个向量进行操作图片赋值是实际改变文件的方法图片图片...% in %图片图片图片向量取子集图片x 的作用可以把T挑选处理，丢弃F图片[]中括号里面的可以是逻辑值判断，可以是具体的值（即下标），可以是函数，可以是向量图片图片图片图片如何修改向量中的某个或者某些元素图片图片简单的向量作图图片图片数据框...多少列，rownames（）行名数据框取子集图片图片图片图片图片图片图片数据库数据框的修改图片图片图片图片图片图片图片矩阵新建和取子集（不支持$）图片矩阵的的转置、转换图片图片图片矩阵画热图图片图片列表的的新建和取子集图片...l[[2]]:取第二个子集，再取矩阵的子集列表支持$图片图片数据结构的总结图片函数和R包图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片R包图片图片1.CRAN网站图片2.bioconductor图片3.github...ggpubr图片图片图片图片图片图片图片图片R语言的综合应用图片1.玩转字符串图片图片图片图片图片由于有多个字符串和多个拆分站点,参数simplify=T给我们提供了一个矩阵(每行是x中的一个字符串,拆分后的每列是一个片段
NuGet包的引用，因为我们打算先使用基于内存的文本向量数据库来运行我们的代码。...Semantic Kernel支持多种向量数据库，比如Sqlite，Azure AI Search，Chroma，Milvus，Pinecone，Qdrant，Weaviate等等。...text-embedding-3-small", "https://qingy-m2e0gbl3-eastus.openai.azure.com", apikey); // 创建用于保存文本向量的内存向量数据库...，可以看到，现在的答案就正确了： 现在看看向量数据库中到底有什么。...查看工具（我用的是SQLiteStudio）打开数据库文件，可以看到下面的表和数据： Metadata字段保存的就是每个段落的原始数据信息，而Embedding字段则是文本向量，其实它就是一系列的浮点值
本教程介绍了如何从CSV文件加载pandas DataFrame，如何从完整数据集中提取一些数据，然后使用SQLAlchemy将数据子集保存到SQLite数据库 。...让我们继续将此子集保存到SQLite关系数据库中。...将DataFrame保存到SQLite 我们将使用SQLAlchemy创建与新SQLite数据库的连接，在此示例中，该数据库将存储在名为的文件中save_pandas.db。...我们只是将数据从CSV导入到pandas DataFrame中，选择了该数据的一个子集，然后将其保存到关系数据库中。...您应该看一下“ 通过研究COVID-19数据学习熊猫” 教程，以了解有关如何从较大的DataFrame中选择数据子集的更多信息，或者访问pandas页面，以获取Python社区其他成员提供的更多教程。
R 中的向量存储单一类型的数据，比如： 数字 image.png 字符串 image.png 逻辑值 当我们欲求同时存放数字和字符的时候，R会将其同时转化为字符串： 生成向量 通过 <- c(...相关函数 单纯依靠冒号，对于向量内容的批量生成还是不够方便，好在R 提供了一个简单的函数。...duplicated(x) 输出非重复值为TRUE table(x) #重复值统计 sort(x) #排序 选择向量内容 利用位置 选择向量中的某个变量 或选择多个变量 也就是取子集的过程 poker_midweek...即将选择向量符合条件的子集部分，并对它们进行赋值，这两个操作的合并便是修改向量中指定的元素值。...x[seq(1,11,2)] # 4.用向量取子集的方法,选出除倒数第2个以外所有的基因名。
操作关系型数据库 关系型数据库就是一个由表和表之间的关系组成的集合。数据库中的表和R中的数据框有相同地形式。表之间可以互相关联，让我们能够轻松合并多张表信息。...下面从最简单数据库开始，SQLite（http://sqlite.org/）是一个轻量级的数据库引擎。 在R中操作SQLite数据库需要用RSQLite扩展包。运行下面代码： if(!...我们可以在关系数据库中创建新表，表看起来和R里的数据框是一样的。 下面创建一个数据框，并将它作为表插入数据库中。...like可用于字符串数据，它可以筛选具有某个模式的字段。...例如选择cut变量以Good结尾的记录，它可以是Good或VeryGood，我们用like '%Good'，这里%可匹配任意字符串。
这例子将展现怎么使用我们熟悉的SQL语句把数据集完美的写在SQLite数据库用于随后的分析，这些数据是关于汽车性能和燃油效率问题的。这数据集包含于初始安装R时。...dbWriteTable(conn, "cars", mtcars) 这个简单的语句在数据库中创建了一张数据类型类似R数据框的列的表。表列的名称是基于在数据框中的列的名称。...RStudio掩盖这种复杂性，并提供了导入文件的简单对话。如果你没有一个得心应手的CSV文件，您可以基于我们前面看到的mtcars数据集通过R创建一个。...有时，当将要处理的关系数据库中的数据量大的令人不敢问津，或将要创建的数据帧的数量大得使手动导入导出的多个数据文件很繁琐笨重。在这些情况下，对数据库的直接连接是最好的选择。...有大量的数据库专向的包支持直接连接，这些包中绝大部分都是基于RJDBC包，RJDBC包可以独立使用以访问大量类型的数据库。
上证A股数据 本文选取上证A股数据，其数据来源于wind数据库。由于时间间隔较长，本文将通过对相关系数进行计算来分析其之间的相关性，然后再通过聚类分析将其合并来进行研究。...，以上证A股数据作为研究对象，基于 Copula方法构建了对不同投资组合的风险和收益的预测模型；其次，将聚类思想应用到股票选择中，将选择出来的股票进行聚类分析，得出各个聚类结果。...---- 最受欢迎的见解 1.R语言基于ARMA-GARCH-VaR模型拟合和预测实证研究 2.r语言实现copula算法建模依赖性案例 3.R语言COPULAS和金融时间序列数据VaR分析 4.R语言多元...COPULA GARCH 模型时间序列预测 5.GARCH（1,1），MA以及历史模拟法的VaR比较 6.matlab使用Copula仿真优化市场风险数据分析 7.R语言实现向量自动回归VAR模型 8....R语言随机搜索变量选择SSVS估计贝叶斯向量自回归（BVAR）模型 9.R语言VAR模型的不同类型的脉冲响应分析
xml2json 把 XML 转换为 JSON 的时候，会自动抛掉 CDATA 相关的转义字符，再还原回来时，CDATA 内部的 HTML 文本和外部的 XML 混在一起，导致 cusdis 解析文本时发生了错误...决定手动部署一套（无奈还是自己动手了，还好不算折腾），参考 cusdis 的 Manually Install 指南，跑了个 Docker 镜像，并选择了 SQLite 作为评论的存储，配好反向代理、域名...Python 生成 SQL 语句，再粘贴运行修改数据库，最后再以新的数据库文件替换掉线上的。...，重心需要关注一颗完整的 DOM 树，而非停留在数据的流转、状态管理之类，JSON 在 XML 的视角上看，大概算是一个子集 SQLite 非常适合个人本地服务的后端，写入的频率相对比较小，查询的速度和稳定性都非常...disqus，手动修复数据、搓 SQLite 数据库等各种繁琐 提供 PingBack 的集成支持
代码仓库地址 document.ai: 基于GPT3.5的通用本地知识库解决方案 下面图片是整个流程： 导入知识库数据 利用openai的向量接口生成向量数据，然后导入到向量数据库qdrant 这段代码会将指定目录下的所有文件读取出来...最后，将向量和文件名、文件内容一起作为一个文档插入到 Qdrant 数据库中。 具体来说，这段代码会遍历 ....to_embeddings函数会使用 OpenAI 的 API 将文本内容转换为向量，最后返回一个包含文件名、文件内容和向量的列表。...接下来，将向量和文件名、文件内容一起作为一个文档插入到 Qdrant 数据库中。 其中，count变量用于记录插入的文档数量，client.upsert函数用于将文档插入到 Qdrant 数据库中。...，每个匹配的相关摘要我在这里只取了前300个字符，如果想要更多的相关摘要，可以把这里的300改为更大的值 """ for result in search_result:
，基于它可以轻松构建数据可视化看板。...图片 导入工具库我们本次需要用到的工具库包括数据库工具、Python 数据处理工具、可视化工具和看板工具，我们先把这些工具库导入，代码如下：# 数据库import sqlite3# 数据处理import...我们导入数据并选出需要的信息，代码如下：# 连接数据库conn = sqlite3.connect('.....图片 带时间滑块的仪表板Panel 的小部件让我们可以访问各种方法来操作和切分我们的数据子集可视化，例如对时间序列数据可切分：加入选择年份的滑块。...拿到对应的数据子集后，我们把它按大小分类进行分组，并使用.size()计算每组的火灾次数。
DQL语言是一种基于HQL（Hibernate Java库中的Hibernate查询语言）的查询语言，并且是SQL的子集，但DQL也拥有了许多功能，可以帮助我们进行注入操作。...ORM库的作者由于DQL的严格类型限制而未实现UNION运算符（而UNION则意味着可以选择非均匀数据）。 DQL还支持子查询和表达式JOIN，WHERE，ORDER BY，HAVING，IN等。...基于布尔 子字符串函数和子查询允许逐个字符逐个暴力破解模型属性值： 1 or 1=(select 1 from App\Entity\User a where a.id=1 and substring...(a.password,1,1)='$') 屏幕截图显示，我们获得了密码哈希的第一个字符（“ $”）的值。...基于错误（SQLite） 使用SQLite DBMS时，还有一个功能– SQLite语言非常差，并且无论使用什么DBMS，DQL都提供相同的接口。
直接对行向量进行统计也可以作为一类特征，如统计行向量中空值的个数、0的个数、正值或负值的个数，以及均值、方差、最小值、最大值、偏度、峰度等。...特征选择 特征选择是从特征集合中选出一些子集，也称为属性选择或变量选择，是指为了构建模型而选择相关特征的子集。...封装方法是特征子集搜索和评估指标相结合的方法，前者提供候选的新特征子集，后者则基于新特征子集训练一个模型，并用验证集进行评估，为每一组特征子集进行打分。...同时使用序列向前选择和向后选择，当两者搜索到相同的特征子集时停止。 增L去R选择算法。若算法从空集开始，每轮先添加L个特征，再删除R个特征；若算法由全集开始，则每轮先删除R个特征，再添加L个特征。...序列浮动选择。每次选择添加和删除的特征个数不是固定的。 随机搜索。执行序列向前或者向后选择的时候，此算法随机选择特征子集。
RAGxplorer RAGxplorer是一个交互式的streamlit工具，用于支持构建基于检索增强生成（Retrieval Augmented Generation, RAG）的应用程序，通过可视化文档块和嵌入空间中的查询来实现...•块配置：配置块大小和重叠的选项。•嵌入模型选择：all-MiniLM-L6-v2或text-embedding-ada-002。•向量数据库创建：使用Chroma构建向量数据库。...本地安装 ⚙️ 要运行RAGxplorer，请确保已安装Python，然后安装必要的依赖项： pip install -r requirements-local-deployment.txt 提示 ⚠️...import('pysqlite3') import sys sys.modules['sqlite3'] = sys.modules.pop('pysqlite3') 注意 这个仓库目前链接到streamlit...演示，并且这些行是由于免费streamlit部署环境中的运行时添加的。
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