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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Distinct keep unique rows distinct 函数用于去除数据框中的重复观测,仅保留唯一的观测。它可以基于指定的列对数据框进行去重操作,确保每个观测都是唯一的。...Dplyr Join two tables join 函数用于根据指定的键将两个数据框连接起来,可以根据共同的变量将数据框进行合并,支持多种连接操作,如内连接、左连接、右连接和外连接等。...Dplyr Mutate create, modify, and delete columns mutate 函数用于添加新变量或修改现有变量,能够基于已有数据创建新的变量列,支持对数据框进行实时的变量操作和修改...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列,可以保留感兴趣的变量,并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定的行,支持根据行数或行号选择需要的行,也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数

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《高效R语言编程》6--高效数据木匠

用法是:gather(data,key,value,-religion),分别是数据框,要转换成分类的列名,单元值的列名和清除收集的变量 使用seperate()分割联合变量 分割是指将一个实际由两个变量组成的变量分割成两个独立列...使用broom::tidy()广泛应用于模型数据,并以标准数据框格式返回模型输出。使用变量名非标准化求值更高效,见R语言 dplyr传递参数_自由 平等~忠诚 奉献-CSDN博客[2]。...列改名 rename(),使用反引号‘`’包裹,允许R使用不规范的列名。...滤除行 filter() ## 键操作 数据聚合 基于组合变量生成数据汇总,以前称为split-apply-combine。summarize是一个多面手,用于返回自定义范围的汇总统计值。...如果两个都是新手,推荐dplyr。为了提升性能,可以设置键,类似数据库的主键,方便二进制算法提取目标子集行。 ?

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    R数据科学|第九章内容介绍

    使用dplyr处理关系数据 在实际应用中,我们常会涉及到多个数据表,必须综合使用它们才能找到关键信息。存在于多个表中的这种数据统称为关系数据。...本章中的很多概念都和SQL中的相似,只是在dplyr中的表达形式略微不同。一般来说,dplyr 要比 SQL 更容易使用。...处理关系数据有三类操作: 合并连接:向数据框中加入新变量,新变量的值是另一个数据框中的匹配观测。 筛选连接:根据是否匹配另一个数据框中的观测,筛选数据框中的观测。...,它先通过两个表格的键匹配观测,然后将一个表格中的变量复制到另一个表格中。...下面借助图形来帮助理解连接的原理: ? 有颜色的列表示作为“键”的变量:它们用于在表间匹配行。灰色列表示“值”列,是与键对应的值。

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    DAY6-学习R包

    ") 加载 library和require 使用一个R包需先安装再加载 library(dplyr)dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length...*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值select()按列筛选select(test,1)#筛选test中的第一列select(test,c(1,5))#筛选...)选择字符向量中的列,select中不能直接使用字符向量筛选,需要使用one_of函数vars dplyr两个实用技能管道操作 %>% —— 相当于将左边的作为右边函数的第一个参数,快捷键: ctrl+shift+M(不管用——改为Ctrl+a) test %>%  group_by(Species...) %>%  summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))count统计某列的unique值count(test,Species)dplyr处理关系数据

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    从头学R语言——DAY 3

    学习资源来自生信星球R包R包直接在Rstudio页面下载的3大来源:官网CRAN、Biocductor、github设置镜像CRAN的镜像网站可以直接在tools-global options(或快捷键...包dplyr作为tidyverse中的核心包之一,主要用于数据转换。...此处先掌握dplyr的5个基本函数:mutate(),select(),filter(),arrange(),summaries();1个重要的管道工具%>%#用dplyr包进行数据转换#5个核心函数test...个实用工具#管道工具,表示然后test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))#计数某列的...= 'x')列名下3或4个字母的缩写,是变量的类型:int:整数型变量dbl:双精度浮点数型变量,即实数chr:字符串dttm:日期+时间型变量lgl:逻辑型变量fct:因子,R中具有固定数目的值的分类变量

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    【教你R语言】转换长宽格式表的落地方案

    前言 做数据分析以及制作表格的时候,会遇到长宽格式数据之间相互转换的问题,之前介绍了如果在Hive是使用sql语句实现,现介绍一下如何在R语言中实现长宽格式数据相互转换。...宽格式数据:每个变量单独成一列为宽格式数据,变量的所有属性都在同一行。 长格式数据:长数据中变量的ID没有单独列成一列,而是整合在同一列。 需求描述 下面左右两种长宽格式数据相互转换: ?...= c("2018/1/3", "2018/5/5", "2018/5/4")) reshape2包实现长宽数据转换 ##长格式数据转换成宽格式数据library(reshape2)library(dplyr...= "detail" #理解为value) %>% arrange(user_no) tidyr包实现长宽数据转换 ##长格式数据转换成宽格式数据library(tidyr)library(dplyr...总结 R语言reshap2和tidyr包都可以实现长宽格式数据相互转换,相比较而言,更喜欢tidyr包中的实现方式,与Hive中类似,中间过渡map格式类型数据,key键和value值明确,结合sql

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    干货 | 男朋友老是说自己R语言很6,快来用这40道题目检测他

    下面代码中的哪些(个)能把数据表基于列2进行升序排列,同时对列3进行降序排列A) dplyr::arrange(table,desc(Column3),Column2) B) table[order(-...duplicated(df),] B) unique(df) C) dplyr::distinct(df) D) All of the above 答案:(D) 上述所有答案都是基于这两列删除重复行的不同方法...33 创建一个表示另一变量是否有缺失值的特征数据,有时对于预测模型来说非常有用。 下方数据框中的某一列有缺失值。...36 有时候,我们会遇到这样的情况,即一个数据集包含两列,而我们希望知道其中一列的哪些元素不存在于另一列中。这在R中使用setdiff命令很容易实现。...使用B列中的值来表示条形图的高度。

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    生信星球Day4 学习R包

    /p/861224f4251aoptions() 设置R运行过程中的一些选项设置options()$repos 查看使用install.packages安装时的默认镜像options()$BioC_mirror...查看使用bioconductor的默认镜像R最重要的两个配置文件: 一是.Renviron,能够设置R的环境变量; 二是.Rprofile,如果启动时找到这个文件,那么就替我们先运行一遍(这个过程就是在启动...(dplyr)dplyr五个基础函数mutate() 新增列,(x,列名=相关数据)select() 筛选列,(x,列号或列名)filter() 筛选行,(x,列名==想要的行)需要逻辑判断arrange...unique值,即统计同类项连接两个表的不同方式inner_join() 內连,取交集,by="x"基于x的列left_join() 左连,保留前一个表,以此多舍少补后一个表full_join()...全连semi_join(x= ,y= ,by="某列") 半连接,返回能够与y表匹配的x表所有记录anti_join(x= ,y= ,by="某列") 反连接,返回无法与y表匹配的x表所有记录简单合并

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    手把手教你R语言方差分析ANOVA

    ()等函数)或进行变量选择(使用子集选择或dplyr包的select()函数)。...在R中,你可以使用aov()函数来执行方差分析。这个函数需要一个公式,该公式描述了你要分析的数值型变量和分类变量之间的关系。...(变量中的水平数减1)和残差的自由度(观察总数减1和自变量中的水平数减1); Sum Sq列显示平方和(即组均值与总体均值之间的总变化)。...;Mean Sq列是平方和的平均值,通过将平方和除以每个参数的自由度来计算;F value列是F检验的检验统计量。这是每个自变量的均方除以残差的均方。...另一种方法:t-test仅仅适合2组比较,因此需要筛选data_ttest % dplyr::filter(D %in% c("B", "C")) #%>% #dplyr

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    生信代码:数据处理( tidyverse包)

    tidyverse 包是 Hadley Wickham 及团队的集大成之作,是专为数据科学而开发的一系列包的合集, 基于整洁数据,提供了一致的底层设计、语法、数据结构,包括数据导入,数据规整,数据处理,...dplyr包下主要是以下几个操作: select()——选择列 filter/slice()——筛选行 arrange()——对行进行排序 mutate()——修改列/创建列 summarize(...mydata %>% mutate(sumx=x1+x2, meanx=sumx/4)##dplyr允许使用管道%>%操作,且meanx可以引用sumx 2...,如果后续要使用到,需要保存下来 5 arrange() R base包中涉及到排序的包括 sort(),rank(),order(),而在dplyr包中与排序相关的是arrange()包,默认是从高到低进行排序...,如果变换排序顺序则可以使用-(变量)或者desc(变量)。

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    R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

    ),2), LETTERS[4:6])] DT[, c("V1","V2") := NULL] 通过list的方式来更新了数据,以及使用null的方式来删除列。...2、按条件行筛选 从前用subset的方式进行筛选比较多, new=14,select=a:f) (1)单变量 现在data.table与dplyr from_dplyr =...在筛选列变量的数据,也可以与%in%集合运算联用(集合运算见博客:R语言︱集合运算)。...SD只能在位置j中使用。 .SDcols常于.SD用在一起,他可以指定.SD中所包含的列,也就是对.SD取子集。...2016-11-28补充: 留言区大神给了一个比较好的选中列的方式,其中主要就是对with的使用: data.table取列时,可以用data[,1,with=FALSE]取data的第一列

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    生信学习-Day6-学习R包

    在 iris 数据集中,Petal.Length 和 Petal.Width 分别代表花瓣的长度和宽度。 因此,当你使用 vars 变量时,你实际上是在引用那些具有这些名称的列。...在dplyr包的filter()函数中使用时,它可以用于筛选数据框中匹配给定集合中任一值的行。这行代码的作用如下: filter(test, ...): 在test数据框中筛选行。...数据框是R语言中类似于表格的二维数组结构,每一列包含了一个变量的值,每一行包含了每个变量的一个值集。...z = c("A","B","C",'D'): 类似地,这部分代码创建了另一个名为z的列,包含四个字符值:'A'、'B'、'C'和'D'。...这意味着函数将查找 test1 和 test2 中列名为 "x" 的列,并基于这两列中的匹配值来合并行。只有当两个数据框中都存在列 "x" 且某些行在这一列的值相等时,这些行才会出现在最终的结果中。

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