根据fastq序列的id,从原始fastq中提取序列这个操作,应该是大家在处理序列文件的过程中经常遇到的。如果大家用过Biopython,应该知道Bio模块在做fastq这些文件的处理时非常方便。...还是举个例子比较好,我从比对筛选过滤之后的bam文件中提取了第一列序列名,保存为id.name文件,想根据这个id文件从原始的fastq文件(单端)raw.fastq中把序列提出来。...raw.fastq 我首先写了一个脚本:(这里要用到biopython模块以及pandas模块,如果没安装的话可以装一下anaconda,它已经集成了这些常用包了,安装教程及使用见这里Anaconda:...2:37.37 total 两分钟,感觉有点久,然后我查了下Bio中其实有针对fastq快速处理的FastqGeneralIterator,于是我使用FastqGeneralIterator又写了一个脚本...include=t 这里很多参数的意义都很明了,include=t是提取id.name中的序列,include=f是提取非id.name中的序列,这里我们应该用t。
前言 接口返回的json数据,需要取值后断言,本篇使用jsonpath来提取接口返回的数据 接口返回数据 接口返回一个 json 类型的数据,以下数据是很常见的一种数据结构 { "code": 0, "...相对节点 就是不管位置,选择所有符合条件的条件 * * 匹配所有元素节点 [] [] 迭代器标示(可以在里面做简单的迭代操作,如数组下标,根据内容选值等) | [,] 支持迭代器中做多选 []...相对节点取值,取出所有的子孙节点符合的值 list取值 1.根据下标取出data里面的第一条数据,下标从 0 开始计算 data1 = jsonpath.jsonpath(s, '$.data[0]')...一个典型的过滤器将是 [?(@.age > 18)],其中@表示正在处理的当前项目。 可以使用逻辑运算符&& 和 ||创建更复杂的过滤器。字符串文字必须用单引号或双引号括起来 ([?...表达式必须求值为一个布尔值,表达式一般结合@获取当前节点来过滤 1.找出商品价格大于30的全部商品信息 # 价格大于30的 data1 = jsonpath.jsonpath(s, '$.data[?
不过,习惯使用fastjson的同学,可以在fastjson解析方法的基础上,封装一个工具方法,可以使用"$.list[0]"的方式去提取元素,具体代码见https://blog.csdn.net/mu_wind...3 jsonpath 前面两种json解析都有一定的不足之处,幸好,还有jsonpath这一款神器。首先,它的maven地址是: gatling/jsonpath --> io.gatling</groupId...提供了非常丰富便捷的解析表达式,以上面的json串为例,演示几个示例: import com.jayway.jsonpath.JsonPath; import com.jayway.jsonpath.ReadContext...最小值:min,平均值:avg,标准差:stddev 13 $.data.list[?
Dubbo 压测插件已开源,本文涉及代码详见 gatling-dubbo Gatling 是一个开源的基于 Scala、Akka、Netty 实现的高性能压测框架,较之其他基于线程实现的压测框架,Gatling...基于 Gatling 的优势和在有赞的使用基础,我们扩展 Gatling 开发了 gatling-dubbo 压测插件。...分别是: protocol 协议,设置为 dubbo generic 泛化调用设置,Dubbo 压测插件使用泛化调用发起请求,所以这里设置为 true,有赞优化了泛化调用的性能,为了使用该特性,引入了一个新值...execute 方法必须以异步方式执行 Dubbo 请求,这样前一个 Dubbo 请求执行后但还未等响应返回时虚拟用户就可以通过 AKKA Message 立即发起下一个请求,如此一个虚拟用户可以在很短的时间内构造大量请求...异步请求响应后会执行 onComplete 方法,校验请求结果,并根据校验结果记录请求成功或失败日志,压测报告就是使用这些日志统计计算的。
$('.refund-btn').click(function(){ //此处必须是$(this),否则$('.refund-btn')重新获取,导致值一直不变 var id = $(this...).attr('data-id'); //var id = $('.refund-btn').attr('data-id');错误,这样会导致一直一个id值,一直不变,需要用$(this).attr...('data-id') var form = $('#refund-order-form'); form.attr('action', form.attr('action').replace...('__order_id__', id)); $.get('{$ajaxRefundInfoUrl}'.replace('__id__', id),function(rs){
插件已开源,详见 gatling-dubbo:https://github.com/youzan/gatling-dubbo.git 上一篇《Dubbo压测插件的实现——基于Gatling》中,我们介绍了基于...所以,我们又开发了基于普通 API 调用的 Gatling Dubbo 压测插件,即 gatling-dubbo2.0。...下一步就是准备发起新的 Dubbo 请求,如果开启了 Rps 阀门(throttled),则会根据当前的 Rps 和 Rps 阀门阈值动态调整发送请求的频率,在施压机(consumer)未达到性能瓶颈的情况下...你可以使用 DSL threadPoolSize(threadPoolSize: Int) 按照你的机器配置设置一个合适的线程池大小。...在有赞的一个典型使用场景,即评估一个应用的单实例性能。
任务背景:需要根据经纬度坐标提取AIG文件(AIG—Arc/Info二进制网格)对应像素值 了解到gdal能够完成这项任务,但是之前没有接触过gdal,所以现在网络上查找资料,发现如下链接所示的教程。...基于GDAL批量提取经纬度/投影坐标对应像元的值 查找gdal支持的数据格式,了解gdal支持AIG数据格式: gdal文档 具体格式介绍如上,只需知在给予‘hdr.adf'文件的路径的条件下即可打开AIG...文件 直接在上述教程进行测试 发现能够顺利读取AIG,但是根据正确坐标返回的坐标为像素值为空(或者在行列计算时就不存在),思考该问题应该是投影系统出现了问题。...代码实现 // ''' 本脚本通过来拾取影像上的像素值,支持gdal可读的所有格式,支持读取方式: 1. input(文件+自设坐标信息) 仅当文件格式特殊且坐标系统没有EPSG编号时 2. input...,【地理空间坐标】,分别为经度、纬度 :param prj_iconfig: 自设投影定义 :return: 列表形式,单个坐标的像素值 ''' dataset, gcs,
标签:Excel公式,INDEX函数,MATCH函数 有时候,工作表行中的数据可能并不在第1个单元格,而我们可能会要获得行中第一个非空单元格中的数据,如下图1所示。...公式中,使用通配符“*”来匹配第一个找到的文本,第二个参数C4:G4指定查找的单元格区域,第三个参数零(0)表示精确匹配。 最后,IFERROR函数在找不到单元格时,指定返回的值。
平台可以支持3种方式提取结果 1.body.key 方式根据属性点的方式提取,或者下标取值body.data.0.key 2.支持jsonpath取值,复杂的json数据,可以用jsonpath取值 3...运行结果 如果想取出data 下第一个name 的值 ‘yoyo’ 于是表达式可以这样写 body.data.0.name jsonpath取值 如果你熟悉jsonpath 取值,那么这里可以直接上手解析...json数据 对于复杂的场景,我秒也可以轻松取值,比如: 取出data数据里面的name=”yoyo111” 的mail值‘123445@qq.com’ 于是可以用到jsonpath的过滤器取值 $....(@.name=='yoyo111')].mail re 正则取值 如果返回的是 json 格式,用 jsonpath 取值完全够用了,有时候返回的不是json格式,比如返回一个html格式,这时候就需用到正则表达式取值...以访问我的博客为例https://www.cnblogs.com/yoyoketang/ 我希望取到title的值, 于是可以直接写正则表达式 运行结果 extract 提取结果 extract
sort方法接收一个函数作为参数,这里嵌套一层函数用来接收对象属性名,其他部分代码与正常使用sort方法相同. var arr = [ {name:'zopp',age:0}, {name...value2 = b[property]; return value1 - value2; } } console.log(arr.sort(compare('age'))) 如何根据参数不同...//数组根据数组对象中的某个属性值进行排序的方法 //使用例子:newArray.sort(sortBy('number',false)) //表示根据number属性降序排列;若第二个参数不传递
遇到问题 使用jsonpath提取器,提取返回结果,校验结果的时候,部分代码示例如下 validate: - eq: [status_code, 200] - eq: [headers.Content-Type...like below: { "code": 200, "data": { "items": [{ "id": 1, "name": "Bob" }, { "id": 2, "name": "James"...} ] }, "message": "success" }:param field: Jsonpath expression, e.g. 1)$.code 2) $..items.*.id :return...jsonpath 第一个参数应该传一个json()解析后的对象,可以修改成 self.json就行了。...提取和校验 jsonpath 提取返回结果,提取出匹配到的第一个值, 校验结果也一样 # 作者-上海悠悠 QQ交流群:717225969 # blog地址 https://www.cnblogs.com
前言 jsonpath用来解析json数据使用的,是一种简单的方法来提取给定JSON文档的部分内容。JsonPath有许多编程语言,如Javascript,Python和PHP,Java。...相对节点 就是不管位置,选择所有符合条件的条件 * * 匹配所有元素节点 [] [] 迭代器标示(可以在里面做简单的迭代操作,如数组下标,根据内容选值等) | [,] 支持迭代器中做多选 []...(jsonobj, '$..output') print("output:%s" % output) print("================================") id = jsonpath.jsonpath...(jsonobj, '$...id') print("id:%s" % id) 执行结果: C:\python3.6\python.exe E:/Gitwokspace/Daily_py/Fileprocessing.../test/jsonpath11.py msg:['success'] ================================ data:[{'output': [{'id': '867899031136606
组名,一般为XX.XX 第一个XX为域com、cn、org等,第二个XX为公司名称 7、输入:klicen # artifactId 坐标ID,一般为项目名称,会在当前目录创建一个同名的文件夹 8、输入...Check’s saveAs——从请求的返回值中提取和保存内容 3、manually with the Session API——用各种java提供的函数生成,缺点是可能影响一点性能 三、虚拟用户场景...,运行指定时间,并发增长的周期是一个规律的值; setUp(scn.inject(rampUsersPerSec(30) to (50) during(15 seconds)).protocols(httpConf...)) 7、rampUsersPerSec(rate1) to(rate2) during(duration) randomized:定义一个并发数区间,运行指定时间,并发增长的周期是一个随机的值; setUp...但在某些情况下,我们需要使用Gatling自带的throttle方法,来对请求数做一个限制。 注意 - 我们仍然需要在场景等级中注入虚拟用户。
二、配置“EvaluateJsonPath”处理器 “EvaluateJsonPath”处理器根据FlowFile的内容计算一个或多个JsonPath表达式。...通过添加用户自定义的属性来输入Jsonpath,添加的属性的名称映射到输出流中的属性名称,属性的值必须是有效的JsonPath表达式(例如:$.name)。"...如果所提供的JsonPath计算为指定的值,JSON的返回类型可以返回"scalar"。...如果设置为flowfile-content,则只能指定一个JsonPath,并且忽略属性名。...(注意:当输出选择flowfile-attribute时,即使jsonpath匹配不到值,流文件也会路由到matched) 输入json如下: 输出结果如下: 提取流文件json内容,作为输出流的内容
隔开 encoding:默认是UTF-8,设置json数据的编码方式 sort_keys:将数据根据keys的值进行排序。 ...不管位置,选择所有符合条件的节点 * * 匹配所有元素节点 @ n/a 根据属性访问,JsonPath不支持 [] [] 迭代器(可以在里边做简单的迭代操作,如数组下标,根据内容选值等) | [,] 支持迭代器中做多选.../JsonPath 使用方法:jsonpath.jsonpath(),结果会以列表形式返回,如下请求接口返回数据提取例子 参数1:数据对象 参数2:jsonpath表达式 import requests...= jsonpath.jsonpath(json_data, "$..id")[0] type_token = jsonpath.jsonpath(json_data, "$..token_type"...)[0] token = jsonpath.jsonpath(json_data, "$..token")[0] print(json_data) print("会员id:{}".format(member_id
前言接口返回的json数据,需要取值后断言,本篇使用jsonpath来提取接口返回的数据接口返回数据接口返回一个 json 类型的数据,以下数据是很常见的一种数据结构{"code": 0,"msg":...,根据内容选值等)[,][,]支持迭代器中做多选[]?...相对节点取值,取出所有的子孙节点符合的值list取值1.根据下标取出data里面的第一条数据,下标从 0 开始计算data1 = jsonpath.jsonpath(s, '$.data[0]')print...一个典型的过滤器将是 [?(@.age > 18)],其中@表示正在处理的当前项目。可以使用逻辑运算符&& 和 ||创建更复杂的过滤器。 字符串文字必须用单引号或双引号括起来 ([?...表达式必须求值为一个布尔值,表达式一般结合@获取当前节点来过滤1.找出商品价格大于30的全部商品信息# 价格大于30的data1 = jsonpath.jsonpath(s, '$.data[?
2 在Python中使用JSONPath提取json数据 jsonpath是一个第三方库,所以我们首先需要通过pip install jsonpath对其进行安装。...让我们来演示一下它们的一些用法: # 提取所有duration键对应值 jsonpath(demo_json, '$..duration') # 提取所有steps键的子节点对应instruction...,action]') # 配合@,选择steps键的最后一个子节点对应的instruction与action值 jsonpath(demo_json, '$..steps[(@.length-1)][...instruction,action]') 「条件筛选」 有些时候我们需要根据子节点的某些键值对值,对选择的节点进行筛选,在jsonpath中支持常用的==、!...(@.orientation == "西")]') 而如果想要提取所有具有指定键的节点,可以参考下面的例子: # 找到所有具有polyline键的节点对应的polyline与road键对应值 jsonpath
注:本文基于Elasticsearch 6.1.2编写 最近遇到这样一个需求,要通过Elasticsearch将Doc根据A字段降序,然后获得B字段的值,最终根据B字段的值再去做Pipeline Aggregation...先尝试了Max Aggregation,但是Max Aggregation只能获得A字段的最大值。...”分bucket,这个会用到Date Histogram Aggregation 获得每个bucket里的最后一次的价格数据,这个会用到Scripted Metric Aggregation 最后根据算每个
前言 我们在做接口测试时,大多数返回的都是json属性,我们需要通过接口返回的json提取出来对应的值,然后进行做断言或者提取想要的值供下一个接口进行使用。...jsonpath jsonpath是使用一种简单的方法来提取给定JSON内容。...通过jsonpath提取 同样的json数据,我们通过jsonpath进行提取: data = jsonpath.jsonpath(result,'$..[?...jsonpath的其他用法 上面介绍的只是jsonpath的一个用法,下面小编介绍几种jsonpath的其他用法。...Id=792。
/data" # 新建一个文件夹 文件夹名data 当前目录下 你也可以指定 if not os.path.exists(path2): os.mkdir(path2) for
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