首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    10X scATAC-seq的结果 fragment files 含义

    Greenleaf团队开发的ArchR软件分析scATAC-seq数据时,发现他使用的输入数据跟 Signac 软件的输入数据不一样,使用的是名字为 fragments.tsv.gz的文件,下面看看这个文件的内容...和 fragments.tsv.gz.tbi文件,所以,我们现在知道了这个结果来自Cellranger ATAC软件的运行结果!...fragments.tsv.gz 的内容 关于这个文件的说明,官方文档见:https://www.10xgenomics.com/support/software/cell-ranger-atac/latest...fragments.tsv.gz.tbi fragments.tsv.gz.tbi 文件是一个片段区间的 tabix 索引,便于从任意基因组区间随机访问记录。...实战数据GSE173682 GSE173682数据中的 fragments.tsv.gz 内容如下: # zless -S GSM5276944_3533EL_ATAC_fragments.tsv.gz

    56510
    领券