mutate(mth = match(months, month.name)) %>% mutate(date= zoo::as.yearmon(paste(year, mth), "%Y %m")) 排序
Ahigh-qualitygenomecompendiumofthehumangutmicrobiomeofInnerMongolians4.pdf 论文中大部分作图数据都有，争取把论文中的图都复现一下 今天的推文我们试着复现一下论文中的Figure2b image.png 今天推文的主要知识点就是四个柱子，每个柱子单独配色，然后4个图例如何调整四个图例的前后顺序
尽管Transformer在时间序列预测中应用广泛，但在部署到多样化的时间序列任务中，尤其是那些数据量较小的任务时，因于其庞大的参数规模，这可能导致过拟合并引起计算效率问题。...本文作者把注意力从多层感知器（MLPs）和Transformers转向探索卷积操作在时间序列分析中的潜力。...这种差异突出了一个关键问题：如何增强CNNs以扩展它们在更广泛的时间序列任务中的稳健性能？显然，通过学习时间序列数据中的短期和长期依赖性，可以扩展CNNs的能力。...输入的时间序列被分割成多个小块（patches），并添加了位置嵌入。接下来，输出嵌入通过TSLANet层，每层由两个主要组件组成。...本文实验 在时间序列分类、预测和异常检测任务上的广泛实验表明，TSLANet在各种数据集上的表现始终优于基线模型。
标题 + theme(legend.title = element_blank()) 翻转legend顺序 + guides(fill = guide_legend(reverse = TRUE)) 重新排列图例的布局...默认的ggplot图例在各个图例项目之间几乎没有空格。...按大小重新排序栏 默认情况下，R将按字母顺序显示数据，但按大小排列则很简单：只需将reorder（）包装在要重新排列的x或y变量周围，然后指定要变量 重新排序。 例如。...x =重新排序（国家/地区，流行）。...image.png 修改柱状图柱子顺序 有时，您需要以不按字母顺序或按大小重新排序的方式对数据进行排序。
：基于时间序列对象（ts） ggfortify 包中的 autoplot() 可以对时间序列直接绘图。...(title="AirPassengers") + theme(plot.title = element_text(hjust=0.5)) 时间序列图：基于时间序列对象（ts） 6.2 时间序列图...：时间跨度为 1 年 6.3 多个时间序列 在本例中，基于长数据格式进行可视化。...因此，默认情况下不会绘制图例，需要手动添加。...这更适用于时间点很少的时间序列。下面给出使用 ggplot2 包绘制的案例，来源于：Top 50 ggplot2 Visualizations[5]。
一、前言二、初阶图形2.1 基本条形图2.2 水平柱状图2.3 带图例的堆叠柱状图2.4 带图例的分组柱状图2.5 ggplot作图2.6 plotly作图三、进阶图形3.1 水平柱状图3.2 显著性柱状图..."),fill = c("#1b98e0", "#353436"))图片2.5 ggplot作图#下载和加载包install.packages("ggplot2") library("ggplot2")...check.names =FALSE)rt1=table(c(as.vector(rt[,1]),as.vector(rt[,2]))) #统计rt1=sort(rt1,decreasing =T) #排序...text(x=-0.2,y=bar,label=names(n),xpd=T,pos=2) #基因名称dev.off()图片3.2 显著性柱状图常用于展示KEGG通路富集、有统计P值可视化等library(ggplot2...sort.val = "asc", #倒序，顺序改为desc sort.by.groups=TRUE)+ #按组排序scale_y_continuous
今天尝试解决使用ggplot2画图时的一个问题，图例不按规矩出牌。 ggplot2的作者们在测试时发现更新版本也出这问题了，正好可以用于简单说明。 本来是一个这样的图形 ? 新版本变成了 ?...而我是画两个相似的图形时出现这问题，数据结构一样，然后画图后图例的顺序变了~ 根据文档，默认使用了某种“秘密魔法”？！...如果我们要改变图例顺序，按下面的操作，将color变成1，然后fill使用默认排序： # And we can reverse the order p + guides( color = guide_colorbar
作为ggplot2的拓展包，ggtree可以充分利用ggplot2来进行系统发育树的注释和美化，做出更加丰富多彩的图形。...values = c("orangered","cyan4","green3","blue","brown")) + #设置填充颜色 theme(legend.position="right") #显示图例并调整其位置...接下来我们还可以使用gheatmap在发育树后面绘制每个物种的序列分布热图，gheatmap支持矩阵作为输入数据，完整脚本如下： library(ggplot2) library(ggtree) library...=0.25, colnames=F) %>% scale_x_ggtree #创建热图并融合两边坐标轴 graph #查看图形 上面图形仍十分粗操，接下来对图形进行调整美化，调节展示方式、颜色范围、图例位置等...green3","blue","brown")) + theme_inset(legend.position=c(2.2,-20)) }) names(bar1)=1 #bar1主要作用是添加图例
今天分享R语言中的柱形图，所有图表语法都基于ggplot2包中的ggplot函数完成 。...包中的ggplot函数（需先加载ggplot2工具包支持） ?...当然我们也可以设置两个序列堆叠。...通过设定柱形图填充顺序与图例显示顺序，使得图例中的颜色顺序与图表中一致。...大部分都接触的标准长数据，也就是一维表），那么你完全可以直接在excel中将宽数据转化为长数据（二维转一维），或者直接将数据库中的长数据导入R，只需做一些基本的设定即可，至少不会在数据长宽格式转换上浪费太多时间和精力
align_order()：根据统计权重重新排序布局观察结果，或手动指定观察索引。 align_dendro()：根据层次聚类重新排序或分组布局。...与 ComplexHeatmap 比较 优点 与 ggplot2 生态系统完全集成。 热图注释轴和图例自动生成。 树状图可以轻松自定义和着色。 对图表大小和间距有灵活的控制。...align_order：根据统计权重重新排序布局观察值，或允许根据用户定义的标准手动重新排序。 align_kmeans：根据 k-means 聚类结果排列图表。...在这里，我们根据均值重新排序行。...align_group(column_groups) + align_dendro(aes(color = branch)) 您可以通过设置 reorder_group = TRUE 对组进行重新排序
但是如果有数据的话我们自己也可以用ggplot2来做。 做曼哈顿图的数据通常是以下这种格式 ?...里做这种图的函数是geom_jitter() 今天用到的数据集是来自于rMVP这个包中的pig60K数据集 首先是获得这个数据集 library(rMVP) data('pig60K') 使用ggplot2...画图 library(ggplot2) ggplot(pig60K,aes(x=Chromosome,y=trait1))+ geom_jitter() ?...image.png 右侧的图例可以不要，把它去掉 ggplot(pig60K,aes(x=Chromosome,y=trait1))+ geom_jitter(aes(color=Chromosome...image.png 这个时候还有一个问题是X轴不是按照1,2,3这样依次排下来的，我们可以通过更改因子水平来给X轴重新排序 df$Chromosome<-factor(df$Chromosome,
在用RStudio的ggplot2包进行画图时常常记不住对应的美化代码，检索又要花费大量的时间。...ggThemeAssist[1]是一个RStudio的扩展R包，提供了一种用于修改ggplot2主题的图形交互式界面。...可以调节的内容有图形的比例（Settings）、调色板和背景（Panel&Background）、坐标轴（Axis）、标题和标签（Title and label）、图例（Legend）、副标题和说明文字...设置好以后，点击右上角的“Done”即可在原作图代码的基础上添加修改代码，重新运行作图代码即可完成修改。...演示 示例数据 本次我们采用ggplot2的内置数据diamonds，考虑到diamonds的数据太多，我们随机选出部分做演示。
通过强大的ggplot2包，也可以画出有特色的条形图。 在网上看到有人画的正负区分条形图，花了点时间打磨其中的美化细节，基本也算是原样画出了。...实现过程 首先，载入ggplot2包，并随机生成二维数据。 ? 接下来，用ggplot()＋geom_bar()画出基本的条形图。 ?...这里面，使用reorder()函数，使得按照Difference取值大小，条形图进行排序。同时，在这一步设置对每个条形加黑色边框，调整条形宽度，并使得中间留有空隙。 ?...最后，我们修改图例的颜色、字体，并在条形图两侧加入标签文字，就可以得到最终的效果了。 ? ? 想要图表做的好看，工具的使用是一方面，审美与图表思维的培养也是特别重要。从模仿开始，是不错的学习方式。
R语言中的ggplot2是最美的绘图包之一。但调整主题的细节需要写大量代码，而且还要反复修改、预览，很是费时费力。...ggThemeAssist横空出世，它依赖shiny (>= 0.13), miniUI (>= 0.1.1), rstudioapi (>= 0.5), ggplot2和formatR，可以对ggplot2...坐标轴文字 Axis text Family：字体家族，默认为Sans，和我们常用的Arial类似；还常用Courier系列等宽字体，如显示核酸、蛋白序列对齐时要求使用；Helvetica是Science...Legend Text 同上 图例背景属性 Legend Background 括填充色Fill，外边框类型Type、线宽Size和颜色Colour 图例核心属性 Legend Keys 即图例中颜色图状的属性...想要添加中文信息的话可以在代码输出之后手动添加，重新运行。
这个包的主要功能是:可以创建交互式的各种图表，如散点图、气泡图、时间序列、热图、树形图、条形图等；支持各种R对象；支持Highstocks图表、Choropleths；支持管道方法和各种各样的主题与外观...hchart():一个泛型函数，它接受一个对象(如向量、时间序列、数据框、likert对象等)并返回一个对象(chart)，和ggplot2中qplot()用法类似。...hc_add_series():根据数据的类型将数据添加到现有对象的通用函数，和ggplot2中geom_类似。 hcaes():和ggplot2中ase()用法相似。...准备数据 data("mpg", "diamonds", "economics_long", package = "ggplot2") head(mpg) ## # A tibble: 6 x 11...这些名称在图例和工具提示中使用。还可以修改颜色和其他属性。
也许你不仅仅对 2007年 感兴趣，而且你想看看这张图表是如何随着时间的推移而演变的。...04 颜色面板和序列 在上面的一些图中你会注意到一些不错的色标。...你可以拖动尺寸以重新排序它们并选择值范围之间的交叉点。 ? 并行类别是并行坐标的分类模拟：使用它们可视化数据集中多组类别之间的关系。...接受整个整洁的 dataframe 的列名作为输入（而不是原始的 numpy 向量）也允许 px 为你节省大量的时间，因为它知道列的名称，它可以生成所有的 Plotly.py 配置用于标记图例、轴、悬停框...你可以对大多数函数使用 category_orders 参数来告诉 px 你的分类数据“好”、“更好”、“最佳” 等具有重要的非字母顺序，并且它将用于分类轴、分面绘制 和图例的排序。
也许你不仅仅对 2007年 感兴趣，而且你想看看这张图表是如何随着时间的推移而演变的。...颜色面板和序列 在上面的一些图中你会注意到一些不错的色标。...您可以拖动尺寸以重新排序它们并选择值范围之间的交叉点。 ? 并行类别是并行坐标的分类模拟：使用它们可视化数据集中多组类别之间的关系。...接受整个整洁的 dataframe 的列名作为输入（而不是原始的 numpy 向量）也允许 px 为你节省大量的时间，因为它知道列的名称，它可以生成所有的 Plotly.py 配置用于标记图例、轴、悬停框...您可以对大多数函数使用 category_orders 参数来告诉 px 您的分类数据“好”、“更好”、“最佳” 等具有重要的非字母顺序，并且它将用于分类轴、分面绘制 和图例的排序。
受 Seaborn 和 ggplot2 的启发，它专门设计为具有简洁，一致且易于学习的 API ：只需一次导入，您就可以在一个函数调用中创建丰富的交互式绘图，包括分面绘图（faceting）、地图、动画和趋势线...也许你不仅仅对 2007年 感兴趣，而且你想看看这张图表是如何随着时间的推移而演变的。...您可以拖动尺寸以重新排序它们并选择值范围之间的交叉点。 image.png 并行类别是并行坐标的分类模拟：使用它们可视化数据集中多组类别之间的关系。...接受整个整洁的 dataframe 的列名作为输入（而不是原始的 numpy 向量）也允许 px 为你节省大量的时间，因为它知道列的名称，它可以生成所有的 Plotly.py 配置用于标记图例、轴、悬停框...您可以对大多数函数使用 category_orders 参数来告诉 px 您的分类数据“好”、“更好”、“最佳” 等具有重要的非字母顺序，并且它将用于分类轴、分面绘制 和图例的排序。
✦ 标度（Scales）是将数据的取值映射到图形空间，例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值，展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...ggplot2 Scatterplot 这个教程侧重于8个单元： 展现单个连续变量：散点图，折线图，气泡图 进阶条形图：区域图 展现排序：棒棒糖图 展现连续变量的统计分布：条形图，箱线图，小提琴图，峰峦图...另外推荐5个ggplot2资源 ggplot2作者亲自写的书 链接：https://ggplot2-book.org/facet.html 书名是：ggplot2: Elegant Graphics for...: elegant graphics for data analysis” 虽然这本书有对应的中文译本，但是时间上相对滞后，建议直接看这个在线实时更新版本。...://mp.weixin.qq.com/s/_Q16zDZgCr3XoO0r3wqRkw 如果我说，全部学完，需要一年的时间，不知道你还是否愿意入坑呢？
云服务器
ICP备案
云直播
对象存储
即时通信 IM
