（1）微观层次的数据挖掘，主要在移动对象轨迹数据内部，从采样点及采样时间的分布上来研究移动对象的活动特征。其包括轨迹的聚类分析、轨迹的分类分析、轨迹的异常检测分析、轨迹的异常检测分析、轨迹的索引建立。
在生物学和基础医学领域，研究细胞类型的分化和细胞状态的转化是非常重要的一环，它可能与疾病的发生发展有着重要且密切的联系。单细胞转录组测序可以保留单个细胞的转录组信息，且由于细胞分化是一个连续的过程，所以单细胞转录组测序可以捕获处于不同分化状态的单细胞进行细胞分化的研究。在单细胞转录组数据中，细胞分化状态体现在不同细胞之间基因表达的连续变化，基于基因表达的连续变化，可以使用拟时序分化轨迹的方法进行细胞分化的分析。通过拟时序分化轨迹分析可以推断出生物过程中细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程，用拟时间来表征，拟时间越早代表该细胞位于分化转化过程的早期，反之则位于分化转化过程的晚期。
轨迹推断（Trajectory Inference，TI），是分析从千上万单细胞的组学数据中推断细胞发育轨迹的重要方法，也被称为伪时序分析 (pseudotime analysis)，该方法根据细胞表达模式的相似性对细胞进行排序。这为应用单细胞转录组学、蛋白质组学和表观组学数据研究细胞内的动态过程，如细胞周期、细胞分化和细胞激活等，提供了新的契机。
scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了，自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析（Trajectory）已经有五个年头了。除了经典的Monocle（只不过是一个R包）之外出现了许多应用方便的分析工具与算法，由我带大家认识一款在Linux（命令行版）和Windows（界面版）都可以使用的分析工具——STREAM。
轨迹分析是比物体追踪更上层的一种应用。Vision框架中提供了检测视频中多个物体的运动轨迹等能力，在健身，体育类应用中非常有用。
当今很多业务的开展，如公共交通、物流运输、配送、打车、共享单车、智能硬件、车载设备的管理追踪等，都需要对位置及轨迹的有效管理才能得以实现，并高效运行。 而要实现轨迹的管理应用，需要具备定位、大数据存储、空间检索、轨迹纠偏算法、道路数据体系，导航路线计算等多方面能力的才能实现，而这对于开发者而言却是很难达到的。 为降低企业对轨迹应用的门槛，腾讯位置服务推出轨迹云，它是腾讯位置服务在物流、出行、跑步运动等领域的轨迹应用实践中打磨形成的一套轨迹管理及应用平台，可帮助开发者快速实现业务需求。 轨迹云现提供了轨迹存
出处：http://hi.baidu.com/icekeydnet/blog/item/965b25154a19f3dea6ef3ffe.html
当今很多业务的开展，如公共交通、物流运输、配送、打车、共享单车、智能硬件、车载设备的管理追踪等，都需要对位置及轨迹的有效管理才能得以实现，并高效运行。
【新智元导读】在刚刚结束的 MedInfo 2017 上，IBM 中国研究院共发表了 8 篇论文。 IBM 中国研究院认知医疗研究总监谢国彤向新智元介绍了研究院认知医疗的研究焦点。8 篇论文中，《针对房颤患者长期华法林用药的基于群的轨迹分析》获得了最佳论文第二名。我们请到了论文的第一作者郭世婧为大家做论文解读。 MedInfo 2017（第十六届世界医药健康信息学大会）刚刚在杭州闭幕，今年大会的主题是“基于医药信息学的精准医疗”。作为国际著名的健康和生物医学信息领域的盛会， MedInfo 在某种意义上也成
Spatial analysis algorithm simplemented in stLearn
作者|訾竣喆 转自|雷锋网 如今，当我们看板球或是网球的比赛的时候很容易发现，机器视觉技术（machine-vision techniques）早已革命性地开始辅助裁判进行现场的即时分析和判罚。例如，
python爬虫，搞定HYSPLIT轨迹制作。还好有人之前做过，分析了一遍官网，把思路写一下，核心的几个接口参数说明一下吧。环保上面研究这个的人还挺多的。
不过今天我还是想介绍一下如何将 GPS 数据转换为行驶轨迹，推断某个时间点或时段车辆所在的位置，并判断车辆是否经过指定区域。
在大数据时代背景下，存在于社会任何行业、组织及个人不可能独善其身，或者成为数据贡献者，或者成为数据采集者。物流行业是近些年快速发展起来的朝阳行业，正是互联网技术的发展催生出的电子商务给物流行业带来了前所未有机遇。
薛老师和他的猫推荐你关注思影科技 来自美国加州SRI国际健康科学中心、斯坦福大学等机构的研究人员联合在The American journal of psychiatry杂志上发表的一项纵向研究指出，饮酒会破坏青少年大脑的正常生长轨迹：特定脑区灰质体积下降更快，白质体积增加更慢。 对大脑的纵向研究发现，大脑成熟的特征为：前十年内皮层灰质体积的增加，随后持续减少；与之相反白质体积在青春期持续增长，直到第三个十年增长轨迹放缓。鉴于许多青少年会在青春期冒险尝试“成人行为”（如饮酒），因此推测青少年大脑的进化可
屏幕1秒60帧，平均每帧16.6毫秒，如果代码实现不佳，或者过于复杂，导致一帧绘制时间大于16.6毫秒，则无法完成绘制，造成丢帧，连续出现掉帧，在现象上表现为卡顿。
Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial. Mol. Syst. Biol. 2019, 15: e8746.
常见的单细胞轨迹研究方法包括拟时序分析及RNA 速率分析等，广泛应用于发育研究，干细胞分化及肿瘤微环境免疫细胞的动态变化研究等。
最近我们被客户要求撰写关于潜类别（分类）轨迹模型LCTM的研究报告，包括一些图形和统计输出。
神经网络优化本质上是非凸的，但简单的基于梯度的方法似乎总是能解决这样的问题。这一现象是深度学习的核心支柱之一，并且也是我们很多理论学家试图揭示的谜题。这篇文章将总结一些试图攻克这一问题的近期研究，最后还将讨论我与 Sanjeev Arora、Noah Golowich 和 Wei Hu 合作的一篇新论文（arXiv：1810.02281）。该论文研究了深度线性神经网络上梯度下降的情况，能保证以线性速率收敛到全局最小值。
SIGCOMM 2015年中，由微软研究院发表了题为《Packet-Level Telemetry in Large Datacenter Networks》的论文。基于本文设计的EverFlow系统，运行在端系统之上，并利用已有的OpenFlow交换机的功能特性，实现了数据中心网络中Packet-Level的网络数据监测。本文尝试概述了该系统的核心思想，作为网络测量领域相关工作的一次备忘。
在本文中，潜类别轨迹建模 (LCTM) 是流行病学中一种相对较新的方法，用于描述生命过程中的暴露，它将异质人群简化为同质模式或类别。然而，对于给定的数据集，可以根据类的数量、模型结构和轨迹属性得出不同模型的分数
哺乳动物的大脑皮层具有着无与伦比的细胞类型多样性，为了维持皮质正常的分层与行使功能，这些细胞类型是在一系列严格约束下产生的；此外，随着皮质的发育，大量细胞还会经历细胞状态的转换。因此，研究支配皮质细胞类型的产生和组织的分子机制存在难度。本研究中，作者采用单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序以及空间转录组技术，单细胞多组学的结合生成了发育中的小鼠新皮质的综合图谱，绘制了整个小鼠皮质发生过程中所有细胞类型的发育轨迹，确定了伴随个体细胞类型谱系规范的纵向分子动力学，从而能够对异常皮质发生的机制进行探索。
物流大数据，都是哪些数据？ 物流大数据主要包括运单信息的数据和车辆信息的数据，然而关于运单信息往往涉及商业机密，并且信息分布于不同行业企业内部，不宜公开。因此当前现实的数据条件来看，实业界和学术界的物
openair 是一个R语言工具，旨在用于分析空气质量数据以及大气成分数据。起初主要用于处理空气质量数据，目前也可以用于分析大气成分数据。此工具具有如下特点：
项目地址 https://github.com/guoyaohua/GodsEYE 开发环境 Android studio 2.3.1 极光推送IM SDK 百度鹰眼SDK 背景介绍 定位监控系统，不仅仅是用于监视、监控情景，而更重要的是应用在安全领域，例如儿童、老人外出，如果能将其自身的位置实时共享给家人，这样能带来一份安全保障。本应用利用百度鹰眼SDK和极光推送IM SDK开发了一款可以共享自身位置的APP。 功能描述 用户注册、登陆、头像上传。 自身位置实时定位 自身轨迹查询 查看指定用户实时最新位置
全球化经济的不断发展使得快递业变得越来越重要，而快递物流地图轨迹查询 API 也因此应运而生。
英文标题：Optimal-Transport Analysis of Single-Cell Gene Expression Identifies Developmental Trajectories in Reprogramming
分子动力学模拟（Molecule Dynamics Simulation，MD），本质上是一门采样技术。通过配置力场参数、拓扑结构和积分器，对一个给定的体系不断的采样，最终得到一系列的轨迹。那么得到分子动力学模拟的轨迹之后，如何使用后分析工具进行轨迹分析，也是一项很重要的工作。目前来说，基于Python的开源工具MDAnalysis（简称mda）是一个比较常用的MD后分析工具。本文主要介绍基于MindSponge分子动力学模拟框架生成了相应的轨迹之后，如何使用MDAnalysis工具进行分析。
现在，华科大和上科大团队提出了一个赋予多模态大语言模型前瞻性思维的学习范式，并基于这一范式构建了多模态大语言模型Merlin（梅林）。
视频监控平台与AI技术的结合为安防领域带来了革命性的进步。通过引入AI技术，视频监控平台可以实现对监控视频内容的智能分析、识别和理解，从而提高监控效率和准确性，为城市安全和管理提供有力支持。
Monocel3是单细胞分析领域一个重要的R 包，它是之前 Monocel和 Monocel2的升级版本，之前的 Monocel2 主要用于单细胞拟时分析。而新版本的 Monocel3 在原有基础上，还可以进行聚类，单细胞亚型分类，细胞注释，拟时分析，基因表达等分析。包含了 Seurat+SingleR 的功能，可以说一个 R 包可以完成单细胞数据分析绝大部分的功能。使用同一个 R 包分析起来更加方便。
A comparison of single-cell trajectory inference methods[1](Saelens et al., 2019)的作者做了一个R包--dyno为终端用户提供完整的TI分析流程，dyno特点如下：
案例地址：http://rotatecaptcha.demo.api0.cn/ 案例内容：对某站的旋转验证码进行逆向分析，本文只作为学习案例。
通过安装在出租车上的GPS设备，可以采集到大量的轨迹数据，从而帮助我们分析人们出行信息，达到优化交通的目的。
当我们漫不经心浏览网站时，如果蹦出一张美女图，您的眼睛会盯向哪里？近日国外有一间调查公司借助眼球追踪技术，分析了消费者的网站浏览重点。其中有几项调查是针对男女生看到广告后的眼球轨迹，发现男生与女生所注意的“重点”差异很大。下面就让我们通过13组比较图来看我们“看法”的差异。 主要技术来源：EYETrackshop。很多时候，你的眼睛背叛了你的心。EyeTrackShop是一个用摄像头来追踪眼球运动轨迹的研究调查平台。使用该技术可以全面的分析计算机用户正在凝视着屏幕的哪一个区域。（在眼球轨迹分布图中，颜色越
最近我们被客户要求撰写关于出租车GPS轨迹数据的研究报告，包括一些图形和统计输出。
2023年1月，华大自主单细胞DNBelab C系列平台助力中国科学院大学、华大、深圳儿童医院等多家科研团队，于Clinical and Translational Medicine（影响因子8.554）发表题为“Stemness-related genes revealed by single-cell profiling of naïve and stimulated human CD34+ cells from CB and mPB”的文章，揭示了与细胞来源和培养时间相关的干性相关基因（Stemness-related genes, SRG），为理解HSC的干性提供有益见解。
AI 科技评论按：神经网络的优化本质上是一个非凸问题，而简单的基于梯度的算法在实践中似乎总是能够解决这类问题。这种现象是深度学习的核心支柱之一，而目前有许多理论科学家家正试图解开这个谜：为什么基于梯度的方法能够在深度学习的优化中行之有效。
如何对人员流动加以管控，如何准确识别潜在的传染风险，成为摆在各地防控部门面前的难题。
单细胞转录组测序（scRNA-seq）和空间转录组学等新兴技术为分析细胞组织、形态和分子特性的分化以及系谱分配开辟了新途径。
免疫检查点阻断（ICB）联合新辅助化疗可改善乳腺癌（BC）的病理完全反应，本文研究为什么只有一部分肿瘤对 ICB 有反应。激素受体阳性或三阴性乳腺癌患者在手术前接受了抗 PD1 治疗，作者对接受抗 PD1 治疗的初治患者（n = 29）或抗 PD1 治疗前接受新辅助化疗的患者（n = 11）的治疗前与治疗中活检样本进行单细胞转录组、T 细胞受体和蛋白质组分析。结果表明三分之一的肿瘤含有表达 PD1 的 T 细胞；无论肿瘤亚型如何，这些 T 细胞在抗 PD1 治疗后都会克隆扩增，扩增主要涉及具有明显细胞毒活性（PRF1、GZMB）、免疫细胞归巢（CXCL13）和耗竭标志物（HAVCR2、LAG3）的 CD8+ T 细胞，以及以 T-helper-1 表达为特征的 CD4+ T 细胞（IFNG)和滤泡辅助 (BCL6, CXCR5) 标志物。在治疗前活检中，免疫调节树突细胞 (PD-L1+)、特定巨噬细胞表型 (CCR2+ 或 MMP9+) 和表现出主要组织相容性复合体 I/II 类表达的癌细胞的相对频率与 T 细胞扩增呈正相关。相反，未分化的前效应/记忆 T 细胞TCF7+、GZMK+）或抑制性巨噬细胞（CX3CR1+、C3+）与 T 细胞扩增呈负相关。总的来说，作者的数据确定了与抗 PD1 治疗后 T 细胞扩增呈正相关或负相关的各种免疫表型和相关基因组。阐明了乳腺癌中抗 PD1 治疗反应的异质性。
scRNA-seq已广泛应用于癌症相关研究，单细胞分辨率的转录组分析能够定量检测肿瘤内细胞表型多样性的分子活性。这样的高维数据需要计算分析，以提取有关驱动癌症发展、发病机制和临床结果的细胞类型和状态的相关生物学信息。
GPS信号模拟器能够模拟卫星信号运动轨迹，模拟GPS卫星导航系统的导航信号。GPS轨迹发生器可以模拟导航系统确定位置点如日期、时间、经度、纬度、海拔信息、速度等。GPS轨迹模拟器可以为基本型和授时型用户提供设备的研制、开发、生产和测试，适用于依赖卫星导航定位功能的相关产品的研制开发测试工作。
作者，Evil Genius前几天在一个医院开了一次空间转录组的公开课，突然发现，老师们几乎没有基础，空转么，做的人也是相当的少，我讲的很多分析现场几乎都没人知道，顿时感觉在对牛弹琴，所以讲的时候也不敢再往深了去讲了，能跳过的都跳过了，ppt放出来，大家随意查看。ppt涉及的空间个性化分析包括基础分析（Spatial Area）基础分析（空间聚类）基础分析（空间分子聚类）基础分析（空间分子聚类注释问题）基础分析（单细胞空间联合）基础分析（空间细胞分布）基础分析（空间分层注释）基础分析（空间通讯）基础分析（
本文介绍了如何在大数据GIS应用中利用SuperMap iObjects Java for Spark实现分布式空间大数据处理和分析，包括空间数据索引、空间数据复制、空间数据连接、空间数据聚合等。通过这些功能，用户可以方便地对空间大数据进行预处理、分析、可视化，从而为城市规划、公共安全、环境保护等领域提供有价值的决策支持。
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