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让cshell脚本等待LSF作业完成

cshell脚本是一种用于Unix/Linux系统的脚本语言,LSF(Load Sharing Facility)是一个用于分布式计算的作业调度和管理系统。在使用cshell脚本时,有时需要等待LSF作业完成后再继续执行后续操作。

为了实现cshell脚本等待LSF作业完成,可以使用LSF提供的命令和功能。以下是一个可能的解决方案:

  1. 使用bjobs命令检查LSF作业的状态。bjobs命令可以列出当前正在运行的作业和作业的状态信息。
  2. 在cshell脚本中使用循环来检查作业状态,直到作业完成。可以使用bjobs -a命令来获取所有作业的状态信息,并通过解析输出来判断作业是否完成。
  3. 在循环中添加适当的延迟,以避免频繁检查作业状态。可以使用sleep命令来暂停脚本的执行一段时间。
  4. 当作业完成后,脚本可以继续执行后续操作。

下面是一个示例cshell脚本,用于等待LSF作业完成:

代码语言:txt
复制
#!/bin/csh

# 提交LSF作业
bsub -J myjob -o myjob.out mycommand

# 等待作业完成
set job_status = ""
while ($job_status != "DONE")
    set job_status = `bjobs -a | grep myjob | awk '{print $3}'`
    if ($job_status != "DONE") then
        echo "Job is still running. Waiting..."
        sleep 10  # 每隔10秒检查一次作业状态
    endif
end

# 作业完成后继续执行后续操作
echo "Job completed. Continuing with the script..."

在这个示例中,首先使用bsub命令提交一个名为"myjob"的LSF作业,并将输出重定向到"myjob.out"文件中。然后,使用循环和bjobs命令来检查作业状态,直到作业状态为"DONE"。在每次循环中,如果作业状态不是"DONE",则打印一条消息并暂停10秒。当作业完成后,脚本会打印一条消息并继续执行后续操作。

请注意,这只是一个示例,具体的实现方式可能因环境和需求而有所不同。在实际使用中,您可能需要根据自己的情况进行适当的调整和修改。

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