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2025 KDD | PatchSTG: 不均匀空间点 Patching 助力大规模时空图预测

patch 化方法,以将Transformer 从空间的patch-level 而非point-level 应用于大规模交通预测。...交通和视觉及时序数据的区别在于,像素与时间点是均匀且连续的,而交通传感器在道路上的分布不均匀且在计算机中的存储不连续。...主要的贡献有三: PatchSTG 是第一个从空间数据管理角度出发,从而将 KDTree 发展为不均匀空间点 Patching 技术的方法,其可将不均匀分布的节点均匀且不重叠的划分为 patch 块,以降低后续...Spatial Patching:用于将相同数量的点分割到 patch; Dual Attention Encoder:用于提取空间信息; Projection Decoder: 用于预测未来值。...来寻找分割不均匀分布交通数据的解决方案。

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SpatialCPie:用于空间转录组聚类评估的工具

新兴的空间转录组(ST)领域的技术发展开辟了一个未经探索的领域,将转录信息置于空间环境中。聚类通常是分析这类数据的核心组成部分。...结果以两种方式可视化:用聚类图显示不同分辨率之间的聚类重叠情况;用二维数组图,其中每个点用饼图表示,表示其与不同聚类中心点的相似度。 SpatialCPie的用户界面是用Shiny实现的。...Array plot 二维数组图(图1,右),每个“斑点”的饼图显示了“斑点”和“簇”中心点之间的相似度得分。...SpatialCPie的实例演示 SpatialCPie可以用来分析任何具有空间分布的计数数据的数据集,开发团队展示了其在三个公开的ST数据集(发育中的人类心脏、原位乳腺癌和黑色素瘤)上的实用性,在此之前所有数据均使用...流出道的均匀性也很明显;它的大部分“斑点”都表现出与单个聚类(cluster 2)的高度相似性,并且该聚类在颜色空间中与其他聚类明显分离。

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    SpatialCPie:用于空间转录组聚类评估的工具

    新兴的空间转录组(ST)领域的技术发展开辟了一个未经探索的领域,将转录信息置于空间环境中。聚类通常是分析这类数据的核心组成部分。...结果以两种方式可视化:用聚类图显示不同分辨率之间的聚类重叠情况;用二维数组图,其中每个点用饼图表示,表示其与不同聚类中心点的相似度。 SpatialCPie的用户界面是用Shiny实现的。...Array plot 二维数组图(图1,右),每个“斑点”的饼图显示了“斑点”和“簇”中心点之间的相似度得分。“斑点”s和“簇”k之间的相似度得分定义为: ?...饼状图将聚类分配关系化,从而有可能识别基因表达的空间趋势 ?...流出道的均匀性也很明显;它的大部分“斑点”都表现出与单个聚类(cluster 2)的高度相似性,并且该聚类在颜色空间中与其他聚类明显分离。 ? ?

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    ClusterMap:用于空间基因表达的多尺度聚类分析 | 空间转录组分析工具推荐

    ClusterMap从基于原位转录组数据的预处理成像开始,原始荧光图像被转换成具有物理3D位置和基因身份的离散RNA点。...开发团队引入了一个高维向量,称为邻域基因组成(NGC),它是通过考虑每个RNA点上圆形窗口的基因表达谱来计算的。...每个RNA点的NGC坐标和物理坐标通过计算整合成每个点上的联合物理和NGC(P-NGC)坐标。接下来的目标是在P-NGC坐标系中对RNA进行聚类,以便进行下游分割。...开发团队选择了密度峰值聚类算法(DPC)来计算两个变量:P-NGC联合空间中每个点的局部密度ρ和距离δ。然后将这两个变量的乘积γ按照递减的顺序进行排序,以找到真正的具有高数量级γ值的集群。...除了空间转录组数据外,ClusterMap还可以被推广应用于其他二维和三维映射的高维离散信号(如蛋白质或活细胞成像数据)。

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    QQ空间“点赞”的那些事儿 - 腾讯ISUX

    点赞,是空间小伙伴间最常用的互动表达方式。...点赞一按即可,不费心思,操作简单,随便就能给个赞;熟悉的人彼此支持一下,借此沟通感情,来个赞;点赞之后可以收获赞,被点赞后表示感谢也给别人来个赞;点赞表明“朕已阅”,等等。...大家通过点赞表达赞同,喜欢和祝福, 甚至用来表达调侃。 点赞的背后,反映出真实的自己。送出和收获的赞的多少,赞的对象偏好等,在某种程度能反映出你是怎样的人以及处于何种状态。...现在,就让我们用官方大数据来告诉你QQ空间点赞的那些事儿~ 感谢你的阅读,本文由 腾讯ISUX 版权所有,转载时请注明出处,违者必究,谢谢你的合作。

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    已知空间两点组成的直线求线上某点的Z值

    已知空间两点组成的直线求线上某点的Z值,为什么会有这种看起来比较奇怪的求值需求呢?因为真正三维空间的几何计算是比较麻烦的,很多时候需要投影到二维,再反推到三维空间上去。...复习下空间直线方程:已知空间上一点 (M0(x0,y0,z0)) 和方向向量 (S(m,n,p)) ,则直线方程的点向式为: \[ \frac{X-x0}{m}=\frac{Y-y0}{n}=\frac...{ double tx = (vp.x - v1.x) / s.x; double ty = (vp.y - v1.y) / s.y; //说明点不可能在直线上...= 4.6; vp.y = 4.6; vp.z = 0.0; if (CalLinePointZ(v1, v2, vp)) { cout 点的高程...:" << vp.z << endl; } return 0; } 注意根据方向向量的值做特殊情况判断,当直线的方向向量 (S(m,n,p)) 的 (m=n=0) 时,是无法正确求值的

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    空间组学 | Nat.Biotech | 协方差环境定义了用于空间推断的细胞微环境

    ENVI 包含两个解码器:一个用于在空间模态中推断基因表达,另一个用于将空间信息投射到单细胞数据上。...与仅建模两种模式中均测量的基因的其他用于空间推断的 CVAE 不同,ENVI 明确建模全基因组范围内的空间信息和基因表达。...Para_02 ENVI架构包括一个用于空间和单细胞基因组数据的单一编码器以及两个解码网络:一个用于完整的转录组,另一个用于提供空间背景的COVET矩阵。...ENVI 考虑了这一点,通过边缘化特定技术对表达的影响,并在每个模态的编码和解码网络的输入层添加一个辅助二元神经元来增强标准变分自编码器(VAE)。...此外,ENVI 包含两个解码器:一个用于表达,其中包括从 scRNA-seq 数据中学习基因表达的额外神经元;另一个用于预测空间背景。

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    FEC:用于点云分割的快速欧几里德聚类方法

    基于聚类的方法。聚类算法根据元素的相似性将元素划分为类别,可应用于点云分割。...因此,K均值、均值漂移、DBSCAN和欧几里德聚类提取(EC)常被用于这项任务,尽管基于聚类的方法简单,但点云中每个点的高迭代率导致了高计算负担并降低了效率。...3.基于学习的方法其他当前方法直接在点云上使用深度学习或投影到二维图像中,以分割点云中的实例,基于深度学习的方法通常存在运行时间长和处理大规模点云的问题。...将所提出的快速欧几里得聚类算法应用于一般点云分割问题,实现了类似的质量,但比现有工作加快了100倍。代码(用C++、Matlab和Python实现)将在文章接受后公开。...图4:EC、RG和FEC的运行时间,随着集群数量(a)、密度(b)、数量和密度(c)的双重混合以及每个点云集群的不均匀性(d)的增加。

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    多波段VAE:用于持续学习中知识整合的潜在空间对齐

    ,该方法通过重新调整变分自动编码器的潜在空间。...最近的生成性持续学习工作解决了这个问题,并试图从新数据中学习而不忘记以前的知识。然而,这些方法通常侧重于人工场景,其中示例在随后的数据部分之间几乎没有相似性,这在持续学习的实际应用中是不现实的假设。...在这项工作中,作者确定了这一局限性,并将生成性持续学习的目标定位为知识积累任务。作者通过不断调整新数据的潜在表示来解决这个问题,作者称之为附加潜在空间中的频带,其中示例的编码与源任务无关。...此外,作者还介绍了一种控制遗忘过去数据的方法,该方法简化了这一过程。...在标准的持续学习基准之上,作者提出了一个新的具有挑战性的知识整合场景,并表明所提出的方法在所有实验和额外的实际评估中表现出了两倍于最先进的水平。

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    可用于大规模点云表面重建的深度学习算法

    基于徳劳内三角化的表面重建是基于空间点云的四面体表达(如图1右边)。...首先将空间点云进行德劳内三角化,然后将空间四面体集合转化为一个图结构,每个四面体对应图的一个节点,相邻的节点用边连接起来,利用先验的可见性信息(visibility information)计算每个节点的数据项...之前的深度学习表面重建算法大都只能用于几千到几万规模点云数据的表面重建,甚至对这样规模的点云都需要进行降采样才能够处理(如ONet)。...它主要包含两个部分,左侧部分用于点特征提取,右侧用于顶点特征构建和顶点的标签预测,右侧顶点通过一个切平面卷积包含周围的点特征信息,完成特征的构建。网络的左侧部分编码输入点云的?...,能够应用于没有可视性信息的任意点云。

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    用于三维形状生成的隐点云扩散模型

    王豫 编辑 | 赵晏浠 论文题目 LION: Latent Point Diffusion Models for 3D Shape Generation 论文摘要 去噪扩散模型(DDMs)在三维点云合成中取得了很好的效果...为了改进3D DDMs并使其对数字艺术家有用,人们需要(i)高生成质量,(ii)操作和应用的灵活性,如条件合成和形状插值,以及(iii)输出光滑表面或网格的能力。...为此,作者引入层次潜点扩散模型(LION)来生成三维形状。LION被设置为具有层次潜空间的变分自编码器(VAE),该潜空间结合了全局形状潜表示和点结构潜空间。...对于生成,作者在这些潜在空间中训练两个分层DDM。与直接在点云上操作的ddm相比,分层的VAE方法提高了性能,而点结构的隐藏层仍然非常适合基于DDM的建模。...此外,作者的VAE框架允许作者轻松地将LION用于不同的相关任务:LION擅长于多模态形状去噪和体素条件合成,它可以适用于文本和图像驱动的3D生成。

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    HyperAid:用于树拟合和层次聚类的双曲空间去噪

    ,用树形度量拟合距离的问题在理论计算机科学和机器学习界都得到了极大的关注。...尽管存在几种可证明的精确算法,用于对本质上服从树形度量约束的数据进行树形度量拟合,但对于如何对结构与树形有适度(或大幅)差异的数据进行最佳的树形度量拟合,人们所知甚少。...对于这种有噪声的数据,大多数可用的算法表现不佳,并且经常在代表树中产生负的边缘权重。此外,目前还不知道如何选择最合适的近似目标进行噪声拟合。...作者的贡献如下:首先,作者提出了一种在双曲空间中进行树度量去噪的新方法(HyperAid),当以Gromov的δ双曲性来评价时,该方法将原始数据转化为更像树的数据。...第三,作者将HyperAid与强制非负边权的方案集成在一起。

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    ECCV 2020 | SADNet:用于单图像去噪的空间自适应网络

    https://github.com/JimmyChame/SADNet Title:Spatial-Adaptive Network for Single ImageDenoising(SADNet):用于单张图像去噪的空间自适应网络...为了适应空间纹理和边缘的变化,设计了一个残差空间自适应块(residual spatial-adaptive block)。...通过从粗到细的噪声去除,得到高质量的noise-free image。该方法可以用于synthetic noisy image和real-world noisy image的去噪。 1....随着深度学习的兴起,CNN被广泛应用于Denoising而且取得了不错的效果。 早期工作中大多假设噪声是独立且均匀分布的,加性高斯白噪声常被用于建模生成噪声图像。...Deformable convolution可以改变卷积核的形状,它首先为每个位置学习一个偏移图(offset map)然后将所得偏移图应用于特征图,对相应特征进行重采样来进行加权。

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    BayesSpace:亚点分辨率下的空间转录组学

    作者 | 崔雅轩 编辑 | 陈兴民 今天给大家带来一篇发表在nature biotechnology上研究空间转录组的文章。最近的空间基因表达技术能够在保留空间背景的同时全面测量转录组谱。...然而,现有的分析方法并没有解决技术的分辨率或有效地利用空间信息。在这里,作者介绍了贝叶斯空间,一种完全贝叶斯统计方法,它利用来自空间邻域的信息来提高空间转录组数据的分辨率和聚类分析。...在空间转录组的分析中除了分辨率问题,另一个难点是如何获得更接近组织学特征的聚类结果,目前的分析多是基于 scRNA-seq 的聚类算法,忽略了空间相邻点之间的相似性,而作者希望聚类结果在空间坐标中更接近组织学特征的同时...二、模型与方法 文章介绍,BayesSpace通过对低维的基因表达矩阵进行建模,并通过空间先验知识诱导真实的邻近点聚集,以此进行推广,从而实现空间聚类。...这种方法来自于此前开发的用于图像分析和微阵列数据的空间统计方法。与已有的方法相比,BayesSpace允许对聚类结构和错误项进行更灵活的调整和规范。

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    PV-RAFT:用于点云场景流估计的点体素相关场(CVPR2021)

    由于点云是不规则且无序的,因此从3D空间中的所有对(all-pairs)场中有效提取特征十分具有挑战性,其中所有对相关性在场景流估计中起着重要作用。...但考虑到点云的不规则性,在3D空间构建结构化的all-pairs相关场仍然十分困难,为了解决这些问题,作者提出了点体素相关性场,以多尺度方式对目标点云进行体素化以构建金字塔相关体素,这些场融合了基于点和基于体素的相关性的优点...每次迭代都将以下变量作为输入:(a)相关特征,(b)当前流估计,(c)前一次迭代的隐藏状态,(d)上下文特征。 (4)流细化。设计这个流程细化模块的目的是使场景流预测f在3D空间中更加平滑。...另一个基准KITTI Scene Flow 2015 是一个用于真实扫描场景流估计的数据集。它是通过利用 KITTI 原始数据进行动态运动标注构建的。...作者依次将基于点的相关性、基于体素的相关性和细化模块应用于所提框架。 作者最后还对点体素相关场进行了可视化。第一行,绿点代表平移的点云P1+f,而红点代表目标点云P2。

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    知识积累---Graph Fourier transform用于复杂器官的空间组学表征和分析

    空间图傅里叶变换(SpaGFT),将图信号处理应用于广泛的空间组学分析平台。...基于图的方法提供了一种强大的分析能力,可以有效地编码和利用空间组学数据表示中组织内的空间关系。假设FTU可以直观地看作是一个图;其节点表示spot或细胞,边缘连接空间相邻或功能相关的节点。...空间图傅里叶变换(SpaGFT),这是一种分析特征表示方法,用于编码平滑图信号,以表示组织和细胞内的生物过程。它连接了图形信号处理技术和空间组学数据,使各种下游分析和促进有见地的生物学发现成为可能。...结果1、空间组学数据的平滑信号将当前的空间分辨组学总结为与节点粒度相关的三种类型的空间图,范围从亚细胞水平(即像素级)到更广泛的细胞水平(即细胞水平)和基于空间分辨率的多细胞尺度(即spot水平)。...具体来说,低频调频有助于图形信号的低而平滑变化,代表空间组织模式,而高频调频有助于图形信号的快速变化,通常指空间组学数据中的噪声。

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    LVBA:用于RGB点云建图的LiDAR-视觉联合优化

    然而,目前用于生成RGB彩色地图的方法主要依赖基于滤波估计或滑动窗口优化的实时定位,这些方法可能在精度和全局一致性上有所欠缺。...本文主要贡献: 光度联合优化方法,本文提出了一种基于LiDAR点云先验的光度联合优化方法,用于估计相机状态,即使在时间对齐不准确或外参未精细校准的情况下,也能提高点云上色质量。...LiDAR辅助场景点生成和可见性确定算法:我们提出了一种包含全局相机帧共视性的算法,有助于构建全局光度视觉联合优化问题。 开发了一个工具链,用于评估彩色点云地图的精度与一致性。...全局场景点选择与可见性生成:为了提供更多全局约束,全局场景点用于优化相隔较远的相机帧: 利用LiDAR扫描数据构建全局可见性体素地图,每个体素记录其可见的相机帧集合。...通过将相机的光度束调整(BA)与几何先验相结合,我们实现了相机位姿与LiDAR点云的高精度对齐。LiDAR辅助可见性判定算法使得该BA方法能够有效地应用于全局。

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