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MR应知应会:MungeSumstats包

该推论首先来自输入文件的列标题,但是,等位基因翻转检查通过将 A1(应该是参考等位基因)与参考基因组进行比较来确保这一点。...如果 SNP 的 A1 DNA 碱基与参考基因组不匹配,但 A2(应该是替代等位基因)与参考基因组匹配,则等位基因将与效应信息(例如 Beta、优势比、签名汇总统计、FRQ、Z)一起翻转。...strand_ambig_filter 应删除具有链模糊等位基因的 SNP。默认为FALSE。 allele_flip_check 是否应根据参考基因组检查等位基因列以推断是否需要翻转。...默认值为 TRUE。 allele_flip_drop控制是否删除 A1 或 A2 碱基对值均不与参考基因组匹配的 SNP。默认值为 TRUE。...对于翻转值,这表示等位基因是否根据 MungeSumstats 从输入列标题中选择的 A1、A2 进行切换,因此可能与创建者的意图不符。请注意,这些列将出现在返回的格式化摘要统计信息中。

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MySQL 系列教程之(七)DQL:从 select 开始丨【绽放吧!数据库】

使用子句的次序不对将产生错误消息 过 滤 数 据 WHERE 数据库表一般包含大量的数据,很少需要检索表中所有行。 通常只会根据特定操作或报告的需要提取表数据的子集。...LIKE与通配符 前面介绍的所有操作符都是针对已知值进行过滤的。 但是,这种过滤方法并不是任何时候都好用。 例如,怎样搜索产品名中包含文本anvil的所有产品?...使用这些函数,MySQL查询可用于检索数据,以便分析和报表生成 确定表中行数(或者满足某个条件或包含某个特定值的行数)。 获得表中行组的和。...找出表列(或所有行或某些特定的行)的最大值、最小值和平均值。 上述例子都需要对表中数据(而不是实际数据本身)汇总。...这使我们能够对行进行计数,计算和与平均数,获得最大和最小值而不用检索所有数据 目前为止的所有计算都是在表的所有数据或匹配特定的WHERE子句的数据上进行的。

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    Python数据分析笔记——Numpy、Pandas库

    3、基本的索引和切片 (1)元素索引、根据元素在数组中的位置来进行索引。...一维数组的索引 多维数组的索引 (2)切片索引 一维数组的切片索引(与Python列表的切片索引一样) 多维数组的切片索引 (3)花式索引 元素索引和切片索引都是仅局限于连续区域的值,而花式索引可以选取特定区域的值...也可以在创建Series的时候为值直接创建索引。 b、通过字典的形式来创建Series。 (3)获取Series中的值 通过索引的方式选取Series中的单个或一组值。...也可以给某一列赋值一个列表或数组,其长度必须跟DataFrame长度相匹配。如果赋值的是一个Series,则对应的索引位置将被赋值,其他位置的值被赋予空值。...根据数组中数据的类型不同,产生的统计指标不同,有最值、分位数(四分位、四分之三)、标准差、方差等指标。 7、唯一值的获取 此方法可以用于显示去重后的数据。

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    PostgreSQL 教程

    LIMIT 获取查询生成的行的子集。 FETCH 限制查询返回的行数。 IN 选择与值列表中的任何值匹配的数据。 BETWEEN 选择值范围内的数据。 LIKE 基于模式匹配过滤数据。...完全外连接 使用完全连接查找一个表中在另一个表中没有匹配行的行。 交叉连接 生成两个或多个表中的行的笛卡尔积。 自然连接 根据连接表中的公共列名称,使用隐式连接条件连接两个或多个表。 第 4 节....分组集、多维分组和汇总 主题 描述 分组集 在报告中生成多个分组集。 CUBE 定义多个分组集,其中包括所有可能的维度组合。 ROLLUP 生成包含总计和小计的报告。 第 7 节....子查询 主题 描述 子查询 编写一个嵌套在另一个查询中的查询。 ANY 通过将某个值与子查询返回的一组值进行比较来检索数据。 ALL 通过将值与子查询返回的值列表进行比较来查询数据。...检查约束 添加逻辑以基于布尔表达式检查值。 唯一约束 确保一列或一组列中的值在整个表中是唯一的。 非空约束 确保列中的值不是NULL。 第 14 节.

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    SQL 语法速成手册

    列(column) - 表中的一个字段。所有表都是由一个或多个列组成的。 行(row) - 表中的一个记录。 主键(primary key) - 一列(或一组列),其值能够唯一标识表中每一行。...SQL 语法要点 SQL 语句不区分大小写,但是数据库表名、列名和值是否区分,依赖于具体的 DBMS 以及配置。 例如:SELECT 与 select 、Select 是相同的。...DISTINCT 用于返回唯一不同的值。它作用于所有列,也就是说所有列的值都相同才算相同。 LIMIT 限制返回的行数。可以有两个参数,第一个参数为起始行,从 0 开始;第二个参数为返回的总行数。...内连接 vs 自然连接 内连接提供连接的列,而自然连接自动连接所有同名列。 外连接返回一个表中的所有行,并且仅返回来自次表中满足连接条件的那些行,即两个表中的列是相等的。...确保某列(或两个列多个列的结合)有唯一标识,有助于更容易更快速地找到表中的一个特定的记录。 FOREIGN KEY - 保证一个表中的数据匹配另一个表中的值的参照完整性。

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    SQL 语法速成手册

    列(column) - 表中的一个字段。所有表都是由一个或多个列组成的。 行(row) - 表中的一个记录。 主键(primary key) - 一列(或一组列),其值能够唯一标识表中每一行。...SQL 语法要点 SQL 语句不区分大小写,但是数据库表名、列名和值是否区分,依赖于具体的 DBMS 以及配置。 例如:SELECT 与 select 、Select 是相同的。...DISTINCT 用于返回唯一不同的值。它作用于所有列,也就是说所有列的值都相同才算相同。 LIMIT 限制返回的行数。可以有两个参数,第一个参数为起始行,从 0 开始;第二个参数为返回的总行数。...内连接 vs 自然连接 内连接提供连接的列,而自然连接自动连接所有同名列。 外连接返回一个表中的所有行,并且仅返回来自次表中满足连接条件的那些行,即两个表中的列是相等的。...确保某列(或两个列多个列的结合)有唯一标识,有助于更容易更快速地找到表中的一个特定的记录。 FOREIGN KEY - 保证一个表中的数据匹配另一个表中的值的参照完整性。

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    Mysql 必知必会(一)

    ; 切换数据库:use local; 显示数据库下所有表名:show tables; 显示表中字段名、数据 类型、是否允许NULL、键信息、默认值以及其他信息:show columns from fee...这两个值必须用AND关键字 分隔。BETWEEN匹配范围中所有的值,包括指定的开始值和结束值。...包含 文本1000的所有行 REGEXP后所跟的东西作 为正则表达式(与文字正文1000匹配的一个正则表达式)处理。...如果分组列中具有NULL值,则NULL将作为一个分组返回。如果列中有多行NULL值,它们将分为一组。 GROUP BY子句必须出现在WHERE子句之后,ORDER BY子句之前。...子句顺序 子句 说明 是否必须使用 SELECT 要返回的列或表达式 是 FROM 从中检索数据的表 仅在从表选择数据时使用 WHERE 行级过滤 否 GROUP BY 分组说明 仅在按组计算聚集时使用

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    2024重生之回溯数据结构与算法系列学习(10)【无论是王道考研人还是IKUN都能包会的;不然别给我家鸽鸽丢脸好嘛?】

    溯数据结构与算法系列学习之栈和队列精题汇总 (1)题目:设计一个递归算法,删除不带头结点的单链表L 中所有值为 x 的结点。...TailInsert(L); // 尾插法插入节点 DelValue(L, 2); // 删除链表中所有值为 2 的节点 Print(L); // 打印链表中的节点 } (2...= j; // 将列索引存入三元组 t[len].value = arr[i][j]; // 将非零值存入三元组 len++; // 增加三元组的计数...{ return array[(j - 1) * 3 + i - 1]; // 根据行列索引计算一维数组中的位置并返回值 } // 打印二维数组 void PrintTwoDim(int arr...array, 3, 2); // 输出从一维数组中取出的特定元素 }

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    使用连接组优化连接 (IM 6)

    关于连接组 当启用IM列存储时,数据库可以使用连接组来优化在IM列存储中填充的表的连接。 使用连接组的目的 在某些查询中,连接组消除了解压缩和哈希列值的性能开销。...在IM列存储中填充表时,以下连接运行速度更快: 适合使用Bloom过滤器的连接 将多个小维度表与一个事实表连接起来 两个具有主键 - 外键关系的表之间的连接 02关于连接组 当启用IM列存储时,数据库可以使用连接组来优化在...03连接组如何工作 在连接组中,数据库使用相同的通用字典压缩连接组中的所有列。 本节包含以下主题: 主题: 连接组如何使用通用字典 一个通用字典是一个表级的,特定于实例的字典代码集合。...连接组如何优化扫描 关键优化是加入通用字典代码而不是列值,从而避免使用散列表进行连接。 连接组如何使用通用字典 一个通用字典是一个表级的,特定于实例的字典代码集合。...它为每个匹配过滤器的行(仅限德国汽车)存储1,每个与过滤器不匹配的行存储0。

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    MYSQL必知必会笔记

    (schema)关于数据库和表的布局及特性的信息 列(column)表中的一个字段。...每个列都有相应的数据类型,用来定义列可以存储的数据种类 行 表中的数据是按行存储的,所保存的每个记录存储在自己的行内 主键(primary key)一列(或一组列),其值能够唯一区分表中的每一行...注意:1、任意两行都不具有相同的主键值 2、每个行都必须具有一个主键值(主键列不允许NULL值) SQL是结构化查询语言(Structured Query Language)的缩写,是一种专门用来与数据库通信的语言...table 用来显示创建特定的数据库和表的MySQL语句 show grants 用来显示授予用户(所有用户和特定用户)的安全权限 show errors和show warnings 用来显示服务器错误或警告消息...在LIKE与REGEXP之间有一个重要的差别 进行OR匹配(|) 匹配几个字符之一可通过指定一组用[和]括起来的字符来完成(eg:WHERE prod_name REGEXP '[123] Ton'

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    SQL反模式学习笔记15 分组

    目标:查询得到每组的max(或者min等其他聚合函数)值,并且得到这个行的其他字段 反模式:引用非分组列   单值规则:跟在Select之后的选择列表中的每一列,对于每个分组来说都必须返回且仅返回一直值...,无论这个组匹配多少行; Max()等表达式也能保证每组都返回单一的值,即传回参数中的最大值。...2、使用关联子查询:关联子查询会引用外连接查询,并且根据外联结果查询中的每一条记录最终返回不同的结果。...6、链接同组所有值:MySQL与SQLite提供了一个叫做Group_Contract()函数,能将这一组中的所有的值连在一起作为单一值返回, 多个值之间用逗号分隔。...结论:遵循单值规则,避免获得模棱两可的查询结果。 SQL反模式,系列学习汇总

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    SQL语法速成手册,建议收藏!

    列(column) - 表中的一个字段。所有表都是由一个或多个列组成的。 行(row) - 表中的一个记录。 主键(primary key) - 一列(或一组列),其值能够唯一标识表中每一行。...SQL 语法要点 SQL 语句不区分大小写,但是数据库表名、列名和值是否区分,依赖于具体的 DBMS 以及配置。 例如:SELECT 与 select 、Select 是相同的。...DISTINCT 用于返回唯一不同的值。它作用于所有列,也就是说所有列的值都相同才算相同。 LIMIT 限制返回的行数。可以有两个参数,第一个参数为起始行,从 0 开始;第二个参数为返回的总行数。...内连接 vs 自然连接 内连接提供连接的列,而自然连接自动连接所有同名列。 外连接返回一个表中的所有行,并且仅返回来自次表中满足连接条件的那些行,即两个表中的列是相等的。...确保某列(或两个列多个列的结合)有唯一标识,有助于更容易更快速地找到表中的一个特定的记录。 FOREIGN KEY - 保证一个表中的数据匹配另一个表中的值的参照完整性。

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    Mysql 快速指南

    SQL 语法要点 SQL 语句不区分大小写,但是数据库表名、列名和值是否区分,依赖于具体的 DBMS 以及配置。 例如:SELECT 与 select 、Select 是相同的。...DISTINCT 用于返回唯一不同的值。它作用于所有列,也就是说所有列的值都相同才算相同。 LIMIT 限制返回的行数。可以有两个参数,第一个参数为起始行,从 0 开始;第二个参数为返回的总行数。...内连接 vs 自然连接 内连接提供连接的列,而自然连接自动连接所有同名列。 外连接返回一个表中的所有行,并且仅返回来自次表中满足连接条件的那些行,即两个表中的列是相等的。...,但在 UNION 中,所有查询的列数和列顺序必须相同。...确保某列(或两个列多个列的结合)有唯一标识,有助于更容易更快速地找到表中的一个特定的记录。 FOREIGN KEY - 保证一个表中的数据匹配另一个表中的值的参照完整性。

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    《SQL必知必会》万字精华-第1到13章

    表是某种特定类型数据的结构化清单。 存储在表中的数据是同一种类型的数据或者清单 数据库中的每个表都有自己的名字,并且这个表是唯一的。 列 表是由列组成的,列存储表中某部分的信息。列是表中的某个字段。...主键 表中每一行都应该都有一列或者几列来唯一标识自己。主键用来表示一个特定的行。 主键:一列或者几列,其值能够标识表中每行。...如果将值和字符串类型的比较,需要使用限定符号 3、用来与数值列进行比较的值,则不用括号。...AND...联合使用 空值检查 当我们创建表的时候,可以指定其中的列是否包含空值。在一个列不包含值时,称其包含空值NULL。...:AVG()函数会忽略掉值NULL的行 2、COUNT()函数 COUNT()函数进行计数,可以使用它来确定表中的函数或者符合特定条件的行的数目,两种使用情况: count(*):不管是空值(NULL)

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    MySQL必知必会总结

    (通常是一个文件或一组文件) 表(table) 某种特定类型数据的结构化清单 列(column) 表中的一个字段,列中存储着表中某部分的信息 数据类型(datatype) 所容许的数据的类型 行(row...) 表中的一个记录 主键(primary key),一列(或一组列),其值能够唯一区分表中每个行,用来表示一个特定的行 任意两行都不具有相同的主键值 每个行都必须具有一个主键值(主键列不允许NULL值)...Like匹配整列,REGEXP是匹配列中;可以通过BINARY关键字区分大小;匹配特殊字符前必须用\\为前导,即转义; # 搜索prod_name 包含文本 1000 的所有行 select prod_id...set cust_email = NULL where cust_id = 10005; # 为了删除某个列的值,可设置它为NULL 删除数据,可使用DELETE语句,从表中删除特定的行,从表中删除所有行...对于含有关键字NOT NULL的列会阻止插入没有值的列。 不要把NULL值与空串相混淆。NULL值是没有值,它不是空串。空串是一个有效的值,它不是无值。

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    python数据分析——数据分类汇总与统计

    数据分类汇总与统计 前言 数据分类汇总与统计是指将大量的数据按照不同的分类方式进行整理和归纳,然后对这些数据进行统计分析,以便于更好地了解数据的特点和规律。...第一个阶段,pandas对象中的数据会根据你所提供的一个或多个键被拆分(split)为多组。拆分操作是在对象的特定轴上执行的。...首先,根据day和smoker对tips进行分组,然后采用agg()方法一次应用多个函数。 如果传入一组函数或函数名,得到的DataFrame的列就会以相应的函数命名。...关键技术:在pandas中透视表操作由pivot_table()函数实现,其中在所有参数中,values、index、 columns最为关键,它们分别对应Excel透视表中的值、行、列。...: 行名称 margins : 总计行/列 normalize:将所有值除以值的总和进行归一化,为True时候显示百分比 dropna :是否刪除缺失值 【例19】根据国籍和用手习惯对这段数据进行统计汇总

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    两种主要列存储方式的区别

    这意味着并非行的所有部分都在存储器中的单个I / O操作中被拾取,如果只有行的子集与特定查询相关,这被认为是一件好事。然而,列族可能由许多列组成,列族中的这些列不能单独访问。...组B分别存储来自传统关系数据库表的列,以便可以单独访问它们。与A组类似,这对仅访问任何特定查询中的表属性子集的查询很有用。...我们可以找出它来自哪个列,因为来自同一列的所有值都是连续存储的。我们可以通过计算在同一列中有多少值来计算它来自哪一行。 id列中的第四个值匹配到与姓氏列中的第四个值相同的行以及电话列中的第四个值等。...请注意,这意味着必须明确存储特定行的未定义的列作为列在列表中的NULL;否则我们不能再根据它们在相应列表中的位置来匹配值。 同时,组A中的系统将为每个值显式存储行名称,列名称或二者。...因此,这些系统将显式地为列族中的一行中的每个元素或单个列column-family中的每个元素的行名/值对提供列名/值对。 (组A通常还会存储每个值的时间戳,但解释这只会使这个讨论复杂化)。

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    Python 数据处理:Pandas库的使用

    和 Series 之间的运算 2.9 函数应用和映射 2.10 排序和排名 2.11 带有重复标签的轴索引 3.汇总和计算描述统计 3.1 相关系数与协方差 3.2 唯一值、值计数以及成员资格 ---...1.1 Series Series是一种类似于一维数组的对象,它由一组数据(各种 NumPy 数据类型)以及一组与之相关的数据标签(即索引)组成。...,它含有一组有序的列,每列可以是不同的值类型(数值、字符串、布尔值等)。...'dense' 类似于'min'方法,但是排名总是在组间增加1,而不是组中相同的元素数 ---- 2.11 带有重复标签的轴索引 直到目前为止,所介绍的所有范例都有着唯一的轴标签(索引值)。...样本值的累计最大值和累计最小值 cumprod 样本值的累计积 diff 计算一阶差分(对时间序列很有用) pct_change 计算百分数变化 ---- 3.1 相关系数与协方差 有些汇总统计(

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    MySQL(五)汇总和分组数据

    一、汇总数据 工作中经常需要汇总数据而不是将它们全部检索出来(实际数据本身:返回实际数据是对时间和处理资源的浪费),这种类型的检索有以下特点: ①确定表中的行数(或者满足某个条件或包含某个特定值的行数)...②获得表中行组的和 ③找出表列(或所有行或某些特定的行)的最大值、最小值和平均值 聚集函数(aggregate function):运行在行组上,计算和返回单个值的函数(MySQL还支持一些列的标准偏差聚集函数...1、avg()函数 avg()通过对表中行数计数并计算特定列值之和,求得该列的平均值;avg()可用来返回所有列平均值,也可用来返回特定列的平均值; select avg(prod_price) as...,不管表列中包含的是空值(null)还是非空值; ②使用count(column)对特定列中具有值的行进行计数,忽略null值; select count(*) as num_cust from customers...子句保证只统计某个指定列的数值; PS:利用标准的算数操作符,所有聚集函数都可用来执行多个列上的计算(sum()函数忽略列值为null的行) 6、distinct与聚集函数 MySQL5.0.3以及之后的版本

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    SQL Server 2005 正则表达式使模式匹配和数据提取变得更容易

    模式匹配 确定字符串是否与模式匹配是对正则表达式的最简单应用,如图 1 所示,而且易于操作。 首先,我使用“选项”字段来存储函数的正则表达式选项。...然而,Match 对象并非用于测试匹配而是为在输入字符串中找到的第一个匹配项创建的。Match 对象用于检索指定的组。如果在输入中未找到匹配项,则返回空值。...通过将额外列添加到此表,您可以存储特定于国家的验证模式。这样可允许适用于某地址行的约束根据该行对应的国家而变化。 在代表客户端存储数据的数据库中,通常已经有一个表示客户端的表。...由于我们还必须在每个匹配项中循环访问组,因此分组是唯一略微复杂的操作。在图 4 中,GroupNode 类与 MatchNode 类一样,除了它还包括其所代表的组的名称。...在图 5 中,RegexGroups 函数定义与 RegexMatches 函数定义一样,除了它还返回匹配项中包含组名称的其他数据列。

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