之前我学习和自己分析时就遇到过，尝试使用判断的方式事先检查它是不是数据存在问题（这类数据明显不服从正态分布），可以使用正态性检验，或者直接判断是不是样本组内的数据是完全一样的，如果一样就不要这个了。...所遇到的问题： 分析两个样本之间是否存在差异，每个样本三个重复。现在用的是t.test，但有些样本三个重复的值一样（比如有0,0,0或者2,2,2之类的），想问下像这种数据应该用什么检验方法呢？...，我们需要解决的就是这个问题。...为什么出现这问题？如果解决？以下是我的回答： 数据是恒量是无法做t检验的，因为计算公式分母为0（不懂的看下统计量t的计算公式，一般标准差/标准误为分母，所以恒量是不能算的）。...，如果出问题，返回相应的NA，这样我们可以算完后再检查数据。
前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息，从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。...首先我们做准备工作，读入这两个文件，会用到前面讲过的☞正则表达式 #读入转录本和基因名之间的映射关系 mapping=read.table("id_mapping.txt",sep="\t",row.names...参考资料： ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列
TRICONEX 3636R 服务器中聚合来自多个来源的数据图片在异构计算平台上节省资源和可普遍部署的应用程序在工业数据方面为工业4.0提供了新的世界。...容器应用程序是提供严格定义的功能的小软件模块，是自动化世界中聪明的数据管理的一个例子。Softing推出了一个新的产品系列，将容器技术用于西门子和Modbus控制器。...背后的想法如前所述，容器应用程序是具有精确定义的功能的软件模块，允许新的部署选项，为自动化技术带来许多好处。好处是运行在不同计算机平台上的低资源、通用的应用程序或软件的实际隔离、封装和可移植性。...这确保了容器应用程序总是行为一致，而不管它在什么环境中执行。下载后，容器应用程序可以在几秒钟内使用单个命令行进行部署，并且在生产级别提供了实现简单集中管理的优势。...这可以在内部使用设备管理系统(DMS)或在云环境中完成(例如微软Azure物联网边缘, AWS物联网绿草)，而且随着机器工作负载的变化，工作TRICONEX 3351TRICONEX AI3351 TRICONEX
，但是对于数据清理来说，工作才刚刚开始，这是一种逻辑的数据清理，因为目前分区表中重新分区后没有数据，对于历史数据可以选择按照分区逻辑使用insert append的方式进行数据导入。...不过还是有一定的隐患，后面会单独说。 按照表的数据量，每天的增量数据都在百万，千万，所以按照天来导入还是比较合理的，如果按照月，可能时间会很长，而且不好控制。...比如 SYSDATE-31 ------------------- 2015-06-20 17:30:23 我们就根据sysdate-i的方式来得到相应的日期。...tmp_date_a||chr(39)||','||chr(39)||'YYYYMMDD'||chr(39)||');'||chr(10)||'commit;'); end loop; end; / 在绝大多数的场景里这种数据导入方式是没有问题的...所以在检查的时候会有一些问题。 可以这么改。
昨天刚到公司，开发的同事就找到我，让我帮他看看某一台mysql的库，似乎数据是不同步了。...大体的意思是，A地库中的数据会同步到B地，B地的数据会同 步到C地，C地就是开发最终需要访问的数据，这些业务都是独立的，但是一部分数据是需要同步的。听起来比较拗口，实现方式也比较有意思。...但是指同步一部分数据比如A,B ? 按照这样的结构图，目前发现是Area3中的数据没有同步过来，所以排查的思路也就很清晰了。...所以早上的问题因为网络问题导致了数据的不同步，但是初步的网络问题解决了，不知道怎么的，又把防火墙设置进行了修改，导致Area3的备库压根连不到Area2，所以日志始终接收不了。...这个问题虽然比较简单，但是作为MySQL新手还是需要好好了解一下开源中的数据复制实现方式与方法。这个问题的分析中根据业务的架构实现还是需要很熟练的掌握，这样在问题发生的时候才不至于太手忙脚乱。
在生产环境中，做数据迁移需要考虑很多的可能性和场景，尽量排除可能发生的问题。我自己总结了下，大体有如下需要注意的地方。...一方面可以根据这些测试积累一些必要的数据作为生产中使用参考，另外一方面可以基于之前的测试，总结经验，总结不足之处，加入改进，在生产中每一分钟的改进都是很重要的。...对于lob的数据类型，在使用imp,impdp的过程中，瓶颈都在lob数据类型上了，哪怕表里的lob数据类型是空的，还是影响很大。...3)网络 网络带宽 网络是很重要的一个因素，数据迁移的时候肯定会从别的服务器中传输大量的文件,dump等，如果网络太慢，无形中就是潜在的问题。...的影响 有些外部系统可能为了数据同步，可能会在系统中创建一些物化视图日志，可以和他们做一个确认，删除物化视图日志，减少数据插入的时候物化视图日志的影响， 还有一个问题就是物化视图日志会使rename table
不过今天的重点是两个小问题。...问题2：我在一台服务器上创建数据库，速度非常快，几秒钟就完成了。看日志没有任何异常，输出都很完成，进度显示也很全。...使用sqlplus登录的显示却有些奇怪，而且查看数据目录下，没有生成任何的文件。唯一的文件就是/etc/oratab的记录了。...SQL> exit 所以这个问题看起来真是纠结。 而问题的原因也很明显，就是/etc/hosts中的记录不全，只需补充主机IP的信息即可。...添加一条主机IP和主机名的映射,比如 10.11.1.2 testdb.oracle.com 当然回过头来，原因都是一些很零散的小问题，但是不重视，在紧急情况下，这就是大问题。
原文的内容可以分为三个部分 文本挖掘和探索新数据分析 情感分析和 Topic Modeling with NLP（） 机器学习预测分析 对于自己这样一个不太了解音乐的人来说首先提出的问题就是 Prince...下面开始数据分析的内容 第一部分：数据预处理 1、读入数据，查看变量，查看数据维度 prince_origR.B （peak positions for the US Pop and R&B charts）我理解为另外两个排行榜上的排名 prince...37年 year和peak变量中有一些缺失值 缺失值可以先保留，根据后续的具体分析内容在做处理 8、将年份划分为年代 library(dplyr) prince% mutate(...")) 至此数据预处理就完成了，将结果保存到文件中 write.csv(prince,file="prince_new.csv",row.names = F,quote = F) 第二部分：对数据进行一些简单的可视化
相反，我们使用虚拟变量来衡量它们。 例子：性别 让我们假设x对y的影响在男性和女性中是不同的。 对于男性y=10+5x+ey=10+5x+e 对于女性y=5+x+ey=5+x+e。...因此，在y和x的真实关系中，性别既影响截距又影响斜率。 首先，让我们生成我们需要的数据。...接下来，让我们尝试两个虚拟变量：性别和地点 性别和地点的虚拟变量 性别并不重要，但地点很重要 让我们获取一些数据，其中性别不重要，但地点会很重要。...绘制查看x和y之间的关系，按性别给数据着色，并按地点分开。 plot(d,grid~location) 性别对Y的影响似乎是显著的。但当你比较芝加哥的数据和多伦多的数据时，截距不同，斜率也不同。...性别并不重要，而地点会改变截距和斜率 现在让我们获取一些性别和地点都很重要的数据。让我们从两个地点开始。
这里面涉及到一个“连接函数”和一个“误差函数”，“响应变量的期望”经过连接函数作用后，与“自变量”存在线性关系。选取不同的“连接函数”与“误差函数”可以构造不同的广义回归模型。...针对不同的问题与目的，我们通常采用ROC曲线与lift曲线作为评价logistic回归模型的指标。 1）ROC曲线 设置了两个相应的指标：TPR与FPR。...这两个指标都能够评价logistic回归模型的效果，只是分别适用于不同的问题： 如果是类似信用评分的问题，希望能够尽可能完全地识别出那些有违约风险的客户（不使一人漏网），我们需要考虑尽量增大TPR（覆盖率...条件logistic回归，用 survival 包里的 clogit 二、相关应用例子：Binary Logistic（因变量只能取两个值1和0虚拟因变量） 案例一：本文用例来自于John Maindonald...所著的《Data Analysis and Graphics Using R》一书，其中所用的数据集是anesthetic，数据集来自于一组医学数据，其中变量conc表示麻醉剂的用量，move则表示手术病人是否有所移动
习题 3 每天每个交易所上涨、下跌的股票各有多少？ 分析： 这题和Ex-2非常类似，唯一的不同就是分组变量多了一个：对于每个交易日，我们不仅需要根据涨跌updown分组，还要根据交易所分组。...字符串截取函数str_sub来自stringr包。str_sub(symbol, start = -2, end = -1)的意思是截取symbol最后两个字符（注意start/end取了负值）。...为了方便计算，我们首先在原数据集中新增一个变量ret，表示股票的日收益率。'...注意以上运算的结果是一个取值为True或False的向量，data.table最终会挑选出为True的那些行。 我们仍旧使用ifelse函数生成updown这个变量。...大猫的微信号是： iRoss2007 村长的B站主页是：http://space.bilibili.com/40771572 大猫的R语言课堂关注R语言、数据挖掘以及经济金融学。
本练习题来源于Renkun (github.com/renkun-ken/r-data-practice) 在Github上的共享，我们认为它包括了绝大多数实践中会遇到的问题，特别具有代表性。...共同组成的“面板数据”在工作中几乎随处可见。...问题分析 首先，我们需要把股票代码symbol中包含8的那些观测找出来。我们可以借助与stringr这个字符串处理包。这一步不难，稍微有些挑战的是去重。如果我们不去重，那么我们会得到非常多的重复观测。...(date, updown)这个结构，他的意思是，把整个数据集按照date和updown两个变量进行分组，并依次排序。...其中，updown是我们新建的字符变量，用来表示分组，它只取两个值：UP, DOWN。这其中的难点是建立updown这个变量。我们使用了ifelse这个函数。
save(pd,exp,gpl,file = "steploutput,Rdata")，这句代码将几个第一个脚本有用的变量保存到Rdata文件中，下次使用这些变量时直接加载load这个Rdata文件即可...变量，自带变量名称，不需要再次赋值，也没有参数。undefined表格文件需要赋值，读取参数不同导致读取结果不同，不能在后续代码中同等处理。...Rdata可以保存多个变量，下次使用只需要一次load可以的到多个数据。-Rdata不仅可以保存数据框，也可以保存其他任何数据结构，包括复杂的对象！...生信实战中R语言的几个重点函数【小洁老师语录】编程能力，就是解决问题的能力，也是变优秀的能力R语言基础入门课程-到此结束7. 数据挖掘生信技能树小洁老师7.1 为什么数据挖掘？...数据分析筛选。表达矩阵：一行是一个基因在所有样品里的表达，一列是一个样本里所有基因的表达。在表达矩阵中，寻找在不同组有表达差异的基因。
不统一的导入导出方式 还是数据导入的问题，开发提交了两个数据补丁，按照补丁的提示是需要导入一些表，然后提供了脚本做数据稽核，但是第一个dump文件就让人很纠结了，第二个也没让人省心。...分布式部署环境的集中管理 目前在一个项目中使用的环境有上百套，不同的业务，不同的环境，有时候弄几个数据补丁感觉很费劲，因为很多时间都在找环境上，公司内网的环境，客户的环境，各种类型的测试环境，在文档中描述得还算清晰...补丁中的update导致的数据问题 这个问题源于一个同事的疑问，因为在环境中某个服务出现了问题，开发同事在查找的时候发现有些地方的数据出现了不一致的情况也不好定位，刚好最近部署了一个数据补丁，就希望我来看看...(30)); 然后往两个表中插入数据，test_sub表中的数据是完整的数据，有6条，test_temp中少一些，只有4条。...对于这个问题的反思还是尽量在一些数据补丁中避免使用复杂的子查询和过滤，可能直接根据限定的列来做数据变更，控制范围更加合理，不会有牵一发而动全身的感觉。
Age和Salary是独立变量，通过这两个独立变量预测是否会Purchase（非独立变量）。...（Encoding categorical data） 对于数据集中的同类别的数据（如country列）为非numerical的数据，可以用数字1,2,3区分不同国家，但是会出现问题。...因此需要设置哑变量，不同的类别（如不同国家）单独分为一个列，属于这个国家的设置为1，不属于的设置为0。...注：在R语言中不需要特别将每一类别分为一列，因为每一列用vector来表示，可以接受不同的大小。...，在机器学习中，由于每个变量的范围不同，如果两个变量之间差距太大，会导致距离对结果产生影响。
行列引用、条件筛选等可以简单的数据管理，但其在无法有效处理多次、多重、有规律的循环和判断问题，而控制流却可以通过循环、判断、跳错等等操作轻松处理此类问题。...其中，分支控制是根据条件表达式的结果，执行不同的代码段；循环控制是根据条件重复执行代码块，为了避免无限循环，可以根据条件结束循环。接下来分别从分支控制和循环控制，对R语言中的控制流做简单讲述。...（即变量名）时，返回参数的值 > t = "r" > switch(t,r='re',g='gr',b='bl',"error") [1] "re" #如果不匹配任何参数名，switch函数不返回任何值...2.1 for循环 使用迭代器和一个向量参数，在每个循环中，迭代器变量从向量中取得一个值，直到迭代所有得向量 #语句 for (变量 in 序列/字符集) {语句/表达式} 示例 #依次执行序列/字符集中的每一个数据...function关键字定义函数，函数主要由函数名称，参数，运行的代码块和返回值组成，函数名称是变量，参数是调用函数时需要传递的形式参数；代码块是由由大括号构成，是调用函数时需要执行的代码逻辑；R的函数不需要显式地使用
因此，上面的输出结果看上去和原来的数据框没有什么差别，但实质上是不同的。最本质的差别是多了一个分组属性（Groups），即上面的结果包含了 3 个数据框，分别对应于变量 race 的 3 个类别。...与 R/Rstudio 上不同，notebook 这里把它显示成了 A grouped_df: 189 × 10（而非 # A tibble: 189 x 10)，实际它仍然包含 tibble（注意其中的...income中的9变成NA am = ifelse(am == 99, NA, am), # 将变量am中的99变成NA reason = ifelse(reason ==...9, NA, reason), # 将变量reason中的9变成NA bps = ifelse(bps == 0 | bps == 999, NA, bps), # 将变量bps中的0和999变成..., NA, wt), # 将变量wt中的0和大于99的值变成NA ht = ifelse(ht == 0 | ht > 300, NA, ht) # 将变量ht中的0和大于300的值变成
作者：科研猫 | 西红柿 责编：科研猫 | 馋猫 背景 将竞争风险模型的cmprsk包加载到R中，使用cuminc()函数和crr()函数可以进行考虑竞争风险事件生存数据的单变量分析和多变量分析。...$ 来源：干预类型，因素变量，2个类别：“ BM + PB（骨髓移植+血液移植）”，“ PB（血液移植）”。 $ ftime：时间变量，连续变量。 首先，进一步处理数据集bmt中的变量。...因此，为了绘制竞争风险模型的列线图，我们需要对原始数据集进行加权，以创建用于竞争风险模型分析的新数据集。mstate包中crprep()函数的主要功能是创建此加权数据集，如下面的R代码所示。...我们定义的发生在第31号患者的终点事件，即患者移植后复发，根据竞争风险和Cox比例风险模型计算的结果差异不大。当患者被截断或发生竞争风险事件时，两种模式的结算结果明显不同，读者可以自行尝试。...R中的riskRegression包可以对基于竞争风险模型构建的预测模型进行进一步评估，例如计算C指数和绘制校准曲线等。
一是充分利用了信息，二是把数千个基因与表型的关联转换为数个基因集与表型的关联，免去了多重假设检验校正的问题。 理解WGCNA，需要先理解下面几个术语和它们在WGCNA中的定义。...如果没有合适的power，一般是由于部分样品与其它样品因为某种原因差别太大导致的，可根据具体问题移除部分样品或查看后面的经验值。 Module(模块)：高度內连的基因集。...构建基因共表达网络：使用加权的表达相关性。 识别基因集：基于加权相关性，进行层级聚类分析，并根据设定标准切分聚类结果，获得不同的基因模块，用聚类树的分枝和不同颜色表示。...如果数据来自不同的批次，需要先移除批次效应 (记得上次转录组培训课讲过如何操作)。如果数据存在系统偏移，需要做下quantile normalization。...(corType=="pearson",1,0.05) # 关联样品性状的二元变量时，设置 robustY = ifelse(corType=="pearson",T,F) ##导入数据## dataExpr
一是充分利用了信息，二是把数千个基因与表型的关联转换为数个基因集与表型的关联，免去了多重假设检验校正的问题。 理解WGCNA，需要先理解下面几个术语和它们在WGCNA中的定义。...如果没有合适的power，一般是由于部分样品与其它样品因为某种原因差别太大导致的，可根据具体问题移除部分样品或查看后面的经验值。 Module(模块)：高度內连的基因集。...基本分析流程 构建基因共表达网络：使用加权的表达相关性。 识别基因集：基于加权相关性，进行层级聚类分析，并根据设定标准切分聚类结果，获得不同的基因模块，用聚类树的分枝和不同颜色表示。...如果数据来自不同的批次，需要先移除批次效应 (记得上次转录组培训课讲过如何操作)。如果数据存在系统偏移，需要做下quantile normalization。...(corType=="pearson",1,0.05) # 关联样品性状的二元变量时，设置 robustY = ifelse(corType=="pearson",T,F) ##导入数据## dataExpr
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