我们可以开始尝试分析一些文献的公共数据集啦,不过在处理那些数据的过程中,我们还需要传授给大家几个小技巧。...合并两个不同panel的cytof数据集
有一些情况下,你的同一个实验项目的多个FCS文件,它们的抗体顺序并不一致。...prepData(fs, panel, md, features = panel$fcs_colname)
rowData(sce1)[,1]
rowData(sce2)[,1]
可以看到,两个数据集的...,r2$channel_name)
r1;r2[n,]
# 首先合并抗体信号矩阵
ct=cbind(ct1,ct2[n,])
ex=cbind(ex1,ex2[n,])
# 然后合并细胞的样本来源及其分组信息...)
sce
得到的全新的SingleCellExperiment对象就包含了两个不同panel顺序的cytof数据集啦。