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【数据分析 R语言实战】学习笔记 第四章 数据的图形描述 （上）

4.1 R绘图概述 以下两个函数,可以分别展示二维,三维图形的示例: >demo(graphics) >demo(persp) R提供了多种绘图相关的命令，可分成三类: 高级绘图命令：在图形设备上产生一个新的图区...，它可能包括坐标轴、标签、标题等。...使用R语言作图，主要按照以下步骤进行: ①取原始数据，准备好绘图需要的变量。 ②如有需要，对绘图区域进行设置、分割。 ③绘制图形，例如创建坐标轴井绘制点图、曲线或其他类型的图。 ④标注图形。...对图形进行标注，包括在图形中添加标题、坐标轴标注、文字标注等。 ⑤设置图形格式，添加图例。包括设置图形中的线宽、线型、颜色，标一记点的形状、大小、颜色，以及坐标轴格式等。 ⑥保存和导出图形。...R中另一个比较有意思的交互函数是identify()它用于在散点图中找出点。

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    Matplotlib常用画图的简单使用记录

    目录 绘制二维散点图 绘制三维散点图 每个点加标签 坐标取消科学计数法 绘制二维散点图 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.array...绘制图例 plt.legend(loc=1, bbox_to_anchor=(1.0, 1.0)) # 限制x轴坐标长度 plt.xlim(right=5) # 展示 plt.show() 绘制三维散点图...loc) 还想再调整，可以使用参数bbox_to_anchor=(1.3, 1.0) 每个点加标签 两种方式可以实现： text: 称为无指向型标注，标注仅仅包含注释的文本内容； annotate:...称为指向型注释，标注不仅包含注释的文本内容还包含箭头指向，能够突显细节； text方式： import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x =...箭头头部的长度 'width': 4, # 箭头尾部的宽度 'facecolor': 'r', # 箭头的颜色 'shrink': 0.1, # 从箭尾到标注文本内容开始两端空隙长度 }, family

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    Matplotlib 绘2D图

    例如，我们在使用机器学习算法聚类的时候，往往就会通过散点图将样本数据展示出来。Matplotlib 中，绘制散点图的方法我们已经知道了，那就是 matplotlib.pyplot.scatter()。...如：X轴上的0.1，代表了X轴总长自左向右的10%位置。 整个画图区域就是一个axes，通过Axes参数选项可以对画图区域的坐标点与大小进行设置，如未设置会自动帮接近覆盖整个figure的值。...axes参数设置如下： axes([x,y,xs,ys])#其中x代表在X轴的位置，y代表在Y轴的位置，xs代表在X轴上向右延展的范围大小，yx代表在Y轴中向上延展的范围大小。...图像标注 当我们绘制一些较为复杂的图像时，阅读对象往往很难全面理解图像的含义。而此时，图像标注往往会起到画龙点睛的效果。图像标注，就是在画面上添加文字注释、指示箭头、图框等各类标注元素。...最基本的样式为 matplotlib.pyplot.text(x, y, s)，其中 x, y 用于标注位置定位，s 代表标注的字符串。

    2.4K50

    原创 | R的基础及进阶数据可视化功能包介绍

    首先，需要有一张空白的画布， 如下图所示。其次，我们需要根据数据确定X轴、Y轴，以及X轴Y轴的取值范围，因为一个平面直角坐标系在R绘图过程中是必不可少的。...在拥有空白画布的基础上，我们可以使用R自带的可视化功能语句plot()来描绘散点图、折线图、柱状图等，辅助用户用于观察整个数据集的潜在趋势。...Figure 5 plot()在特定位置添加文本信息 和text()同理， legend() 语句可对图表呈现方式进行标注方便理解， lines() 语句允许我们在散点图的基础上加入折线图并且调整折线的粗细...标签(lab): 定义标注的X、Y轴名称，主标题、副标题等 在开始前，我们需要下载并调用ggplot2 注意：下载以及调用时工具包名称为”ggplot2”，但声明时，我们需要声明ggplot()语句...data=mpg表示使用的数据集为mpg，mapping中是定义了映射到图表X轴、Y轴的数据属性，以及每个数据点的颜色（映射在X轴上的数据属性是displ，Y轴是hwy，颜色则按照数据集中class的种类标注

    3.7K30

    图形解读系列 | 散点图也不简单

    来源：https://www.r-graph-gallery.com/272-basic-scatterplot-with-ggplot2.html 这是个一般的散点图，展示的是X轴变量Sepal.Length...常见的有： 差异基因火山图： 在一般散点图的基础上，根据P value/Q value和log(FC)值给点着色，用以标注需要关注的显著差异点。...曼哈顿图： 曼哈顿图是基因组学中使用的一种特殊类型的散点图。 X轴显示基因组上的基因变异体的位置。 不同的颜色表示不同的样本。 Y轴显示的是与表型性状的关联检验的p值。...Pearson’s productmoment correlation coefficient is indicated (r)....jitter plot有着尽量多的二维信息，每个点是一个基因，类似于火山图的一维展示形式，横坐标是log2(FC)，这意味着越往两侧的点，log2(FC)也就越小或者越大，即基因变化倍数越大，同时也可以用颜色标注出几个比较关注的基因

    2.5K30

    【数学建模】——matplotlib简单应用

    专栏：数学建模学习笔记 matplotlib模块依赖于numpy模块和tkinter模块，可以绘制多种形式的图形，包括线图、直方图、饼状图、散点图、误差线图等等。...绘制散点图 使用numpy创建数据数组a和b。 使用scatter函数绘制散点图。 通过参数修改散点符号、大小、颜色和线宽。 生成随机数据，使用scatter绘制散点图，设置符号形状、大小和颜色。...使饼状图中的某些部分裂开，设置阴影和开始角度。 设置坐标轴刻度和标签。 设置坐标轴跨度和纵横比。...为每个柱形添加文本标注。...其基本用法包括导入必要的模块，如 numpy 和 matplotlib.pyplot，并生成数据进行绘图。例如，可以通过线图、散点图、柱状图和雷达图来展示数据。

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    数据视化的三大绘图系统概述：base、lattice和ggplot2

    R语言不仅提供了基本的可视化系统graphics包，简单的图+修饰，例如：plot、 hist(条形图)、 boxplot(箱图)、 points 、 lines、 text、title 、axis(坐标轴...)等；还提供了更加高级的图形系统lattice和ggplot2. base基本图形系统相关内容可参照：《R语言 图形初阶：hist、plot和图形布局layout | 第6讲》，作为R语言图形绘制的入门一节...，可以添加第三个元素，以指定页数 Main/sub 字符型向量，设定主标题和副标题 Panel 函数，设定每个面板要生成的图形 Scales 列表，添加坐标轴标注信息 Strip 函数，设定面板条带区域...Split/position 数值型向量，在一页上绘制多幅图形 Type 字符型向量，设定一个或多个散点图的绘图参数，（如p=点，l=线，r=回归，smooth=平滑曲线，g=格点） xlab/ylab...position方法，设定坐标，原点位于页面左下角，x轴和y轴维度范围为（0, 1），position = (xmin, ymin, xmax, ymax)。

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    快速上手matplotlib画图

    通过Matplotlib，开发者可以仅需要几行代码，便可以生成绘图，直方图，功率谱，条形图，散点图等。...▲更改后的坐标名称 那么如果我想把坐标轴上的字体更改成数学的那种形式： #在对应坐标处更换名称 plt.yticks([-2,-1,0,1,2],[r'$really\ bad$',r'$b$',r'$...('bottom') #ACCEPTS:['top' | 'bottom' | 'both'|'default'|'none'] #设置x轴的位置(设置底的时候依据的是y轴) ax.spines['bottom...； xycoords = 'data'说明的是要注释点的xy的坐标是以横纵坐标轴为基准的； xytext=(+30,-30)和textcoords='data'说明了这里的文字是基于标注的点的x坐标的偏移...+30以及标注点y坐标-30位置，就是我们要进行注释文字的位置； fontsize = 16就说明字体的大小； arrowprops = dict()这个是对于这个箭头的描述，arrowstyle='-

    1.5K20

    画图手册 | ImageGP：今天你“plot”了吗？

    R语言 - 基础概念和矩阵操作 热图绘制 R语言 - 热图美化 R语言 - 线图绘制 R语言 - 线图一步法 R语言 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图） R语言 - 火山图 R语言 - 富集分析泡泡图...R语言 - 散点图绘制 R语言 - 韦恩图 R语言 - 柱状图 R语言 - 图形设置中英字体 一文看懂PCA主成分分析 读懂PCA和PCoA R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换 桑基图riverplot...设置图例的位置，线条粗细和是否平滑，以及x轴刻度标记的倾斜度。...，说明相应位置对应的信息 线图； Modify plot titles（修改图的标题） 修改主图和图中X,Y轴的标题 线图；GO富集泡泡图；箱线图；散点图；柱状图；火山图；曼哈顿图；直方图；韦恩图；密度图...(提示信息一般都比较清楚，优先读英文信息，中文信息部分为自动翻译，还未做校正) 结果导出： 生成的结果图会在网页下端的“Plot area”区域，点击图片就会放大，导出的文件也是PDF格式的矢量图，有时候直接打开会因为篇幅有限

    3.3K31

    数据可视化详解+代码演练

    完整的绘图程序如下所示，包括图例、坐标轴、取值范围、刻度值、标题、注解等内容。...) plt.ylim(-1.5, 4.0) # 设置 x, y 轴的刻度值 plt.xticks([2, 4, 6, 8, 10], [r'2', r'4', r'6', r'8', r'10'])...=dict(arrowstyle='->', connectionstyle='arc3, rad=0.1', color='#090909')) # 设置标题、x轴、y轴 plt.title(r'$...常用的属性有hue：对数据按照不同的类型先做分组，再分别对每组数据绘图；col：用于多列数据都出现分组时；markers：用哪种符号对数据进行标注，Ci：是否开启置信区间；color、data、x、y等...fontsize=20) plt.ylabel('Passengers',fontsize=20) plt.legend([u"乘客量均值", u"乘客量标准差"],fontsize=15) #把label标注的内容显示出来

    1.2K40

    数据导入与预处理-拓展-pandas可视化

    散点图 4.1生成数据 4.2 绘制大小不一的散点图 4.3 设置渐变色/边缘/边缘宽度 4.4 绘制多组散点图 4.5 六边形箱型图 5....loc=4) # 指定图例的位置 plt.show() 输出为： 1.4 绘制折线图-双y轴 折线图–双y轴 A、C、D使用一个y轴，B使用一个y轴 # 折线图｜双y轴 # A、C、D使用一个y轴...='数量', # y轴标签 左侧的y轴 fontsize = 13) # 字体大小 ax.right_ax.set_ylabel('ACD') # 设置右边轴的标签 ax.legend...(loc=2) # 右侧坐标轴的图例位于右上角 plt.legend(loc=1) # 左侧坐标轴的图例位于左上角 ax.set_ylabel('B') # 设置左侧坐标轴的label plt.show...散点图 4.1生成数据 # 散点图｜常规 # 重新生成数据 df4 ，并制作散点图，X轴为 a，Y轴为 b df4 = pd.DataFrame(np.random.rand(50, 4), columns

    3.1K20

    R in action读书笔记（22）第十六章 高级图形进阶（下）

    position = c(xmin, ymin, xmax, ymax)，该页面的x-y坐标系统是矩形，x轴和y轴的维度范围都是从0到1，原点（0, 0）在图形左下角。...注意表达式使用的是字母x和y，而不是变量的名称对于method = "gam"，一定要记得加载mgcv包。对于method ="rml"，则需加载MASS包 x、y ：指定摆放在水平轴和竖直轴的变量。...16.4 交互式图形 16.4.1 与图形交互：鉴别点 可对散点图中的点进行鉴别和标注的函数：identify()。...利用该函数，你可用鼠标对散点图中所选择的点标注行数或者行名称，直到你选择了Stop或者右击图形识别工作才会停止。...单击散点图上的点，可以对它们进行标注，直到你从Graphics Device（图形设备）菜单中选择了Stop，或者右击了图形并从右键菜单中选择了Stop。

    1.4K20

    matplotlib学习之基本使用

    matplotlib学习之基本使用 1.figure学习2.设置坐标轴3.Legend 图例4.Annotation 标注5.tick能见度 1.figure学习 导包 import matplotlib.pyplot...''' 设置对应坐标用汉字或英文表示，后面的属性fontproperties表示中文可见，不乱码， 内部英文$$表示将英文括起来，r表示正则匹配，通过这个方式将其变为好看的字体 如果要显示特殊字符，比如阿尔法...') matlibplot并没有设置默认的x轴与y轴方向，下面就开始设置默认轴 ax.xaxis.set_ticks_position('bottom') ax.yaxis.set_ticks_position...plot一下，画出垂直于x轴的一条线，[x0,x0]表示两个点的x,[0,y0]表示两个点的y 绘制(x0,y0)垂直于x轴的线 # k--表示黑色虚线，k代表黑色，--表示虚线,lw表示线宽 plt.plot...和 textcoords='offset points' 对于标注位置的描述 和 xy 偏差值, arrowprops是对图中箭头类型的一些设置. ''' plt.annotate(r'$2x+1=%

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    Matplotlib引领数据图表绘制

    plt.show() 设置坐标轴 通过 xlim 和 ylim 来限定坐标轴的范围，只能确定一个数值区间 通过 xlabel 和 ylabel 来设置坐标轴的名称 通过 xticks 和 yticks...loc 关键字控制，其取值范围为 0-10，每个数字代表图表中的一处位置 添加注释 有时候我们需要对特定的点进行标注，我们可以使用 plt.annotate 函数来实现 　　这里我们要标注的点是..., -30) 和 textcoords=‘offset points’ ：对于标注位置的描述 和 xy 偏差 \值，即标注位置是 　　xy 位置向右移动 30，向下移动30； arrowprops ：对图中箭头类型和箭头弧度的设置...(x), 'r') ax2 = plt.subplot(2, 2, 2, sharey=ax1) # 与 ax1 共享y轴 plt.plot(x, 2 * np.sin(x), 'g') ax3 =...可以使用DataFrame.plot.scatter()方法创建散点图。

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    Day7：R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    导出在R环境之外使用的图片。 1.设置数据框以进行可视化 在本课中需要制作与每个样本中的平均表达量相关的多个图，还需要使用所有可用的metadata来适当地注释图表。 观察rpkm数据。...映射的例子包括： 位置（即在x和y轴上） 颜色（“外部”颜色） 填充（“内部”颜色） 形状（点数） 线型 尺寸 首先，必须添加x轴和y轴的位置，因为geom_point需要有关散点图的最基本信息，即要在...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中（而不是简单地在屏幕上显示）。第一种（也是最简单的）是直接从RStudio“Plots”面板导出，点击绘图面板上方的Export。...在R的术语中，输出被定向到特定的输出设备，并指示输出文件的格式。必须创建或“打开”设备才能接收图像输出，对于在磁盘上创建文件的设备，还必须关闭设备才能完成输出。 将散点图输出成pdf文件格式。...然后我们使用刚刚创建的ggplot散点图将图像绘制到设备上。

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